Name: 에어로빅 곰팡이에 의해 제어 플랜트 조직 분해에 대한 한천 - 블럭 Microcosms (동영상) | JoVE Journal
Uploaded: 2011-02-03T17:00:00.000+00:00
Duration: 12 min 34 s
Description: 학습하세요 한천 블록 미시환경에서 호기성 곰팡이에 의한 목재 생분해 메커니즘을 연구하는 방법을. 수분과 외부 기질을 정밀 제어하여 재현성 높은 결과를 얻을 수 있습니다.

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<ol><li>ASTM D1413-07. Standard test method for testing wood preservatives by laboratory soil-block cultures. . <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=%22Annual+Book+of+ASTM+Standards%22">Annual Book of ASTM Standards</a>. , 185-192 (2007).</li>
<li>Bravery, A. F. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aBravery%2C+AF+%22A+miniaturized+wood+block+for+the+rapid+evaluation+of+wood+preservative+fungicides%22">A miniaturized wood block for the rapid evaluation of wood preservative fungicides</a>. , International Research Group on Wood Protection (IRG/WP 2113). (1978).</li>
<li>Low, G. A., Young, M. E., Martin, P., Palfreyman, J. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Assessing+the+relationship+between+the+dry+rot+fungus+Serpula+lacrymans+and+selected+forms+of+masonry%5BTitle%5D)+AND+%22Int.+Biodeterior.+Biodegrad%22%5BJournal%5D)">Assessing the relationship between the dry rot fungus Serpula lacrymans and selected forms of masonry.</a> Int. Biodeterior. Biodegrad. 46, 141-150 (2000).</li>
<li>Nicolas, D. Volume I (One/1) - Degradation and Protection of Wood (Syracuse Wood Science Series #5). <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aNicolas%2C+D+%22Wood+Deterioration+and+Its+Prevention+by+Preservative+Treatments%22">Wood Deterioration and Its Prevention by Preservative Treatments</a>. , Syracuse University Press. (1973).</li>
<li>Schilling, J. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Effects+of+calcium-based+materials+and+iron+impurities+on+wood+degradation+by+the+brown+rot+fungus+Serpula+lacrymans%5BTitle%5D)+AND+%22Holzforschung%22%5BJournal%5D)">Effects of calcium-based materials and iron impurities on wood degradation by the brown rot fungus Serpula lacrymans.</a> Holzforschung. 64, 93-99 (2010).</li>
</ol>

관심 없음 충돌 선언하지 않습니다.

우리 한천 블록 설정 (그림 1)를 사용 Serpula lacrymans은 (그림 3 제어 갈색 - 부패 소나무 블록에 60 % 이상의 체중 감소로 이어지는, 석고 표면과 나무 블록 (그림 2)에 직접 접촉하는 성장 ). 이것은 쉽게&gt; 50 %의 부패의 ASTM 표준 목표를 만족하고,에서 부패에 변화의 평균 계수 (C V)는 주 16 0.055했다. 이 데이터는 실링 7 게시됩니다. 다시 다른 곰팡이는 토양 블록보다 한천 블록에서 더 이상 부화가 필요합니다. 참고로, 우리는 성공적으로 자주 외인성와 연결을 확인하는 전자 흩어지는 분광법 (SEM - EDS) 및 유도 결합 플라즈마 분광법 (ICP - 관한 것)과 전자 현미경을 스캔 사용하는 다른 곰팡이 종의 다양한 여러 과거의 실험에서 유사한 디자인을 실행 기판과 나무 8,9에 칼슘 및 다른 요소의 translocation. 낮은 다양성뿐만 아니라...

<table><tbody><tr><td>페트리 접시</td><td>Nalge Nunc international</td><td>4014</td><td>25 x 150 mm</td></tr><tr><td>한천, Type A</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>A4550</td><td></td></tr><tr><td>질산 암모늄, NH&lt;sub&gt;4&lt;/sub&gt;NO&lt;sub&gt;3&lt;/sub&gt;</td><td>Millinckrodt</td><td>3436-12</td><td></td></tr><tr><td>인산 칼륨, KH&lt;sub&gt;2&lt;/sub&gt;PO&lt;sub&gt;4&lt;/sub&gt;</td><td>JT Baker</td><td>3246-01</td><td></td></tr><tr><td>황산 마그네슘 7-수화물, MgSO&lt;sub&gt;4&lt;/sub&gt;&amp;#8226;7H&lt;sub&gt;2&lt;/sub&gt;O</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>230391</td><td></td></tr><tr><td>D-(+)-포도당</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>G8270</td><td>덱스트로스</td></tr><tr><td>붕산, H&lt;sub&gt;3&lt;/sub&gt;BO&lt;sub&gt;4&lt;/sub&gt;</td><td>Mallinckrodt Baker Inc.</td><td>2549-04</td><td></td></tr><tr><td>황산 아연 7-수화물, ZnSO&lt;sub&gt;4&lt;/sub&gt;&amp;#8226;7H&lt;sub&gt;2&lt;/sub&gt;O</td><td>Mallinckrodt Baker Inc.</td><td>8880-12</td><td></td></tr><tr><td>염화 망간 4-수화물, MnCl&lt;sub&gt;2&lt;/sub&gt;&amp;#8226;4H&lt;sub&gt;2&lt;/sub&gt;O</td><td>JT Baker</td><td>2540-04</td><td></td></tr><tr><td>황산 구리(II) 5-수화물, CuSO&lt;sub&gt;4&lt;/sub&gt;&amp;#8226;5H&lt;sub&gt;2&lt;/sub&gt;O</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>209198</td><td></td></tr><tr><td>헵타몰리브데이트 암모늄 4-수화물, (NH&lt;sub&gt;4&lt;/sub&gt;)&lt;sub&gt;6&lt;/sub&gt;Mo&lt;sub&gt;7&lt;/sub&gt;O&lt;sub&gt;24&lt;/sub&gt;&amp;#8226;4H&lt;sub&gt;2&lt;/sub&gt;O</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>431346</td><td></td></tr><tr><td>염화 칼슘 이수화물, CaCl&lt;sub&gt;2&lt;/sub&gt;&amp;#8226;2H&lt;sub&gt;2&lt;/sub&gt;O</td><td>Mallinckrodt Baker Inc.</td><td>4160-12</td><td></td></tr><tr><td>염화 나트륨, NaCl</td><td>Mallinckrodt Baker Inc.</td><td>7581-12</td><td></td></tr><tr><td>황산 철 7-수화물, FeSO&lt;sub&gt;4&lt;/sub&gt;&amp;#8226;7H&lt;sub&gt;2&lt;/sub&gt;O</td><td>Mallinckrodt Baker Inc.</td><td>5056-12</td><td></td></tr><tr><td>Pipet-aid</td><td>Drummond Scientific</td><td>4-000-110</td><td>무선&lt;br/&gt;표면을 EtOH로 닦아냄</td></tr><tr><td>10 ml 멸균 폴리스티렌 피펫</td><td>BD Biosciences</td><td>357551</td><td></td></tr><tr><td>거터 가드(Gutter Guard)</td><td>Thermwell Products Co.</td><td>VX620</td><td>비누로 사전 세척함&lt;br/&gt;철물점 구매</td></tr><tr><td>황산 칼슘 반수화물, CaSO&lt;sub&gt;4&lt;/sub&gt;&amp;#8226;0.5H&lt;sub&gt;2&lt;/sub&gt;O</td><td>Acros Organics</td><td>385355000</td><td></td></tr><tr><td>#4 코르크 보러</td><td>Boekel Scientific</td><td>1601</td><td></td></tr><tr><td>Parafilm &quot;M&quot;</td><td>Pechiney Plastic Packaging</td><td>PM-996</td><td></td></tr></tbody></table>

에어로빅 곰팡이에 의해 제어 플랜트 조직 분해에 대한 한천 - 블럭 microcosms

Agar-Block Microcosms for Controlled Plant Tissue Decomposition by Aerobic Fungi

리그노셀룰로오스성 식물 조직의 곰팡이 biodegradation를 공부에 대한 두 가지 주요 방법은 목재 방부제 테스트 (; 한천 블록 토양 블록)에 대한 개발되었습니다. 이것은 토양 블록 microcosms 높은 붕괴 속도, 적은 수분 문제, 연구 중 낮은 다양성, 그리고 방부제의 독성 높은 임계값을 얻을 것을 잘 허용됩니다. 토양 블록 테스트 따라서 더 활용 기법이며, 테스트 및 재료에 대한 미국 사회 (ASTM) (방법 D 1413-07)에 의해 표준화되었습니다. 토양 블록 디자인은 로컬 변수 토양 소스를 사용하지만, 단점을 가지고 있으며, 썩어 조직에 영양분을 외부 (외인성)의 통제를 제한 인치 이러한 단점은 다른, 점점 인기를 연구 목적으로이 방법을 적용의 문제로 등장했습니다. 이러한 현대의 목적은 네트워크 hyphal 함께 산화 메카니즘 및 추적 translocated 요소를 평가 공동 대사 toxics의 bioremediation 테스트 bioenergy 연구를위한 굴욕 lignocellulosics를 포함. 토양 - 블록은 이러한 응용 프로그램에 충분한 제어를 빌려하지 않습니다. 정제 한천 블록 접근 방식이 필요합니다. 여기, 우리는 나무 저하 곰팡이 Serpula lacrymans은 낮은 칼슘 한천과 함께 깊은 배양 접시를 이용하여 한천 블록 microcosms의 나무이 저하될 수있는 갈색 썩음을 사용합니다. 우리는 유틸리티 및 예상 다양성을 설명하는 시간 시리즈 부패에 대한 외인성 석고의 역할을 테스트합니다. 싱글 보드 격랑 (세로 컷)에서 블록은 냉방 무게, autoclaved, 플라스틱 메쉬 위에 무균 소개하고 있습니다. 외인성 석고는 인터페이스에서 추가로 곰팡이 예방 접종, 각 블록 얼​​굴을하고 있습니다. 수확은 최종 파괴 추수 때까지 무균 수 있습니다. 이러한 microcosms은 한천이나 배양 접시의 벽 블록 접촉을 피하기 위해 설계되었습니다. 결로는 접시 쏟아 도중 부화하는 동안 최소화합니다. 마지막으로, inoculum / 석고 / 목재 간격은 있지만 접촉을 허용하지 않고 최소화됩니다. 한천 블록 디자인이 덜 기술적인 관점은 또한 오류 및 연구 사이에 변화의 핵심 소스의 가장 흔한 원인입니다. 비디오 간행물이 경우에 따라서 유용합니다, 우리는 낮은 다양성, 높은 품질의 결과를 보여줍니다.

이 동영상은 호기성 곰팡이로 리그노셀룰로오스성 식물 조직의 저하를 연구하기위한 통제된 환경의 접근 방식을 보여줍니다. 영양 소스 및 습기를 제어하는​​ 능력은 한천 블록 microcosms의 주요 장점이지만, 그 접근 방식은 종종 혼합 성공을 산출. 우리는 재현성, 낮은 다양성의 결과를 얻을 수에 중요한 함정을 해결합니다.

에어로빅 곰팡이에 의해 제어 플랜트 조직 분해에 대한 한천 - 블럭 Microcosms

리그노셀룰로오스 식물 조직의 진균 생분해를 연구하기 위한 두 가지 주요 방법은 목재 보존제 테스트를 위해 개발되었습니다(토양 블록법; ...

본 절차의 전반적인 목적은 목재 수분과 외생 기질이 엄격하게 제어되는 페트리 접시 마이크로코즘에 호기성 목재 분해 균류를 접종하는 것입니다. 이는 먼저 알려진 배지를 정확한 부피로 사용하여 마이크로코즘을 준비함으로써 달성됩니다. 그다음, 분해될 목재와 모든 외생 고체 기질을 기질 간의 접촉이 없도록 하여 한천 표면의 플라스틱 그리드 위에 배치합니다.그 다음 마이크로코스모스에 테스트 곰팡이를 접종하고 배양합니다. 배양 후, 질량 손실을 측정하고 분석용 조직을 준비하기 위해 목재 블록을 수확합니다. 최종적으로 질량 손실 측정, 균사 형태 관찰, 유도결합 플라즈마 분광법과 같은 표적 원소 분석을 통해 목재의 생분해 정도와 외인성 원소 공급원의 역할을 보여주는 결과를 얻을 수 있습니다.안녕하세요, 저는 미네소타 대학교 생물제품 및 생물시스템 공학과의 Jonathan Schilling 박사님 연구실 소속 Brooke Jacobson입니다. 오늘은 호기성 진균에 의한 식물 조직 분해를 위한 미세환경으로 페트리 접시를 사용하는 절차를 보여드리겠습니다. 저희 연구실에서는 진균의 리그노셀룰로오스 분해 메커니즘을 연구하기 위해 이 절차를 사용합니다.리그노셀룰로오스는 리그닌, 셀룰로오스 및 헤미셀룰로오스로 구성된 식물 조직입니다. 우리가 가장 자주 연구하는 조직은 목재이며, 오거 블록 설계의 비기술적인 측면에서 발생하는 실수가 가장 흔한 실패 원인이자 연구 간 변동성의 주요 원인이 되므로, 당사의 오거 블록 설정 과정을 비디오로 공개하는 것이 유용합니다. 우리는 경험을 통해 이 절차가 고품질의 낮은 변동성 결과를 산출한다는 것을 알고 있습니다.그럼 시작하겠습니다. 본 실험에서는 미세생태계 내 나무 블록 상단의 헤드스페이스(headspace)를 넓히기 위해, 일반적인 페트리 접시보다 1cm 더 깊은 페트리 접시를 사용하십시오.칼슘과 철이 없는 배지를 페트리 접시당 20 milliliters가 되도록 충분히 제조하여 마이크로코즘 준비를 시작합니다. 보충제가 첨가된 약 400 milliliters의 탈이온수가 들어 있는 500 milliliter 부피 플라스크에 agar 15 grams를 넣습니다. 미리 준비된 스탁 용액을 사용하여 혼합물에 미량 영양소를 첨가합니다.영양분을 첨가한 후, 부피 플라스크의 500 milliliter 표시선까지 채웁니다. 그다음, 배지를 1000 milliliter 플라스크로 옮깁니다. 121 degrees

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라벨 플라스틱 필름은 "생분해 성"뿌리 덮개로 농업 사용을 위해 상업적으로 사용할 수 있습니다. 경작 매력적인 처리 방법을 나타냅니다 있지만, 현장 조건에서 분해가 제대로 이해된다. 본 연구의 목적은 현장 매장 한 후 플라스틱 뿌리 덮개 필름을 식민지 기본 토양 곰팡이와 박테리아를 분리하는 방법을 개발하는 것이 었습니다.

생분해 성 플라스틱 뿌리 덮개 필름을 부셔 가능성이있는 기본 토양 미생물의 분리가 농업에 사용

이 문서는 생태계 식물 및 높게 통제 된 실험실 조건에서 식물-미생물 상호작용 연구를 활성화 하는 장치 (EcoFABs)의 제조에 대 한 상세한 프로토콜을 설명 합니다.

식물-미생물 상호작용 연구 위한 실험실 생태계의 건설에 대 한 생태계 제조 (EcoFAB) 프로토콜

의무 혐기성 유기체는 산소 노출시 성장할 수 없기 때문에 혐기성 배양 기술의 사용은 필수적입니다. 여기서, 우리는 배지 제제로부터 가스 및 휘발성 지방산 정량화에 이르기까지 바이오가스 플랜트로부터 유래된 혼합 배양을 배양하는 간단하고 효과적인 방법을 입증한다.

엄격하게 혐기성 /안산 조건하에서 미생물의 재배를위한 중간 준비

여기에서, 우리는 재석회화 물질의 분해에 관여하는 곰팡이 균주를 찾기 위해 토양 생물 다양성을 스크리닝하기위한 프로토콜을 제시합니다. 첫째, 휴믹산 또는 리그노셀룰로오스 상에서 성장할 수 있는 곰팡이 균주가 분리된다. 그들의 활성은 효소 분석과 탄화수소 및 플라스틱과 같은 오염 물질에 대해 테스트됩니다.

석회화 물질의 분해에 관여하는 곰팡이에 대한 토양 생물 다양성으로부터의 분리 및 스크리닝

토양의 불투명도로 인해 구성 미생물 간의 상호 작용은 세포 분해능으로 쉽게 시각화 될 수 없습니다. 여기에서는 곰팡이 - 미생물 상호 작용을 조사하기위한 새로운 기회를 제공하는 두 가지 미세 유체 도구가 제시됩니다. 이 장치는 다재다능하고 사용하기 쉬우므로 세포 수준에서 높은 시공간 제어 및 고해상도 이미징이 가능합니다.

세포 수준에서 곰팡이 - 미생물 상호 작용을 조사하기위한 미세 유체 도구

여기에서는 초흡수성 고분자 기반 독립 영양 시스템에서 arbuscular mycorrhizal fungi를 접종하고 관찰하기 위한 간단하고 저렴한 기술에 대해 설명합니다.

Superabsorbent Polymer-based Autotrophic Systems에서 Arbuscular Mycorrhizal Cultures 접종 및 관찰

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Attine Ants' Gardens의 미생물군: 주사 전자 현미경을 통한 미생물 풍경 시각화

이 프로토콜은 혐기성 조건에서 복잡한 배설물 군집의 연속 유동 배양에 활용되는 미니 생물반응기 어레이의 조립에 대해 자세히 설명합니다. 또한 추가 분석을 위해 반응기의 조립, 접종 및 샘플링 방법에 대해서도 논의합니다.

복잡한 분변 군집의 지속적인 배양을 위한 Bioreactor Assembly

여기에서는 석유화학 제품 및 단열 응용 분야를 위한 오염 물질로부터 균사체 기반 복합재(MBC)를 생산하기 위한 최적화된 방법론을 제시합니다. 탄소 중립적이고 지속 가능해지기 위해서는 균사체 바이오 복합재와 같은 바이오 기반 및 퇴비화 가능한 재료가 해결책이 될 수 있습니다. 건설 기준을 충족하는지 확인하기 위해 몇 가지 실험이 수행되었습니다.

유채 짚 및 영지, 수지 균사체 생물 복합재의 수분 거동 및 열적 특성의 생산 및 테스트

우리는 온도 구배 블록을 소개하고 그 구성 및 활용법을 자세히 설명합니다. 이 블록은 사용자가 정의한 0에서 90 °C 범위 사이에 선형적으로 분포된 22가지 개별 온도를 제공합니다.  이 환경에서 수집된 데이터는 토양 유기물 분해 속도의 온도 반응에 관한 새로운 이론을 검증하고 개발하는 데 도움을 줍니다.

토양 유기물 분해 속도의 온도 반응: 온도 구배 블록의 구성 및 적용

학습하세요 한천 블록 미시환경에서 호기성 곰팡이에 의한 목재 생분해 메커니즘을 연구하는 방법을. 수분과 외부 기질을 정밀 제어하여 재현성 높은 결과를 얻을 수 있습니다.

에어로빅 곰팡이에 의해 제어 플랜트 조직 분해에 대한 한천 - 블럭 Microcosms

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