Quantitative Analysis of Chromatin Proteomes in Disease

Emma Monte; Haodong Chen; Maria Kolmakova; Michelle Parvatiyar; Thomas M. Vondriska; Sarah Franklin

doi:10.3791/4294

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Quantitative Analysis of Chromatin Proteomes in Disease

질병의 염색질 Proteomes의 정량 분석

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08:11 min

December 28, 2012

DOI: 10.3791/4294-v

Emma Monte¹, Haodong Chen¹, Maria Kolmakova¹, Michelle Parvatiyar¹, Thomas M. Vondriska^1,2,3, Sarah Franklin^1,4

¹Department of Anesthesiology,David Geffen School of Medicine at UCLA, ²Department of Medicine,David Geffen School of Medicine at UCLA, ³Department of Physiology,David Geffen School of Medicine at UCLA, ⁴Department of Internal Medicine,Nora Eccles Harrison Cardiovascular Research and Training Institute, University of Utah

Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

질량 분광법의 발전은 조직의 호스트에 단백질 표현 및 수정의 높은 처리량 분석을 허용하고 있습니다. subcellular 분류 및 질병 모델, 분광 및 생물 정보학은 생물 시스템에 새로운 속성을 표시 할 수 있습니다 양적 질량과 결합. 여기에 설명 된 방법은 심장 질환의 설정에 염색질 - 관련 단백질을 분석하고 다른 사람에게 쉽게 적용 할 수 있습니다

이 절차의 전반적인 목표는 마우스 심장에서 염색질 결합 단백질을 분리하는 것입니다. 이것은 먼저 심장을 균질화한 다음 심장핵 바이러스 자당, 밀도 구배를 분리함으로써 수행됩니다. 다음으로, 다음으로, 핵 플라스마는 염색질 분획(chromatin fraction)에서 분리됩니다.

그런 다음 염색질 펠릿에서 단백질을 추출하여 DNA에 느슨하게 결합된 단백질을 농축합니다. 마지막으로, 단백질은 DNA에 단단히 결합된 단백질을 농축하기 위해 다른 염색질 펠릿에서 추출됩니다. 궁극적으로, 정량적 label-free 질량 분석기 분석을 통해 다양한 생리학적 조건에서 핵 단백질체의 특성을 보여주는 결과를 얻을 수 있습니다.

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