Generation of High Quality Chromatin Immunoprecipitation DNA Template for High-throughput Sequencing (ChIP-seq)

Sandra Deliard; Jianhua Zhao; Qianghua Xia; Struan F.A. Grant

doi:10.3791/50286

높은 처리량 시퀀싱을위한 고품질 염색질 면역 침전의 DNA 템플릿의 생성 (칩 SEQ)

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Biology

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Generation of High Quality Chromatin Immunoprecipitation DNA Template for High-throughput Sequencing (ChIP-seq)

높은 처리량 시퀀싱을위한 고품질 염색질 면역 침전의 DNA 템플릿의 생성 (칩 SEQ)

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09:52 min

April 19, 2013

DOI: 10.3791/50286-v

Sandra Deliard¹, Jianhua Zhao¹, Qianghua Xia¹, Struan F.A. Grant^1,2

¹Division of Human Genetics,Children's Hospital of Philadelphia Research Institute, ²Department of Pediatrics, Perelman School of Medicine,University of Pennsylvania

Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

염색질의 immunoprecipitation과 매우 높은 처리량 시퀀싱 (칩 SEQ)의 조합은 특정 조직이나 세포주에서 단백질 DNA 상호 작용을 파악하고 매핑 할 수 있습니다. 설명은 예를 들어 전사 인자 TCF7L2 경험을 사용하여 다음 순서를위한 고품질 칩 템플릿을 생성하는 방법이다.

이 절차의 전반적인 목표는 염색질을 통해 단백질 결합 영역을 식별하는 것입니다. 이것은 먼저 단백질을 DNA에 가교함으로써 달성됩니다. 두 번째 단계는 DNA를 깎는 것입니다.

다음으로, DNA 결합 표적 단백질을 면역 침전시킨 다음 암시합니다. 마지막 단계는 가교를 역전시키고 DNA를 분리하는 것입니다. 궁극적으로 염색질 면역침전은 게놈 전반에 걸쳐 단백질 결합의 국소화를 보여주는 데 사용됩니다.

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