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결합 된 DNA-RNA 형광 현장에서 하이브리드 화 (물고기) 차별화 된 여성 마우스 배아 줄기 세...
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Biology
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JoVE Journal Biology
Combined DNA-RNA Fluorescent In situ Hybridization (FISH) to Study X Chromosome Inactivation in Differentiated Female Mouse Embryonic Stem Cells

결합 된 DNA-RNA 형광 현장에서 하이브리드 화 (물고기) 차별화 된 여성 마우스 배아 줄기 세포에서 X 염색체의 불 활성화를 연구하는

Full Text
28,555 Views
15:54 min
June 14, 2014

DOI: 10.3791/51628-v

Tahsin Stefan Barakat1, Joost Gribnau1

1Department of Reproduction and Development,Erasmus MC - University Medical Center

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Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

Overview

This protocol describes the simultaneous detection of RNA and DNA using fluorescent in situ hybridization (FISH) to study X chromosome inactivation in female mouse embryonic stem cells. The method allows researchers to observe nucleic acids in their native cellular environment.

Key Study Components

Area of Science

  • Neuroscience
  • Cell Biology
  • Genetics

Background

  • X chromosome inactivation is a crucial process in female mammals.
  • Understanding this process can provide insights into gene regulation.
  • FISH is a powerful technique for visualizing nucleic acids.
  • This study focuses on differentiated female mouse embryonic stem cells.

Purpose of Study

  • To investigate X chromosome inactivation mechanisms.
  • To utilize FISH for simultaneous detection of RNA and DNA.
  • To enhance understanding of embryonic development.

Methods Used

  • Induction of differentiation in female mouse embryonic stem cells.
  • Fixation of cells using paraldehyde.
  • Preparation of probes for detecting DNA and RNA.
  • Labeling DNA fragments with biotin or digoxigenin.

Main Results

  • Successful simultaneous detection of RNA and DNA.
  • Observation of enhanced transcription during X chromosome inactivation.
  • Accumulation of cyst RNA coding for the inactive X chromosome.
  • Validation of the FISH technique for studying gene regulation.

Conclusions

  • The protocol effectively demonstrates X chromosome inactivation.
  • FISH is a valuable tool for studying nucleic acids in situ.
  • This method can be applied to other genetic studies.

Frequently Asked Questions

What is FISH?
FISH stands for fluorescent in situ hybridization, a technique used to detect specific nucleic acid sequences in cells.
Why study X chromosome inactivation?
Studying X chromosome inactivation helps understand gene regulation and developmental processes in female mammals.
What are the key steps in the protocol?
Key steps include inducing differentiation, fixing cells, preparing probes, and performing FISH.
How does this method contribute to neuroscience?
This method provides insights into genetic regulation that can affect neural development and function.
Can this technique be used for other types of cells?
Yes, FISH can be adapted for use in various cell types to study different genetic phenomena.
What is the significance of cyst RNA?
Cyst RNA is associated with the inactive X chromosome and plays a role in X chromosome inactivation.

현장 하이브리드 화 (물고기)의 형광은 세포 내에서 네이티브 환경에서의 핵산을 검출 할 수 있습니다. 우리는 여기에 마우스 배아 줄기 세포에서 X 염색체의 불 활성화를 연구하는 데 사용할 수있는 FISH에 의해 RNA와 DNA의 결합, 동시 검출을위한 프로토콜을 설명합니다.

이 절차의 전반적인 목표는 C 2 혼성화 또는 D-N-A-R-N-A 어류에서 형광성 DNA와 RNA를 동시에 결합하여 분화된 암컷 마우스 배아 줄기 세포에서 X 염색체 불활성화를 연구하는 것입니다. 이것은 먼저 암컷 마우스 배아 줄기 세포에서 분화를 유도함으로써 달성됩니다. 정상적인 착상 후 배아 발달을 시뮬레이션하는 이 과정에서 X 염색체 불활성화가 시작되어 낭종 RNA의 전사 및 축적이 향상되어 미래의 비활성 X 염색체를 암호화합니다.

두 번째 단계는 파라알데히드를 사용하여 분화된 배아 줄기세포를 고정하는 것입니다. 다음으로, DNA 단편을 비오틴 또는 디고 게닌으로 표지하여 X 염색체와 낭종 RNA의 DNA를 모두 검출하기 위한 프로브를 준비합니다. 닉 번역을 사용합니다.

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