Name: 건설 및 바이너리 또는 삼항 암모늄 Triphenylacetates와 초분자 클러스터의 시리즈의 체계적 대칭 연구 (동영상) | JoVE Journal
Uploaded: 2016-02-15T13:00:00.000+00:00
Duration: 6 min 35 s
Description: 탐색하세요 초분자 클러스터의 선택적 구성 및 대칭 특성 분석 방법을 배우세요. 수소 결합을 이용한 결정 공학 기법으로 구성 요소 구조로부터 초분자 대칭을 예측하는 연구에 활용됩니다.

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이 작업은 일본 문부과학성(MEXT)과 JSPS의 과학 연구 B 보조금(24350072, 25288036)과 혁신 분야에 대한 과학 연구를 위한 보조금(24108723)의 재정 지원을 받았습니다. T.S.는 일본 문부과학성의 JSPS 펠로우를 위한 보조금(25763), 오사카 대학의 GCOE 프로그램 및 우수한 대학원에 대한 보조금을 인정합니다.

차 암모늄 Triphenylacetates으로 구성 단일 결정의 1. 준비 <ol><li> 유기 염, 차 암모늄 triphenylacetates (그림 1a)를 준비합니다. <ol><li> 트리 페닐 아세트산 (TPAA, 0.10 g, 0.35 mmol) 및 차 아민을 용해 : N 부틸 아민 (N 니어, 2.5 × 10-2 g, 0.35 mmol)을, 이소 부틸 (isoBu, 2.5 × 10-2 g, 0.35 mmol)을, t 부틸 아민, 또는 메탄올 함께 t의 -amylamine (t의 암, 3.0 × 10 -2 g, 0.35 mmol)을, (20 ㎖) TPAA에서 (니어, 2.5 × 10-2 g, 0.35 밀리몰 t) : 아민 = 1 : 이진 유기 염 준비를위한 1 몰비. </li><li> 삼원 유기 염의 경우 TPAA (0.10 g, 0.35 mmol) 및 차 아민 이가지 용해 : N 니어 (1.3 × 10-2 g, 0.17 밀리몰) - 니어 t (1.3 × 10-2 g을 0.17 밀리몰 ), N 니어 (1.3 × 10-2 g, 0.17 밀리몰) - t의 암 (1.5 × 10-2 g, 0.17 밀리몰), ISOBU (1.3 × 10-2 g, 0.17 mmol)을 - 니어 t (1.3 × 10-2 g, 0.17 mmol)을, 또는 isoBu (1.3 × 10-2 g, 0.17 mmol)을 - t의 암 (1.5 × 10-2 g 0.17 mmol)을 함께 메탄올 TPAA에 (20 mL) 중 : 아민 1 : 아민 2 = 2 : 1 : 1이다. </li><li> 유기 염 수득 회전 증발기 (40 ° C, 200 토르)에 의해 솔루션을 모두 증발 : TPAA- N 니어, TPAA-isoBu, TPAA- t 니어을 TPAA- t 암, TPAA- n은 뷰렛 t 니어, TPAA- 뷰렛 t 암, TPAA - isoBu- t 니어 및 TPAA-isoBu- t 암 N. </li></ol></li><li> 초분자 클러스터로 구성된 하나의 결정을 준비합니다. <ol><li> 초분자 클러스터 바람직 비극성 환경에서 구축되기 때문에 선택된 비극성 좋은 용매로서 톨루엔의 유리 바이알의 유기 염 (5.0 mg)를 (0.30 ㎖)의 각각을 녹인다. 유기 염 TPAA- t 니어, TPAA- t 암, TPAA - isoBu- t 니어 및 TPAA-isoBu- t 암, 열 톨루엔 최대 t에 대한40 ° C O를을 용해한다. </li><li> 헥산 추가 : 0.5 ml를, 0.5 ml의 0.5 ml를 2 ml를 2 ml의 1 ml의 0.5 ml에, TPAA- N 니어, TPAA-isoBu, TPAA- t 암, TPAA- (n)의 유기 염 용액에 뷰렛 t 니어, TPAA- N 니어 - t의 암, TPAA - isoBu- t 니어 및 TPAA-isoBu- t 암, 각각 유기 염 용액을 제외하고, 유기 소금의 용해도를 감소시키는 빈 용매로 TPAA- t 니어. </li><li> 일 이내에 단결정 수득 유리 바이알을 실온에서 용액 안정성 유지. </li></ol></li><li> 푸리에에 의해 유기 염 형성 적외선 (FT-IR) 스펙트럼 (35, 36)을 변형 확인합니다. <ol><li> 1 브롬화 칼륨 (KBr을)과 유기 염의 단결정 믹스 : 100 중량비. </li><li> 이 균질 한 분말 혼합물이 될 때까지 마노 유발로 혼합 분쇄. </li><li> 라운드 다이 (직경 5mm)를 입력 분말 혼합물 및 페이지하여 펠렛을펠렛 프레스를 ressing. </li><li> FT-IR 분광계로 펠렛을 넣고 측정을 수행 (누적 : 16, 해상도 : 1cm-1). </li></ol></li></ol> 2. 결정학 연구 <ol><li> 유리 접시에 파라핀에 유리 병 유리 유기 염 TPAA- t 암의 고품질의 단결정을 선택합니다. 결정은 결정이 여러 결정하지만 단결정 어셈블리없는 의미 실체 현미경 균일 보이는 균열없이 0.3 내지 1 mm의 주위 결정 크기를 갖는다. </li><li> 루프에 단결정을 넣습니다. </li><li> 단일 결정 X 선 회절 장치에 단결정으로 루프를 설정한다. </li><li> 콜리메이터 선택 : 0.3, 0.5, 0.8, 또는 1 밀리미터, 단결정의 최대 크기에 따라. </li><li> 단 C를 이용하여 단결정 X 선 회절 패턴을 수집 37,38 단결정 X 선 회절 측정을 시작 준비rystal X 선 회절 장치 (방사선 소스 : 흑연 단색화 구리 K의 α (λ = 1.54187 Å), 노출 시간 : 크리스탈 크기에 따라 30 초 (결정), 검출기 : 예를 들어, 이미징 플레이트, 크리스탈 - 투 - 검출기 거리 : 127.40 mm, 온도 : 213.1 K, 프레임 수 : 3). </li><li> 가능한 결정 파라미터를 결정 및 조건 설정 : 상기 예비 측정 결과에 기초하여 다음 측정을위한 프레임 ω, χ 및 φ 및 번호 : 노광 시간, X 선 노광 각도. </li><li> (조건 단결정 X 선 회절 장치를 이용하여 단결정으로부터 37, 38를 X 선 회절 패턴을 수집하는 방사선 소스를 단일 결정 X 선 회절의 일반 측정을 시작 흑연의 Cu K의 α를 단색화 (λ = 1.54187 Å), 검출기 : 예를 들어, 이미징 플레이트, 크리스탈 - 투 - 검출기의 distANCE : 127.40 mm, 온도 : 213.1 K). </li><li> 직접 방법에 의해 SIR2004 39 또는 40 SHELXS97 회절 패턴에서 결정 구조를 해결하고, F (2)에 기초하여 모든 관찰 반사를 이용한 전체 행렬 최소 자승 방법에 의해 정제. 등방성 치환 파라미터로 모든 비 - 수소 원자를 수정하고, 결합 된 비 수소 원자에 대해 품위하지 등방성 변위 파라미터를 이상적인 위치에 수소 원자를 놓는다. 이러한 CrystalStructure 41으로 소프트웨어를 사용하여 다음의 계산을 수행한다. </li><li> χ, ω, 및 φ 및 프레임 수 : 콜리메이터 크기, 예비 측정과 정기적 인 측정을위한 X 선 노출 시간, X 선 노출의 각도 : 단계 일부 조건의 수정을 2.1-2.8에서 절차를 반복합니다 유기 염의 단일 결정에 대한 : TPAA- N 뷰렛 t 니어, TPAA- N 뷰렛 &lt;엠&gt; t 암, TPAA - isoBu- t 니어 및 TPAA-isoBu- t 오전 자신의 결정 구조를 공개합니다. </li><li> TPAA- N 니어 (REFCODE : MIBTOH) 유기 염 결정 구조 검색 (22), TPAA-isoBu (REFCODE : GIVFEX) (24), 및 TPAA- t 니어 (REFCODE : GIVFIB) 소프트웨어를 사용하여 캠브리지 구조 데이터베이스 (42)로부터 23 일, 정복 (43), 또는 요청 양식 44. </li><li> 이러한 수은 45 ~ 48과 파이 몰 49 소프트웨어를 사용하여 컴퓨터 그래픽에 의한 결정 구조의 초분자 클러스터를 조사; 미리 분류 된 것 (도 1b) 및 Λ 또는 Δ (도 1a)와 트리 틸기의 키랄 배좌으로 얻어지는 패턴을 비교하여 초분자 클러스터의 수소 결합 패턴 점군 대칭을 결정한다. </li><li> 결정 구조의 각 클러스터의 초분자 다면체 기능 특성화유기 염. <ol><li> 성분 카르 복실 레이트 음이온 및 암모늄 양이온의 탄소 및 질소 원자를 제외 초분자 클러스터의 원자를 모두 삭제한다. </li><li> 원래 카르 복실 레이트 및 암모늄 양이온이 수소 결합에 의해 연결되어있는 탄소와 질소 원자 사이의 결합을 확인합니다. </li><li> 탄소 및 질소 - 질소 원자, 또한 결합 (이 연구에서 각각 탄소 및 질소 - 질소 거리, 5.3 및 4.1 Å 등)를 설정하기위한 경계 사이의 거리를 측정한다. </li><li> 거리가 각각 미만 5.4 및 4.2 Å있는의 탄소 - 탄소 및 질소 질소 원자 사이의 결합을 더합니다. </li><li> 유기 염 결과 다면체 결정 : TPAA-isoBu, TPAA- t 니어, TPAA- t 암, TPAA - isoBu- t 니어 및 TPAA-isoBu- t 암, 트랜스 -bicapped 면체로 (t 보)를 삼각 면체 (TD) co​​nsiderin에 의해 각각 TD, TD 및 TD,g 회전축 (C 3, C 2)뿐만 아니라 다면체의면의 수. </li><li> 초분자 클러스터의 양측 대칭 요소 및 분자간 상호 작용의 수를 고려하여 TPAA- 니어 N, N TPAA- 뷰렛 t 니어 및 TPAA- N 뷰렛 t 오전 : 유기 염의 생성 다면체 추가적인 결합을 만들기 TD, t 보 및 엇 사각 기둥 (SA) : 그들은 이상적인 것보다 적은 측면이 있기 때문이다. </li><li> 인해 C 2 대칭 14 원래의 채권이 또한 결합을하여 SA와 TPAA- N 니어 소금의 다면체를 결정합니다. 뷰렛 t 니어와 TPAA- n은 뷰렛 t 암 N TD 그들의 C 2 대칭 및 초분자 클러스터 주변의 트리 틸 그룹의 &quot;밴드&quot;를 기반으로 TPAA- 유기 염의 다른 다면체를 결정합니다. 즉, 원의 유기 염 초분자 클러스터에서 틸 그룹 형성4, 자신의 세 페닐 고리와 다면체 TD를 물리는에 의해 밴드 &quot;네 산 (그림 1C (II)), 의미가 유사한 구조적 특징을 연결 측면이있다. </li></ol></li></ol>

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폐 수소 결합 네트워크와 초분자 클러스터 시리즈 성공적 지어진 틸기를 갖는 TPAA, 다양한 종류의 일차 아민의 조합의 유기 염을 사용하는 키랄 관점과 다면체의 기능을 특징으로한다. 이 방법에서 중요한 단계는 비 - 극성 용매의 분자와 카운터 이온으로 이루어지는 유기 염 부피 틸 그룹 및 재결정과 분자의 도입이다. 초분자 클러스터가 역 미셀 구조를 갖고 있기 때문에, 즉, 이온, 수소 결합 및 소수성 탄화수소 안과 밖에 각각이다. 따라서, 초분자 클러스터는 안정적이고 선택적 비극성 환경에서 구성된다. 초분자 클러스터 항상 네 질산 네 triphenylacetates이 있지만, SU를주는 두 질산의 종류뿐만 아니라 암모늄의 종류를 도입 할 수있다이진에 더하여 원 초분자 클러스터를 형성함으로써 pramolecular 클러스터의 다양한. 초분자 클러스터를 형성 이러한 유연성은 구성 요소뿐만 아니라 종류의 의존도뿐만 아니라 숫자를 명확히하기위한 효과적인 체계적인 대칭 연구에 이르게하...

초분자는 이러한 초분자 구조의 구성으로서 그들의 고유 함수 흥미롭고 중요한 연구 대상이다 이온 및 / 또는 분자의 분리 및 키랄 감지가요 비공유 결합 1-11를 사용하여 분자 인식 능력에 유래. 분자 인정에서, 초분자 어셈블리의 대칭 가장 중요한 요소 중 하나입니다. 중요성에도 불구하고, 부품 수와 종류뿐만 아니라 각도와 비공유 결합 거리의 유연성으로 인해 원하는 대칭으로 초분자를 설계하는 것은 여전히​​ 어렵다. 체계적인 연구를 기반으로 초분자 및 그 구성 요소의 대칭 사이의 상관 관계의 설명이 원하는 초분자의 구조를 달성하기 위해 유용한 전략이다. 이들은 성분의 한정 구성되어 있기 때문에 이러한 목적으로, 초분자 클러스터는 연구 대상으로 선정 하였다d를 이론적으로 12-14 평가가 있습니다. 그러나, 금속 착체는 달리, 초분자 구조를 유지하기 위해 (15, 16) 때문에 비공유 결합의 낮은 안정성 초분자 클러스터를 구성하는 보고서 제한된 수있다. 이러한 낮은 안정도는 구조물의 동종이 초분자 어셈블리 시리즈 얻는데 문제가된다. 이 연구에서 가장 강력한 비 - 공유 결합 17-20 중 하나의 유기 염, 담당 보조 수소 결합은, 주로 특정 초분자 우선적 21-32 어셈블리를 구성하는데 이용된다. 이 유기 염은 산 및 염기, 유기 염 따라서 수많은 종류로 구성되어 쉽게 단지 산 및 염기의 상이한 조합을 혼합하여 얻어지는 것도 주목할 만하다. 반대 이온의 다양한 종류의 특정 성분의 조합 supramo 동일한 타입의 결과 때문, 특히 유기 염 체계적인 연구에 유용lecular 어셈블리. 따라서, 반대 이온의 종류를 기반으로 초분자 어셈블리의 구조적 차이를 비교할 수있다. 이전의 작업에서, (0-D) 0 차원 1 차원 (1-D) 및 2 차원으로 초분자 (2-D)의 차 암모늄 카르 복실 레이트에 의해 수소 결합 네트워크 확인 및 키랄면에서 특징했다 32. 이러한 다차원 초분자는 차원을 악용 중요한 연구 계층 크리스탈 디자인 (27)의 목표뿐만 아니라 응용 프로그램입니다. 또한, 수소 결합 네트워크의 특성으로 인해 모든 아미노산의 생체 분자의 역할에 대한 중요한 지식을 줄 것이다 암모늄 및 카르복실기가있다. 이러한 초분자를 얻기 위해 가이드 라인을 제공하는 것은 별도 응용 프로그램에서 그들에게 더 기회를 제공합니다. 이러한 초분자에서 0-D 수소 결합 네트워크와 클러스터의 초분자 구조는 relativel어려운 Y 통계 연구 (28)에 설명 된대로. 그러나, 초분자 클러스터를 구성하는 요소의 설명 후에, 선택적으로 구성하고, 초분자 클러스터 일련 21-25,32을 얻었다. 이러한 작동은 가능한 초분자 클러스터 - 의존 컴포넌트 대칭 특성을 명확히하기 위해 초분자 클러스터에서 대칭 체계적인 연구를 수행 할 수 있습니다. 이를 위해 차 암모늄 triphenylacetates의 초분자 클러스터 흥미로운 기능을 가지고, 즉, 자신의 대칭 특성과 성분 틸 그룹의 키랄 배좌 (도 1a를 반영 수소 결합 네트워크 24, 32에서의 위상 다양하며 1B). 귀신 여기 차 암모늄 triphenylacetates 초분자 클러스터를 사용하는 일련의 구성과 초분자 클러스터 대칭 기능 특성화이다 방법론보이는 것. 초분자 클러스터의 건설을위한 키는 비극성 용매에서 유기 염 부피가 큰 트리 틸 그룹의 소개와 재결정 있습니다. 바이너리 및 삼항 차 암모늄 triphenylacetates는 초분자 클러스터의 건설을위한 준비 하였다. 수소 결합 네트워크 24, 32, 지형 틸 그룹 (33, 34)의 (입체) 및 octacoordinated 다면체 (12) (도 1C)의 유사체 분자 배열의 토폴로지의 관점에서 결정 학적 연구는 초분자 클러스터 성분 의존 대칭 특성을 밝혀 25.

<table><tbody><tr><td>트리 페닐 아세트산</td><td>Aldrich</td><td>T81205-10G</td><td></td></tr> <tr><td>< > n -Butylamine</td><td>TCI</td><td>B0707</td><td></td></tr><tr><td>Isobutylamine</td><td>TCI</td><td>I0095</td><td></td></tr> <tr><td>tert -Butylamine</td><td>TCI</td><td>B0709</td><td></td></tr><tr><td>tert -Amylamine</td><td>TCI</td><td>A1002</td><td></td></tr><tr><td>메탄올</td><td>와코</td><td>131-01826</td><td>유해 물질</td></tr><tr><td>톨루엔</td><td>와코</td><td>204-01866</td><td>유해 물질</td></tr><tr><td>헥산</td><td>와코</td><td>085-00416</td><td></td></tr><tr><td>KBr</td><td>와코</td><td>165-17111</td><td></td></tr></tbody></table>

건설 및 바이너리 또는 삼항 암모늄 triphenylacetates와 초분자 클러스터의 시리즈의 체계적 대칭 연구

Construction and Systematical Symmetric Studies of a Series of Supramolecular Clusters with Binary or Ternary Ammonium Triphenylacetates

나노 또는 하위 나노 규모의 클러스터의 기능이 크게 구성 요소의뿐만 아니라 그 구성 요소 종류뿐만 아니라 준비, 또는 대칭에 따라 달라집니다. 따라서, 클러스터의 배치는 정밀하게, 특히 금속 착체를 들어, 특성화되었다. 이에 대하여, 유기 분자로 구성된 초분자 클러스터의 분자 배열의 특성화는 몇 가지 경우로 제한됩니다. 특히 초분자 클러스터의 시리즈를 얻기 초분자 클러스터의 건설 의한 공유 결합 비교할 비공유 결합의 안정성이 낮은 것이 곤란하기 때문이다. 이러한 관점에서, 유기 염의 활용은 가장 유용한 전략 중 하나입니다. 초분자의 시리즈는 다양한 반대 이온으로 특정 유기 분자의 조합에 의해 구성 될 수있다. 특히, 차 암모늄 카르 복실 레이트는 카르 복실 산의 각종 때문에 초분자의 전형적인 예로서 적합일차 아민은 상업적으로 입수 가능하고 그들의 조합을 쉽게 변경할 수있다. 이전에는 차 암모늄 triphenylacetates 구체적 비극성 용매로부터 얻어진 결정에 전하 보조 수소 결합에 의해 조립 사 질산 네 triphenylacetates 구성되는 초분자 클러스터를 구성하는 일차 아민의 각종을 사용하는 것이 입증되었다. 이 연구는 분자 초분자의 배열과 종류 및 구성 요소의 수 사이의 상관 관계를 명확히 체계적인 대칭 연구를 수행하기위한 전략으로 초분자 클러스터의 특정 구성의 응용 프로그램을 보여줍니다. 이진 triphenylacetates 이루어지는 염 및 질산 차 일가지, triphenylacetates 이루어지는 삼원 유기 염 및 질산 이가지과 동일한 방법으로 각종 성분 및 숫자와 초분자 클러스터 일련 수득 클러스터를 구성하는 초분자.

TPAA과 주 아민의 유기 염 형성은 FT-IR 측정에 의해 확인되었다. 유기 염의 결정 구조는 단일 결정 X 선 회절 측정에 의해 분석 하였다. 그 결과, 네 질산 전하 보조 수소 결합 (도 1A)를 기준으로 네 triphenylacetates 구성되는 초분자 클러스터의 동종이 종류의 수에 관계없이, 유기 염 단결정 모두에서 확인되었다 구성 요소 질산 (표 1, 그림 2). 이 결과는 초분자 클러스터의 구성 요소에 의존하는 대칭 종류를 명확히하기 위해 체계적인 대칭 연구에 적용 할 수있다. 초분자 클러스터의 대칭 체계적인 연구에 의하면, 초분자 클러스터의 키랄성 및 다면체 특징을 발견 하였다 (도 1b </strong&gt;와 <stron...

이 기사에서는 비극성 용매에서 재결정화된 1차 암모늄 트리페닐아세테이트를 사용하여 결정에서 일련의 수소 결합 초분자 클러스터를 구성하는 방법을 설명합니다. 초분자 클러스터의 이러한 선택적 구성은 초분자 클러스터와 그 구성 요소 간의 상관 관계에 대한 효과적인 체계적 대칭 연구로 이어집니다.

건설 및 바이너리 또는 삼항 암모늄 Triphenylacetates와 초분자 클러스터의 시리즈의 체계적 대칭 연구

Functions of clusters in nano or sub-nano scale significantly depend on not only kinds of their components but also arrangements, or symmetry, of their ...

본 실험의 전반적인 목표는 독특한 초분자 클러스터를 선택적으로 형성하고 그 대칭적 특징을 규명하는 것입니다. 이 방법은 특정 대칭성을 가진 초분자의 설계와 같이 초분자 화학의 핵심적인 질문들에 답하는 데 도움이 될 수 있습니다. 이 기술의 주요 장점은 모든 초분자의 구조나 대칭성을 구성 성분의 구조로부터 예측할 수 있다는 점입니다.이성분 유기염을 준비하려면, TPAA 대 아민의 몰 비를 1:1로 하여 트리페닐아세트산(TPAA)과 1차 아민(n-부틸아민, 이소부틸아민, t-부틸아민 또는 t-아밀아민 중 하나)을 20 mL의 메탄올에 함께 녹입니다. 삼성분 유기염의 준비 방법은 텍스트 프로토콜을 참조하십시오. 회전 증발기로 모든 용액을 증발시키면 유기염을 얻을 수 있습니다.초분자 클러스터로 구성된 단결정을 준비하려면, 각 유기염 5.0 mg을 유리 바이알에 넣고 비극성 양용매인 톨루엔 0.30 mL에 녹입니다. 초분자 클러스터는 비극성 환경에서 더 잘 형성되므로 톨루엔을 선택하였습니다. 유기염을 용해시키기 위해 톨루엔을 40 °C까지 가열하십시오.TPAA t-butylamine 유기염 용액을 제외한 나머지 유기염 용액에, 유기염의 용해도를 낮추기 위해 빈용매로 헥산(hexane)을 첨가합니다. 유리 바이알에 담긴 용액을 상온에서 안정 상태로 유지하여 하루 이내에 단결정을 얻습니다. 텍스트 프로토콜에 설명된 대로 푸리에 변환 적외선 스펙트럼을 측정하여 유기염의 형성을 확인합니다.입체현미경 하에서 균일해 보이며 균열이 없고 크기가 약 0.3에서 1 mm 정도인 고품질의 TPAA t-amylamine 유기염 단결정을 선택합니다. 균일한 결정이란 여러 결정의 집합체가 아닌 단일 결정을 의미합니다. 유리 바이알에서 결정을 꺼내 유리판 위의 파라핀으로 옮깁니다.단결정을 루프 위에 올립니다. 단결정이 놓인 루프를 단결정 X선 회절 장치에 장착합니다. 텍스트 프로토콜에 설명된 대로 단결정 X선 회절 장치를 사용하여 X선 회절 패턴을 수집하기 위한 단결정 X선 회절 예비 측정을 시작합니다.그런 다음, 텍스트 프로토콜에 설명된 대로 단결정 x선 회절 장비를 사용하여 단결정 x선 회절의 정규 측정을 시작하고 x선 회절 패턴을 유사하게 수집합니다. 텍스트 프로토콜에 설명된 대로 결정 구조를 분석한 후, Mercury 소프트웨어를 이용한 컴퓨터 그래픽으로 결정 구조 내의 초분자 클러스터를 조사합니다. 얻어진 패턴을 이전에 분류된 패턴들과 비교하여 초분자 클러스터 내 수소 결합 패턴의 점군 대칭성을 결정합니다.유기염의 각 결정 구조에서 초분자 클러스터의 다면체 특징을 분석하십시오. 먼저, 구성 성분인 카르복실산 음이온과 암모늄 양이온의 탄소 및 질소 원자를 제외한 초분자 클러스터 내의 모든 원자를 삭제하십시오. 그런 다음, Pimal 소프트웨어를 사용하여 원래의 카르복실산 및 암모늄 양이온이 수소 결합으로 연결되어 있는 탄소 원자와 질소 원자 사이에 결합을 생성하십시오.탄소-탄소 및 질소-질소 원자 사이의 거리를 측정하고 추가 결합 형성을 위한 경계값을 설정합니다. 거리가 5.4 Å 미만인 탄소-탄소 원자와 거리가 4.2 Å 미만인 질소-질소 원자 사이에 추가 결합을 형성합니다. 다면체의 회전축과 면의 수를 고려하여 유기염으로부터 생성된 다면체를 결정합니다.여기서 TPAA isobutylamine은 trans bicapped octahedron을 형성하는 반면, TPAA t-butylamine, TPAA amylamine, TPAA isobutylamine t-butylamine 및 TPAA isobutylamine t-amylamine은 triangular dodecahedron을 형성합니다. 초분자 클러스터 내의 면의 수, 대칭 요소 및 분자 간 상호작용을 고려하여 유기염으로 인해 생성된 다면체에 추가 결합을 형성하십시오. TPAA n butylamine 염의 다면체는 C-2 대칭성과 14개의 기존 결합로 인해 두 개의 추가 결합을 형성함으로써 square antiprism으로 결정됩니다.C-2 대칭성과 초분자 클러스터 주변의 트리틸 그룹 밴드를 기반으로, 유기염 TPAA n-butylamine t-butylamine 및 TPAA n-butylamine t-amylamine의 다른 다면체들이 삼각형 십이면체임을 확인하였습니다. 단결정 X선 분석의 대표적인 결과가 여기에 제시되어 있습니다. 초분자 클러스터에 대한 대칭성 분석 결과, 이들의 구조적 특징이 8배위 다면체의 유사체임이 밝혀졌습니다.이 영상을 시청한 후에는 대칭의 관점에서 초분자를 특성화하는 방법에 대해 충분히 이해하게 될 것입니다.

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연구

JoVE Journal

Chemistry

화학

본 실험의 목적은 파악하고 물 속에 자기 조립 discotic amphiphiles의 크기, 모양과 안정성을 조절하는 것입니다. 수성 기반의 supramolecular 폴리머의 경우 제어와 같은 수준은 매우 어렵습니다. 우리는 반발하고 매력적인 상호 작용을 모두 사용하는 전략을 적용합니다. 이 시스템을 특성을 적용하여 실험적인 기법을 광범위하게 적용할 수 있습니다.

물에 Supramolecular 폴리머의 크기, 모양과 안정성을 제어

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짧은 펩타이드의 자기 조립에 의해 주문 생체 고분자 구조의 형성

초분자 부분으로 코팅된 콜로이드의 합성 및 특성화를 위한 프로토콜이 설명되어 있습니다. 이러한 초분자 콜로이드는 자외선에 의해 표면에 고정된 분자 사이의 수소 결합이 활성화될 때 자체 조립을 거칩니다.

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Mesogens의 새로운 종류의 합성에 대 한 프로토콜 할로겐 보 세 supramolecular 음이온에 따라 [CnF2n + 1-I··· I··· CnF2n + 1]−, 보고 됩니다.

분자 재료를에서: 할로겐 결합을 통해 새로운 이오니아 액체 크리스탈 엔지니어링

원자 해상도 supramolecular 단백질 어셈블리의 구조 생물학 현상의 다양 한에서 그들의 중요 한 역할 때문에 높은 관련성의 이다. 여기, 우리는 매직-각도 회전 하는 고체 핵 자기 공명 분광학 (매스 SSNMR)에 의해 불용 성 및 비 결정 고분자 단백질 어셈블리에 고해상도 구조 연구를 수행 하는 프로토콜을 제시.

고체 핵 자기 공명 분광학에 의해 고분자 어셈블리의 원자 규모 구조 연구

1, 2-dithiolane의 합성에 대 한 프로토콜 펩 티 드와 펩 티 드에서 자기 조립 결과 supramolecular 구조의 특성 수정.

합성 및 특성 1, 2-Dithiolane의 수정 자가 조립 펩 티 드

정보 부호화 된 펩토이드 올리고머의 합성과 동적 공유 반응체 쌍 및 루이스 산성 희토류로 아민과 알데히드를 사용하여 분자 사다리로 이러한 펩토이드의 시퀀스 지시자가 조립하기 위한 프로토콜이 제시됩니다. 다중 역할 시약으로 금속 triflates.

정보 베어링 펩토이드의 합성과 시퀀스 지향 동적 공유자 자체 조립

약하게 결합된 분자 클러스터의 대기 농도는 유전 알고리즘과 반 경험적 및 ab initio 양자 화학을 활용하는 다단계 구성 샘플링 방법을 통해 발견되는 저에너지 구조의 열화학적 특성으로부터 계산할 수 있습니다.

ab initio 열화학에서 분자 클러스터의 대기 농도 계산

이 기사에서는 전기 분무 이온 이동성 - 질량 분광법, 반 경험적 양자 계산 및 에너지 해결 임계 충돌 유도 해리를 사용하여 관련 삼원 금속 착물의 해리의 상대적 열화학을 측정하는 실험 프로토콜을 설명합니다.

이온 이동성-질량 분광법을 이용한 Ni(II) 및 Zn(II) 삼항 복합체의 열화학적 연구

우리는 구성 DNA 올리고뉴클레오티드에서 시작하여 양친매성 DNA 나노스타로 구성된 합성 생체 분자 응축물을 제조하기 위한 프로토콜을 제시합니다. 응축물은 단일 nanostar 구성 요소 또는 두 가지 구성 요소로 생성되며 내장된 DNA 템플릿에서 RNA의 시험관 내 전사를 유지하도록 변형됩니다.

양친매성 DNA 나노 구조의 합성 응축물 및 세포와 같은 구조

탐색하세요 초분자 클러스터의 선택적 구성 및 대칭 특성 분석 방법을 배우세요. 수소 결합을 이용한 결정 공학 기법으로 구성 요소 구조로부터 초분자 대칭을 예측하는 연구에 활용됩니다.

건설 및 바이너리 또는 삼항 암모늄 Triphenylacetates와 초분자 클러스터의 시리즈의 체계적 대칭 연구

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