Name: 에 RNAi의 트리거 배달 아노 펠 레스 gambiae 번데기 (동영상) | JoVE Journal
Uploaded: 2016-03-08T15:00:00.000+00:00
Duration: 9 min 58 s
Description: 학습하세요 Anopheles gambiae 번데기 단계에서 RNAi 트리거를 전달하는 방법을. 이 기술은 유전자 녹다운을 통해 벡터 생물학에서 유전자 기능을 연구하는 데 활용됩니다.

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이 연구에 사용된 G3 콜로니와 LacZ 템플릿 DNA를 우리 실험실에 제공해 주신 Flaminia Catteruccia 박사와 그녀의 연구 그룹(매사추세츠주 보스턴 하버드 공중 보건 대학)에 감사드립니다. 곤충 유지 관리에 도움을 주신 Adam Jenkins (Boston College, Chestnut Hill, MA)에게 감사드립니다. 보스턴 대학의 생물학과는 이 기술의 개발과 관련된 연구에 아낌없이 자금을 지원했습니다.

1. 합성 및 준비 dsRNA를 <ol><li> 더 식별 오프 대상 영향이없는 것으로 예측되고 관심의 유전자 내에서 (해당 dsRNA를 생성하는) 200-800 bp의 넉다운 영역을 식별합니다 (예를 들어, 다른 유전자 내에서 어떤 서열 상 동성 ≥18 BP) 및 음성 대조군 (예 : 이러한 대장균의 lacZ 유전자로 (GenBank 등록 유전자 ID : 945006) 대상 곤충 게놈 내에 존재하지 않는 이종성 서열. 대안 적으로, SRPN2 21,22로서 쉽게 관찰 된 표현형을 수득 예 양성 대조군 (사용 ,의 GenBank 유전자 ID :. 1,270,169)는 dsRNA를 대상으로 SRPN2의 순서는 미셸 등으로 정의된다 (2005) 21.. 주 : E-RNAi의 이러한 영역의 식별 및 올리고 뉴클레오타이드 프라이머 (23)를 설계하는 과정에 유용 오픈 소스 생물 정보학 자원이다. </li><li> 의를 수행tandard PCR 증폭 (즉,의 Taq DNA 중합 효소는 30-35 사이클을 사용하여 수행) T7 프로모터 서열에 의해 측면 dsRNA를 합성 템플릿을 획득하기 위해 게놈 DNA 또는 cDNA의 템플릿을 이용하여 (5&#39;-TAATACGACTCACTATAGGG-3 &#39;) 및 dsRNA를 준비 진행하고 청소 제조업체의 지침에 따라 상용 시험 관내 전사 키트를 사용하여. 사용 SRPN2 PCR 증폭 조건 등에 제시된 프라이머 정보를 제공합니다. (2011) 22. </li><li> 260 nm의 파장에서의 자외선 흡수 분광법에 의해 정제 된 앰플 리콘 RNA 수율을 정량화의 RNase가없는 물에 소정의 농도 (예를 들면, 3 μg의 / μL)로 조정한다. <ol><li> 낮은 RNA 농도 문제 해결을 위해, 아래로 실온에서 진공 원심 분리기에서 샘플을 회전하거나 샘플을 동결 건조 및 물을 작은 볼륨을 재구성하여 액체 부피를 줄일 수 있습니다. 샘플을 동결 건조에 필요한 시간을 따라 달라질초기 샘플 볼륨과 dsRNA를 농도에. </li></ol></li><li> TAE 1X TBE 또는 준비 2 % 아가로 오스 겔상에서의 dsRNA의 품질 및 길이를 확인 버퍼 전사 반응에 사용되는 주형 DNA와 함께, 에티 디움 브로마이드 (EtBr이)으로 염색. dsRNA를 템플릿의 DNA보다 더 느리게 마이그레이션합니다. 품질 및 길이가 더 비특이적 dsRNA에 제품이 없을 보장함으로써 각각의 표준 DNA 마커 제품을 비교하여 평가할 수있다. 참고 : EtBr이이 강력한 돌연변이에 따라 적절하게 처리해야한다. 주 : 3 μg의 / μL의 농도에서 dsRNA를 샘플 0.5 μL은 EtBr이 유리화 아가 로스 젤에서 가시화하기에 충분한 것보다 더 많은 것이다. </li><li> 필요할 때까지 -20 ° C에서 dsRNA를 저장합니다. 분취이 dsRNA를 대량 준비를해야하므로 여러 동결 / 해동 사이클은 저하의 원인이 될 수 있습니다. </li></ol> 2. 빠른 그린 FCF 염료 (FGD) 튜브를 준비합니다 <ol><li> 빠른 그린 FCF 염료를 희석의 RNase없는 물에 0.1 % (v / v)의 (작업 용액)에 원액 (≥85 % 염료 함량)에서. </li><li> 피펫 1.5 ml의 마이크로 원심 튜브의 바닥에 염색 1 μL. </li><li> 약 3 시간 동안 65 ° C 열 블록에 넣어 튜브를 사용하기 전에 냉각, 적어도 30 분 동안 실온에서 액체, 다음 장소 튜브 증발합니다. 이 건조 고체 염료를 dsRNA 부유 용액에서 재구성한다. </li></ol> 3. 풀 주입 바늘 <ol><li> 10 ~ 30 ㎛의 팁 직경에 가열 된 바늘 풀러를 사용하여 붕규산 유리 바늘을 빼냅니다. 더 히터의 조정 : 차 설정에 해당합니다. = 100 (1), 히터 조절 없음. 2 = 70. </li><li> 바늘의 미세 팁의 손상을 방지하려면 퍼티의 성형 스트립에 페트리 접시에 수평으로 모두 뽑아 바늘을 배치합니다. 참고 : 방법을 당기는 모세관 바늘에 대한 추가 정보는 말라리아 연구 및 참조 시약 리소스 센터 M에서 더 자세히 볼 수 있습니다R4 설명서 24. </li></ol> 4. 사출 역을 준비 <ol><li> 필요한 자료를 수집 : 유리 마이크로 캐 필러 바늘이 미세 팁, 마이크로 인젝터, 얇은 필터 종이와 두꺼운 종이 필터, 페트리 접시, 전송 피펫, 페인트 브러시 및 해부 광학 현미경으로 당겼다. </li><li> 마이크로 인젝터 설명서의 지침에 따라 마이크로 인젝터를 준비하고, 펄스 당 원하는 볼륨 (예를 들어, 펄스 당 69 NL의 최대)에 주입 볼륨을 설정합니다. </li><li> 현미경 다루기 쉬운 플랫폼 (예, 스티로폼 튜브 랙의 평탄한 측면) 위에 얇은 여과지 개의 필터 종이 시트를 적층하고, 가장자리 테이프로 고정. </li><li> 얼음의 각 dsRNA를 별도의 색 염료 튜브 용액 및 장소 10 μl를 재현 탁. </li></ol> 5. 주입을위한 번데기를 수집 <ol><li> 탈 물 10ml 및 수집 ~ 50 창백한 번데기 (두리 채우기 작은 60mm는 X 15mm 페트리 접시일회용 플라스틱 전송 피펫을 사용하여 insectary 트레이에서 번데기 후 첫 24 시간)를 ng를. </li><li> 어두운 표피 선탠 중간을 가지고있는 번데기를 제거합니다. 참고 : 표피가 황갈색 시작하면, 그것은 훨씬 더 높은 치사율의 표피, 사출 결과를 침투하는 것이 더 어려워진다. </li></ol> 6. dsRNA를 주입 <ol><li> 해부 현미경 하에서 미세 포셉 쌍 주사 바늘의 말단 팁을 끊는. </li><li> (3 인치, 30 게이지 바늘과 주사기를 사용) 미네랄 오일 바늘을 메우기 및 마이크로 인젝터와 과잉 오일을 추방함으로써 주사 바늘을 준비한다. </li><li> 전면 dsRNA를 최대 양의 주사 바늘을 작성하고 액체의 분배를 보장하기 위해 현미경으로 하나의 펄스를 꺼냅니다. 어떤 액체가 취해지지 및 / 또는 배출되는 경우에, 임의의 차단을 위해 바늘의 말단 팁을 확인 바늘 단단히 microinjecto 확보되도록아르 자형. </li><li> 1-3 번데기를 선택하고, 여과지에 배치합니다. </li><li> 붓을 사용하여, 지느러미 표피 접근과 필터 종이에 번데기를 놓고 필터 종이에 밀어 초과 물을 흡수하기 위해 붓을 사용합니다. </li><li> 붓의 끝 번데기를 안정화하고, 번데기의 등의 표면에 대하여 약 30 °의 각도로 흉부와 복부 사이의 지느러미 표피에 바늘을 삽입합니다. 사출가 번데기와 바늘의 후방 끝으로 이동해야는 전방 - 투 - 후방 방향으로 이동해야한다. </li><li> 체액에 3 μg의 / μL dsRNA를 솔루션의 두 펄스 (펄스 당 69 NL)를 주입하고, 몸 전체 색의 분포를 확인합니다. 어떤 색상이 확인되지 않은 경우, 장애물에서 팁을 취소 약간 주사 바늘의 위치를​​ 이동 및 액체 전달을 반복합니다. </li><li> 부드럽게 배양 물에 바늘에서 번데기를 이동 젖은 붓을 사용합니다. 티그는 가벼운 접촉시 붓에 충실해야 번데기. </li></ol> 7. 후 주입 조건 <ol><li> 적절한 공기 흐름 (예를 들어, 메쉬 케이지 또는 메쉬 뚜껑이있는 용기)와 모기 케이지에 주입 번데기와 페트리 접시를 놓습니다. 번데기 사육 조건은 27 ± 3 ° C의 온도에서 지속적으로 유지 75 ± 5 %의 습도와 일 빛 아래해야 : 8 시간 : 16 어두운주기. </li><li> 성인 공급을위한 메쉬 포도당 용액 (V / w)의 10 %를 준비하고, 모기 케이지에 솔루션 포화 목화 공을 놓습니다. </li></ol> 8 최저 평가 <ol><li> 원하는 시간 점 (들)에서, 컨트롤에 비해 실험 dsRNA를 주입 곤충의 표현형을 평가. <ol><li> -20 ℃에서 2-3 분 동안 성인을 놀 2 ° C에서 콜드 플레이트로 옮기고 15 배에 해부 현미경을 이용하여 임의의 의사 - 종양 형성을 확인함으로써 매일 dsSRPN2 및 dsLacZ 곤충 평가브라이트 조명 확대. 평가 후, insectary 조건 (27 ± 3 ° C, 75 ± 5 % 습도)에 성인을 반환합니다. 참고 :이 프로토콜에서 사용되는 실험 및 제어 dsRNA에 각각 dsSRPN2 및 dsLacZ 있습니다. 컨트롤에 적합한 많은 옵션이 있습니다; 그러나, 제안되는 표현형 및 / 또는 발현이 용이하고 /하거나 정량 [예를 들어, 정량적 실시간 PCR (QRT-PCR), 웨스턴 블롯]를 사용한다 (예를 들어, 현미경 해부) 가시화되는 양성 대조군 웨스턴 블롯 및 QRT-PCR을 통해이 기술. SRPN2 단백질 및 성적 증명서 정량을 배울 때, 각각 외. (2005) (21) 미셸에 설명되어 있습니다. </li></ol></li></ol>

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</ol>

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모기에 비 형질 전환의 RNAi를 유도하는 현재의 방법은 성인 hemocoel 12, 13 또는 RNAi의 트리거 코팅 된 나노 입자 14 ~ 17 또는 미세 조류 기반의 dsRNA를 18 분자의 애벌레 먹이로 dsRNA를 직접 주입을 포함한다. 성인 모기 타겟팅, 매우 가치있는 동안, 이전의 개발 기간 동안 작동 유전자의 큰 숫자를 제외 할 수 있습니다. 유충의 공급에 의해 초기화가 최저 번데기 통해 가변 단백질 지속성 전위에 부분적으로 인해 성인 단계에서 일치 표현형을 생성 할 수있다. 따라서,보다 완전 성인 단계에서 유전자 기능을 평가하기 위해 유전자 전 성인 발달 단계 중 기능뿐만 아니라 향상된 능력을 평가하는 수단을 제공한다 번데기 개발시 RNAi의 개시에서 특히 목적으로 추가 도입 방법. dsRNA를 주입 또는 발현 유전자 녹다운의 지속성에 기초하여 유전자 녹다운 방식과 마찬가지로예측 될 수 없다. 따라서, 성적 증명서 또는 단백질 수준은 관심의 개발 기간 동안 관심의 유전자를 평가해야한다. SRPN2 dsRNA를 주입 동물 SRPN2에 대한 5 일 후 분사에서 단백질 수준을 감소의 우리가 계속 관찰하지만, 단백질 회전율 및 반감기 등의 요소는 서로 다른 대상에 대해 다를 수 있습니다. 잘 농축 dsRNA를 사출에 사용되는 것이 아니라 보장하는 것이 중요하고, 아가 로스 겔에 그대로 나타난다. 우리는 최저 결과가 충분하지 않은 경우 실험자 이러한 요인을 재평가 추천 및 dsRNA를 각각의 농도는 특정 유전자의 대상에 대해 경험적으로 테스트 할 필요가있다. 우리의 번데기 단계에서 RNA 간섭을 개시하기위한 방법을 설명한다. gambiae 개발. 이 방법은 직접 초기 번데기의 hemocoel에 dsRNA를 미세 주입을 통해 도입에 의존하여 사출 품질의 평가를 할 수 있습니다염료 표지 된 dsRNA를 사용합니다. 주입 품질을 시각화 할 수있는 능력은 성공적인 최저 보장하는 중요한 향상을 구성하고 성인 단계에 초점을 이전에보고 된 대부분의 dsRNA를 기반​​ 프로토콜에서 고려되지 않은 사출 기반 유전자 녹다운의 양상을 구성한다. 이 개발 기간이 중요한 발달 구간에서 역할을 할 수 유전자의 발현에 번데기를 표적으로하거나, 성인의 초기 단계에서 기능적으로 평가 될 수있다. 또한,이 방법은 변형시 액세스 셀 dsRNA를 세포에 전달하고, RNA 간섭의 확립을 가능하게 할 수 있지만 완전히 형성 성인 모기 덜 접근. 하커 등의 최근 마이크로 어레이 분석. (2012) (560)를 확인했다. 업 규제 또는 배아에서 성인에 이르기까지 서로 다른 발달 단계에서 최소 4 배에서 하향 조정했다 gambiae 성적 증명서. (56)의0 성적 증명서는 식별 (309)의 세트는 번데기 개발 (27) 중에 조절 하였다. 이러한 연구 결과는 번데기 단계에서 발생하는 것과, 유기체가 변태를 겪는 동안 간격을 포함하여 모기의 개발을 통해 차동 유전자 발현에 대한 많은 요구 사항이 있다는 것을 시사한다. 등 많은 곤충 종에서. gambiae, 이러한 개발 (즉, 번데기 cuticular 및 키틴 결합 단백질) 등의 과정에 관여하는 유전자 27-31과 면역 반응 (즉, 수신자 수용체 같은 단백질) 27,32-34 매우 번데기 단계에서 표현된다. 완전히 형성 성인 등장하면, 환경 생리 35 변화에 따라 유전자 발현이 계속된다. 특히, 초기 성인 개발 과정, 발달 유전자 (즉, 성인 cuticular 및 근질 단백질) (36)의 발현 증가뿐만 아니라 다른 주요 유전자가 (즉, </em&gt;, 정자 특정 단백질과 사이토 크롬 P450 대사 효소) 27,36. 이 프로토콜 SRPN2의 개발에 사용하는 포지티브 제어 수단이다. gambiae 세린 프로테아제 억제제 (세르 핀). SRPN2 곤충 melanization 곤충 (21, 22)의 폭 넓은 선천성 면역 반응의 네가티브 조절에 중요한 역할을한다. 의사 - 종양 형성 (21, 22)를 쉽게 광학 현미경을 이용하여 관찰 표현형 성인 모기 결과 SRPN2의 최저. 이 별개의 표현형 쉽게 라이브 곤충 득점 할 수 있음을 감안할 때, 우리는 초기 번데기 단계의 RNAi 주사에 대한 SRPN2을 사용했다. 또한, SRPN2하여 초기 성인에서 번데기 RNAi의 주입 및 기능 평가를위한 좋은 목표를 제공, 모든 발달 단계 (37) 동안 표현된다. 우리는 우리가 개발 한 방법은 유도 유사한 성인 melanotic pseud 할 수 있음을 입증<html> 개발 번데기 기간 동안 수행 dsRNA를 주사의 결과로서 오 - 종양 형성. 이 프로토콜을 개발, 우리는 (즉, 애벌레 - 번데기의 탈피 후 첫 24 시간)이 최적의 성인 출현을 얻기위한 중요한 초기 번데기 개발하는 동안 그 주사를 관찰했다. 불량한 출현 후 분사 획득되는 경우, 우리는 이하 광범위한 표피 경화와 번데기를 구하여 초기 번데기 주입이 달성 보장하기 위해 더 정확하게 유충 스테이징 바랍니다. 또한, 주입시 최적의 출현 비율의 표피 결과에 손상이 증가 배율을 최소화하는 것은 동물의 의도 영역이 천공되어 있는지 확인 할 수 있습니다. 바늘 복부 표피 뚫할지, 염료 표지 된 액체의 풀링 번데기의 외관에 명백 할 것이다 또는 여과지를 포화한다. 매우 개 이상의 표피 구멍이있는 모든 번데기를 폐기하는 것이 좋습니다. 성인 모기 주사의 성능에 많은 실험실의 폭 넓은 경험과 함께 jove_content은 &quot;&gt; 이전에 확인 된 미세 주입 방식은 번데기의 RNAi 실험에 사용하기위한 간단한 프로토콜 수정하여 적용 할 수 있습니다. 전반적으로,이 방법의 목표는 연구자에게 능력을 제공하는 것입니다 유전 분석은 상기 신규 한 벡터 제어 전략의 개발을 지원하는 연구를 가능하게 수행 될 수 역방향 동안 기간을 확대. 흥미롭게도, 이러한 Rhodnius의 prolixus 및 스포 도프 테라 프 루기 페르 다른 종에서 실험, 침묵 효과를 크게하는 경향이 유전자를 밝혀 사전 성인 중 시작 할 때 더 큰 개발의 모든 단계 동안. 38, 39 스테이지, 넉다운 RNAi를 매개 유전자는 신속성과 유전자 침묵의 지속성 및 대상 유전자에 의해 코딩되는 단백질의 안정성에 대한 고려 될 수 있습니다. 이상적인 RNAi의 대상 유전자 PROTEI를 인코딩 자들을 경향n 또는 RNA 짧은 반감기와 높은 이직률 11,40을 갖는다. 유전자의 RNAi 전략은 또한 사전 성인 단계 동안 신속성 및 RNAi의 지속성에 대한 고려 사항을 해결하기 위해 채용 될 수 있지만, 형질 전환 기법은 많은 결점 (모기 교배 곤충을 생성하기위한 예를 들면, 트랜스 제닉 라인의 생성에 필요한 시간, 실험 시간 프레임을 규제 dsRNA를 발현, 및 형질 전환 주식의 유지 보수)와 함께. 대조적으로, 우리의 프로토콜은 번데기 개발 과정 및 유래 및 변형 동안 액세스 할 수 있지만, 성인 덜 액세스 할 수있는 세포 유형에 유전자 최저를 시작하기위한 쉽고 빠른 방법을 제공한다. 염료 표지 된 dsRNA를 현탁액의 사용은 쉽게 주입 성공의 평가와 번데기에서 도입 된 물질이 분산이 가능합니다. 성인 주입 된 동물에 비해 번데기 주입 성인에서 종양 형성의 개시에 대한 우리의 데이타는 초기화와 일치의 iation 번데기 단계에서 최저의 RNAi는 매개. 우리의 G3 모기 라인을 사용하고 insectary 조건에서, 우리는 성인의 포스트 분사가 3~5일에게 포스트 출현을 주입 이르면 10 일 성인 melanotic 의사 종양 형성을 관찰합니다. 초기 번데기 단계의 주입을 수행함으로써, 우리는 초기 오일 주입 후 (즉, 3~4일가 등장 게시)으로 볼 수 melanotic 의사 종양 형성을 관찰합니다. 이러한 데이터는이 방법은 이전에 아래 - 연구 개발 기간 (즉, 번데기 개발) 동안 유전자 최저의 개시를 할 수 있음을 의미한다. 우리의 염료 라벨링 방법은 때문에 모든 애벌레 령충 동안 표피의 반투명 특성으로 새로운 애벌레 주입 프로토콜의 개발에 유용 할 수 있습니다. 본 연구에 사용 된 컨트롤이 최저 표현형을 표시하는 성인 단계로 진행을해야하지만, 미래의 실험을 제공합니다 초기 번데기의 주입 다음 번데기 특정 표현형을 평가하기늦은 번데기 개발 등의 추가 개발 기간에이 방법의 확장에 대한 귀중한 통찰력. 요약하면,이 방법은 RNAi를 매개 유전자 최저의 번데기 개시를위한 가치있는 RNAi의 프로토콜을 제공하고 벡터 곤충 연구 커뮤니티 내에서 사용할 수있는 기능 유전체학 도구를 확장합니다.

말라리아는 매년 개인의 수백만에 영향을 미치는 모기 매개 전염병이다. 세계 보건기구 (WHO)는 2013 년 오년 1 세 미만의 소아에서 발생한 78 퍼센트의 어느 인해 말라리아 약 584,000 죽음이 있었다는 것을보고합니다. 인간의 말라리아의 원인 병원체는 속 변형체 내에서 정단 복합체 충류 기생충과 여성 아노 펠 레스 모기에 의해 자신의 인간의 호스트 사이에 전송된다. 모기가 후속 혈액 식사에 감염되지 않은 개인에 다음 예금 감염 기생충에 감염된 개인으로부터 혈액 식사를한다, 때 변속기가 발생합니다. 속 아노 펠 레스 내 아노 펠 레스 gambiae는 최대의 vectorial 용량 종이며, 사하라 사막 이남의 아프리카 1-3에서 가장 눈에 띄는 말라리아 벡터이다. 현재, 살충제의 배치에 의해 모기 벡터 제어는 b에 계속인간 말라리아의 부담을 경감하기 위해 사용될 주요 방법으로 전자. 1960 년대 이후 살충제의 사용은 매우 성공적인 것으로 입증되었지만, 살충제 저항 상승은 신규 살충제 및 다른 벡터 제어 전략 4-7의 개발에 대한 필요성을 주도하고있다. 2010 년, WHO에보고 49 (63) 국가의 총 말라리아 벡터 1 살충제 저항성의 발생을 지적했다. 또한, Afrotropical 지역에서 저항 데이터를 평가하는 피어 리뷰 문학을 활용 IR 매퍼 도구는 2001 년과 2012 년 사이에 각각 7 피레스 로이드와 dichlorodiphenyltrichloroethane (DDT)에 대한 내성 46 %와 27 % 증가, 거기보고합니다. RNA 간섭 (RNAi의)는 페튜니아 식물 8,9 및 곰팡이 뉴로 crassa의 9,10- 유전자를 불 활성화하기 위해 사용될 수있는 기술로서 1990에서 확인되었다. 잠시 후,1998 년 RNAi를 먼저 주입 또는 공급 방법 9,11 통해 안티센스 또는 이중 가닥 RNA (dsRNA에)의 도입에 의해 동물 모델에서 유전자 발현을 감소시키는 수단으로서, 예쁜 꼬마 선충에 설명 하였다. 그 발견 이후, RNAi의 연구자들은 빠른 속도로 매우 선택적 전사 후 유전자 침묵 메커니즘을 통해 관심의 유전자의 기능적 역할을 조사하기 위해 역 유전학을 이용 할 수 있도록하여 기능 유전체학의 추구를 혁명을 일으켰다. 노랑 초파리와 같은 일부 생물에서, 간섭 RNA 구조를 표현하는 유전자 변형 생물체의 사용은 유전자 녹다운 (KD) 널리 성공했다. 에서 유전자의 사용 있지만. RNAi에 대한 gambiae이 이용되고있다 대규모 스크린을위한 유용 할 수있다, 유전자 변형 모기 균주의 발생은 노동 및 시간 집약적, 일반적으로 generati 관심의 유전자의 식별에서 이동 2-3 개월 복용 둘 다적절한 형질 전환 재고 (12)에. 현재 유전자 KD의 기본 방법. gambiae는 dsRNA에의, 성인 단계에서, 체액에 주입하여 특정 유전자 12, 13에 대한 구체적인이다. 이 과정은 일반적으로 훨씬 더 빠른 형질 전환 방법 (12)보다 증명, 유전자 KD의 평가에 관심있는 유전자의 식별에서 이동 약 1 개월 소요됩니다. 애벌레 단계의 RNAi하는 방법은 최근에 설립되었다. 14-17 먹이 나노 입자를 통해 또는 구두 전달로 gambiae Aedes aegypti 및 미세 조류 기반의 dsRNA를 개발의 초기 단계에서 기능 유전체학 분석을 수행 할 수있는 기회를 제공하고, 18 분자. 직접 분사, 공급, 및 나노 입자 전달 방법에서, dsRNA를은 &quot;짧은 RNA를 간섭&quot;21 ~ 25 염기 길이 (siRNA를) (19, 20)에 효소 Dicer에 의해 표적 세포에 의해 자율적으로 흡수하고 분해된다. 이러한 siRNA를 다음 있습니다 incorpor로 ated RNA 유도 복합체 (RISC)를 침묵, 한 가닥은 RNA 바인딩 RISC 복합체에 결합 대상의 mRNA를 절단하여 그 수준을 감소시키고 그것의 번역 (19, 20)를 억제 할 수 있도록, 폐기 될로부터. 기본 모기 생물학의 많은 본질적인 기능은 호스트 환경 설정 (예를 들어, 후각, 맛보기), 짝짓기, 재생 및 면역 포함의 vectorial 용량을 조절한다. 이러한 생물학적 과정의 중요성을 감안할 때, 유전 또는 약리학 적 수준에서 자신의 변조 살충제 저항의 우회를 포함하는 벡터 제어를위한 새로운 기회를 제공하고, 벡터 관리에보다 광범위하게 통합 된 접근 방식에 대한 새로운 도구를 제공 할 가능성이 높습니다. 이러한 고유의 생물학적 기능을 기본 유전자의 역할을 평가하는 기능 유전체학의 사용은 새로운 목표의 식별을 가능하게하고 우리가 효과적으로 새로운,보다 효과적인 제어 전략에서을 만드는 방법에 대한 새로운 통찰력을 제공 할 것입니다이거 야. 우리의 번데기 단계에서의 RNAi를 개시하기위한 신속한 주입 방법의 개발과 사용에 대해 설명합니다. gambiae. 우리는 RNAi의 트리거의 번데기 주입 빨리 넉다운 유전자가 포스트 출현 성인에서 시작 된 경우 관찰되는 것보다 출현 이후, 즉, 초기 단계의 성인에서 생성 된 표현형의 관찰을 가능하게 관찰. 이 방법은 유전자 번데기 발달 구간에서 시작하여 성숙한 단계 등 번데기 개발 중에 개시 유전자 녹다운이 지속하고 영향을 줄 수 있다는 초기 성인 체액 액세스 유형의 세포,뿐만 아니라 세포 유형으로 연장 넉다운 수 있다는 변태 중에 더 체액 - 접근 이러한 출현 다음 성인 부속에있는 감각 신경 세포와 성인에서보다.

<table><tbody><tr><td>MEGAscript RNAi 키트</td><td>Ambion</td><td>AM1626</td><td></td></tr><tr><td>Nanoject II 인젝터</td><td>Drummond</td><td>3-000-204</td><td></td></tr><tr><td>Nanoject II 풋 스위치</td><td>Drummond</td><td>3-000-026</td><td></td></tr><tr><td>붕규산 유리 모세관</td><td>Drummond</td><td>3-000-203-G/X</td><td></td></tr><tr><td>유리 마이크로피펫 풀러</td><td>Narishigne</td><td>PB-7</td><td></td></tr><tr><td>Fast Green FCF 염료</td><td>Sigma</td><td>F7258</td>은 <td>무독성 식품 염료로 대체할 수 있습니다.</td></tr><tr><td>플라스틱 이송 피펫</td><td>Thermo Scientific</td><td>1371150</td><td>&frac14; 팁에서 인치를 잘라 더 넓은 개구부를 만듭니다.</td></tr><tr><td>왓맨 " 얇은" 여과지&nbsp;</td><td>GE 헬스케어</td><td>1001-090</td><td>직경 9cm의 1등급이지만 주사 패드의 크기에 따라 변경될 수 있습니다.</td></tr><tr><td>웨스턴 오점 " 두꺼운" 여과지</td><td>BioRad</td><td>107-3931</td><td>이것은 일반적으로 Western blots에 사용되는 여과지입니다.</td></tr><tr><td>페트리 접시 (60mm x 15mm)</td><td>Fisher Scientific</td><td>FB0875713A</td><td></td></tr><tr><td>페인트 브러시 (크기 0)</td><td>마이클 의 Art</td><td>10474940</td><td>브러시 크기와 브랜드는 재고 상황과 사용자 선호도에 따라 달라질 수 있습니다.</td></tr><tr><td>광학 현미경 해부</td><td>&nbsp;----&nbsp;</td><td>-----</td><td>이는 가용성 및 사용자 선호도에 따라 달라질 수 있습니다.</td></tr></tbody></table>

에 rnai의 트리거 배달<em&gt; 아노 펠 레스 gambiae</em&gt; 번데기

RNAi Trigger Delivery into Anopheles gambiae Pupae

진핵생물에서 자연적으로 발생하는 현상인 RNA interference(RNAi)는 실험실에서 기능적 유전체 연구를 위해 활용할 수 있는 매우 유용한 도구입니다. 이 역 유전 기술을 통해 개별 유전자를 선택적으로 녹다운할 수 있는 능력을 통해 많은 연구자들은 기능 상실 표현형을 평가하여 많은 유기체 내에서 수많은 유전자의 생물학적 역할을 신속하게 밝힐 수 있었습니다. 주요 인간 말라리아 매개체인 Anopheles gambiae에서 표적 유전자의 기능을 감소시키는 데 사용되는 주된 방법은 성체 모기의 혈구에 이중 가닥(dsRNA)을 주입하는 것입니다. 이 방법은 성공적이었지만, 성체의 유전자 녹다운은 성체 모기의 제한된 수의 세포에서 발현되는 유전자뿐만 아니라 성체 이전 단계에서 발현되고 잠재적으로 역할을 할 수 있는 유전자의 기능적 평가를 배제합니다. 번데기 초기 단계에서 Serine Protease Inhibitor 2 (SRPN2) dsRNA를 주입하는 방법을 설명하고 SRPN2 녹다운 성체 모기에서 표적 단백질 수준 감소 및 흑색성 가성 종양 형성을 관찰하여 SRPN2 단백질 knockdown을 검증합니다. 이 명백한 표현형은 이전에 SRPN2 기능의 성체 단계 녹다운에 대해 설명되었으며, 번데기 발달 중에 시작된 SRPN2 녹다운에 의해 이 성체 표현형을 다시 요약했습니다. 염료 표지된 dsRNA 용액과 함께 사용할 경우, 이 기법을 사용하면 간단한 광학 현미경으로 주입 품질 및 혈구 내 dsRNA 분포를 쉽게 시각화할 수 있습니다.

유전자 KD 수익률 주입 초기 번데기 단계에서 수행되는 최적의 결과, 표피 선탠 수준이 낮은 경우 (그림 1A가, 왼쪽 및 1B)에 대한 번데기 주입. 일반적으로 24 시간 주입 다음 증가 번데기 죽음의 결과 (그림 1A, 중앙 및 오른쪽) 후, 선탠과 표피의 경화를 증가. 번데기 개발 속도는 insectary 조건과 동물의 밀도 (24, 25)에 따라 달라질 수 있습니다; 따라서, 그것은 시각적으로 색소 침착을 평가하는 것이 가장 좋습니다. 주입 과정 모세관 바늘은 후방 방향 (도 2A)에 앞쪽에서 대략 30 °의 각도로 지느러미 표피에 삽입된다. 니들이 삽입 된 dsRNA + 0.01 %되면 (V / W) FGD가 분배되는 색소의 분포 (체액 걸쳐 Figu 분명) 2B 다시. 번데기에 대한 성인 출현의 평가 FGD 비 주사 컨트롤 (그림 3A)의 96.7 %의 출현에 비해 70 % 출현의 평균 속도를 보여 (V / w) 0.01 % 주입. 참고로, 번데기 경우와 부분 출현 비 생존 모기 (도 3b)의 다수 관찰되었다. 주입 동물 출현 시간에 더 지연 (그림 4A) 또는 중 성별 (그림 4B)에 바이어스 영향을 전시하지 않습니다. 성인 생존의 추가 평가는 10 포스트 출현은 이후 출현 성인 생존 (그림 4C)에는 분명 영향을 알 수없는 일까지 실시했다. KD 품질 및 유효성은 최저 대한 양성 대조군으로 21,22 넉다운 SRPN2와 연관된 melanotic 의사 종양 (어둡게 착색 조직 클러스터) 표현형에 의하여 평가 하였다<html> 음성 대조군으로 dsLacZ 주입과 관련된 표현형의 부재. 등장 성인 모기는 8 일 후 분사 (하루 6 ~ 7 후 출현)에서 득점했다. Melanotic 의사 종양 (도 5a 및도 5b) dsSRPN2 대 93.5 %의 표피를 통해 관찰 dsLacZ 성인 모기 (도 6A)의 0 %. 음울 흑화 조직의 클러스터는 색소 패치 (그림 5C)의 해부에 확인되었다. 의사 종양이 빠르면 3 일 후 출현으로 성인 표피에 볼 수 있었고, 또한 dsSRPN2의 체액과 장 조직의 하위 집합에 존재 (데이터가 표시되지 않음). 5 포스트 분사 (초기 성인 단계)에서 크게 dsSRPN2에 SRPN2 수준을 감소하지만, dsLacZ 또는 비 주입 체액 단백질 분리하지 (그림 6B)를 관찰 하였다. ftp_upload / 53738 / 53738fig1.jpg &quot;/&gt; 그림 1 : 번데기 dsRNA를 주입하기위한 발달 준비 성인 무대에 최적의 생존과 진행에 dsRNA를 결과의 조기 번데기 주입.. 표피 색소의 낮은 수준 (A, 왼쪽 및 B)는 제 0-24 시간 내에 다음 번데기 관찰 할 수있다. 가난한 생존에 적당한에서 번데기 표피 앞의 분사 (A, 센터 및 오른쪽) 결과 태닝. <img alt="그림 2" src="/files/ftp_upload/53738/53738fig2.jpg" /> 그림 2 :. 전방에서 약 30 °의 각도로 주입 위치와 지느러미 표피에 색소 표지 dsRNA를의 염료 표지 된 dsRNA를 (A) 모세관 바늘 주입 분포, 방향을 후부합니다. (B) 염료가 눈에 띄게 번데기 체액에 분포한다. 0.01 % F (138)로 표지 된 dsRNA (NL)의 주입량,GD (W / V). <img alt="그림 3" src="/files/ftp_upload/53738/53738fig3.jpg" /> 도 3. 사후 주입 성인 등장 (A) 번데기의 70 %는 비 분사 제어 (N = 60)의 96.7 %에 비해, (N = 60) (V는 / W)를 성공적으로 등장 0.01 %의 FGD 주입. 세 가지 생물학적 복제가 수행되었다. 번데기 경우와 (B) 부분 출현은 비 생존 모기 다수 관찰되었다. 오차 막대는 평균 (SEM)의 표준 오차를 나타낸다. <img alt="그림 4" src="/files/ftp_upload/53738/53738fig4.jpg" /> 그림 4 : 출현 비율, 성 평가 및 성인 생존 (A) 비 주입 번데기에 비해 필적 출현 시간은, 0.01 %의 FGD (24 시간 = 80 %와 48 시간 = 20 %)와 번데기 주입 다음 관찰되었다 (24. 시간 = 83 %와 4​​8 시간 = 17 %). (B </str옹&gt;) 약 동일한 남성과 여성의 성인 출현은 0.01 %의 FGD 주입 번데기 (여성 = 48 %와 남성 = 52 %)과 비 주입 번데기 (여성 = 52 %와 남성 = 48 %) 관찰되었다. (C) 생존 분석은 0.01 % FGD와 주사 10 일 후 출현까지 ​​평가, 성인 생존에 영향을주지 않음을 알 수있다. 결과는 3 개의 독립적 인 주입 0.01 %의 FGD 실험 (N = 60) 및 비 주사 (N = 60) 번데기 (남성과 여성의 동등한 숫자) 데이터를 나타냅니다. 오차 막대는 평균 (SEM)의 표준 오차를 나타낸다. <img alt="그림 5" src="/files/ftp_upload/53738/53738fig5.jpg" /> 그림 5 : 의사 종양 양성 대조군 표현형이 성공적으로 최저를 반영하는 의사 종양 (A) 복부 및 주사 하였을 dsSRPN2의 (B) 흉부 표피에서 관찰하지만, 하루 8 포스트 분사에 주사 하였을 성인 모기를 dsLacZ되지 않았다..(C) 높은 배율 (400X) 및 표피 색소 패치 해부 이미지 (a)는 (b) 어둡고 흑화 셀 클러스터를 보여준다. <img alt="그림 6" src="/files/ftp_upload/53738/53738fig6.jpg" /> 도 6 : 의사 - 종양 형성의 정량은 SRPN2 단백질 수치 감소 (A) 번데기 주사 0 dsLacZ 컨트롤 % (N = 19)와 비교하여 (N = 21) dsSRPN2 성인의 93.5 %에서 의사 - 종양 형성을 초래한다. . 결과는 8 일 후 분사를 획득했습니다. (B) 웨스턴 블롯 (왼쪽)에 도시 한 dsSRPN2에 SRPN2 수준을 감소하지만 dsLacZ 또는 비 - 주입 된 체액 단백질 분리 물 (5 일 후 분사). 결과 3 개의 독립적 인 실험을 기반으로. 1,000 : 1 : 2,000, 각각 사용 방지 SRPN2 21 항 SRPN3 (26) 항체 희석은 1이었다. 염소 항 - RA5000 : BBIT의 IgG-HRP (제품 SC-2004, 산타 크루즈 생명 공학, 달라스 TX는) 1을 사용 하였다. 모든 단백질 수준이 짝 t 시험으로 비교하여 통계적으로 SRPN3에 밴드 강도 (ImageJ에 소프트웨어, NIH, 베데스다, MD), 정규화에 의해 (오른쪽) 정량화 하였다. P &lt;0.05 : *, P ≥0.05 : NS (중요하지 않음). 오차 막대는 평균 (SEM)의 표준 오차를 나타낸다.

RNA interference (RNAi)는 유전자 기능을 밝히는 데 매우 유용한 도구입니다. 그러나 성체 이전 단계에서 RNAi를 사용하여 유전자를 표적으로 하는 능력은 주요 인간 말라리아 매개체인 Anopheles gambiae에서 제한됩니다. 번데기 발달 중 직접 주입을 통해 유전자 기능을 감소시키는 RNAi 프로토콜에 대해 설명합니다.

에 RNAi의 트리거 배달<em&gt; 아노 펠 레스 gambiae</em&gt; 번데기

RNA interference (RNAi), a naturally occurring phenomenon in eukaryotic organisms, is an extremely valuable tool that can be utilized in the laboratory ...

이 방법의 전반적인 목표는 Anopheles gambiae에 RNA 간섭 트리거를 전달하여 번데기 발달 단계부터 시작되는 유전자 넉다운을 유도하는 것입니다. 이 방법은 매개체 생물학 분야의 핵심 질문에 답하고, 성충 이전 또는 성충 초기 발달 단계에서 역할을 하는 유전자를 발견하는 데 도움이 될 수 있습니다. 이 기술의 주요 장점은 과거에 RNA 간섭 주입 프로토콜이 시행되지 않았던 발달 간격인 번데기 단계에서 유전자 넉다운을 시작함으로써, 연구자가 신속한 기능 유전체 연구를 수행할 수 있는 기회를 제공한다는 점입니다.주입 단계에서 요구되는 정밀도와 해당 발달 단계에서 번데기의 섬세한 특성 때문에 숙달이 어려울 수 있으므로, 이 방법의 시각적 시연이 매우 중요합니다. 관심 유전자를 선택한 후, 오프타겟 효과(off target effects)가 없을 것으로 예측되는 200~800 base pair 영역을 식별하고 표준 PCR 증폭을 수행하여 T7 프로모터 서열이 양 끝에 위치한 이중 가닥 RNA 합성 템플릿을 얻습니다. 그런 다음 이중 가닥 RNA를 합성하고 상용 in vitro 키트를 사용하여 생성물을 정제합니다.최종 RNA 농도를 µL당 3 µg으로 조정합니다. 다음으로, 표준 2% agarose gel을 사용하여 0.5 µL의 이중 가닥 RNA를 템플릿 DNA 및 표준 마커와 비교합니다. 전기영동이 완료되면, 이중 가닥 RNA 밴드의 품질과 길이를 확인합니다.가시적인 비특이적 생성물이 없어야 합니다. 이중 가닥 RNA는 템플릿 DNA보다 더 느리게 이동합니다. 보관을 위해 이중 가닥 RNA를 소분하여 -20 °C에서 보관하십시오.Fast Green FCF 염료 준비부터 시작합니다. 먼저, RNase-Free water를 사용하여 염료를 0.1% v/v 농도로 희석합니다. 그 다음, 준비된 용액 1 µL를 1.5 mL 마이크로원심분리기 튜브에 옮깁니다.물을 증발시키기 위해 시료가 담긴 튜브를 65 °C에서 약 3시간 동안 가열하십시오. 그 다음, 고체 염료를 사용하기 전에 튜브를 최소 30분 동안 냉각하십시오. 이어서, 붕규산 유리 튜브를 이용하여 인출 유리 주입 바늘을 제작하십시오.니들 풀러(needle puller)를 팁 직경 10~30 µm로 설정하십시오. NARISHIGE 모세관 풀러의 경우, 첫 번째 히터를 100으로, 두 번째 히터를 70으로 설정하십시오. 그 다음 모세관 니들을 고정하고 풀링(pulling)을 진행하십시오.이제 주입 스테이션을 준비합니다. 현미경 아래에서 쉽게 조작할 수 있는 플랫폼을 선택하십시오. 플랫폼 위에 먼저 두꺼운 여과지를 테이프로 고정합니다.그 다음, 두꺼운 여과지 위에 얇은 여과지 한 장을 테이프로 고정합니다. 이어서 염료 고체 튜브에 주입할 각 이중 가닥 RNA 10 µL를 첨가하고 염료를 재현탁합니다. 이 튜브들을 얼음에 보관하십시오.이제 주입할 번데기를 수집합니다. 60mm 페트리 접시에 3ml의 탈이온수를 채우고, 플라스틱 전이 피펫을 사용하여 색이 옅은 번데기 약 50마리를 접시로 옮깁니다. 이미 중간에서 진한 정도의 경화 단계에 도달한 번데기는 큐티클 손상이 발생하여 생존율이 낮으므로, 색소 침착이 적은 번데기만을 사용하십시오.미세주입의 첫 번째 단계는 바늘의 끝을 여는 것입니다. 현미경 하에서 미세 핀셋을 사용하여 바늘의 최말단 팁을 제거합니다. 그런 다음 30 gauge 바늘과 주사기를 사용하여 바늘 내부에 미네랄 오일을 채웁니다.채운 후, 마이크로인젝터를 사용하여 과잉 오일을 배출하십시오. 마이크로인젝터가 69 nanoliter 부피를 흡입하도록 설정하십시오. 그런 다음, 준비된 주입용 RNA로 니들의 앞부분을 채우십시오.이중 가닥 RNA의 분주 상태에 문제가 없는지 테스트하십시오. 팁의 막힘과 바늘의 불완전한 고정이 주요 문제 원인입니다. 인젝터 준비가 완료되면, 번데기 1~3마리를 선택하여 거름종이 스테이지로 옮기십시오.붓을 사용하여 배측 큐티클에 접근할 수 있도록 번데기의 방향을 잡습니다. 종이를 눌러 번데기에 묻은 과잉 수분을 흡수시킵니다. 젖은 붓으로 번데기를 고정한 상태에서, 앞쪽에서 뒤쪽 방향으로 움직여 복부와 흉부 사이의 배측 큐티클에 약 30도 각도로 바늘을 삽입합니다.그 다음, 이중 가닥 RNA를 혈림프에 1~2회 펄스로 주입합니다. 주입이 성공했다면 염료가 전신으로 퍼지는 것이 보여야 합니다. 번데기에 주입할 때는 바늘이 등쪽 큐티클만 관통하도록 하는 것이 매우 중요합니다.바늘 천자가 복부 큐티클을 관통한 경우, 염색된 액체가 번데기 외부에 고이거나 여과지에 염료가 묻어 나오는 것이 확인됩니다. 이러한 경우에는 해당 번데기를 폐기해야 합니다. 염료가 혈림프 전체로 확산되지 않는다면, 바늘 팁이 막혔을 가능성이 높습니다.팁을 약간 움직여 RNA와 염료가 방출되었는지 확인합니다. 염료 방출의 징후가 없다면, 해당 번데기는 폐기하십시오. 그다음 바늘 끝의 상태를 평가하고 새로운 번데기에 다시 주입을 수행합니다.번데기에 성공적으로 주입한 후, 젖은 붓을 사용하여 바늘에서 조심스럽게 분리하고, 발달을 완료할 수 있도록 물이 담긴 접시에 옮깁니다. 주입된 번데기가 담긴 접시를 정상적인 사육 조건의 모기 케이지 또는 용기에 넣습니다. 성충의 먹이원으로는 10% w/v 농도의 glucose 용액을 적신 솜구를 제공합니다.성충이 우화한 후, 대조군과 비교하십시오. 예를 들어, 이중 가닥 SRPN2 곤충의 경우 가성종양(pseudotumor) 형성 여부를 매일 평가해야 합니다. 이를 위해 성충을 -20 °C에서 2~3분 동안 냉각시킨 후, 관찰을 위해 2 °C 콜드 플레이트로 옮기십시오.성충 관찰 후, 이들을 곤충 사육 구역으로 돌려보내십시오. 해당 기술을 숙달했을 때, 주입된 번데기의 우화율은 약 70%였습니다. 주입된 번데기의 일부에서는 번데기 허물에서 부분적으로만 우화하여 생존 불가능한 모기가 되는 현상이 발생했습니다. 주입된 모기와 주입되지 않은 모기 간의 우화 속도 차이는 없었으며, 주입의 영향은 성별에 따라 다르지 않았습니다.우화 10일 후, 주입된 모기의 생존율은 주입하지 않은 대조군과 비교하여 눈에 띄는 변화가 없었습니다. 세린 프로테아제 억제제인 SRPN2는 양성 대조군으로 사용되었으며, 이중 가닥 LacZ는 이중 가닥 RNA 주입의 음성 대조군으로 사용되었습니다. 우화 후 3일째에, 이중 가닥 SRPN2가 주입된 성체에서 광학 현미경을 통해 가성종양이 확인되었습니다.8일 후, 가성종양(pseudotumors)이 매우 뚜렷하게 나타났습니다. 성체 단계의 모기에서, double-stranded SRPN2를 주입한 대부분의 개체는 큐티클을 통해 멜라닌화된 가성종양을 관찰할 수 있었던 반면, 대조군에서는 가성종양이 관찰되지 않았습니다. 주입 5일 후, double-stranded SRPN2를 주입한 모기의 SRPN2 단백질 수치는 double-stranded LacZ를 주입한 대조군 및 비주입 대조군과 비교하여 유의미하게 낮았습니다.이 영상을 시청하고 나면, 새롭게 개발된 주입 프로토콜을 사용하여 Anopheles gambiae 번데기에 RNA 간섭 트리거를 전달하는 방법을 충분히 이해하게 될 것입니다. 일반적으로 이 방법에 익숙하지 않은 사용자는 번데기의 예측 불가능한 움직임으로 인해 어려움을 겪습니다. 하지만 번데기의 정확한 위치 선정과 고정 방법을 연습하면 주입 성공률과 주입 품질을 크게 높일 수 있습니다.기술을 숙달하고 나면, 번데기당 주입에 약 30초가 소요됩니다. 이 기술의 개발을 통해 벡터 생물학 분야의 연구자들이 말라리아 매개체인 Anopheles gambiae의 성충 전 단계 및 초기 성충 발달 단계에서 유전자 기능을 탐구하고 평가할 수 있는 길을 열었습니다. 본 절차 이후, Western blot 분석이나 정량적 PCR과 같은 다른 방법을 수행하여 단백질 또는 전사체 발현 수준에서 표적 유전자의 녹다운 정도를 각각 결정할 수 있습니다.궁극적으로, 이 기술은 모기에 의한 기생충 전달에 결정적인 역할을 하는 유전자를 식별하는 데 도움이 될 수 있으며, 이러한 접근 방식은 새로운 표적을 찾아내고 더욱 효과적인 매개체 제어 전략을 수립하는 방법에 대한 새로운 통찰력을 제공할 것입니다.

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연구

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생물학

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에 RNAi의 트리거 배달

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