Name: 실시간 고해상도 질량 분석에 직접 분석을 사용하여 식물 소재의 신속한 높은 처리량 종 확인 (동영상) | JoVE Journal
Uploaded: 2016-10-02T13:00:00.000+00:00
Duration: 11 min 14 s
Description: 학습하세요 실시간 고해상도 질량 분석법을 활용한 식물 종의 신속한 식별 방법을. 최소한의 시료 전처리로 크라톰과 담배나무 종을 분석하고 생리활성 화합물을 탐색하는 이 기법은 식물 화학 연구에 효율적인 도구를 제공합니다.

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저자는 감사 연구 및 법의학 및 사이버 보안 부여, 국립 과학 재단 (National Science Foundation) 부여 (부여 번호 1310350)과 국립 연구소 법무부 부여 (부여 # 2015-DN-BX-에 장학금 알바니 - SUNY 대통령 이니셔티브 기금에서 대학을 인정 K057은) RAM합니다. 우리는 또한 식물 재료의 사진 촬영을 위해 저스틴 E. Giffen을 인정합니다.

식물 재료 1. 준비 <ol><li> Kratom 신선한 잎 소재 <ol><li> M.에서 Kratom 잎 재료의 균일 한 chads을 만들기 위해 6mm 직경의 구멍 펀치를 사용하여 speciosa의 공장. 5 번 반복합니다. </li></ol></li><li> Kratom 분말 추출 <ol><li> 추출 용매 혼합물 1 : 1을 작성할 에탄올 5 ㎖ 및 증류수 5 mL를 섞는다. </li><li> 1의 EtOH : H 2 O 용매 혼합물 1.5 ml의 마이크로 원심 튜브에, 소량의 1 1 ㎖에 Kratom 발리 분말 (~ 5 mg)을 일시. 5 번 반복합니다. </li><li> 주위 온도에서 30 분 동안 초음파 용기에 Kratom 발리 분말 추출물 샘플을 초음파 처리. </li><li> 상온에서 750 XG에서 2 분 동안 Kratom 발리 분말 추출물 샘플을 원심 분리기. </li><li> 후속 분석을 위해 분말 잔류 용매를 경사 분리한다. </li></ol></li><li> 흰 독말풀 씨앗 준비 <ol><li> D. 슬라이스 STRAM면도날을 사용하여 횡단면에 걸쳐 반 오늄 시드. 5 가지 씨앗을 사용하여 반복합니다. </li><li> D. 반복 inoxia 및 D. ferox 씨앗. </li></ol></li></ol> 실시간 이온 소스 매개 변수 2. 직접 분석 <ol><li> 가스 히터 온도 <ol><li> 350 ℃로 이온 소스의 가스 히터 온도를 설정한다. </li></ol></li><li> 이온 모드 <ol><li> 250 V. 그리드 전압 양 이온 모드에서 분석을 수행 </li></ol></li><li> 헬륨 가스 유량 <ol><li> 2.0 L / 초 헬륨 가스 유량을 설정한다. </li></ol></li></ol> 3. 비행 시간 형 질량 분석기 매개 변수 <ol><li> 오리피스 전압 <ol><li> 20 V에 오리피스 (1) 전압 5 V.에 구멍이 전압을 설정 </li></ol></li><li> 링 렌즈 및 피크 전압 <ol><li> 5 링 렌즈 전압을 조정V 600 V로 피크 전압을 변경할 </li></ol></li><li> 질량 스펙트럼 획득 <ol><li> m / Z 60-800의 질량 범위에서 초당 1 스펙트럼 질량 스펙트럼 수집 속도를 설정합니다. </li></ol></li><li> 질량 분광계 해결 전원 <ol><li> FWHM 6000 질량 분석기의 분해능을 설정합니다. </li></ol></li></ol> 식물 재료 4. 분석 <ol><li> Kratom 잎의 분석 <ol><li> 질량 분석기 제어 소프트웨어 누르고 &quot;시작 실행&quot;. 스펙트럼이 얻어 질 때까지 핀셋 이온 소스 및 질량 분광계 입구 (입구로부터 약 2cm) 사이 식물 재료의 차드 일시. 식물 재료의 별도의 chads과 5 번 반복합니다. </li><li> 폴리에틸렌 글리콜 600 (PEG)와 스펙트럼을 보정합니다. <ol><li> 페그 표준으로 융점이 모세관 튜브의 폐쇄 단부를 딥. betw 코팅 된 모세 혈관을 일시 중단EEN 이온 소스와 질량 분석기 입구. </li></ol></li><li> PEG의 표준을 분석 한 후, 분석 실행을 종료합니다 &quot;정지&quot;버튼을 선택합니다. </li><li> 질량 분석기 제어 소프트웨어 누르고 &quot;시작 실행&quot;. 스펙트럼이 얻어 질 때까지 핀셋 이온 소스 및 질량 분광계 입구 사이 건조 잎 물질 소량을 정지. 새로운 식물 재료마다 분석, 5 번 반복합니다. </li><li> PEG와 스펙트럼을 보정합니다. <ol><li> 페그 표준으로 모세 혈관의 폐쇄 끝을 찍어. 이온 소스 및 질량 분광계 입구 사이의 코팅 모세관 일시. </li></ol></li><li> PEG의 표준을 분석 한 후, 분석 실행을 종료합니다 &quot;정지&quot;버튼을 선택합니다. </li></ol></li><li> Kratom 분말의 분석 <ol><li> 질량 분석기 제어 소프트웨어 누르고 &quot;시작 실행&quot;. Kratom 분말로 녹는 점 모세관의 폐쇄 단부를 딥. </li><li> SuspenD 스펙트럼까지 이온 소스 및 질량 분광계 입구 모세관 사이의 코팅이 얻어진다. 새로운 모세관으로 분석 할 때마다 5 번 반복합니다. </li><li> PEG와 스펙트럼을 보정합니다. <ol><li> 페그 표준으로 모세 혈관의 폐쇄 끝을 찍어. 이온 소스 및 질량 분광계 입구 사이의 코팅 모세관 일시. </li></ol></li><li> PEG의 표준을 분석 한 후, 분석 실행을 종료합니다 &quot;정지&quot;버튼을 선택합니다. </li></ol></li><li> Kratom 추출물의 분석 <ol><li> 추출물에 모세관 튜브의 폐쇄 단부를 담근다. </li><li> 질량 분석 장치에 장착 된 리니어 레일 12의 샘플 홀더에 모세관을 정지. 다른 추출물마다 5 회 반복합니다. </li><li> 질량 분석기 제어 소프트웨어 누르고 &quot;시작 실행&quot;. 제어판을 사용하여 1mm / 초의 속도로 이온 스트림을 통해 직선 레일을 진행하기 위해 &quot;&gt;&quot;버튼을 선택합니다스펙트럼을 수집합니다. </li><li> PEG와 스펙트럼을 보정합니다. <ol><li> 페그 표준으로 모세 혈관의 폐쇄 끝을 찍어. 이온 소스 및 질량 분광계 입구 사이의 코팅 모세관 일시. </li></ol></li><li> PEG의 표준을 분석 한 후, 분석 실행을 종료합니다 &quot;정지&quot;버튼을 선택합니다. </li></ol></li><li> 흰 독말풀 씨앗 분석 <ol><li> 질량 분석기 제어 소프트웨어 누르고 &quot;시작 실행&quot;. 스펙트럼이 수집 될 때까지 핀셋 이온 소스 및 질량 분광계 입구 사이 계시 시드 절반 일시. 절단 된면이 이온 소스에 직면 지향되어 있는지 확인합니다. 새로운 씨앗을 반마다 분석, 5 번 반복합니다. </li><li> PEG와 스펙트럼을 보정합니다. <ol><li> 페그 표준으로 모세 혈관의 폐쇄 끝을 찍어. 이온 소스 및 질량 분광계 입구 사이의 코팅 모세관 일시. </li></ol></li><li> 페그 기준을 분석 한 후,분석 실행을 종료합니다 &quot;정지&quot;버튼을 선택합니다. </li><li> 각 흰 독말풀 종 단계를 반복 4.4.1-4.4.3. </li></ol></li></ol> 5. 데이터 처리 <ol><li> 번역 데이터 파일 <ol><li> 데이터 처리 소프트웨어에서 파일을 선택, 보정 데이터 파일을 생성, 설정 &quot;자동 보정&quot;과 &quot;DART 파일을 번역&quot;. </li><li> 클릭 왼쪽과 크로마토 그램의 첫 번째 피크 주위에 상자를 드래그하고 평균 스펙트럼을 생성하는 &quot;평균&quot;을 선택합니다. </li><li> 마우스 오른쪽 버튼으로 클릭하고 어떤 샘플이 수집되지 않은 영역 주위에 상자를 드래그하여 평균 스펙트럼에서 배경을 뺄 &quot;배경으로 평균 전체 상자&quot;를 선택합니다. </li><li> .txt 파일로 질량 스펙트럼을 저장합니다. </li><li> 단계를 반복 5.1.1-5.1.4 각 파일에 복제에 대한 크로마토 그램의 각 피크는 평균 스펙트럼을 생성하는. </li><li> 수집 된 각 파일에 대해 단계를 반복 5.1.2-5.1.5. </li></올&gt; </li></ol> 6. 통계 분석 <ol><li> 주성분 분석 <ol><li> 스펙트럼 분석 소프트웨어의 분류 섹션에서 &quot;설정&quot;탭에서, (재료의 목록 참조) &quot;클래스 추가&quot;를 선택하여 데이터 처리를위한 클래스를 만들 수 있습니다. </li><li> &quot;파일 (들)을 추가&quot;를 선택하여 데이터의 텍스트 파일을 가져옵니다. </li><li> 텍스트 파일을 선택하여 식물의 적절한 클래스에 데이터 파일을 지정하고 &quot;선택한 파일에 대한 클래스를 설정합니다.&quot; </li><li> 1 % 트레이닝 세트에서 MS에서 차별과 설정 임계 값 % 선택 기능 대중. </li><li> 10 질량 허용 오차 (MMU)을 설정하고 &quot;데이터 파일에서 벡터를 구축&quot;. </li><li> 은 &quot;계산&quot;섹션에서 3D PCA 그래프의 체크 박스를 선택하여 주성분 분석을 수행하고 &quot;계산&quot;을 선택합니다. </li><li> 선택하여 휴가-한 아웃 교차 유효성 검사를 수행 &quot;유효성 검사가 (SLOW!).&quot; </li></ol></li><li><strong&gt; 열지도를 생성 <ol><li> 스펙트럼 분석 소프트웨어의 주파수 플롯 탭에서 선택하여 데이터의 히트 맵을 생성 &quot;열지도.&quot; </li><li> 1 %에 풍부한 임계 값을 설정하려면 &quot;임계 값 저장된 데이터&quot;를 선택합니다. </li><li> 선택하여 스프레드 시트에 열지도를 내 보냅니다 &quot;Excel로 저장 열지도.&quot; </li><li> 스프레드 시트 프로그램에서 .txt 파일로 내 보낸 열 맵을 저장합니다. </li></ol></li><li> 계층 적 클러스터링 분석 <ol><li> 클러스터 3.0 소프트웨어에 .txt 파일로 열 맵을 가져옵니다. </li><li> 유전자 및 배열에 따라 클러스터 3.0의 계층 탭에서 상자 &quot;클러스터&quot;및 &quot;계산 무게&quot;를 확인합니다. 0.1에서 차단을 설정하고 분석을 수행하기 위해 하나의 연결 클러스터링을 선택 1. 지수입니다. </li><li> 자바 트 리뷰에서 생성 된 .cdt 데이터 파일을 볼 수 있습니다. </li></ol></li></ol>

<ol><li>Authority, E.F.S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((EFSA+Compendium+of+botanicals+that+have+been+reported+to+contain+toxic%2C+addictive%2C+psychotropic+or+other+substances+of+concern+onrequest+of+EFSA%5BTitle%5D)+AND+%22EFSA+Journal%22%5BJournal%5D)">EFSA Compendium of botanicals that have been reported to contain toxic, addictive, psychotropic or other substances of concern onrequest of EFSA.</a> EFSA Journal. 7, 1-100 (2009).</li>
<li><a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=%22The+challenge+of+new+psychoactive+substances%3A+list+of+plant-based+substances+%2820+Substances%29%22">The challenge of new psychoactive substances: list of plant-based substances (20 Substances)</a>. , UNODC. 101-102 (2013).</li>
<li>Kratom (Mitragyna speciosa Korth). , US Drug Enforcement Administration. Available from: 
 <a target="_blank" href="http://www.deadiversion.usdoj.gov/drug_chem_info/kratom.pdf">http://www.deadiversion.usdoj.gov/drug_chem_info/kratom.pdf</a> (2013).</li>
<li>Jimson Weed (Datura stramonium). , US Drug Enforcement Administration. Available from: 
 <a target="_blank" href="http://www.deadiversion.usdoj.gov/drug_chem_info/jimson_w.pdf">http://www.deadiversion.usdoj.gov/drug_chem_info/jimson_w.pdf</a> (2013).</li>
<li>Jansen, K., Prast, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Ehtnopharmacology+of+Kratom+and+the+Mitragyna+alkaloids%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Ethnopharmacol%22%5BJournal%5D)">Ehtnopharmacology of Kratom and the Mitragyna alkaloids.</a> J. Ethnopharmacol. 23, 115-119 (1988).</li>
<li>Matsumoto, K. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aMatsumoto%2C+K+%22Pharmacological+Studies+on+7-Hydroxymitragynine%2C+Isolated+from+the+Thai+Herbal+Medicine+Mitragyna+speciosa%3A+Discovery+of+an+Orally+Active+Opioid+Analgesic%22">Pharmacological Studies on 7-Hydroxymitragynine, Isolated from the Thai Herbal Medicine Mitragyna speciosa: Discovery of an Orally Active Opioid Analgesic</a>. , Chiba University. (2006).</li>
<li>Matsumoto, K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Involvement+of+%C2%B5-opioid+receptors+in+antinociception+and+inhibition+of+gastrointestinal+transit+induced+by+7-hydroxymitragynine%2C+isolated+from+Thai+herbal+medicine+Mitragyna+speciosa%5BTitle%5D)+AND+%22Eur.+J.+Pharmacol%22%5BJournal%5D)">Involvement of µ-opioid receptors in antinociception and inhibition of gastrointestinal transit induced by 7-hydroxymitragynine, isolated from Thai herbal medicine Mitragyna speciosa.</a> Eur. J. Pharmacol. 549, (2006).</li>
<li>Matsumoto, K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Antinociceptive+effect+of+7-hydroxymitragynine+in+mice%3A+Discovery+of+an+orally+active+opioid+analgesic+from+the+Thai+medicinal+herb+Mitragyna+speciosa%5BTitle%5D)+AND+%22Life+Sciences%22%5BJournal%5D)">Antinociceptive effect of 7-hydroxymitragynine in mice: Discovery of an orally active opioid analgesic from the Thai medicinal herb Mitragyna speciosa.</a> Life Sciences. 74, 2143-2155 (2004).</li>
<li>El Bazaoui, A., Stambouli, H., Bellimam, M. A., Soulaymani, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Determination+of+tropane+alkaloids+in+seeds+of+Datura+stramonium+L.+by+GC%2FMS+and+LC%2FMS%5BTitle%5D)+AND+%22Ann.+Toxicol.+Anal%22%5BJournal%5D)">Determination of tropane alkaloids in seeds of Datura stramonium L. by GC/MS and LC/MS.</a> Ann. Toxicol. Anal. 21, 183-188 (2009).</li>
<li>Friedman, M., Levin, C. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Composition+of+Jimson+Weed+%28Datura+stramonium%29+seeds%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Agr.+Food+Chem%22%5BJournal%5D)">Composition of Jimson Weed (Datura stramonium) seeds.</a> J. Agr. Food Chem. 37, 998-1005 (1989).</li>
<li>Philipof, S., Berkhov, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((GC-MS+Investigation+of+tropane+alkaloids+in+Datura+stramonium%5BTitle%5D)+AND+%22Z+Naturforsch%22%5BJournal%5D)">GC-MS Investigation of tropane alkaloids in Datura stramonium.</a> Z Naturforsch. 57, 559-561 (2002).</li>
<li>Preissel, U., Preissel, H. -G. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aPreissel%2C+U+%22Brugmansia+and+Datura%3A+Angel%27s+Trumpets+and+Thorn+Apples%22">Brugmansia and Datura: Angel's Trumpets and Thorn Apples</a>. , Firefly Books. (2002).</li>
<li>Boumba, V. A., Mitselou, A., Vougiouklakis, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Fatal+poisoning+from+ingestion+of+Datura+stramonium+seeds%5BTitle%5D)+AND+%22Vet.+Hum.+Toxicol%22%5BJournal%5D)">Fatal poisoning from ingestion of Datura stramonium seeds.</a> Vet. Hum. Toxicol. 46, 81-82 (2004).</li>
<li>Kronstrand, R., Roman, M., Thelander, G., Eriksson, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Unintentional+Fatal+Intoxications+with+Mitragynine+and+O-Desmethyltramadol+from+the+Herbal+Blend+Krypton%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Anal.+Toxicol%22%5BJournal%5D)">Unintentional Fatal Intoxications with Mitragynine and O-Desmethyltramadol from the Herbal Blend Krypton.</a> J. Anal. Toxicol. 35, 242-247 (2011).</li>
<li>Neerman, M., Frost, R., Deking, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+drug+fatality+involving+Kratom%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Forensic+Sci%22%5BJournal%5D)">A drug fatality involving Kratom.</a> J. Forensic Sci. 58, 278-279 (2013).</li>
<li>Steenkamp, P. A., Harding, N. M., Van Heerden, F. R., Van Wyk, B. -E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Fatal+Datura+poisoning%3A+Identification+of+atropine+and+scopolamine+by+high+performance+liquid+chromatography+%2F+photodiode+array+%2F+mass+spectrometry%5BTitle%5D)+AND+%22Forensic+Sci.+Int%22%5BJournal%5D)">Fatal Datura poisoning: Identification of atropine and scopolamine by high performance liquid chromatography / photodiode array / mass spectrometry.</a> Forensic Sci. Int. 145, 31-39 (2004).</li>
<li><a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=%22Scientific+Working+Group+for+the+Analysis+of+Seized+Drug+Recommendations%22">Scientific Working Group for the Analysis of Seized Drug Recommendations</a>. , Scientific Working Group for the Analysis of Seized Drugs. (2014).</li>
<li>Kikura-Hanajiri, R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Simultaneous+analysis+of+mitragynine%2C+7-hydroxymitragynine%2C+and+other+alkaloids+in+the+psychotropic+plant+%22Kratom%22+%28Mitragyna+speciosa%29+by+LC-ESI-MS%5BTitle%5D)+AND+%22Forensic+Toxicol%22%5BJournal%5D)">Simultaneous analysis of mitragynine, 7-hydroxymitragynine, and other alkaloids in the psychotropic plant "Kratom" (Mitragyna speciosa) by LC-ESI-MS.</a> Forensic Toxicol. 27, 67-74 (2009).</li>
<li>Wang, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Comparison+of+three+chromatographic+techniques+for+the+detection+of+mitragynine+and+other+indole+and+oxindole+alkaloids+in+Mitragyna+speciosa+%28Kratom%29+plants%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Separation+Sci%22%5BJournal%5D)">Comparison of three chromatographic techniques for the detection of mitragynine and other indole and oxindole alkaloids in Mitragyna speciosa (Kratom) plants.</a> J. Separation Sci. , (2014).</li>
<li>Cody, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Observation+of+molecular+ions+and+analysis+of+nonpolar+compounds+with+the+Direct+Analysis+in+Real+Time+ion+source%5BTitle%5D)+AND+%22Anal.+Chem%22%5BJournal%5D)">Observation of molecular ions and analysis of nonpolar compounds with the Direct Analysis in Real Time ion source.</a> Anal. Chem. 81, 1101-1107 (2009).</li>
<li>Cody, R., Laramee, J., Durst, H. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Versatile+new+ion+source+for+the+analysis+of+materials+in+open+air+under+ambient+conditions%5BTitle%5D)+AND+%22Anal.+Chem%22%5BJournal%5D)">Versatile new ion source for the analysis of materials in open air under ambient conditions.</a> Anal. Chem. 77, 2297-2302 (2005).</li>
<li>Musah, R. A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+High+Throughput+Ambient+Mass+Spectrometric+Approach+to+Species+Identification+and+Classification+from+Chemical+Fingerprint+Signatures%5BTitle%5D)+AND+%22Sci.+Rep%22%5BJournal%5D)">A High Throughput Ambient Mass Spectrometric Approach to Species Identification and Classification from Chemical Fingerprint Signatures.</a> Sci. Rep. 5, (2015).</li>
<li>Lesiak, A. D., Cody, R. B., Dane, A. J., Musah, R. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Rapid+detection+by+direct+analysis+in+real+time-mass+spectrometry+%28DART-MS%29+of+psychoactive+plant+drugs+of+abuse%3A+The+case+of+Mitragyna+speciosa+aka+%22Kratom%22%5BTitle%5D)+AND+%22Forensic+Sci.+Int%22%5BJournal%5D)">Rapid detection by direct analysis in real time-mass spectrometry (DART-MS) of psychoactive plant drugs of abuse: The case of Mitragyna speciosa aka "Kratom".</a> Forensic Sci. Int. 242, 210-218 (2014).</li>
<li>Lesiak, A. D., Cody, R. B., Dane, A. J., Musah, R. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Plant+Seed+Species+Identification+from+Chemical+Fingerprints%3A+A+High-Throughput+Application+of+Direct+Analysis+in+Real+Time+Mass+Spectrometry%5BTitle%5D)+AND+%22Anal.+Chem%22%5BJournal%5D)">Plant Seed Species Identification from Chemical Fingerprints: A High-Throughput Application of Direct Analysis in Real Time Mass Spectrometry.</a> Anal. Chem. , (2015).</li>
<li>Espinoza, E. O., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Distinguishing+wild+from+cultivated+agarwood+%28Aquilaria+spp.%29+using+direct+analysis+in+real+time+and+time+of-flight+mass+spectrometry%5BTitle%5D)+AND+%22Rapid+Commun.+Mass+Spectrom%22%5BJournal%5D)">Distinguishing wild from cultivated agarwood (Aquilaria spp.) using direct analysis in real time and time of-flight mass spectrometry.</a> Rapid Commun. Mass Spectrom. 28, 281-289 (2014).</li>
<li>Lancaster, C., Espinoza, E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Evaluating+agarwood+products+for+2-%282-phenylethyl%29chromones+using+direct+analysis+in+real+time+time-of-flight+mass+spectrometry%5BTitle%5D)+AND+%22Rapid+Commun.+Mass+Spectrom%22%5BJournal%5D)">Evaluating agarwood products for 2-(2-phenylethyl)chromones using direct analysis in real time time-of-flight mass spectrometry.</a> Rapid Commun. Mass Spectrom. 26, 2649-2656 (2012).</li>
<li>Sisco, E., Dake, J., Bridge, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((%22Screening+for+trace+explosives+by+AccuTOF%E2%84%A2-DART%C2%AE%3A+An+in-depth+validation+study.%22%5BTitle%5D)+AND+%22Forensic+Sci.+Int%22%5BJournal%5D)">"Screening for trace explosives by AccuTOF™-DART®: An in-depth validation study.".</a> Forensic Sci. Int. 232, 160-168 (2013).</li>
<li>Fernandez, F. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Characterizatoin+of+solid+counterfeit+drug+samples+by+desorption+electrospray+ionization+and+direct+analysis+in+real+time+coupld+to+time-of-flight+mass+spectrometry%5BTitle%5D)+AND+%22Chem.+Med.+Chem%22%5BJournal%5D)">Characterizatoin of solid counterfeit drug samples by desorption electrospray ionization and direct analysis in real time coupld to time-of-flight mass spectrometry.</a> Chem. Med. Chem. 1, 702-705 (2006).</li>
</ol>

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남용의 식물성 약품을 식별 할 수있는 능력으로 인해 예기치 않은 향정신성 물질의 극적인 마케팅, 판매 상승하고 소비 할 필요가 증가된다. 식물 재료의 식별이 전통적인 방법은 일반적으로 분석과 함께 물리적 특성의 특성을 포함 하이픈 크로마토 그래피 - 질량 분석 방법으로 화학 성분. 그러나 이러한 접근 방법 간소화 분석 본 과제의 양. 식물은 건조 분쇄 또는 제조 과정에서 추출하고, 이와 같이, 단독의 물리적 특징에 기초하여 서로 식물계 향정신성 제품의 한 종류를 구별하는 것이 어려운 경우 식물의 물리적 특성은 종종 파괴된다. (23) 분석에 의해 크로마토 그래피 - 질량 분석 방법은 매트릭스 식물의 향정신성 화합물의 식별을 가능하게 할 수 있지만, 샘플 준비 및 방법이 개발 시간 A는차 자원 집약적, 각 클래스 또는 남용의 식물 기반 약물의 종류에 대한 새로운 프로토콜의 생성은 많은 법의학 화학 실험실에서 비실용적이다. 그러한 잎 분말, 추출물과 씨앗 등 복잡한 매트릭스가 작은 시료 제조 분석 할 수 있기 때문에 실시간으로 고해상도 질량 분광법 직접 분석은 이러한 문제점의 일부를 우회. 여기에서 샘플 재료의 복소 행렬들에도 불구하고, 향정신성 성분 의한 질량 분석의 높은 감도로, 심지어 21 나노 그램의 농도에서 쉽게 식별 할 수 있었다. 종자, 잎 분말을 용이하게 실시간으로 고해상도 질량 분광법 직접 분석에 의해 분석 될 입증하고, 재료의 다른 형태의 다양한도 TLC 판, 통화, 정제, 꽃을 포함하여 동일하게 샘플링 될 수있다 고체상 마이크로 추출 (SPME) 섬유, 심지어 곤충 puparial 케이스. 21 ~ 22 정확한 질량 아나을 통해용해 원소 조성 판별 및 동위 매칭 생체 관심의 화합물없이 화합물이 잎에 포함 여부에 TLC 플레이트에서 목격 또는 모세관에 도포, 식별 될 수있다. 실험 실험에서 수정 될 필요가 거의 파라미터가 실시간으로 고해상도 질량 분석 방법 직접 분석 유선형 분석에 이용 될 수있다. 분석은 양이온 또는 음이온 모드에서 수행 될 수 있고, 3,000 AMU의 분자는 두 경우 모두에서 검출 될 수있다. 양이온 모드에서 이온화 양성자 활성 물의 클러스터 (21)로부터 전송 및 이온화 될 물보다 높은 양성자 친화 임의의 화합물에 의해 발생한다. 여기서, 포지티브 이온 모드 때문에 그들이 용이하게 양성자가 이온화되도록 알칼로이드 높은 양성자 친화력으로 사용 하였다. 음 이온 모드에서 분석 hydrocarb의 성공적인 검출을 위해 사용될 수있다기능 21 폭발물 27 의한 양성자 이동의 이온화 방법 및 다중 하전 된 이온, 실시간으로 고해상도 질량 직접 분석을 생성 할 수 없다는 그러한 말라리아 약물의 artesunate. 28 유기산 (O 2 부가 물 등) 분석법은 3,000 AMU의 작은 분자의 분석에 주로 한정된다. 이온화 모드 이외의 이온 소스의 온도는 중요한 파라미터이고, 적당한 온도는 대체로 분석 시료에 따라 다르다. 예를 들어, 높은 온도 (~ 500 ℃)가 탈착 아미노산 분석을 위해 사용되어야하는 동안 섬유에 코팅 물질의 파괴를 방지 할 SPME 파이버 분석 낮은 온도 (~ 250 ℃)를 사용하는 것이 중요하고 이후 이온화. 이 알칼로이드와 함께 관심의 다른 화합물의 이온화 수 있습니다 여기에, 식물 재료의 분석은, 350 ° C에서 수행되었다식물 매트릭스 화합물의 열분해를 야기 아웃. 실시간 고해상도 질량 분석기 분석을 직접 분석뿐만 아니라 정확한 질량 원소 조성 판별 및 동위 원소 매칭에 기초하여 식물 재료의 정신 활성 성분의 식별을 가능하게하지만, 또한, 사용하는 종의 식별을 위해 이용 될 수 독특한 화학적 핑거 프린트를 생성 더 작은 데이터 세트와 높은 재현성 결과 다변량 통계 분석. 다 변수 통계 분석 방법의 다양성과 재현성을 보여주는, 목재, puparial 케이싱, 종자, 잎 물질 및 바이오 디젤 fuelstocks로부터 유도 된 것을 포함하여, 실시간으로 고분해능 질량 분석 데이터를 직접 분석하는 다양한 적용되었다. 실시간 고해상도 질량 분광법 직접 분석 22-26 하이 스루풋 기능 질량 spectr 다량의 취득을 가능하게알 단시간에 데이터 및 통계 분석에 필요한 복제의 다수 쉽게 방법을 이용하여 획득된다. 계시와 Kratom의 실시간 고해상도 질량 분석 질량 스펙트럼 데이터 세트에서 직접 분석은 총 시간 투자 시간 미만으로 수집 된 100 개 이상의 개별 스펙트럼으로 구성되었다. 이러한 추출 또는 유도체와 같은 샘플 제조 단계에 대한 추가 시간을 고려하지 않고, 약 50 시간이 걸릴 것이라고 30 분 오븐 온도 프로그램으로 GC-MS를 사용하여 스펙트럼의 동일한 수를 얻었다. 주성분 분석이 선택 기능 질량의 존재 및 강도를 기초로 식물 물질의 세트 사이의 차이를 강조 할 수있다. 통계 분석 처리부는 종 식별뿐만 아니라, 품종 정보를 제공한다. 계층 적 클러스터링 분석 (HCA) 통계적 분석의 다른 방법도있을 수있다기능 대중의 사전 선택없이 적용. 광범위한 화학 지문 HCA의 결과는 통계 분석 자율 성공적 남용 식물성 약품 종의 식별을 위해 적용될 수 있음을 보여준다. 25 실시간 고해상도 질량 분광법 직접 분석에 의한 정밀 식물 재료의 종류의 판별은 향정신성 화합물 및 소프트 이온화 질량 스펙트럼 다른 바이오 마커의 식별 및 다 변수 통계 분석 응용 프로그램을 사용하여 입증되었다. 통계 분석의 두 종류의 애플리케이션은 공개뿐만 남용 식물성 약제의 종류를 식별 할 수 있지만, 또한 다양한 약물이 직접 분석에 의하여 관찰 된 독특한 화학적 핑거 프린트에 기초하여 결정될 수있는 상기 종의 실시간 고해상도 질량 분석. 여기에 제시된 방법은 MI의 신속하고 높은 처리량 식별 가능종래의 분석 방법에서 발생하는 문제를 회피하고, 특성화하고 시간없이 향정신성 식물 물질을 식별하는 방법 및 집중 개발 자원 수단과 정밀 실험실을 제공하는 방식으로 물질 ND-변경. 이 프로토콜은 다른 식물 유래 물질의 다양한 종 분화에 확장 될 수있다. 22-26

천년를 들어, 정신 천연 제품은 무속 의례에 사용 된 자신의 마음 변경 속성에 대한 학대, 그들의 의약 속성에 대한 소비. 이러한 식물과 관련 식물 기반 물질의 섭취는 풍토 성 지역에서 중요 할 수 있습니다, 그들은 사회적, 경제적 중요성을 가지고있다. 최근 그러나, 인터넷을 통한 상거래 접근성 용이 이러한 &quot;천연&quot;약물의 사용이 크게 증가되고있다. 이러한 물질은 안전하게 사용할 수 있다는 인식은, 보유 및 남용 및 합성 물질의 전통적인 약물의 사용에 증가 단속과 함께, 식물 기반의 약물 남용의 스파이크에 기여했다. 이들 제품 및 무해한 식물 물질을 구별하는 시각화하여 일반적으로 곤란하며, 따라서, 이러한 제품을 식별 사용될 수있는 방법의 개발에 관심이있다. 공장 그러나, 기존의 분석 방법종 식별이 시간을 소비하고 수행하는 것은 비실용적이다. 또한, 상기 방법의 개발 과정은 시간 및 자원 집약적이다. 이러한 요소들은 이러한 물질의 사용은 지금까지 자신의 학대에 에스컬레이션의 비율 뒤쳐 억제 법의 공예를 만들었습니다. 따라서, 이러한 자연 psychoactives 대부분의 생산, 제조, 판매 및 소비를 조절하고 같은 다른 형태의 수천명의 사용자가 사용할 학대 식물의 수백이 몇 가지 법칙이 있습니다. 1, 2 학대의 두 등 식물 기반의 약물은 흰 독말풀 속, 즉 D.에서 Mitragyna 일반적으로 Kratom로 알려진 speciosa의, 및 식물 가시 독말풀, D. ferox 및 D. inoxia. Kratom과 흰 독말풀은 미국에서 예약되지 않은,하지만 마약 단속 관리는 우려 의약품으로 모두 나열하고있다. 3,4 Kratom은 정신 화합물의 존재에 의해 특징으로하는 mitragynine차 7 hydroxymitragynine뿐만 아니라 mitraphylline, paynantheine, corynoxeine 및 rhynchophylline을 포함하는 다른 비 정신 알칼로이드. 흰 독말풀 종의 4-8 정신 속성. 아트로핀 및 스코 폴라 민 만, 식물에서 발견 된 다른 트로 알칼로이드 다양한 기인한다. 9-12 Kratom 및 계시 모두 중독 및 사망에 관련되어 있고, 그들의 식별로, 모두 정밀 및 독성 학적 상황에서 점점 더 필요 이 제품의 남용이 증가하고있다. 13 ~ 16 함으로써 및 색상 검사, 현미경, 라만 분광법 및 적외선 등의 정밀 약물 물질의 분석에 사용되는 대형 전통적인 방법, 규칙 인 / 아웃 룰 용량 추정에 사용된다. 이러한 GC-MS 액체 크로마토 그래피 질량 분석 (LC-MS) 등의 기술은 하이픈 검출 분석의 정보의 비교에 기초하여 확증 분석 방법이다압수 약의 분석 (SWGDRUG) 라이브러리 표준에 과학 워킹 그룹에. 17 분쇄, 추출, 유도체 및 증발을 포함하여 선행 분석을 수행 샘플 처리 단계는 실행 시간에 시간을 추가하고 샘플을 섞음 수, 9,11 코카인이나 헤로인 같은 학대의 다른 전통 의약품에 비해 간단보다 작은 식물 약의 18, 19 결정 분석. 또한, 각각의 크로마토 그래피 프로그램은 각 종 또는 루틴 케이스 틀에 매우 비실용적 남용 식물성 약품의 다양한 표준 운영 프로토콜 구현하게 관심있는 모든 제품에 대한 개발이 필요하다. 실시간 고해상도 질량 분광법 직접 분석은 종래의 분석 방법과 관련된 문제의 일부를 우회 주변 이온화 질량 분석 기술이다. 가스, 액체, 고체, 분말, TLC 판과 식물 이잖아요IAL 모든 실시간 고해상도 질량 분광법으로 직접 분석을 이용하여 직접적으로 해석 될 수 있고, 극성 및 비극성 화합물 모두 쉽게 복잡한 매트릭스에서 검출 될 수있다. 20 내지 22은 또한, 연구 향정신성 화합물 빠르게 식별 될 수 있다는 것을 보여 주었다 실시간 고해상도 질량 분광법 직접 분석 종 특정 정보에 의해 식물 재료의 질량 스펙트럼 데이터의 통계 처리로부터 얻을 수있다. 22-26 여기서는 실시간 고해상도 질량 분광법 직접 분석 빠르게 향정신성 구성 요소에 대한 다양한 식물 재료 (예를 들어, 식물, 분말, 추출 및 종자)를 평가하는데 사용될 수 있음을 입증하고, 그 공장 -의 종 및 변종 가공 제품은 신속하고 높은 처리량 방법으로 결정될 수있다. 시료 준비 단계 또는 긴 크로마토 그래피 없이도 포렌식 관련 식물성 물질의 분석분석 실행 시간은, 식물 종의 식별에 추가로보고됩니다.

<table><tbody><tr><td>AccuTOF 질량 분석기</td><td>JEOL USA, Inc.</td><td></td><td></td></tr><tr><td>DART-SVP 이온 소스</td><td>IonSense, Inc.</td><td>DART-SVP</td><td></td></tr><tr><td>선형 레일 시스템</td><td>IonSense, Inc.</td><td>HW-10029</td><td></td></tr><tr><td>홀 펀처(6mm)</td><td>스윙라인</td><td>A7074005</td><td></td></tr><tr><td>원파인트 소형 초음파 세척기</td><td>Cole-Palmer</td><td>EQ-08849-00</td><td></td></tr><tr><td>1.5ml Eppendorf 마이크로 원심분리기 튜브</td><td>Fisher Scientific</td><td>02-682-550</td><td></td></tr><tr><td>AccuSpin Micro 17R 원심분리기</td><td>Fisher Scientific</td><td>13-100676</td><td></td></tr><tr><td>#9 스테인리스 스틸 면도날</td><td>Stanley</td><td>11-515</td><td></td></tr><tr><td>Dip-it 팁 홀더</td><td>IonSense, Inc.</td><td>SCT-70003</td><td></td></tr><tr><td>딥 잇 팁</td><td>IonSense, Inc.</td><td>DPT-110</td><td></td></tr><tr><td>융점 모세관</td><td>Krackeler Scientific</td><td>1-9530-3</td><td></td></tr><tr><td>폴리에틸렌 글리콜 (600)</td> <td>Sigma Aldrich</td><td>81180</td><td></td></tr><tr><td>Rifat Kratom Live Plant</td><td>세계 종자 공급 Kratom Collection</td><td>LIVEKRATOMPLANT</td><td></td></tr><tr><td>발리 Kratom 건조 잎</td><td>The Kratom King</td><td>OZKRAPCOM</td><td></td></tr><tr><td>발리 Kratom 분말</td><td>The Kratom King</td><td>OZKRAPCOMPOW</td><td></td></tr><<tr><td>em>Datura stramonium 씨앗</td><td>Horizon Herbs LLC</td><td>PDATUJ</td><td></td></tr><tr><td>Datura inoxia 씨앗</td><td>Horizon Herbs LLC</td><td>PDATUM</td><td></td></tr><tr><td>Datura ferox 씨앗</td><td>Georgia Vines</td><td>255/737</td><td></td></tr><tr><td>에탄올, 무수</td><td>Krackeler Scientific</td><td>1328-E402-4L</td><td></td></tr><tr><td>Mass Mountaineer Spectral Analysis Software</td><td>mass-spec-software.com</td><td>MM-20030-PCA-DVD</td><td></td></tr><tr><td>TSSPro3 데이터 처리/데이터 축소 소프트웨어</td><td>Shrader Labs</td><td></td><td></td></tr><tr><td>Cluster 3.0</td><td>http://bonsai.hgc.jp/~mdehoon/software/cluster/software.htm</td><td>오픈 소스 소프트웨어</td><td></td></tr><tr><td>Java Treeview</td><td>http://jtreeview.sourceforge.net/</td><td></td> <td>Open Source 소프트웨어</td></tr></tbody></table>

실시간 고해상도 질량 분석에 직접 분석을 사용하여 식물 소재의 신속한 높은 처리량 종 확인

Rapid High-throughput Species Identification of Botanical Material Using Direct Analysis in Real Time High Resolution Mass Spectrometry

우리는 실시간으로 고해상도 질량 분광법 직접 분석 식물 물질의 질량 스펙트럼의 프로파일을 생성하는 데 사용될 수 있음을 입증하고, 이러한 화학 지문 종의 식별을 위해 사용될 수있다. 질량 스펙트럼 데이터는 표본 추출, 유도체 또는 pH 조절 단계를 필요로하지 않고 신속하고 높은 처리량의 방식으로 획득 될 수있다. 이 기술의 사용은 긴 크로마토 그래피 분석 시간과 자원 집약적 방법을 포함하는 더 많은 종래의 기술에 의해 제시된 문제들을 무시. 데이터의 다 변수 통계 분석 처리와 결합 실시간 고해상도 질량 분석 프로토콜 직접 분석의 높은 처리 능력, 식물뿐만 클래스 특성을 제공 할뿐만 아니라, 종 및 품종 정보를 얻었다. 여기서, 상기 기술은 두 개의 정신 식물 제품, Mitragyna의 speciosa의 (Kratom)와 흰 독말풀로 설명된다질량 분광 데이터에 대한 통계적 분석 처리 하였다 실시간 고해상도 질량 분광법으로 직접 분석 하였다 (Jimsonweed). 탠덤 이러한 도구 애플리케이션은 식물 재료를 신속하고 다양한 종의 레벨에서 식별 될 수 있었다.

Kratom 제품과 계시 씨앗 실시간 고해상도 질량 분석 데이터 대표적인 소프트 이온화 양이온 모드 직접 분석은도 2 및도 3에 도시되어있다. 다양한 화합물은 이전에 M.에서 격리 mitragynine 포함 speciosa의, (C 23 H 30 N 2 O 4 + H +, m / z 399.2284) 및 7 hydroxymitragynine (C 23 H 30 N 2 + H +가, m이 / z 415.2233 5 O), 네에서 검출되었다 시료 및 상응하는 질량 측정 데이터는 표 1에 제시되어있다. 4-8 주제 계시 데이터는도 3에 도시되고, 아트로핀 (C 17 H 23 NO 3 + H +, m / z 290.1756) 및 스코 폴라 민 (C (17)를 포함하여 서명 생체 H 21 NO 4 + H + </sup&gt;, m / z 304.1549)는 세 종에서 검출되었다. 그림 3과 관련된 질량 측정 데이터는 표 2에 제시되어있다. 9-12 복합 정체성 문학의 보고서 원소 조성 결정, 동위 원소 매칭 및 비교를 통해 확인 하였다. 23 ~ 24 Kratom 및 계시 실시간 고해상도 질량 분석 스펙트럼의 직접적인 분석을 열지 렌더링은도 4에 도시되어있다. 제시된 데이터의 식물성 약품의 두 개의 클래스를 구별하기 위해 주성분 분석 (PCA)에 사용 된 남용 (그림 5). PCA에 플롯은 흰 독말풀 데이터를 나타내는 Kratom 데이터와 빨간색 사각형을 나타내는 파란색 원으로, (표 3) 열 기능 질량을 사용하여 구성 하였다. 선택한 기능 대중이 다양한 알칼로이드에 맞습니다에 제시흰 독말풀 또는 Mitragyna 종.의 정신 화합물 아트로핀, 스코 폴라 민, mitragynine 및 7 hydroxymitragynine 포함. 23 ~ 24 세 주요 구성 요소는 분산의 75.26 %를 차지 떠나-한 아웃 교차 검증 (LOOCV)은 100 %였다. PCA에 플롯은 명확하게 Kratom 데이터와 흰 독말풀 데이터가 아니라 서로 해결 것으로 나타났다. PCA 분석은 계시의 Kratom의 각 종류 및 종 식별하고 서로 (그림 6)과 구별 될 수있는 것으로 나타났습니다. LOOCV 세 가지 주요 구성 요소는 분산의 75.26 %를 커버와 94.29 %였다. 그들은 종 M.에 속하는 것을 나타내는 함께 클러스터 (빨간색 사각형 파란색 원과 아파 드 발리) Kratom의 두 가지 종류, speciosa의는하지만, 서로 다른 품종을 나타낸다는 것을 보여주는, 서로 해결됩니다. 또한, 흰 독말풀 종의 군을 함께하고 M. 분리 SPeciosa 데이터는하지만, 흰 독말풀 (녹색 삼각형 라의 inoxia, 분홍색 사각형 청록색 서클 D.의 ferox 라의 가시 독말풀)의 개별 종의 각각 명확하게 구분됩니다. D.에 대한 데이터 점에도 불구하고 가시 독말풀은 아웃 라이어가 될 나타나는 시드가 제대로 D.로 분류 가시 독말풀하지 D. inoxia PCA를 사용. 가장 중요한 D. 사이 시드 색의 차이를 가시 독말풀 및 D. inoxia는 다른 종 확인하고, 해당 데이터 포인트 D. 수 없다는 inoxia. 계층 적 클러스터링 (그림 7) 기능 대중의 사전 선택없이 수행 하였다. 대신, m / z 60-800의 질량 범위에 걸친 스펙트럼 데이터 세트들의 전체 그룹은 오픈 소스 게놈 클러스터링 소프트웨어로 반입하고,이 데이터를 갖춘 dendrogram은 제조 하였다. 그 결과 오f를 HCA는 유일하게 실시간으로 고해상도 질량 분석 파생 데이터를 직접 분석을 기반으로 클래스, 종 및 다양한 분화를 공개하고, PCA 분석들을 확인했다. 남용, Kratom과 흰 독말풀의 식물 기반 약물의 두 클래스는 dendrogram은 개별 clades로 분리 하였다. 또한, Kratom의 아파 드 발리 품종은 각각 Kratom 클래스 내의 개별 하위 clades로 분리 하였다. 마찬가지로, D. inoxia, D. ferox 및 D. 가시 독말풀은 흰 독말풀 클래스 내 종에 의해 자신의 clades에 해결되었다. <img alt="그림 1" src="/files/ftp_upload/54197/54197fig1.jpg" /> M. 1. 이미지 그림 speciosa의 (Kratom) 제품과 흰 독말풀 종 씨앗 : 발리 Kratom 건조 잎; B :.. 발리 Kratom 분말; C : 아파 드 Kratom 라이브 공장; <strong&gt; D : D. 가시 독말풀 씨앗, 이메일 : D. inoxia 씨앗, F : D. ferox 씨. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/54197/54197fig1large.jpg" target="_blank">이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.</a> <img alt="그림 2" src="/files/ftp_upload/54197/54197fig2.jpg" /> 실시간 높은 M.의 해상도 질량 분석 긍정적 인 이온 스펙트럼 그림 2. 직접 분석 speciosa의 (Kratom) 제품 A : 아파 드 신선한 잎; B :. 발리 건조 잎; C : 발리 분말 D : 발리 분말 추출물. 이러한 스펙트럼과 관련된 질량 측정 데이터는 표 1에 나타내었다. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/54197/54197fig2large.jpg" target="_blank">이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.</a> <img alt="그림 3" src="/files/ftp_upload/54197/54197fig3.jpg" /> 흰 독말풀 종의 실시간 고해상도 질량 분석 긍정적 인 이온 스펙트럼 그림 3. 직접 분석. . 씨앗 : D. ferox; B : D. inoxia; C : D. 가시 독말풀. 이러한 스펙트럼과 관련된 질량 측정 데이터가 표 2에 나타내었다. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/54197/54197fig3large.jpg" target="_blank">이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.</a> <img alt="그림 4" src="/files/ftp_upload/54197/54197fig4.jpg" /> 그림 실시간 높은 Kratom과 흰 독말풀 식물 재료의 해상도 질량 분석 스펙트럼에서 직접 분석 4. 히트 맵 렌더링. 안녕GH 강도 피크가 어두운 빨간색과 낮은 강도 피크에 표시됩니다 라이터 음영으로 표시됩니다. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/54197/54197fig4large.jpg" target="_blank">이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.</a> <img alt="그림 5" src="/files/ftp_upload/54197/54197fig5.jpg" /> Kratom 및 계시 제품도 5 주성분 분석 (PCA) 플롯 세 주성분 (PCS)가 변동 75.26 %를 차지했다. 실시간 고분해능 질량 분석 유래 데이터의 직접적인 분석을 이용하여 구성하고, 작별 액형 교차 검증 (LOOCV)에서 100 %였다. PCA에 사용되는 기능의 질량은 표 3에 나와 있습니다. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/54197/54197fig5large.jpg" target="_blank">이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.</a> 실시간 고해상도 질량 분석 데이터에 직접 분석을 사용 Kratom 및 계시 제품도 6 주성분 분석 (PCA) 플롯. 클래스 지정은 식물 재료의 다양성 (Kratom) 또는 종 (계시)에 기초 하였다. 세 가지 주요 구성 요소 (PCS)는 변화와 휴가-한 아웃 교차 검증 (LOOCV)의 75.26 %를 차지 94.29 %였다. PCA에 사용되는 기능의 질량은 표 3에 나와 있습니다. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/54197/54197fig6large.jpg" target="_blank">이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.</a> <img alt="그림 7" src="/files/ftp_upload/54197/54197fig7.jpg" /> 도 7 계층 클러스터링 결과 실제 TI의 직접적인 분석을 이용하여 얻어진Kratom과 흰 독말풀 식물 재료의 분석에서 나를-고해상도 질량 분석에서 파생 된 데이터. 식물의 두 종류가 명확하게 (각각 Kratom과 흰 독말풀 파란색과 빨간색 괄호 안에 표시) dendrogram은 두 개의 서로 다른 가지로 구분됩니다. 흰 독말풀 씨앗 종은 서로 해결 (녹색, 청록색에 도시와 핑크는 각각 D.의 inoxia, D. ferox 및 D의 가시 독말풀에 대한 상자를 점선). Kratom의 식물 재료는 다양한에 의해 분리 (아파 드 발리, 각각에 대한 점선 빨간색과 파란색 상자 참조). <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/54197/54197fig7large.jpg" target="_blank">이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.</a> <img alt="1 번 테이블" src="/files/ftp_upload/54197/54197tbl1.jpg" /> Kratom produ의 부드러운 이온화 스펙트럼과 관련된 표 1 질량 측정 데이터그림 2에 제시 캐럿. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/54197/54197tbl1large.jpg" target="_blank">이 테이블의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.</a> <img alt="표 2" src="/files/ftp_upload/54197/54197tbl2.jpg" /> 표 그림 3에 제시 흰 독말풀 씨의 부드러운 이온화 스펙트럼과 관련된 2. 질량 측정 데이터. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/54197/54197tbl2large.jpg" target="_blank">이 테이블의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.</a> <img alt="표 3" src="/files/ftp_upload/54197/54197tbl3.jpg" /> 도 5 및도 6에 도시 Kratom과 계시 제품의 주성분 분석 플롯 사용 표 3 특징 매스.

실시간 고해상도 질량 분석 다변량 통계 분석을 직접 분석에 의해 식물 재료의 종을 식별하는 방법이 제공된다.

We demonstrate that direct analysis in real time-high resolution mass spectrometry can be used to produce mass spectral profiles of botanical material, ...

이 실험의 전반적인 목표는 주변 이온화 질량 분석법을 사용하여 식물 물질의 종을 식별하는 것입니다. 다변량 통계 분석과 함께. 이 방법은 예를 들어 화학적 지문을 기반으로 어떤 종류의 식물을 가지고 있는지와 같은 화학 및 생물학 분야의 주요 질문에 답하는 데 도움이 될 수 있습니다.또한 식물 조직에 있는 생체 활성 분자에 대한 정보도 얻을 수 있습니다. 이 기술의 주요 장점은 분석에 필요한 샘플 준비가 거의 없고 몇 분 내에 데이터를 얻을 수 있다는 것입니다. 이 방법은 화학의 다른 문제를 해결하는 데에도 사용할 수 있습니다.예를 들어, 유기 합성에서 반응 중간체 및 산물을 추적하고, 다양한 유형의 복잡한 매트릭스를 분석하고, 헤드스페이스 분석을 수행합니다. kratom 신선한 잎 물자를 준비하기 위하여는, M.speciosa 식물에서 kratom 잎 물자의 획일한 chads를 창조하기 위하여 6mm 직경 구멍 펀치를 사용하십시오. 이 과정을 5회 반복합니다.크라 톰 분말을 추출하려면 1.5 밀리리터 마이크로 원심 분리기 튜브에서 작동하고 1 대 1 에탄올의 1 밀리리터에 소량의 크라 톰 발리 분말을 현탁시켜 용매 혼합물을 수놓는다. 이 과정을 5회 반복합니다. 크라톰 발리 분말 추출물 샘플을 상온에서 30분 동안 초음파 수조에 넣어 초음파 처리합니다.그런 다음 크라톰 발리 분말 추출물 샘플을 상온에서 750 배 G로 2 분 동안 원심 분리하십시오. 후속 분석을 위해 잔류 분말에서 용매를 디캔팅합니다. datura 씨앗을 준비하려면 면도날을 사용하여 횡면을 가로질러 D.stramonium 씨앗을 반으로 자릅니다.5개의 다른 시드를 사용하여 이 과정을 반복합니다. 텍스트 프로토콜에 설명된 대로 질량 분석기 또는 MS 매개변수를 설정한 후 질량 분석기 제어 소프트웨어에서 Start Run을 눌러 크라톰 잎을 분석합니다. 스펙트럼이 얻어질 때까지 핀셋으로 이온 소스와 질량 분석기 입구 사이에 크라톰 잎 식물 재료의 차드를 매달아 놓습니다.별도의 식물 재료로 이 절차를 5번 반복합니다. 폴리에틸렌 글리콜 600(약칭 PEG)으로 스펙트럼을 보정하려면 융점 모세관 튜브의 닫힌 끝을 PEG 표준물질에 담그십시오. 이온 소스와 질량 분석기 주입구 사이에 코팅된 모세관을 매달아 놓습니다.중지 단추를 선택하여 해석 실행을 종료합니다. 질량 분석기 제어 소프트웨어에서 Start Run을 눌러 건조된 크라톰 잎을 분석합니다. 스펙트럼이 얻어질 때까지 핀셋으로 이온 소스와 질량 분석기 입구 사이에 소량의 건조된 잎 물질을 매달아 놓습니다.매번 새로운 식물 재료를 분석하면서 수집을 5회 반복합니다. 이전과 같이 PEG로 스펙트럼을 보정한 다음 Stop(중지) 버튼을 선택하여 분석 실행을 종료합니다. 크라톰 분말을 분석하려면 질량 분석기 제어 소프트웨어에서 Start Run을 누르십시오.융점 모세관의 닫힌 끝을 크라톰 분말에 담그십시오. 스펙트럼을 얻을 때까지 이온 소스와 질량 분석기 주입구 사이에 코팅된 모세관을 매달아 놓습니다. 매번 새로운 모세관으로 분석을 5회 반복한 다음 PEG 보정을 수행합니다.크라톰 추출물을 분석하려면 모세관 끝을 추출물에 담그십시오. 모세관 튜브를 질량 분석기의 선형 레일에 있는 12개의 샘플 홀더에 매달아 놓습니다. 매번 다른 추출물로 5회 반복합니다.질량 분석기 제어 소프트웨어에서 Start Run을 누릅니다. 제어판을 사용하여 forward advance 버튼을 선택하여 초당 1mm의 속도로 이온 스트림을 통해 선형 레일을 전진시켜 스펙트럼을 수집합니다. 이전과 같이 PEG로 스펙트럼을 보정하고 Stop을 눌러 분석 실행을 종료합니다.datura seed를 분석하려면 질량 분석기 제어 소프트웨어에서 Start Run을 누릅니다. 스펙트럼이 수집될 때까지 핀셋을 사용하여 이온 소스와 질량 분석기 주입구 사이에 datura seed를 절반 동안 매달아 놓습니다. 절단면이 이온 소스를 향하도록 향하고 있는지 확인하십시오.이 절차를 5회 반복하여 매번 새 시드를 절반씩 분석합니다. PEG 검량으로 분석을 완료하고 Stop을 눌러 분석 실행을 종료합니다. 텍스트 프로토콜에 설명된 대로 데이터 처리를 수행한 후 Setup 탭에서 스펙트럼 분석 소프트웨어의 Classify 섹션으로 이동하고 Add Class를 선택하여 데이터 처리를 위한 클래스를 생성하여 기본 구성 요소 분석을 수행합니다.Add Files(파일 추가)를 선택하여 데이터의 텍스트 파일을 가져옵니다. 텍스트 파일(Text Files)을 선택하고 선택한 파일에 대한 클래스 설정(Set Class for Selected Files)을 선택하여 데이터 파일을 적절한 플랜트 클래스에 지정합니다. 트레이닝 세트에서 MS를 구별하기 위해 특징 질량을 선택하고 임계값 백분율을 1%로 설정합니다.그런 다음 질량 허용 오차를 10으로 설정하고 Build Vectors from Data Files를 선택합니다.컴퓨팅 섹션에서 3D PCA 그래프 확인란을 선택하여 주요 구성 요소 분석을 수행하고 계산을 선택합니다. Validate를 선택하여 leave-one-out 교차 유효성 검사를 수행합니다. 그런 다음 스펙트럼 분석 소프트웨어의 Frequency Plot 탭으로 이동하여 Heat Map을 선택하여 데이터의 히트 맵을 생성합니다.Threshold saved data(임계값 저장 데이터)를 선택하여 풍부도 임계값을 1%로 설정합니다.Save Heat Map to Excel(Excel에 히트 맵 저장)을 선택하여 히트 맵을 스프레드 시트로 내보냅니다. 스프레드시트 프로그램에서 내보낸 히트 맵을 텍스트 파일로 저장합니다. 그런 다음 계층적 클러스터링 해석을 수행하려면 히트 맵을 텍스트 파일로 Cluster 3.0 소프트웨어에 가져옵니다.Cluster 3.0의 Hierarchical(계층) 탭에서 Genes and Arrays(유전자 및 배열) 확인란을 선택하고 Weights(가중치를 계산합니다)를 선택합니다. 컷오프를 0.1로 설정하고 지수를 1로 설정합니다. 분석을 수행할 단일 링크 클러스터링을 선택합니다.마지막으로 생성된 cdt 데이터 파일을 Java 트리 뷰에서 봅니다. 크라톰 생성물의 대표적인 소프트 이온화 양이온 모드 스펙트럼이 여기에 나와 있습니다. 이전에 M.speciosa에서 분리된 화합물이 확인되었습니다.향정신성 바이오마커 미트라기닌(Mitragynin) 및 7-하이드록시-미트라기닌(7-Hydroxy-mitragynine) 포함. datura seeds의 대표적인 소프트 이온화 양이온 모드 스펙트럼이 여기에 나와 있습니다. 이전에 datura에서 분리된 화합물은 향정신성 바이오마커인 Atropine과 Scopolamine을 포함하여 확인되었습니다.질량 분석 데이터의 히트 맵 렌더링이 여기에 설명되어 있습니다. 크라톰 및 datura 데이터의 주성분 분석 또는 PCA 플롯이 표시됩니다. PCA 플롯은 크라톰 데이터와 독말투가 서로 잘 분리되어 있음을 명확하게 보여줍니다.PCA 분석은 또한 크라톰의 개별 품종과 다른 종의 독수리를 식별하고 서로 구별할 수 있음을 밝혔습니다. 크라톰 및 datura 질량 스펙트럼 데이터의 계층적 클러스터링 분석 또는 HCA 결과가 표시됩니다. HCA의 결과는 실시간 고해상도 질량 분석에서 파생된 데이터의 직접 분석만을 기반으로 클래스, 종 및 품종 구별을 밝혔고 PCA 분석 결과를 확인했습니다.일단 마스터하면 이 기술은 제대로 수행되면 가지고 있는 샘플의 수에 따라 한 시간 이내에 완료할 수 있습니다. 이 비디오를 시청한 후에는 직접 분석 및 실시간 질량 분석기를 사용하여 복잡한 샘플을 분석하고 데이터의 통계 분석 처리를 사용하여 종 정보를 얻는 방법을 잘 이해하게 될 것입니다. 이 절차를 시도하는 동안 샘플의 완전한 질량 스펙트럼을 얻기 위해 적절한 시간 동안 이온 스트림에 샘플을 유지하는 것이 중요합니다.이 기술을 통해 식물 오믹스, 법의학, 유기 및 분석 화학을 포함한 많은 분야의 연구원들은 식물에서 배출되는 휘발성 물질을 분석하고, 약물을 유도하기 위한 법적 대안을 식별하고, 실시간으로 반응 생성물을 모니터링할 수 있습니다.

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Research

연구

JoVE Journal

Chemistry

화학

질량분석법(UPLC-MS)과 결합된 초고성능 액체 크로마토그래피에 의한 비표적 대사 산물 프로파일링은 대사를 조사하는 강력한 기술입니다.  이 문서에서는 시료 조직 및 준비, 데이터 수집, 데이터 분석, 품질 관리 및 대사 산물 식별을 포함하여 혈청의 비표적 대사 산물 프로파일링에 사용되는 일반적인 워크플로우를 간략하게 설명합니다.

울트라 성능 액체 크로마토 그래피 - 질량 분석법 (UPLC-MS)에 의해 혈청 대규모 비 타겟 Metabolomic 프로파일

단기 (MALDI-TOF) 질량 분석 (MS) 직접 혈액 배양액 행의 매트릭스 보조 레이저 탈착 / 이온화 시간 애플리케이션은 박테리아의 식별을 촉진. 제출 방법은 직접 혈액 배양액에서 그람 음성 박테리아의 식별을위한 신속하고 신뢰할 수있는 방법입니다.

MALDI-TOF 질량 분석기를 사용하여 혈액 배양액에서 그람 음성 박테리아의 빠른 확인

식물 세포벽 구조 및 화학적 특성을 평가하여 바이오 연료 및 바이오 재료에 이상적인 공급 원료를 식별합니다. 표준 방법은 대규모 데이터 세트에 적용할 때 제한이 있습니다. 이러한 고처리량 전처리, 효소 당화 및 열분해 분자 빔 질량 분석 방법은 많은 수의 바이오매스 샘플을 비교하여 실험 시간과 비용을 줄입니다.

총 리그닌, 리그닌 단량체, 및 효소 설탕 자료 : 리그 노 셀룰로오스 바이오 매스의 반항의 변화의 높은 처리량 검열

Proton Transfer Reaction Time of Flight 질량 분석기를 사용하면 휘발성 유기 화합물의 고감도, 신속 및 비침습적 분석을 수행할 수 있습니다. 그 잠재력을 입증하기 위해 요구르트의 젖산 발효(온라인 바이오프로세스 모니터링), 다양한 사과 유전자형(대규모 스크리닝) 및 커피 마신 후 후비강 공간(노즈스페이스 분석)의 세 가지 예를 제공합니다.

자동 샘플링 시스템과 결합 된 PTR-ToF-MS 및 식품 연구를위한 맞춤형 데이터 분석 : 바이오 프로세스 모니터링, 스크리닝 및 코 공간 분석

잎 스프레이 질량 분석 샘플 준비를 최소화 하 고 착 색 인쇄기, 식물 조직에서 작은 분자의 급속 한 탐지에 대 한 수를 제거 하는 직접적인 화학 분석 기술 이다.

잎 스프레이 질량 분석: 식물 조직에서 대사를 직접 평가 하는 급속 한 대기 이온화 기술

이 프로토콜 자연 유기 물질과 다른 생태계에서 미생물 단백질의 완전 한 쌍 특성에 culminating 보완 분석 및 omics 기술에 대 한 단일 처리량을 설명 합니다. 이 이렇게 강력한 비교 대사 경로 및 변환을 설명 하는 온실 가스 생산 및 환경 변화에 대 한 응답을 예측에 대 한 중요 한 식별 수 있습니다.

복잡 한 자연 유기 물질 혼합물을 특성화에 대 한 단일 처리량 보완 고해상도 분석 기법

여기에 휴대용 qPCR 시스템을 사용하여 Matricaria chamomilla의 현장 식별을위한 프로토콜이 여기에 제시된다. 이 수행하기 쉬운 프로토콜은 농장이나 창고와 같이 실험실 장비 및 전문 지식에 대한 액세스가 제한된 위치에서 식물 종의 신원을 확인하는 방법으로 이상적입니다.

휴대용 qPCR 시스템을 이용한 마이트리카리아 샤모말라의 현장 식별

시아노균 꽃과 관련 시아노톡신의 조기 발견을 위한 빠른 종합 전략은 여기에서 기술된다. 그것은 24 시간에서 물 샘플 및 바이밸브 샘플과 같은 유기 매트릭스에서 시아노박테리아 및 관련 시아노톡신의 검출을 허용합니다.

빠른 검출 전략을 사용하여 시아노균 꽃과 관련 된 Cyanotoxins의 조기 발견

우리는 고분해능 질량 분석 및 분자 도킹을 중국 전통 의학 연구에서 통합하는 일반 프로토콜에 대해 설명합니다.

Gynura bicolor DC의 화학 성분을 연구하기 위한 고분해능 탠덤 질량 분석법

트로판 알칼로이드의 고속 질량 분석법(MS)/질량 분석법(MS) 기반 주석 및 분류를 위한 방법을 제시하며, 이는 트로판 함유 샘플의 예비 복제 및 분리를 위한 새로운 알칼로이드의 발견 모두에 유용합니다.

천연 제품 연구에서 액체 크로마토그래피 탠덤 질량분석법의 응용 분야: 사례 연구로서의 트로판 알칼로이드

학습하세요 실시간 고해상도 질량 분석법을 활용한 식물 종의 신속한 식별 방법을. 최소한의 시료 전처리로 크라톰과 담배나무 종을 분석하고 생리활성 화합물을 탐색하는 이 기법은 식물 화학 연구에 효율적인 도구를 제공합니다.

실시간 고해상도 질량 분석에 직접 분석을 사용하여 식물 소재의 신속한 높은 처리량 종 확인

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