2016년 12월 10일
여기, 우리는 고정 된 세포에서 소포체와 미토콘드리아의 내생 적 상호 작용을 시각화하고 고감도로 정량화 할 수있는 절차를 설명합니다. 프로토콜은이 미토콘드리아 관련 막 계면에서 이노시톨에게 1,4,5- 트리 포스페이트 수용체 / 혈당 조절 단백질 75 / 전압 가변 음이온 채널 / 시클로 필린의 D 복합체 타겟팅 시츄 근접 결찰 분석법 최적화 기능.
이 실험의 전반적인 목표는 고정 세포에서 현장 근접 결찰 분석을 사용하여 소포체 미토콘드리아 상호 작용을 시각화하고 정량화하는 것입니다. 이 방법은 간단한 면역형광 기술을 사용하여 고정 세포에서 ER 미토콘드리아 상호 작용을 더 잘 분석하기 위해 생물 의학 분야의 주요 질문에 답하는 데 도움이 될 수 있습니다. 새로운 치료 전략을 제안할 수 있기를 바랍니다. 이 기술의 주요 장점은 고정 세포에서 ER 미토콘드리아 상호 작용을 시각화하고 정량화할 수 있으며 이 기술을 환자의 파라핀 내장 조직 생검에 적용할 수 있다는 것입니다. 이 비디오에서 시연된 현장 근접 결찰 분석을 사용하여 외부 미토콘드리아 막에서 VDAC1에 대해 지시된 마우스 1차 항체와 소포체막에서 IP3R1에 대해 지시된 토끼 1차 항체가 미토콘드리아 관련 막 계면에서 근접한 에피토프에 결합합니다. DNA 말단 꼬리가 부착되어 있고 마우스 및 토끼 IgG를 겨냥한 근접 결찰 프로브가 추가되어 커넥터 올리고의 결찰을 위한 템플릿을 형성할 수 있으며 텍사스 레드 올리고뉴클레오티드를 사용하여 증폭 및 시각화할 수 있습니다. 이는 두 표적 단백질이 40나노미터 미만의 거리에 있는 경우에만 발생할 수 있습니다. 두 소기관 막 사이의 거리에 따라 미토콘드리아 관련 막 계면에서. 현장 근접 결찰 분석을 위한 세포를 고정하고 차단하려면 암호화되지 않은 35mm 유리 바닥 접시당 150, 000개의 세포로 인간 H7 세포를 플레이트화합니다. 다음날 배양 배지를 제거하고 PBS 1mL를 사용하여 세포를 세척합니다. 그런 다음 완충액을 흡입하고 10% 포름알데히드 1mL를 추가합니다. 세포를 고정하기 위해 10분 동안 교반하면서 실온에서 플레이트를 배양합니다. 반응을 멈추려면 1mL의 1M 글리신을 첨가하고 플레이트를 회전하여 혼합합니다. 글리신 용액을 제거하고 1XPBS 1mL를 추가합니다. 그런 다음 플레이트를 짧게 교반하고 버퍼를 흡인합니다. 다음으로, 100mM 글리신 1mL를 세포에 첨가합니다. 접시를 실온에서 15분 동안 교반하면서 배양합니다. 용액을 흡인시킨 후 PBS에 0.1%triton-X100 1mL를 첨가하여 세포를 투과시킵니다. 그리고 배양을 반복합니다. 세제를 흡입하고 PBS 1mL를 첨가하여 세포를 세척합니다. 완충액을 제거한 후 세포의 각 접시에 40마이크로리터의 차단 용액을 추가하고 섭씨 37도의 습한 챔버에서 30분 동안 샘플을 배양합니다. 그런 다음 접시에서 차단 용액을 두드려 슬라이드가 건조되지 않도록 하면서 각 슬라이드에 대해 동일한 잔류 부피의 버퍼를 얻으려고 합니다. 근접 결찰 분석을 수행하려면 PBS를 사용하여 1차 항체를 희석합니다. 소용돌이치고 접시에 용액을 추가하십시오. 4에서 샘플을 배양합니다.
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본 논문은 고정된 세포 내 소포체와 미토콘드리아 간의 상호작용을 고감도로 시각화하고 정량화하는 절차를 제시합니다. 이 방법은 미토콘드리아 연관 막 계면에 있는 특정 단백질 복합체를 표적으로 하는 최적화된 인시튜 근접 결찰 분석법(in situ proximity ligation assay)을 활용합니다.
내인성 ER-미토콘드리아 상호작용을 정량화하는 것은 세포 신호 전달 및 대사 조절과 관련된 초기 발견 가설의 리스크를 낮추는 데 매우 중요합니다. in situ 근접 결찰 분석(proximity ligation assay)은 단백질 과발현 없이 오가넬 접촉 부위를 민감하게 다중 검출할 수 있게 하여, 질환 관련 시스템에 대한 예측 신뢰도를 높여줍니다. 이러한 역량은 타겟 검증과 메커니즘 경로 분석의 교차점에서 포트폴리오 결정 과정을 강화합니다.
본 인 시투 근접 결찰 분석(in situ proximity ligation assay)은 고정된 세포 및 조직 내에서 ER-미토콘드리아 상호작용의 강력한 정량화를 가능하게 함으로써, 초기 발견 단계와 전임상 연구 사이의 가교 역할을 합니다.