은 "RE를 : 좋은 약"을 사용하여 의약품 용도 변경 가설 발전 시스템

이 소프트웨어 도구의 전반적인 목표는 게놈 전체 연관 연구 데이터와 표현형 전체 연관 연구 데이터를 기반으로 약물 용도 변경 가설을 생성하고 우선 순위를 지정하는 것입니다. 이 방법은 질병 적응증을 사용할 때 어떤 사용 가능한 약물의 용도를 변경할 수 있는지, 어떤 후보 물질이 문헌에서 더 많은 지지를 받고 있는지 등 신약 개발 분야의 질문에 답하는 데 도움이 될 수 있습니다. 이 기술의 주요 장점은 특정 질병, 유전자 또는 약물의 관점에서 용도 변경 가능성을 탐색하기 위해 여러 진입점을 사용할 수 있다는 것입니다.

RE:fine Drugs의 홈페이지에 접속합니다. 검색 창에 검색어를 입력하여 시작합니다. 이 용어는 일반 약물 이름, 새로운 질병 적응증 또는 유전자일 수 있습니다.

검색 창 함수를 필터링하여 약물 이름, 새로운 질병 표시, 유전자 기호 또는 모든 범주만 포함합니다. 검색 창에는 쿼리 항목에 대한 자동 채우기 기능이 포함되어 있습니다. 키워드를 입력하고 검색 버튼을 클릭합니다.

결과 테이블은 맨 위 행에 나열된 여러 옵션으로 저장할 수 있습니다. 고급 검색 옵션으로 이동하여 약물 정보 기능을 활성화합니다. 특정 약물에 대한 정보 열에서 아이콘을 클릭합니다.

연관성, 질병 이름, 약물 이름, 유전자 세부 정보 및 약물 세부 정보에 대한 P-Value가 나열된 페이지를 관찰합니다. 여러 옵션에서 페이지 오른쪽에 있는 고급 버튼을 클릭하여 제공된 결과를 더 구체화하십시오. 고급 검색 옵션에는 약물, 연관성, 질병, 잠재력, 유전자 및 작용에 대한 수정이 포함됩니다.

페이지 오른쪽에 있는 Export 버튼을 클릭하여 결과 테이블을 내보냅니다. Simple 버튼을 클릭하여 고급 검색 창을 아래로 당깁니다. 고급 옵션 약물 탭에서 특정 약물 적응증 또는 추가 약물 이름을 지정하여 결과를 필터링합니다.

연관성 탭을 클릭하여 유의 수준 P-값, 거짓 발견률이 있는 조정된 P-값, 효과 크기 및/또는 연구 유형별로 결과를 필터링합니다. 질병 탭에서 예측된 새로운 사용에 대한 특정 질병 설명을 지정합니다. 잠재적 탭 내에서 약물 적응증이 DrugBank 데이터베이스에 포함되어 있는지 여부, 약물 및 질병의 동시 발생과 함께 medline 초록 수, ClinicalTrials 수에 따라 결과를 필터링합니다.

이러한 동시 발생이 있는 gov 데이터베이스 항목과 용도 변경 가능성. 유전자 탭에서 단일 뉴클레오티드 다형성 식별자 또는 유전자 기호를 입력하여 특정 약물 표적 유전자를 기준으로 결과를 필터링합니다. 작업 탭을 클릭하고 약물 대상에 대한 약물 작용 유형을 agonist, antagonist, other, unknown 또는 all로 지정합니다.

이 예에서는 유전자 기반 쿼리로 IL2RB 유전자를 입력하고 IL2RB 유전자에 대한 12개의 약물 용도 변경 가설을 반환합니다. 특정 약물 용도 변경 가설에 대한 자세한 정보 페이지는 정보 열에서 제공됩니다. 여기에 표시된 것은 이식 질환 용어에 대한 알려진 적응증이 있는 약물입니다.

연관성 탭을 통해 사용자는 통계적 유의성 및 유전적 효과 크기별로 SNP 표현형 관계를 필터링할 수 있습니다. 유전적 효과 크기는 SNP 대립유전자가 없는 개인의 확률보다 특정 유전자형을 가진 개인에서 질병이 존재할 확률로 정의됩니다. 잠재력(potential) 탭 아래의 결과는 약물 및 질병 용어의 동시 발생을 포함하는 최소 5개의 medline 초록으로 필터링할 수 있습니다.

이 예에서 유전자 탭 아래의 모든 약물 결과는 원래 쿼리 용어에 해당하는 IL2RB 유전자를 대상으로 합니다. 마지막으로, 작용 탭에서 작용제로 필터링된 결과는 IL2RB 유전자에서 작용제로 작용하는 모든 약물을 반환합니다. 이 동영상을 시청한 후에는 RE:fine Drugs 도구를 사용하여 약물 재배치 가설을 생성하고 우선 순위를 지정하는 방법을 잘 이해하게 될 것입니다.