Single-cell Gene Expression Profiling Using FACS and qPCR with Internal Standards

Joshua R. Porter; William G. Telford; Eric Batchelor

doi:10.3791/55219

Journal

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유전학

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내부 기준에 FACS 및 qPCR에 사용 단일 세포 유전자 발현 프로파일 링

Single-cell Gene Expression Profiling Using FACS and qPCR with Internal Standards

JoVE 신문
유전학

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Single-cell Gene Expression Profiling Using FACS and qPCR with Internal Standards

내부 기준에 FACS 및 qPCR에 사용 단일 세포 유전자 발현 프로파일 링

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10:50 min

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February 25, 2017

DOI:

10.3791/55219-v

DOI:

10.3791/55219-v

•

10:50 min

February 25, 2017

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Joshua R. Porter¹, William G. Telford², Eric Batchelor¹

¹Laboratory of Pathology, Center for Cancer Research,National Cancer Institute, ²Experimental Transplantation and Immunology Branch, Center for Cancer Research,National Cancer Institute

내레이션 대본

Summary

We describe a method to sort single mammalian cells and to quantify the expression of up to 96 target genes of interest in each cell. This method includes the use of internal qPCR standards to enable the estimation of absolute transcript counts.

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Single-cell Gene Expression FACS QPCR Internal Standards Microfluidic Transcript Quantification RNA-Seq Cell Sorting Amplicon Neocarzinostatin Lysis Buffer E. Coli DNA Standards

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