Guided Protocol for Fecal Microbial Characterization by 16S rRNA-Amplicon Sequencing

Ayelet Di Segni; Tzipi Braun; Marina BenShoshan; Sarit Farage Barhom; Efrat Glick Saar; Karen Cesarkas; James E. Squires; Nathan Keller; Yael Haberman

doi:10.3791/56845

Journal

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생물학

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16S rRNA Amplicon 시퀀싱에 의해 배설물 미생물 특성화에 대 한 가이드 프로토콜

Guided Protocol for Fecal Microbial Characterization by 16S rRNA-Amplicon Sequencing

JoVE 신문
생물학

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JoVE 신문 생물학

Guided Protocol for Fecal Microbial Characterization by 16S rRNA-Amplicon Sequencing

16S rRNA Amplicon 시퀀싱에 의해 배설물 미생물 특성화에 대 한 가이드 프로토콜

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08:05 min

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March 19, 2018

DOI:

10.3791/56845-v

DOI:

10.3791/56845-v

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08:05 min

March 19, 2018

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Ayelet Di Segni¹, Tzipi Braun¹, Marina BenShoshan¹, Sarit Farage Barhom¹, Efrat Glick Saar¹, Karen Cesarkas¹, James E. Squires², Nathan Keller^1,3, Yael Haberman^1,4

¹Sheba Medical Center ²Children’s Hospital of Pittsburgh of UPMC ³Ariel University ⁴Cincinnati Children’s Hospital Medical Center

Summary

이 원고는 높은 처리량 16S rRNA amplicon 시퀀싱의 상세한 표준화 된 프로토콜을 설명합니다. 프로토콜은 데이터 분석을 통해 배설물 샘플 컬렉션에서 시작 하는 통합, 제복 및 가능한, 저렴 한 프로토콜을 소개 합니다. 이 프로토콜에는 많은 수의 엄격한 표준 샘플의 분석 및 여러 가지 컨트롤 수 있습니다.