2018년 8월 21일
여기 설명 양적 점 오 점 분석 (QDB)의 상세한 과정 대상된 단백질의 절대 내용을 확인 하 여 상한 걸 단백질, 3 개의 다른 마우스 조직에서 gelsolin 같은 (CAPG), 합니다. 높은 처리량, 세포 및 조직 수준에서 바이오 마커 검증에 대 한 편리 하 고, 양적 immunoblot 기술을 설명합니다.
이 방법은 현재 연구실과 임상 진단 분야에서 표준인 세포 및 조직 수준에서 단백질 함량의 전통적인 상대적 반정량적 정량화와 거리를 두기 위해 조직 수준에서 ELISA라고 불릴 수 있습니다. 이 기술의 주요 장점은 high-throughput, quantitative 및 absolute의 세 단어로 설명할 수 있습니다. 다른 단어를 덧붙이자면, 간단할 것입니다.
이 기술의 의미는 단백질체학 분야로 확장되는 반면 바이오마커의 검증은 고처리량 형식으로 달성할 수 있습니다. 이 방법은 연구 및 임상 분야 전반에 걸쳐 광범위하게 적용됩니다. 세포 및 조직 수준에서 단백질 양의 정량화는 현재로서는 여전히 원시적입니다.
일반적으로 이 방법을 처음 접하는 개인은 이 기술을 배우는 데 문제가 없으며 매우 기본적이며 수행하는 데 최소한의 실험실 기술이 필요합니다. 우리는 동물 모델을 사용하여 기술의 신뢰성, 단순성 및 정확성을 입증하게 되어 기쁩니다. 샘플은 MP40 또는 Triton과 같은 세제의 유무에 관계없이 연구실에서 일반적으로 사용되는 모든 용해 버퍼를 사용하여 기존의 샘플 준비 방법으로 준비할 수 X.In 당사의 경우 Triton X 용해 버퍼를 사용합니다.
1.5ml 튜브에 5-100mg의 조직 조각을 넣는다. 다음으로, 프로테아제 및 인산가수분해효소 억제제가 보충된 200마이크로리터의 용해 완충액을 추가합니다. 다음으로, 얼음 위에서 1분 동안 균질화기로 조직을 균질화합니다.
다음 8, 4 섭씨 온도에 g 곱하기 10 분 동안 표본을 분리기하십시오. 상층액을 새 튜브에 모으고 BCA 분석과 같은 단백질 측정 키트를 사용하여 단백질 용해물의 총 단백질 양을 측정하기 위해 1마이크로리터를 꺼냅니다. 섭씨 37도에서 30분 동안 배양한 다음 마이크로플레이트 리더에서 562나노미터의 흡광도를 측정합니다.
이 단계에서는, 표준으로 알려진 농도를 가진 재조합형 단백질을 사용하여, 12의 농도, 원액으로 마이크로리터 당 000 피코그램의 농도로 단백질을 묽게 하십시오. 한편, 준비된 샘플 용해물을 마이크로리터당 4마이크로그램으로 희석합니다. 보다 신뢰할 수 있는 결과를 얻으려면 개별 샘플 간의 차이를 방지하기 위해 샘플 용해물을 혼합하여 사용하는 것이 좋습니다.
일반적인 용량 연구를 위해 표준 단백질과 준비된 샘플을 모두 연속적으로 희석합니다. BSA는 각 샘플에 대해 거의 동일한 양의 단백질이 적재되도록 보충되었습니다. 그 후, 10마이크로리터의 연속으로 희석된 표준 단백질 또는 샘플 용해물을 10마이크로리터의 2X 로딩 버퍼와 혼합합니다.
그런 다음 혼합물을 섭씨 85도에서 5분 동안 가열합니다. 이 절차에서는 플레이트의 바닥이 테이블 표면에 닿지 않도록 QDB 플레이트 아래에 빈 피펫 팁 상자를 놓습니다. 최대 2마이크로리터의 샘플을 QDB 플레이트의 개별 장치 하단에 있는 멤브레인 중앙에 로드합니다.
적재하는 동안 QDB 플레이트의 바닥이 표면에 닿지 않도록 하고 개별 우물에 너무 많이 적재하지 마십시오. 우리의 경험에 따르면 우물당 4마이크로리터를 넘지 않습니다. 다음으로, 적재된 QDB 플레이트를 실온에서 1시간 동안 그대로 두거나 환기가 잘 되는 공간에서 섭씨 37도에서 15분 동안 적재된 상태로 두십시오.
플레이트를 막으려면 QDB 플레이트를 전송 버퍼에 담그고 10초 동안 부드럽게 흔듭니다. 그 후, TBST로 QDB 플레이트를 부드럽게 세 번 헹군 다음 TBST에서 5분 동안 지속적으로 흔들면서 플레이트를 세척합니다. 그 후, 지속적인 흔들림으로 1시간 동안 차단 버퍼로 QDB 플레이트를 차단합니다.
이제 차단 버퍼의 1차 항체를 선택한 농도로 희석하고 100마이크로리터를 일반 96웰 플레이트의 각 개별 웰에 추가합니다. QDB 플레이트를 96웰 플레이트에 삽입하고 결합된 플레이트를 실온에서 2시간 동안 또는 섭씨 4도에서 밤새 지속적으로 흔들어 배양합니다. 그 후, TBST로 플레이트를 세 번 부드럽게 헹구고 TBST로 세 번 씻으십시오.
다음으로, 선택한 농도의 차단 완충액에 있는 2차 항체를 희석하고 100마이크로리터를 96웰 플레이트의 각 웰에 분취합니다. 그런 다음 로드된 96웰 플레이트 내부의 QDB 플레이트를 실온에서 일정한 쉐이킹으로 1시간 동안 배양합니다. TBST로 QDB 플레이트를 세 번 부드럽게 헹군 다음 TBST로 5분씩 계속 흔들면서 플레이트를 세 번 세척합니다.
정량화를 위해 ECL 기질을 준비하고 웰당 100마이크로리터의 96웰 플레이트로 분취합니다. 그런 다음 QDB 플레이트를 96웰 플레이트 내부에 2분 동안 계속 흔들어 삽입합니다. 그런 다음 96웰 플레이트에서 QDB 플레이트를 제거하고 짧게 흔들어 여분의 액체를 제거합니다.
그런 다음 플레이트를 흰색 마이크로타이터 플레이트에 놓습니다. 다음으로, 정량화를 위해 결합된 플레이트를 마이크로플레이트 리더 내부에 배치하기 전에 마이크로플레이트 리더를 켜고 사용자 인터페이스에서 덮개가 있는 플레이트를 선택합니다. 실수를 방지하기 위해 덮개가 있는 플레이트를 선택해야 합니다.
이 그림은 웨스턴 블롯 분석을 통해 비장, 심장, 근육, 신장, 간 및 전립선에서 준비한 마우스 조직 용해물을 사용하여 토끼 항-CAPG 항체의 특이성을 보여줍니다. 전립선, 신장, 비장에서 준비된 용해물을 사용하고 정제된 재조합 CAPG 단백질 표준물질을 사용하여 토끼 항 CAPG 항체의 QDB 분석의 선형 범위를 정의했습니다. 결과는 평균 3배였습니다.
그리고 여기에 표시된 것은 쥐의 신장, 비장 및 전립선에서 준비된 용해물에서 CAPG 수치의 절대 측정입니다. 이 기술을 숙달하면 제대로 수행되면 4시간에서 24시간 안에 완료할 수 있습니다. 이 절차를 시도하는 동안 전체 절차에 대해 미리 결정된 특정 항체를 사용하는 것을 기억하는 것이 중요합니다.
이 절차에 따라 세포 또는 조직 수준에서 개별 단백질 함량의 절대 측정을 통해서만 달성할 수 있는 추가 질문에 답하기 위해 생물 통계 분석과 같은 다른 방법을 수행할 수 있습니다. 개발 이후 이 기술은 단백질체학 연구 분야의 연구자들이 인구 수준에서 다양한 질병과 단백질 바이오마커의 추정 관계를 탐구할 수 있는 길을 열었습니다. 이 비디오를 시청한 후에는 고처리량 형식으로 QDB 분석을 수행하는 방법을 잘 이해하게 될 것입니다.
사람이나 동물의 조직으로 작업하는 것은 매우 위험할 수 있으므로 이 절차를 수행하는 동안 항상 장갑 사용과 같은 예방 조치를 취해야 한다는 것을 잊지 마십시오.
이 기사는 다양한 마우스 조직에서 캡핑 액틴 단백질인 겔솔린-유사(CAPG)의 절대 함량을 결정하기 위한 정량적 도트 블럿 분석(QDB) 방법을 제시합니다. 이 기술은 높은 처리량, 단순성 및 정량적 정확성을 특징으로 하여 바이오마커 검증에 적합합니다.
Quantitative dot blot analysis (QDB) addresses a critical gap in proteomics by enabling absolute, high-throughput protein quantification at the tissue level, which is essential for biomarker validation and pathway verification. The method provides reliable, reproducible data that supports cross-study comparison and large-scale analysis, reducing mechanistic ambiguity in target validation. Its simplicity and minimal skill requirements facilitate enterprise-wide adoption across discovery and translational workflows.
QDB fits within the discovery continuum by providing absolute protein quantification that informs target validation, enables assay-ready screening, and supports translational continuity through reproducible, quantitative outputs.