Name: 루트 성장 및 지역화 된 양분에 응답을 시각화 하는 최적화 된 Rhizobox 프로토콜 (동영상) | JoVE Journal
Uploaded: 2018-10-22T15:00:00.000+00:00
Duration: 7 min 45 s
Description: 배우세요 투명 아크릴 리조박스를 이용해 옥수리 뿌리 성장을 비침습적으로 측정하는 방법을. 국소 영양소 패치에 대한 뿌리 가소성 반응을 반복 측정하며 비용 효율적인 연구가 가능합니다.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

저자 제 케이 힐 뿐만 아니라 그들의 의견에 대 한 익명 검토자와 rhizobox 프로토콜 개발에 대 한 초기 지침에 대 한 탄 바오를 인정 하 고 싶습니다. 음식과 농업 연구, 식품 및 농업, 농업 실험 역 프로젝트 캘리포니아-D-PLS-2332-H, ag는 하의 미국 농 무부 (USDA) 국립 연구소에 대 한 재단에 의해와 UC 데이비스 부 식물에 의해 제공 된 자금 화목 제를 통해 과학

<ol><li>Hodge, A. <a target="_blank" href="https://link.springer.com/chapter/10.1007/978-3-642-02167-1_12">Roots: The Acquisition of Water and Nutrients from the Heterogeneous Soil Environment.</a> Progress in Botany 71. , 307-337 (2010).</li>
<li>Grossman, J. D., Rice, K. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Evolution+of+root+plasticity+responses+to+variation+in+soil+nutrient+distribution+and+concentration%5BTitle%5D)+AND+%22Evolutionary+Applications%22%5BJournal%5D)">Evolution of root plasticity responses to variation in soil nutrient distribution and concentration.</a> Evolutionary Applications. 5 (8), 850-857 (2012).</li>
<li>Melino, V. J., Fiene, G., Enju, A., Cai, J., Buchner, P., Heuer, S. Genetic diversity for root plasticity and nitrogen uptake in wheat seedlings. Functional plant biology. , Available from:
 <a target="_blank" href="http://agris.fao.org/agris-search/search.do?recordID=US201600101375 ">http://agris.fao.org/agris-search/search.do?recordID=US201600101375 </a> (2015).</li>
<li>Zhang, H., Forde, B. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((An+Arabidopsis+MADS+box+gene+that+controls+nutrient-induced+changes+in+root+architecture%5BTitle%5D)+AND+%22Science%22%5BJournal%5D)">An Arabidopsis MADS box gene that controls nutrient-induced changes in root architecture.</a> Science. 279 (5349), 407-409 (1998).</li>
<li>Hodge, A., Stewart, J., Robinson, D., Griffiths, B. S., Fitter, A. H. <a target="_blank" href="https://besjournals.onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1046/j.1365-2745.2000.00434.x">Competition between roots and soil micro-organisms for nutrients from nitrogen-rich patches of varying complexity.</a> Journal of Ecology. 88 (1), 150-164 (2000).</li>
<li>Trachsel, S., Kaeppler, S. M., Brown, K. M., Lynch, J. P. <a target="_blank" href="https://link.springer.com/article/10.1007/s11104-010-0623-8">Shovelomics: high throughput phenotyping of maize (Zea mays L.) root architecture in the field.</a> Plant and Soil. 341 (1-2), 75-87 (2011).</li>
<li>Rogers, E. D., Monaenkova, D., Mijar, M., Nori, A., Goldman, D. I., Benfey, P. N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((X-ray+computed+tomography+reveals+the+response+of+root+system+architecture+to+soil+texture%5BTitle%5D)+AND+%22Plant+Physiology%22%5BJournal%5D)">X-ray computed tomography reveals the response of root system architecture to soil texture.</a> Plant Physiology. , (2016).</li>
<li>Groleau-Renaud, V., Plantureux, S., Guckert, A. <a target="_blank" href="https://www.infona.pl/resource/bwmeta1.element.elsevier-73516a4a-6de7-3a25-9f72-3c6f9b30e0d2">Effect of mechanical constraint on nodal and seminal root system of maize plants.</a> Comptes Rendus De L Academie Des Sciences Serie Iii-Sciences De La Vie-Life Sciences. 321 (1), 63-71 (1998).</li>
<li>Lin, Y., Allen, H. E., Di Toro, D. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Barley+root+hair+growth+and+morphology+in+soil%2C+sand%2C+and+water+solution+media+and+relationship+with+nickel+toxicity%5BTitle%5D)+AND+%22Environmental+Toxicology+and+Chemistry%22%5BJournal%5D)">Barley root hair growth and morphology in soil, sand, and water solution media and relationship with nickel toxicity.</a> Environmental Toxicology and Chemistry. 35 (8), 2125-2133 (2016).</li>
<li>Wenzel, W. W., Wieshammer, G., Fitz, W. J., Puschenreiter, M. <a target="_blank" href="https://link.springer.com/article/10.1023/A:1013395122730">Novel rhizobox design to assess rhizosphere characteristics at high spatial resolution.</a> Plant and Soil. 237 (1), 37-45 (2001).</li>
<li>Spohn, M., Carminati, A., Kuzyakov, Y. <a target="_blank" href="https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0038071712004725">Soil zymography - A novel in situ method for mapping distribution of enzyme activity in soil.</a> Soil Biology and Biochemistry. 58, 275-280 (2013).</li>
<li>Vollsnes, A. V., Futsaether, C. M., Bengough, A. G. <a target="_blank" href="https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1111/j.1365-2389.2010.01297.x">Quantifying rhizosphere particle movement around mutant maize roots using time-lapse imaging and particle image velocimetry.</a> European Journal of Soil Science. 61 (6), 926-939 (2010).</li>
<li>Hewitt, E. J. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aHewitt%2C+EJ+%22Sand+and+Water+Culture+Methods+Used+in+the+Study+of+Plant+Nutrition%22">Sand and Water Culture Methods Used in the Study of Plant Nutrition</a>. , Commonwealth Bureau. London. (1966).</li>
<li>Choudhary, M. I., Shalaby, A. A., Al-Omran, A. M. <a target="_blank" href="https://www.tandfonline.com/doi/abs/10.1080/00103629509369440">Water holding capacity and evaporation of calcareous soils as affected by four synthetic polymers.</a> Communications in Soil Science and Plant Analysis. 26 (13-14), 2205-2215 (1995).</li>
<li>Bakker, P. A. H. M., Berendsen, R. L., Doornbos, R. F., Wintermans, P. C. A., Pieterse, C. M. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+rhizosphere+revisited%3A+root+microbiomics%5BTitle%5D)+AND+%22Frontiers+in+Plant+Science%22%5BJournal%5D)">The rhizosphere revisited: root microbiomics.</a> Frontiers in Plant Science. 4, 2013(2013).</li>
<li>McNear, D. H. Jr <a target="_blank" href="https://www.thcfarmer.com/community/threads/roots-soil-and-everything-in-between.83844/">The Rhizosphere - Roots, Soil, and Everything In Between.</a> Nature Education Knowledge. 4 (3), 1(2013).</li>
<li>Ortas, I. <a target="_blank" href="https://www.tandfonline.com/doi/abs/10.1080/00103629709369914">Determination of the extent of rhizosphere soil.</a> Communications in Soil Science and Plant Analysis. 28 (19-20), 1767-1776 (1997).</li>
<li>UC Davis Stable Isotope Facility. Carbon (13C) and Nitrogen (15N) Sample Preparation. , Available from:
 <a target="_blank" href="https://stableisotopefacility.ucdavis.edu/13cand15nsamplepreparation.html">https://stableisotopefacility.ucdavis.edu/13cand15nsamplepreparation.html</a> (2018).</li>
<li>Barraclough, D. <a target="_blank" href="https://link.springer.com/chapter/10.1007/978-94-009-1706-4_19">15N isotope dilution techniques to study soil nitrogen transformations and plant uptake.</a> Fertilizer research. 42 (1-3), 185-192 (1995).</li>
<li>Belter, P. R., Cahill, J. F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Disentangling+root+system+responses+to+neighbours%3A+identification+of+novel+root+behavioural+strategies%5BTitle%5D)+AND+%22AoB+PLANTS%22%5BJournal%5D)">Disentangling root system responses to neighbours: identification of novel root behavioural strategies.</a> AoB PLANTS. 7, (2015).</li>
<li>Nagel, K. A., et al. <a target="_blank" href="http://www.publish.csiro.au/FP/FP12023">GROWSCREEN-Rhizo is a novel phenotyping robot enabling simultaneous measurements of root and shoot growth for plants grown in soil-filled rhizotrons.</a> Functional Plant Biology. 39 (11), 891-904 (2012).</li>
<li>Adu, M. O., Yawson, D. O., Bennett, M. J., Broadley, M. R., Dupuy, L. X., White, P. J. <a target="_blank" href="https://www.jstage.jst.go.jp/article/plantroot/11/0/11_16/_article/-char/ja/">A scanner-based rhizobox system enabling the quantification of root system development and response of Brassica rapa seedlings to external P availability.</a> Plant Root. 11, 16-32 (2017).</li>
<li>Neumann, G., George, T. S., Plassard, C. <a target="_blank" href="https://link.springer.com/article/10.1007/s11104-009-9953-9">Strategies and methods for studying the rhizosphere-the plant science toolbox.</a> Plant and Soil. 321 (1-2), 431-456 (2009).</li>
<li>Bodner, G., Alsalem, M., Nakhforoosh, A., Arnold, T., Leitner, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((RGB+and+Spectral+Root+Imaging+for+Plant+Phenotyping+and+Physiological+Research%3A+Experimental+Setup+and+Imaging+Protocols%5BTitle%5D)+AND+%22JoVE+%28Journal+of+Visualized+Experiments%29%22%5BJournal%5D)">RGB and Spectral Root Imaging for Plant Phenotyping and Physiological Research: Experimental Setup and Imaging Protocols.</a> JoVE (Journal of Visualized Experiments). (126), e56251-e56251 (2017).</li>
<li>Kuchenbuch, R. O., Ingram, K. T. <a target="_blank" href="https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1002/1522-2624(200210)165:5%3C573::AID-JPLN573%3E3.0.CO;2-W">Image analysis for non-destructive and non-invasive quantification of root growth and soil water content in rhizotrons.</a> Journal of Plant Nutrition and Soil Science. 165 (5), 573-581 (2002).</li>
<li>Dresbøll, D. B., Thorup-Kristensen, K., McKenzie, B. M., Dupuy, L. X., Bengough, A. G. <a target="_blank" href="https://link.springer.com/article/10.1007/s11104-013-1592-5">Timelapse scanning reveals spatial variation in tomato (Solanum lycopersicum L.) root elongation rates during partial waterlogging.</a> Plant and Soil. 369 (1-2), 467-477 (2013).</li>
<li>Wu, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((RhizoChamber-Monitor%3A+a+robotic+platform+and+software+enabling+characterization+of+root+growth%5BTitle%5D)+AND+%22Plant+Methods%22%5BJournal%5D)">RhizoChamber-Monitor: a robotic platform and software enabling characterization of root growth.</a> Plant Methods. 14 (1), 44(2018).</li>
<li>Rogers, S. W., Moorman, T. B., Ong, S. K. <a target="_blank" href="https://dl.sciencesocieties.org/publications/sssaj/abstracts/71/2/620">Fluorescent In Situ Hybridization and Micro-autoradiography Applied to Ecophysiology in Soil.</a> Soil Science Society of America Journal. 71 (2), 620-631 (2007).</li>
<li>Eickhorst, T., Tippkötter, R. <a target="_blank" href="https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0038071707002477">Detection of microorganisms in undisturbed soil by combining fluorescence in situ hybridization (FISH) and micropedological methods.</a> Soil Biology and Biochemistry. 40 (6), 1284-1293 (2008).</li>
<li>Spohn, M., Kuzyakov, Y. <a target="_blank" href="https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0038071713002800">Distribution of microbial- and root-derived phosphatase activities in the rhizosphere depending on P availability and C allocation - Coupling soil zymography with 14C imaging.</a> Soil Biology and Biochemistry. 67, 106-113 (2013).</li>
<li>Lv, G., Kang, Y., Li, L., Wan, S. <a target="_blank" href="https://link.springer.com/article/10.1007/s00271-009-0200-1">Effect of irrigation methods on root development and profile soil water uptake in winter wheat.</a> Irrigation Science. 28 (5), 387-398 (2010).</li>
<li>Asseng, S., Ritchie, J. T., Smucker, A. J. M., Robertson, M. J. <a target="_blank" href="https://link.springer.com/article/10.1023/A:1004317523264">Root growth and water uptake during water deficit and recovering in wheat.</a> Plant and Soil. 201 (2), 265-273 (1998).</li>
<li>Hernandez-Ramirez, G., et al. <a target="_blank" href="https://dl.sciencesocieties.org/publications/sssaj/abstracts/78/4/1392">Root Responses to Alterations in Macroporosity and Penetrability in a Silt Loam Soil.</a> Soil Science Society of America Journal. 78 (4), 1392-1403 (2014).</li>
<li>Zhang, Y. L., Wang, Y. S. <a target="_blank" href="https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1002016006600829">Soil enzyme activities with greenhouse subsurface irrigation.</a> Pedosphere. 16 (4), 512-518 (2006).</li>
<li>Robinson, D., Hodge, A., Griffiths, B. S., Fitter, A. H. <a target="_blank" href="http://rspb.royalsocietypublishing.org/content/266/1418/431.short">Plant root proliferation in nitrogen-rich patches confers competitive advantage.</a> Proceedings of the Royal Society of London B: Biological Sciences. 266 (1418), 431-435 (1999).</li>
<li>Lobet, G., Draye, X. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Novel+scanning+procedure+enabling+the+vectorization+of+entire+rhizotron-grown+root+systems%5BTitle%5D)+AND+%22Plant+Methods%22%5BJournal%5D)">Novel scanning procedure enabling the vectorization of entire rhizotron-grown root systems.</a> Plant Methods. 9, 1(2013).</li>
<li>Swarup, R., Wells, D. M., Bennett, M. J. <a target="_blank" href="https://www.taylorfrancis.com/books/9781439846490">Root Gravitropism.</a> Plant Roots: The Hidden Half. , (2013).</li>
<li>Smit, A. L., Bengough, A. G., Engels, C., van Noordwijk, M., Pellerin, S., van de Geijn, S. C. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aSmit%2C+AL+%22Root+Methods%3A+A+Handbook%22">Root Methods: A Handbook</a>. , Springer Science & Business Media. (2000).</li>
<li>van Dusschoten, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.plantphysiol.org/content/early/2016/01/04/pp.15.01388.abstract">Quantitative 3D Analysis of Plant Roots Growing in Soil Using Magnetic Resonance Imaging1[OPEN].</a> Plant Physiology. 170 (3), 1176-1188 (2016).</li>
<li>Metzner, R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Direct+comparison+of+MRI+and+X-ray+CT+technologies+for+3D+imaging+of+root+systems+in+soil%3A+potential+and+challenges+for+root+trait+quantification%5BTitle%5D)+AND+%22Plant+Methods%22%5BJournal%5D)">Direct comparison of MRI and X-ray CT technologies for 3D imaging of root systems in soil: potential and challenges for root trait quantification.</a> Plant Methods. 11, 17(2015).</li>
</ol>

저자는 공개 없다.

이 프로토콜에서 설명 하는 rhizoboxes 루트 및 rhizosphere 과학, 다양 한 질문에 대답 하 고 다양 한 사용 하 여 다른10,20,21,,2223 발견을 사용할 수 있습니다. , 24 , 25. 다른 연구자의 rhizoboxes21,,2526시간 경과 이미지 캡처한, 일부를 사용 하 여 자동화 시스템22...

종종 간과 되지만 그들의 지상에 비해 뿌리 역할을 중요 한 식물 영양소 인수에서. 루트 건설 및 유지 보수의 실질적인 탄소 비용을 감안할 때, 식물 뿌리만 구하고 투자 가치를 개발 하는 메커니즘을 진화 했다. 루트 시스템 수 있습니다 따라서 효율적이 고 동적으로 내 리소스 패치 핫스팟, 통풍 관, 그리고 더 전송1에 대 한 체 관 부에 급속 하 게 translocating 영양분의 upregulating 속도에 확산 하 여. 소성 응답 식물 종 또는 genotypes2,3 중 및5영양소 관련된4,화학 형태에 따라 크게 달라질 수 있습니다. 루트 소성에 변화는 또한, 이기종 토양 자원에 대 한 복잡 한 루트 응답 사육 및 농업에 영양소 이용 효율 증가를 관리 전략을 알릴 수 있는 이해 탐험 한다.
필요성 및 이해 플랜트 시스템에 대 한 관련성에도 불구 하 고 시각화 및 측정 관련 비늘에서 루트 소성 기술 도전 포즈. 일반적인 방법 이다 ("shovelomics"6) 토양에서 루트 크라운을 발굴 하지만 잘 뿌리 토양 집계, 사이 작은 구멍을 악용 그리고 발굴 필연적으로 어느 정도 이러한 연약한 뿌리의 손실의. 또한, 파괴적인 수확 하기가 불가능 한 루트 시스템에 변경 시간이 지남에 따라. 계산 하는 x 선 단층 촬영 등 현장에서 이미징 방법 높은 공간 해상도7, 뿌리와 토양 자원의 직접적인 시각화를 허용 하지만 비싸다 및 특수 장비가 필요. 수경 실험 토양에서 뿌리 추출와 관련 된 제약을 방지 하지만 루트 형태학 및 건축 기계 제약와 토양8,9의 생물 복잡성 수성 매체에서 다. 마지막으로, rhizosphere 프로세스 및 기능 발달가 소성이 인공 미디어에서와 통합 될 수 없습니다.
선물이 건설과 시간이 지남에 토양에 뿌리 성장을 하는 낮은-비용, 사용자 정의 방법으로 rhizoboxes (좁은, 일반 단면 사각형 컨테이너)의 사용에 대 한 프로토콜. 특별히 설계 된 프레임 gravitropism, 루트 길이 측정의 정확도 증가 때문에 후면 패널에 대 한 우선적으로 성장 하는 뿌리를 권장 합니다. Rhizoboxes는 일반적으로 루트 성장 및 rhizosphere 상호 작용10,,1112, 공부 하는 데 사용 됩니다 하지만 여기에 제시 된 방법 제공 단순 단일 구획 설계와 저렴 한 장점이 재료, 지역화 된 영양소에 대 한 루트 응답을 공부 하도록 설계 되었습니다. 그러나, 방법 또한 다양 한 내부/interspecies 경쟁 등 다른 루트와 rhizosphere 프로세스, 화합물, 미생물 또는 효소 활동의 공간 배급을 공부에 적응 수 있습니다. 여기, 우리는 패치 15N 표시 된 콩과 식물 잔류물 및 하이라이트 대표 결과의 rhizobox 메서드를 사용 하면 유효성 검사에 대 한 응답 genotypic 옥수수 하이브리드 차이 조사 합니다.

<table><tbody><tr><td>직경 1.27cm PVC 파이프</td><td>JM Eagle</td><td>530048</td><td>상자당 305cm, 프로토콜에 지정된 길이로 절단</td></tr><tr><td>PVC 측면 엘보우</td><td>Lasco</td><td>315498</td><td>상자당 2</td></tr>개 <tr><td>PVC 90도 엘보우</td><td>샬롯</td><td>PVC 02300 0600</td><td>상자당 4</td></tr>개 <tr><td>PVC T 조인트</td><td>샬롯</td><td>PVC 02402 0600</td><td>상자당 4</td></tr>개 <tr><td>압출 아크릴 판</td><td>TAP 플라스틱</td><td>상자당 N/A</td><td>2개, 두께 0.64cm x 너비 40.5cm x 길이 61cm</td></tr><tr><td>HDPE 스페이서(측면)</td><td>TAP 플라스틱</td><td>상자당 N/A</td><td>2개, 두께 0.64cm x 너비 2.5cm x 길이 57cm</td></tr><tr><td>HDPE 스페이서(하단)</td><td>TAP 플라스틱</td><td>상자</td><td>당 1개, 두께 0.64cm x 너비 2.5cm x 길이 40.5cm</td></tr><tr><td>HDPE 스페이서(패치)</td><td>TAP 플라스틱</td><td>상자당 N/A</td><td>2개, 0.64 cm 두께 x 3.8 cm 너비 x 28 cm 길이</td></tr><tr><td>폴리에스터 안솜</td><td>Fairfield</td><td>#A-X90</td><td>2.5 cm x 40.5 cm 상자당 스트립</td></tr><tr><td>20-스레드 나사</td><td>N/A</td><td>N/A</td><td>길이 3.2 cm, 지름 0.64 cm</td></tr><tr><td>와셔</td><td>N/</td><td>A N/A</td><td>내경 0.64 cm</td></tr><tr><td>육각 너트</td><td>N/A</td> N<td>/A</td><td>나사에 맞는 크기</td></tr><tr><td>빛 부족 직물</td><td>Americover, 주식회사</td><td>굵은 글씨체 8WB26.5</td><td>상자 당 너비 95cm, 길이 69cm 1개</td></tr><tr><td>Sand</td><td>Quikrete</td><td>No. 1113</td><td></td></tr><tr><td>필드 토양</td><td>해당</td><td>없음</td><td></td></tr> 추적<tr><td>용 투명 필름</td><td>FXN</td><td>FXNT1319100S</td><td>추적할 상자의 면당 1개</td></tr></tbody></table>

루트 성장 및 지역화 된 양분에 응답을 시각화 하는 최적화 된 rhizobox 프로토콜

An Optimized Rhizobox Protocol to Visualize Root Growth and Responsiveness to Localized Nutrients

뿌리는 악명 높게 공부 하기 어렵다. 토양은 둘 다 시각과 기계적 장벽, 어려운 추적 하 뿌리 제자리에 파괴적인 수확 또는 비싼 장비 없이. 우리는 시간이 지남에 루트 성장의 비 파괴적인 시각화 수 있으며 특히 패치 지역화 된 리소스에 대 한 응답에서 루트 소성 공부에 적합 하는 사용자 정의 하 고 저렴 한 rhizobox 메서드를 제시. 메서드는 15N 표시 된 콩과 식물 잔류물을 포함 하는 패치를 소성 응답에 옥수수 genotypic 변화를 평가 하 여 확인 했다. 메서드는 대표적인 발달 측정 시간이 지남에 얻을, 리소스를 포함 하 고 제어 패치 루트 길이 밀도 측정, 계산 하 루트 성장 속도, 식물 뿌리와 새싹에 의해 15N 복구 확인 설명. 장점, 주의 사항, 및 방법의 잠재적인 미래의 애플 리 케이 션도 설명 되어 있습니다. 실험 조건 루트 성장 데이터를 바이어스 되지 않습니다 않도록 주의 해야 합니다, 하지만 여기에 제시 된 rhizobox 프로토콜 세부 사항에 충분 한 주의 함께 실시 하는 경우 신뢰할 수 있는 결과 생성 합니다.

뿌리는 상자 뒷면에 대 한 우선적으로 성장 예상. 총은 400에서 상자의 앞에 93-758 cm에 비해 1956 cm에 배열 했다 상자 뒷면에 루트 길이 추적. 스캔된 루트 길이와 상자, 상자, 다시의 앞에 추적된 루트 길이 없음을 피어슨 상관 계수 계산 그리고 전면 및 후면의 합 여부 전체 루트 길이 반영 정확 하 게 추적 확인 하 사용 되었다 (n = 23, 한 상자에 공장 사망 실험 기간 동안). 스캔된 전체 루트 길이 크게 상자의 뒷면에 추적된 루트 길이와 상관 했다 (그림 5A, p = 0.0059), 상자 앞 (그림 5B, p = 0.022), 그리고 다시 앞의 합 (그림 5C, p = 0.0036). 따라서 주는 뿌리를 추적 하는 데 필요한 시간을 등분...

시각화 및 루트 성장에서 제자리에 매우 도전 이다. 우리는 루트 개발 및 영양 농축에 대 한 응답에서 시간이 지남에 확산을 추적 하는 사용자 정의 rhizobox 방법을 제시. 이 메서드는 루트 소성 유기 질소 소스에 대 한 응답에서에 옥수수 genotypic 차이 분석 하는 데 사용 됩니다.

루트 성장 및 지역화 된 양분에 응답을 시각화 하는 최적화 된 Rhizobox 프로토콜

Roots are notoriously difficult to study. Soil is both a visual and mechanical barrier, making it difficult to track roots in situ without destructive ...

이 방법은 뿌리가 영양소의 국소 패치에 어떻게 반응하는지와 같은 루트 및 류스피어 과학 분야의 주요 질문에 답하는 데 도움이 될 수 있습니다. 이 기술의 주요 장점은 토양에서 단일 루트 시스템의 반복적이고 비침습적 인 측정을 허용하지만 특수 장비를 필요로하지 않으며 상대적으로 저렴하다는 것입니다. 조립을 위해 Rhizobox의 부품을 수집합니다.여기에는 61cmx40cm정도의 명확한 아크릴로 만든 전면 및 후면 패널이 포함됩니다. 이 시점에서, 뒷면 패널의 상단에 측면과 하단 스페이서가 있다. 스페이서는 패널의 이전에 드릴된 구멍과 정렬됩니다.리조박스 의 바닥을 따라 갈 폴리 에스테르 패딩의 길이를 잘라. 패딩을 아래쪽 스페이서 바로 위에 놓아 누출을 방지합니다. 상단 패널을 스페이서에 배치하여 패딩을 제자리에 고정합니다.이제 하드웨어를 사용하여 Rhizobox를 조립합니다. 나사, 2개의 와셔, 각 구멍에 육각 너트를 사용합니다. 와셔를 전면 패널에 놓고 나사를 후면 패널로 조입니다.또 다른 와셔와 육소 너트. 토양 손실을 방지하기 위해 모든 나사가 매우 단단하도록 하십시오. 또한 두 개의 스페이서를 만들어 치료 및 제어 패치를 형성합니다.고밀도 폴리에틸렌 시트로 만들고 상단의 나사를 고정하여 부분 삽입만 허용합니다. 가벼운 부족과 열 감소를 위해 상자를 둘러싸일 수 있는 보호 케이스를 준비하십시오. 마지막으로, 뿌리가 뒤쪽 패널에 대해 성장하도록 장려하는 프레임을 구축합니다.이 PVC 프레임은 약 55도 각도로 상자를 유지합니다. 필드 토양과 모래의 균질화 혼합물을 준비하십시오. 각 Rhizobox에 대 한 기판 혼합물을 포함 하는 큰 가방으로 시작 합니다.처리 및 제어 패치를 위해 상자당 작은 지퍼 백 두 개를 라벨로 지정합니다. 스케일을 사용하고 토양 모래 기판의 30 그램의 무게. 기판을 컨트롤 백으로 옮기습니다.같은 방법으로, 트리트먼트 백에 기판 30 그램을 추가합니다. 그런 다음 1 그램의 질소 15 라벨질소 소스의 무게를 측정하고 치료 가방에 추가합니다. 기판과 질소 소스를 완전히 섞는다.하나의 Rhizobox와 함께 작동 하 고 그것은 패치 스페이서. 나사가 추가 움직임을 방지할 때까지 두 스페이서를 Rhizobox에 삽입합니다. 리조박스 측면에 있는 스페이서의 아래쪽 가장자리의 깊이를 표시합니다.그런 다음 다음 단계에 대한 스페이서를 제거합니다. 깔때기를 사용하여, 표시된 깊이에 기판의 큰

an-optimized-rhizobox-protocol-to-visualize-root-growth

Research

연구

JoVE Journal

Environment

환경

이 문서 RootChip의 Arabidopsis 모종 배양을위한 프로토콜, 미세한 루트 모니터링 및 세포내 신진 대사 단계의 걱정 기반의 측정과 성장 조건의 자동 제어를 결합한 microfluidic 이미징 플랫폼을 제공합니다.

RootChip를 사용하여 루트 환경의 신속한 조작과 Arabidopsis 루트 성장의 시간 저속 형광 이미징

이 프로토콜은 시중에서 구입할 수있는 평판 스캐너를 사용하여 중력 자극에 응답 애기 모종의 이미지를 신속하게 수집을위한 프로세스를 설명합니다. 방법은 다운 스트림 분석 알고리즘에 대한 의무 고해상도 이미지의 저렴한 대용량 포착을 허용한다.

애기 장대 루트 Gravitropic 응답의 고해상도 시간 경과 이미지를 수집하는 평판 스캐너를 사용하여

여기에는 높은 수치의 조리개 목적과 침지 매질로서의 퍼플 루오로 데칼린을 사용하여 최대 3 일 동안 뿌리 및 배축 발달의 고해상도 공 초점 저속 이미징을위한 간단한 기술이 제시됩니다.

뿌리와 배설물 개발의 장기 공 촛점 이미징을위한 단순한 챔버

이 문서에서는 기본 루트 및 루트 머리카락 하나의 광학 평면을 제한 하는 2 층 미세 플랫폼에서 애기 thaliana 묘 문화 하는 방법을 보여줍니다. 이 플랫폼은 다른 방법으로 고해상도 영상 뿐만 아니라 좋은 루트 형태학의 실시간 광학 영상에 대 한 사용할 수 있습니다.

2 층 미세 플랫폼에서 애기 모종의 루트 머리 형태를 이미징

실험 프로토콜은 RGB와 hyperspectral 화상 식물 루트 시스템을 성장 하는 토양의 평가 대 한 제공 됩니다. RGB 이미지 시간 시리즈 hyperspectral에서 chemometric 정보 검색의 조합 공장 루트 역학에 대 한 통찰력을 최적화 합니다.

RGB 및 식물 형질 및 생리 적 연구에 대 한 스펙트럼 루트 이미징: 실험적인 체제 및 프로토콜을 이미징

여기에서 우리는 종의 존재를 정량화하고 식물 뿌리의 초기 식민지 동안 다른 성장 환경으로의 전송 후 박테리아의 공간 분포를 시각화하는 수경 식물 성장 분석방법을 설명합니다.

부동 수경 시스템에서 애기장대 뿌리에 세균 식민지화 및 유지 보수 모니터링

이 프로토콜은 대량 분광화상 이미징과 결합된 박막(DGT)의 확산 그라데이션을 사용하여 다중 음순 무기 영양소 및 오염 물질 용성 종의 하위 mm 2D 시각화를 위한 워크플로우를 제공합니다. 솔루트 샘플링 및 고해상도 화학 분석은 지상 식물의 뿌리 부피에서 솔틸테의 정량적 매핑을 위해 자세히 설명된다.

토양의 2차원 시각화 및 래빌, 무기 식물 영양소 및 오염 물질의 정량화

여기에서, 우리는 향상된 화학탁증 분석 프로토콜을 제시합니다. 이 프로토콜의 목표는 전통적인 세균 화학 요법 방법의 단계와 비용을 줄이고 식물 미생물 상호 작용을 이해하는 데 중요한 자원역할을하는 것입니다.

루트 엑수데이트에서 뿌리 균 화학 물질의 신속 한 식별에 대 한 향상 된 화학 분석

우리는 간단한 실험실 도구를 사용하여 Arabidopsis 및 Medicago의 루트 시스템 아키텍처 (RSA)를 검사합니다. 묘목은 메쉬 위에 수경 재배되고 아트 브러시를 사용하여 RSA를 드러냅니다. 스캐닝 또는 고해상도 카메라를 사용하여 이미지를 촬영한 다음 ImageJ로 분석하여 특성을 매핑합니다.

플랜트 루트 시스템 아키텍처 특성을 매핑하기 위한 간단한 프로토콜

발전소에서 연소 가스는 조류의 성장을위한 저렴한 CO 2 소스입니다. 우리는 시스템 "재배 조류하는 배기 가스"프로토 타입을 구축하고 조류 재배 과정을 확장하는 방법을 설명했다. 우리는 클로렐라 (SP)의 성장을위한 연도 가스의 최적의 동작을 시뮬레이션하고 설계하는 대량 전송 바이오 반응 모델의 사용을 증명하고있다. 조류 사진 - 생물 반응기.

컴퓨터 시뮬레이션을 통해 광 바이오 반응기에서 미세 조류의 성장을 촉진하기 위해 연소 가스 설정을 최적화

배우세요 투명 아크릴 리조박스를 이용해 옥수리 뿌리 성장을 비침습적으로 측정하는 방법을. 국소 영양소 패치에 대한 뿌리 가소성 반응을 반복 측정하며 비용 효율적인 연구가 가능합니다.

루트 성장 및 지역화 된 양분에 응답을 시각화 하는 최적화 된 Rhizobox 프로토콜

더 많은 동영상 탐색