Name: 수 면과 운동 활동 멕시코 Cavefish에서의 자동화 된 측정 (동영상) | JoVE Journal
Uploaded: 2019-03-21T14:00:00.000+00:00
Duration: 5 min 10 s
Description: 학습하세요 멕시코 동굴어의 수면과 운동 활동을 자동화된 방법으로 정량화하는 기술을. 사회적 환경에서의 행동 변화를 분석하고 다양한 어류 종에 적용 가능한 연구 시스템을 활용하세요.

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참고: 애벌레와 성인 행동 추적을 위한 시스템을 설정 합니다.
1. 애벌레에 대 한 수 면 시스템 구축
참고: 적외선 (IR) 조명, 아크릴 IR 빛 확산 기를 포함 하 여 장비의 여러 조각을 자동 빛 추적 30 dpf A. mexicanus 통해 청소년 물고기 세 일 게시물 수정 (dpf)를 통해 애벌레에 대 한 모니터링 시스템 필요 컨트롤 (타이머), 컴퓨터, 카메라, 및 배선 및 전원 컨트롤러 (그림 1A) 등 보조 재료 다음 지침에 따라 정확 하 게 수 면에 애벌레 circadian 리듬 공부 하 고 운동 동작을 추적 하는 시스템을 구축 하는 방법을 알려드립니다 A. mexicanus.
<ol><li>IR 및 백색 발광 다이오드 (LED)로 구성 된 조명 시스템 구축: 30.5 c m x 30.5 c m 얇은 금속 플랫폼 방열판에 각각 삼각형 약 7.62 c m에서 3 개의 IR 빛을 배치. 전기 철사 시리즈에서 조명 와이어 그리고 전원에 연결 합니다.</li>
	<li>3 IR 빛의 센터에서 단일 백색 광 LED를 놓고 전원에 연결 합니다.</li>
	<li>LED 가벼운 타이머를 표준 circadian 시간 설정에 대 한 전원 공급 장치를 연결 합니다.</li>
	<li>애벌레 추적 시스템을 위한 플랫폼을 구성 합니다. 0.33 c m 두께 흰색 기호 아크릴을 사용 하 여 모든 플랫폼의 구성 요소에 대 한.</li>
	<li>행동 추적 중는 경기장에 있는 것입니다 물고기를 포함 하는 조명된 평방 방열판 위에 기록 플랫폼을 놓습니다.</li>
	<li>
두 번째 아크릴 조명과 최적의 조명 및 대비 IR 확산 동물 사이 상자 안에 놓습니다. 참고: 애벌레 라이트 박스에 대 한 치수는 다음과 같습니다: 두 18 cm x 8.5 cm 및 2 개의 17 cm x 8.5 c m Led는 화학적 형태는 18 cm x 18 cm에 함께 보 세 광장 즉 8.5 c m 높이. 또한, 아크릴 컷 또는 사용자 지정된 크기 조정에 대 한 적절 한 도구를 사용 하 여 드릴에 쉽게 있을 수 있습니다.<ol>
<li>전체 애벌레 추적 단계와 동봉 된 플라스틱 튜브, 내 조명 설치 놓고 튜브 위에 카메라를 위치 합니다. 참고: 그것은이 추적 정확도 손상 것으로 추적 비디오에 나타나지 않도록 조명 반사를 유지 하는 것이 중요입니다. 플랫폼을 둘러싸는 튜브 위에 카메라의 배치 조명과이 실험에 사용 되는 카메라에 대 한 선명도 향상 시킵니다.</li>
	</ol>
</li>
	<li>웹캠을 조작 ( 재료의 표참조) IR 기반 녹음. 회전 도구를 사용 하 여 제조 업체 렌즈 제거 ( 재료의 표참조).</li>
	<li>내부 틀을 제거 하려면 카메라의 뒷면 양쪽에 작은 은색 나사를 제거 합니다.</li>
	<li>카메라 렌즈의 나머지를 풀고 몸 안에 작은 검정색 나사를 제거 합니다. 작은 드라이버를 사용 하 여 렌즈를 절단 후 남아 있는 렌즈의 어떤 부분을 제거.</li>
	<li>제거는 블루 LED는 충전의 상단 부분에 결합 장치 (CCD) 주택.</li>
	<li>그것의 원래 방향으로 다시 내 면 주택 배치 및 그들의 원래 위치로 다시 두 개의 은색 나사를 속이 고 다시 카메라를 함께 넣어.</li>
	<li>경로 사용 하 여 작은 카메라의 내부는 둥근된 플라스틱 라우팅 비트에 맞게 보았다. 여분의 플라스틱 렌즈 어댑터 들어갈 수 때까지 아래로 부드러운.</li>
	<li>카메라와 직접 접촉 하지 않고 가능한 CCD에 가까운 카메라 안에 IR-패스 필터를 설치 합니다. 참고: 알아서 하지 하우징 내에서 카메라의 CCD 칩 손상. 절단 가능한 수준 유지 해야 합니다. IR 필터의 외부와 필터링 없이 CCD에 도달에서 빛을 계속 카메라의 본문 사이 모든 열린 공간을 봉인.</li>
	<li>35mm 고정 렌즈에 카메라를 연결할 ( 재료의 표참조) 렌즈의 뒷면에 카메라의 전면 어댑터를 속이 고 여.</li>
	<li>카메라와 렌즈 무대 및 조명 튜브 위에 뚜껑으로 교 련된 구멍에 놓고 동물에서 기록 될 것입니다 컴퓨터에 USB를 연결 합니다. 참고: 주식 물고기 행동 녹음 하는 동안 최소한의 중단을 보장 하기 위해 보관은 별개 행동 방에 물고기를 놓습니다. 온도 환기는 행동 실험을 혼동 수 있는 동요를 최소화 하기 위해 주의.</li>
</ol>2. 성인을 위한 시스템 자
<ol><li>약 46 cm 간격으로 IR 스트립을 절단 하 여 성인 물고기를 추적 하기 위한 적외선 조명 시스템을 구성 합니다. 1 46 cm 스트립은 각 10 L 동작 탱크에 대 한 충분 합니다.</li>
	<li>각 스트립 DC 전기 와이어를 납땜 일련에 함께 각 스트립 와이어 그리고 9 V 전원에 연결 합니다.</li>
	<li>각 IR 스트립 알루미늄 열 싱크 역할의 51 cm x 5.1 c m 조각에 연결 합니다.</li>
	<li>46 cm x 5 cm, 0.32 cm 두께 9% 빛 통과 흰색 기호 아크릴 시트 IR 확산 각 IR 빛 스트립 앞 직접 빛 장소.</li>
	<li>랙 IR 조명 후면 마운트를 지 원하는 모든 탱크를 배치 합니다.</li>
	<li>10 L 유리 탱크의 불투명 플라스틱 분배기를 사용 하 여 개별 경기장을 만들. 참고: 경기장 크기 사용 분할자의 수와 탱크의 크기에 따라 다양 한 수 있습니다. 경기장 크기 운동 활동 및 동굴에 표면 물고기23수 면에 미치는 영향.</li>
	<li>카메라 탱크에서 약 4-6 m를 탑재 합니다. 각 카메라 수 있습니다 추적에 대 한 충분 한 해상도 제공 하기 위해 한 번에 3 탱크에서 일반적으로 기록 된다. 참고: 성인 행동 녹음은 일반적으로 하루 밤 변화를 제어 하는 별도 흰색 조명 시스템을 필요 하지 않습니다. 단순히 타이머에 연결 하는 행동 방에 표준 오버 헤드 조명 활용 충분할 것입니다.</li>
</ol>3. 녹화 운동 활동
참고: 모든 행동 기록 백업 배터리 소스와 표준 노트북 컴퓨터 또는 데스크탑을 사용 하 여 만들어집니다. 24 h (60-100 기가바이트) 녹음 큰 파일 크기 때문에 외장 하드 드라이브에 모든 녹음을 저장 합니다.
<ol><li>물고기 4-30 세 dpf 녹음을 시작 하기 전에 18-24 h에 대 한 적응 처음 배치 녹음 실에서 녹음을 시작 하기 전에 1 시간 때 라이브 소금물 새우 애벌레 물고기를 먹이. 적응 성인 물고기 기록 동작 하기 전에 4-5 일 하 고 일단 매일 찌 질 음식 또는 라이브 blackworms 피드. 참고: 반드시 기록, 전에 민물에서 애벌레 물고기를 배치로 남은 소금물 새우는 나중에 분석 하는 동안 추적 문제를 일으킬 것입니다. 그들의 소형 추적 방해 하지 않습니다 rotifers와 공동 경작 한 대체 옵션을 제공 합니다.</li>
	<li>장소 물고기 24-잘 조직 문화 접시에 4-6 dpf 세. 집 물고기 기록에 대 한 12 음 조직 문화 접시에 20-30 dpf 세.</li>
	<li>10 L 탱크에 기록 성인 5 개별적으로 지 내게 물고기에 맞게 분배자 또는 기록 수 면과 사회 환경에서 활동 하는 분배자 없이 잘 맞습니다. 참고: 추적 정확도 극대화 하기 위해 녹음을 시작 하기 전에 카메라를 집중 하는 것을 주의. 카메라 렌즈의 조리개를 열지 마십시오 너무 멀리, 이미지의 선명도 대폭 줄어들 것입니다. 그러나 균형, 있다; 조리개를 너무 멀리 닫힌 경우 비디오의 프레임 속도 15.00 fps 아래 떨어질 것 이다. 프레임 속도 일부 사용자 작성 수 면 스크립트23,24와 함께 사용 하기 위해 s 당 15.00 프레임 남아 나중에 분석을 위해 필수적 이다.</li>
	<li>배경 조명과 조명/밝기를 설정 합니다.</li>
	<li>녹음의 시작에 앞서 조명 최적화. 항상 가능한 가장 높은 수준에서 대비를 유지 하 고 동물 들이 가장 명확한 때까지 밝기를 조정 하려면 밝기 및 배경 조명 사용.</li>
	<li>24 또는 48 h에 대 한 기록 물고기입니다. 참고: 정전 시 비상 백업 배터리 팩을 모든 조명, 컴퓨터, 및 카메라 구입할 수 있습니다. 모든 배터리 팩 한다 또한에 연결 비상 전원 콘센트, 가능한 경우. 배터리 팩 일반적으로 하지 시간 보다 몇 분에 대 한 장비를 대부분 전원 되며 다리 사이 지는 주 전원 및 비상 전원 시스템에 전송 하는 역할.</li>
</ol>4. 개별적으로 보관 되어 물고기를 사용 하 여 자동 추적 소프트웨어에서 운동 활동의 분석
<ol><li>행동의 분석을 시작 하려면 열 추적 소프트웨어, 서식 파일에서 새 실험, 다음 선택 미리 정의 된 서식 파일을 적용.</li>
	<li>프로그램이 지금 어떤 종 추적을 요청,으로 생선을 선택 합니다. 드롭다운 상자를 사용 하 여 어느 Zebrafish 애벌레 Zebrafish 성인 따라 실험 패러다임의 선택.</li>
	<li>있는 각 동물을 추적 것입니다 경기장을 설정 합니다. 애벌레, 잘 플레이트 라운드 잘 , 아니 영역 서식 파일을 선택 합니다. 성인을 위한, 아니 영역 템플릿을사용 하 여 오픈 필드, 광장을 사용 합니다. 다음 경기장, 하나는 비디오에 추적 되 고 각 동물에 대 한 적절 한 수를 결정 합니다.</li>
	<li>최적의 추적에 대 한 모델을 선택, 클릭 추적 센터 포인트, 동물 색상을 배경 보다 어두운 것을 선택 해야 하 고. 비디오 구입한 프레임 속도 적용 합니다. 추적 소프트웨어는 자동으로이 감지 한다.</li>
	<li>아레나 설정을사용 하 여 물고기의 운동 동작을 정확 하 게 결정 하는 개체의 실제 거리를 보정 하기 위해 규모를 그립니다.</li>
	<li>그 물고기에 있는 전체 영역을 추적 됩니다; 되도록 무대 편집 그렇지 않으면 샘플 중에 손실 될 것입니다. 참고: 영역을 설정할 때 주의 사용 합니다. 애벌레 물고기는 특히 민감한 경우는 경기장에 너무 큰 또는 작은 오류를 추적 하는. 나쁜 조명 실험에 잘 접시, 생각 하는 프로그램 있습니다 가양성을 생성 하는 동물의 벽에 그림자를 만들 수도 있습니다.</li>
	<li>고급클릭 하십시오. 검색설정에서 방법 동적 빼기, 다음 배경 을 클릭 선택 하 고 시작 학습. 동물, 추적 하 고 배경 이동 추적 발생 하지 때까지 어두운 대비 신호/잡음 비율을 조정 합니다. 참고: 비디오 품질 실험, 각 재판 그에 따라 다른 설정을 사용 해야 할 수도 있습니다 그래서 사이 달라질 수 있습니다. 주제 윤곽 및 제목 크기 기능을 사용 하 여 추적 결과 크게 향상 시킬 수 있습니다.</li>
	<li>재판 목록 선택한 프로그램에 데이터를 기록 하기 시작 하기 전에 적절 한 매개 변수를 로드 합니다.</li>
	<li>인수 탭을 클릭 합니다, 그리고 트랙 모든 계획 재판 을 선택 하 고 레코드 버튼을 클릭 합니다.</li>
	<li>프로 파일 분석에서 거리 및 시간 이동 선택 되어 있는지 확인 합니다. 참고: 나중에 수 면 분석에서 그것은 중요 이러한 설정이 올바른지는.perl으로 파일 수를 계산 하는 올바른 순서에 이러한 데이터를 읽어야 합니다.</li>
	<li>수출, 원시 데이터선택에서 유니코드 텍스트 데이터를 내보낼.</li>
</ol>5. 추적 사회적으로 물고기를 지 내게
<ol><li>4.1-4.4 추적 소프트웨어에서 실험을 설정 하려면 단계.</li>
	<li>드롭다운 메뉴에서 얼마나 많은 동물 실험에 대 한 추적을 선택 합니다.</li>
	<li>무대 설정에서 실제 거리를 보정 하기 위해 정확한 규모를 그립니다.</li>
	<li>검색 설정에서 동적 빼기를 사용 하 고 최고의 동물을 추적 하는 어두운 대비를 조정 합니다.</li>
	<li>동물의 아주 작은 부분만 추적 탐지 설정에서 제목 크기를 조정 합니다. 참고: 동물의 단지 작은 부분을 추적 하 여이 동물 중 경로 교차 하는 경우 전환의 양을 줄어 듭니다.</li>
	<li>트랙 획득 되 면 트랙 편집기 를 사용 하 여 수동으로 수정 시간 물고기 경로 교차 수 있습니다.</li>
</ol>6. 운동 활동에서 수 면 데이터의 추출
참고: 애벌레와 성인 A. mexicanus 수 면 행동 정의 1 분 이상 정지. 이 정의 큰 감각 자극은 수 면 상태에서 행동 응답 시작 해야 흥분을 일으키는 임계값 실험을 사용 하 여 결정 되었다 (> 60 s) 깨어 있는14,17에 비해. 작은 움직임과 떠도는 일반적인 물고기 종, 거기에 대 한 계정에 속도 임계값에 적용 잡음 또는 드리프트에서 실제 움직임을 분리. 이러한 임계값은 계산 파생 된 거리 및 가장 높은 R-제곱 값; 찾을 수 면 기간 사이의 상관 관계를 비교 하 여 따라서 운동과 수 면에 대 한 가장 정확한 속도 결정합니다. 애벌레의 물고기에 대 한 위와 더 낮은 한계는 모두 12 m m/s 만큼은 거의 아무 드리프트. 성인 물고기에 대 한 하한값 2 cm/s 드리프트에 대 한 계정에 4 cm/s의 상한값입니다.
<ol><li>운동 추출 및 동작 자 사용자 작성 스크립트의 실행을 수행 하는 분석 컴퓨터에 Cygwin을 설치 합니다.</li>
	<li>Cygwin 홈 디렉토리 내의 새로운 실험 폴더를 만듭니다.</li>
	<li>추적 소프트웨어에서 원시 유니코드 데이터를 가져올 하 고 u t F-16에서 인코딩을 u t F-8로 변환 하는 Cygwin에서.sh 파일을 실행 합니다.</li>
	<li>수 면 데이터를 추출 하는 Cygwin에서.perl 파일을 실행 합니다.</li>
	<li>매크로 파일을 열고 원하는 대로 데이터 분석을 마무리 하는 스프레드시트 내에서 지침에 따라. 참고: 명령줄 코딩의 기본적인 수준을 분석의이 부분을 수행 하는 데 필요한 것입니다. 일반 리눅스 명령 충분 합니다. 데이터를 제대로 읽을 프로그램에 문제가 있다면 인코딩 소프트웨어를 자유롭게 사용할 수 있는 텍스트 편집기에서를 확실 하 게 추적에서 데이터를 확인 하 고 순서는 제대로 작성 하는 실행 파일에 대 한 올바른.</li>
</ol>

<ol><li>Keene, A. C., Duboue, E. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+origins+and+evolution+of+sleep%5BTitle%5D)+AND+%22The+Journal+of+Experimental+Biology%22%5BJournal%5D)">The origins and evolution of sleep.</a> The Journal of Experimental Biology. , (2018).</li>
<li>Joiner, W. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Unraveling+the+Evolutionary+Determinants+of+Sleep%5BTitle%5D)+AND+%22Current+Biology%22%5BJournal%5D)">Unraveling the Evolutionary Determinants of Sleep.</a> Current Biology. 26 (20), R1073-R1087 (2016).</li>
<li>Allada, R., Siegel, J. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Unearthing+the+phylogenetic+roots+of+sleep%5BTitle%5D)+AND+%22Current+biology%22%5BJournal%5D)">Unearthing the phylogenetic roots of sleep.</a> Current biology. 18, R670-R679 (2008).</li>
<li>Sehgal, A., Mignot, E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Genetics+of+sleep+and+sleep+disorders%5BTitle%5D)+AND+%22Cell%22%5BJournal%5D)">Genetics of sleep and sleep disorders.</a> Cell. 146, 194-207 (2011).</li>
<li>Campbell, S. S., Tobler, I. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Animal+sleep%3A+a+review+of+sleep+duration+across+phylogeny%5BTitle%5D)+AND+%22Neuroscience+and+Biobehavioral+Reviews%22%5BJournal%5D)">Animal sleep: a review of sleep duration across phylogeny.</a> Neuroscience and Biobehavioral Reviews. 8, 269-300 (1984).</li>
<li>Raizen, D. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Lethargus+is+a+Caenorhabditis+elegans+sleep-like+state%5BTitle%5D)+AND+%22Nature%22%5BJournal%5D)">Lethargus is a Caenorhabditis elegans sleep-like state.</a> Nature. 451, 569-572 (2008).</li>
<li>Geissmann, Q., Rodriguez, L. G., Beckwith, E. J., French, A. S., Jamasb, A. R., Gilestro, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Ethoscopes%3A+An+Open+Platform+For+High-Throughput+Ethomics%5BTitle%5D)+AND+%22bioRxiv%22%5BJournal%5D)">Ethoscopes: An Open Platform For High-Throughput Ethomics.</a> bioRxiv. , 113647(2017).</li>
<li>Garbe, D. S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Context-specific+comparison+of+sleep+acquisition+systems+in+Drosophila%5BTitle%5D)+AND+%22Biology+Open%22%5BJournal%5D)">Context-specific comparison of sleep acquisition systems in Drosophila.</a> Biology Open. 4 (11), (2015).</li>
<li>Branson, K., Robie, A. A., Bender, J., Perona, P., Dickinson, M. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((High-throughput+ethomics+in+large+groups+of+Drosophila%5BTitle%5D)+AND+%22Nature+Methods%22%5BJournal%5D)">High-throughput ethomics in large groups of Drosophila.</a> Nature Methods. 6 (6), 451-457 (2009).</li>
<li>Gilestro, G. F., Cirelli, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((PySolo%3A+A+complete+suite+for+sleep+analysis+in+Drosophila%5BTitle%5D)+AND+%22Bioinformatics%22%5BJournal%5D)">PySolo: A complete suite for sleep analysis in Drosophila.</a> Bioinformatics. 25, 1466-1467 (2009).</li>
<li>Swierczek, N. A., Giles, A. C., Rankin, C. H., Kerr, R. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((High-throughput+behavioral+analysis+in+C.+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22Nature+Methods%22%5BJournal%5D)">High-throughput behavioral analysis in C. elegans.</a> Nature Methods. 8 (7), 592-598 (2011).</li>
<li>Branson, K., Robie, A. A., Bender, J., Perona, P., Dickinson, M. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((High-throughput+ethomics+in+large+groups+of+Drosophila%5BTitle%5D)+AND+%22Nature+Methods%22%5BJournal%5D)">High-throughput ethomics in large groups of Drosophila.</a> Nature Methods. 6, 451-457 (2009).</li>
<li>Rihel, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Zebrafish+behavioral+profiling+links+drugs+to+biological+targets+and+rest%2Fwake+regulation%5BTitle%5D)+AND+%22Science+%28New+York%2C+N.Y.%29%22%5BJournal%5D)">Zebrafish behavioral profiling links drugs to biological targets and rest/wake regulation.</a> Science (New York, N.Y.). 327, 348-351 (2010).</li>
<li>Yoshizawa, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Distinct+genetic+architecture+underlies+the+emergence+of+sleep+loss+and+prey-seeking+behavior+in+the+Mexican+cavefish%5BTitle%5D)+AND+%22BMC+Biology%22%5BJournal%5D)">Distinct genetic architecture underlies the emergence of sleep loss and prey-seeking behavior in the Mexican cavefish.</a> BMC Biology. 13, (2015).</li>
<li>Chiu, C. N., Prober, D. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Regulation+of+zebrafish+sleep+and+arousal+states%3A+current+and+prospective+approaches%5BTitle%5D)+AND+%22Frontiers+in+Neural+Circuits%22%5BJournal%5D)">Regulation of zebrafish sleep and arousal states: current and prospective approaches.</a> Frontiers in Neural Circuits. 7 (April), 58(2013).</li>
<li>Elbaz, I., Foulkes, N. S., Gothilf, Y., Appelbaum, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Circadian+clocks%2C+rhythmic+synaptic+plasticity+and+the+sleep-wake+cycle+in+zebrafish%5BTitle%5D)+AND+%22Frontiers+in+Neural+Circuits%22%5BJournal%5D)">Circadian clocks, rhythmic synaptic plasticity and the sleep-wake cycle in zebrafish.</a> Frontiers in Neural Circuits. 7, (2013).</li>
<li>Duboué, E. R., Keene, A. C., Borowsky, R. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Evolutionary+convergence+on+sleep+loss+in+cavefish+populations%5BTitle%5D)+AND+%22Current+Biology%22%5BJournal%5D)">Evolutionary convergence on sleep loss in cavefish populations.</a> Current Biology. 21, 671-676 (2011).</li>
<li>Beale, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Circadian+rhythms+in+Mexican+blind+cavefish+Astyanax+mexicanus+in+the+lab+and+in+the+field%5BTitle%5D)+AND+%22Nature+Communications%22%5BJournal%5D)">Circadian rhythms in Mexican blind cavefish Astyanax mexicanus in the lab and in the field.</a> Nature Communications. 4, 2769(2013).</li>
<li>Keene, A. C., Yoshizawa, M., McGaugh, S. E. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aKeene%2C+AC+%22Biology+and+Evolution+of+the+Mexican+Cavefish%22">Biology and Evolution of the Mexican Cavefish</a>. , (2015).</li>
<li>Jeffery, W. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Regressive+evolution+in+Astyanax+cavefish%5BTitle%5D)+AND+%22Annual+Review+of+Genetics%22%5BJournal%5D)">Regressive evolution in Astyanax cavefish.</a> Annual Review of Genetics. 43, 25-47 (2009).</li>
<li>Gross, J. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+complex+origin+of+Astyanax+cavefish%5BTitle%5D)+AND+%22BMC+Evolutionary+Biology%22%5BJournal%5D)">The complex origin of Astyanax cavefish.</a> BMC Evolutionary Biology. 12, 105(2012).</li>
<li>Aspiras, A., Rohner, N., Marineau, B., Borowsky, R., Tabin, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Melanocortin+4+receptor+mutations+contribute+to+the+adaptation+of+cavefish+to+nutrient-poor+conditions%5BTitle%5D)+AND+%22Proceedings+of+the+National+Academy+of+Sciences%22%5BJournal%5D)">Melanocortin 4 receptor mutations contribute to the adaptation of cavefish to nutrient-poor conditions.</a> Proceedings of the National Academy of Sciences. 112 (31), 9688(2015).</li>
<li>Jaggard, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+lateral+line+confers+evolutionarily+derived+sleep+loss+in+the+Mexican+cavefish%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Experimental+Biology%22%5BJournal%5D)">The lateral line confers evolutionarily derived sleep loss in the Mexican cavefish.</a> Journal of Experimental Biology. 220 (2), (2017).</li>
<li>Jaggard, J. B., Stahl, B. A., Lloyd, E., Prober, D. A., Duboue, E. R., Keene, A. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Hypocretin+underlies+the+evolution+of+sleep+loss+in+the+Mexican+cavefish%5BTitle%5D)+AND+%22eLife%22%5BJournal%5D)">Hypocretin underlies the evolution of sleep loss in the Mexican cavefish.</a> eLife. , e32637(2018).</li>
<li>Hinaux, H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+Developmental+Staging+Table+for+Astyanax+mexicanus+Surface+Fish+and+Pacho+%C2%B4n+Cavefish%5BTitle%5D)+AND+%22Zebrafish%22%5BJournal%5D)">A Developmental Staging Table for Astyanax mexicanus Surface Fish and Pacho ´n Cavefish.</a> Zebrafish. 8 (4), 155-165 (2011).</li>
<li>Bill, B. R., Petzold, A. M., Clark, K. J., La Schimmenti,, Ekker, S. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+primer+for+morpholino+use+in+zebrafish%5BTitle%5D)+AND+%22Zebrafish%22%5BJournal%5D)">A primer for morpholino use in zebrafish.</a> Zebrafish. 6 (1), 69-77 (2009).</li>
<li>Bilandzija, H., Ma, L., Parkhurst, A., Jeffery, W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+potential+benefit+of+albinism+in+Astyanax+cavefish%3A+downregulation+of+the+oca2+gene+increases+tyrosine+and+catecholamine+levels+as+an+alternative+to+melanin+synthesis%5BTitle%5D)+AND+%22Plos+One%22%5BJournal%5D)">A potential benefit of albinism in Astyanax cavefish: downregulation of the oca2 gene increases tyrosine and catecholamine levels as an alternative to melanin synthesis.</a> Plos One. 8 (11), e80823(2013).</li>
<li>Yokogawa, T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Characterization+of+sleep+in+zebrafish+and+insomnia+in+hypocretin+receptor+mutants%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+Biology%22%5BJournal%5D)">Characterization of sleep in zebrafish and insomnia in hypocretin receptor mutants.</a> PLoS Biology. 5, 2379-2397 (2007).</li>
<li>Appelbaum, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Sleep-wake+regulation+and+hypocretin-melatonin+interaction+in+zebrafish%5BTitle%5D)+AND+%22Proceedings+of+the+National+Academy+of+Sciences+of+the+United+States+of+America%22%5BJournal%5D)">Sleep-wake regulation and hypocretin-melatonin interaction in zebrafish.</a> Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 106, 21942-21947 (2009).</li>
<li>Singh, C., Oikonomou, G., Prober, D. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Norepinephrine+is+required+to+promote+wakefulness+and+for+hypocretin-induced+arousal+in+zebrafish%5BTitle%5D)+AND+%22eLife%22%5BJournal%5D)">Norepinephrine is required to promote wakefulness and for hypocretin-induced arousal in zebrafish.</a> eLife. 4 (September), (2015).</li>
<li>Elipot, Y., Hinaux, H., Callebert, J., Rétaux, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Evolutionary+shift+from+fighting+to+foraging+in+blind+cavefish+through+changes+in+the+serotonin+network%5BTitle%5D)+AND+%22Current+Biology%22%5BJournal%5D)">Evolutionary shift from fighting to foraging in blind cavefish through changes in the serotonin network.</a> Current Biology. 23 (1), 1-10 (2013).</li>
<li>Bell, M. A., Foster, S. A. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aBell%2C+MA+%22The+evolutionary+biology+of+the+threespine+stickleback%22">The evolutionary biology of the threespine stickleback</a>. 584, Oxford University Press. Available from:
 <a target="_blank" href="http://books.google.com/books?hl=de&lr=&id=uxC0lN-Z3FIC&pgis=1">http://books.google.com/books?hl=de&lr=&id=uxC0lN-Z3FIC&pgis=1</a> (1994).</li>
<li>Seehausen, O. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((African+cichlid+fish%3A+a+model+system+in+adaptive+radiation+research%5BTitle%5D)+AND+%22Proceedings+of+Biological+Sciences%2FThe+Royal+Society%22%5BJournal%5D)">African cichlid fish: a model system in adaptive radiation research.</a> Proceedings of Biological Sciences/The Royal Society. 273 (1597), 1987-1998 (1597).</li>
<li>Basolo, A. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Female+preference+predates+the+evolution+of+the+sword+in+swordtail+fish%5BTitle%5D)+AND+%22Science%22%5BJournal%5D)">Female preference predates the evolution of the sword in swordtail fish.</a> Science. 250, 808-810 (1990).</li>
</ol>

저자 들은 아무 경쟁 관심사를 선언 합니다.

이 프로토콜에서는 측정 수 면과 운동 활동 애벌레와 성인 cavefish에 대 한 사용자 지정 시스템을 설명 합니다. Cavefish는 수 면 수 면 규칙1의 유전과 신경 기초를 조사 하는 데 사용할 수 있습니다의 진화를 공부에 대 한 최고의 모델로 떠오르고 있다. 이 프로토콜의 중요 한 단계 점화의 최적화를 포함 하 고 정확한 추적을 보장 하기 위해서 비디오 품질은 수 면을 계량 하는 데 필요한. 수집 및 여기서 설명 하는 분석에 대 한 시스템은 많은 다른 시스템, 상업 및 사용자, 운동 및 행동28,,2930척도를 완벽 하 게 기능. 이전 분석 결과 단일 물고기 수 면 검사 그룹 보관 되어 물고기의 분석에 대 한 허용 하도록 확장할 수 있습니다. 문제 해결 또는 분석 실험을 설계 하는 때 중요 한 고려 사항은 이다는 ...

수 면이 높은 생리 기능과 행동 수준1,2,3에 동물의 왕국에 걸쳐 보존 됩니다. 일반적으로 포유류 실험실 동물 수 면 심장학을 사용 하 여 평가, electrophysiological 녹음은 작은 유전자 의무가 모델 시스템에서 덜 실용적 고 따라서 수 면은 일반적으로 측정 동작3 에 따라 , 4. 수 면과 관련 된 행동 특성 높은 동물의 왕국에 걸쳐 보존 및 증가 자극 임계값, 자극, 그리고 장시간된 행동 정지5가역을 포함. 이러한 조치는 인간6선 충 벌레 C. 선 충에서 배열 하는 동물에 잠의 특성을 사용할 수 있습니다.
수 면 하 행동 정지를 사용 하 여 자동화 된 추적 소프트웨어를 필요 합니다. 추적 소프트웨어, 활동과 부동의 기간 일 수를 통해 결정 하 고 비활동의 장기간7,8수 면으로 분류 됩니다. 최근 몇 년 동안, 여러 추적 시스템 개발 되었으며, 다양 한 작은 유전자 의무가 모델 시스템 중 활동 데이터 획득 웜, 과일 파리와 물고기9,,1011를 포함 하 여. 이 프로그램 프리웨어 오픈 소스와 상용 소프트웨어7,12,13,14 포함 하 여 동물의 행동의 자동화 된 추적에 대 한 수 있는 소프트웨어와 함께 제공 됩니다. . 이러한 시스템과 효율적인 검사 및 수 면 고기 수많은 유전자 amendable 모델의 특성에 대 한 허용 그들의 유연성에 다.
Zebrafish, Danio rerio, 수 면의 유전자 조사 수많은 유전자와 잠15,16을 조절 하는 신경 회로의 식별을 주도하 고 있다. 이 척추 동물 실험실 동물에 잠의 신경 기초 조사를 위한 강력한 시스템 훨씬 덜 이며 수 면 진화 하는 방법에 대 한 알려진 어떻게 자연 제공 하는 동안 유사 규제 자에 기여 한다. 멕시코 cavefish, Astyanax mexicanus (A. mexicanus), 수 면, 운동 활동 및 circadian 리듬17,18에 극적인 차이 진화 했다. 이 물고기는 멕시코와 남부 텍사스와 적어도 29의 강에 서식 하는 눈된 표면 물고기 동굴 북동 멕시코19,,2021의 시에라 델 Abra 지역의 인구 존재 합니다. 놀랍게도, 수 면 손실을를 포함 하 여 많은 행동 차이 등장 하지 독립적으로 여러 cavefish 인구14,22에 나타납니다. 따라서, cavefish 수 면, circadian, 그리고 사회적 행동의 수렴 진화를 조사에 대 한 모델을 제공 합니다.
이 프로토콜 수 면 및 A에서 운동 동작 측정을 위한 시스템을 설명 합니다. mexicanus 애벌레 고 어른입니다. 맞춤식 적외선 기반의 녹음 시스템 빛과 어두운 조건 하에서 동물의 비디오 녹화에 대 한 수 있습니다. 상용 소프트웨어를 사용 하 여 활동을 측정 하 고 사용자 정의 매크로 비활성의 여러 측면을 측정 하 고 수 면의 기간을 결정 하는 데 사용 됩니다. 이 프로토콜은 또한 수 면과 사회적 행동 간의 상호 작용을 검사 하는 기능을 제공 하는 탱크 내의 여러 동물의 활동을 추적 하기 위한 실험 수정을 설명 합니다. 이러한 시스템은 측정 자, circadian 동작 및 추가 어 종 zebrafish, sticklebacks 등에서 운동 활동에 적용할 수 있습니다.

<table><tbody><tr><td>12V 전원 어댑터</td>, <td>환경 조명</td>, <td>24와트, 12VDC, 전원 공급 장치</td><td></td></tr><tr><td>, 아크릴 칸막이(성인)</td><td>TAP 플라스틱</td><td></td>, <td>필요에 따라 시트(크기별로 주문</td></tr>), <tr><td>성인용 적외선 전원</td><td>, 환경 조명, 24와트, 12VDC, 전원 공급 장치</td><td></td><td></td></tr>, <tr><td>배터리 팩</td>, <td>CyberPower</td><td>, CP850PFCLCD</td><td></td></tr>, <tr><td>카메라 렌즈(성인)</td><td>Navitar Zoom 7000</td><td>Zoom 7000</td><td></td></tr><tr><td>카메라 렌즈 (애벌레)</td><td>Fujian 35mm f/1.7</td><td>B01CHX7668</td><td>아마존</td></tr><tr><td>카메라 렌즈 어댑터</td><td>d</td><td>1524219</td><td></td></tr><tr><td>카메라 마운트</td><td>CowboyStudio Super Clamp</td><td>B002LV7X1K</td><td>아마존</td></tr><tr><td>어항</td><td>Deep Blue Professional</td><td>ADB11006</td><td></td></tr><tr><td>Heat sink (성인)</td><td>M-D 건축 제품</td><td>SKU: 61085</td><td></td></tr><tr><td>히트 싱크(애벌레)</td>에 맞게 절단<td>M-D 건축 제품</td><td>SKU: 57000</td><td></td></tr><tr><td>적외선(성인)</td>에 맞게 절단환경 <td>조명 적외선 850 nm 5050 LED 스트립</td><td>irrf850-5050-60-reel</td><td></td></tr><tr><td>적외선(유충)</td><td>에</td> 맞게 절단LED 세계 <td>B00MO9H7H4</td><td>아마존에서</td></tr><tr><td>구매 IR 확산 아크릴</td><td>TAP 플라스틱</td><td></td><td>필요에 따라 다양한 크기의 시트를 주문</td></tr><tr><td>하십시오 노트북/컴퓨터</td><td>N/A</td><td>N/A</td><td>모든 노트북이 작동합니다.</td></tr><tr><td>LED 조명</td><td>Chanzon 10 고출력 LED 칩 3W 화이트 (6000K-6500K/600mA-700mA/DC 3V-3.4V/3 와트)</td><td></td><td>B06XKTRSP7 Chanzon 25 pcs 1 W, 3 W, 5 W LED 방열판(2핀 블랙)과 함께 사용 알루미늄 베이스 플레이트 패널</td></tr><tr><td>라이트 타이머</td><td>세기 24시간 플러그인 기계식 타이머 접지</td><td></td><td></td></tr><tr><td>IR용 플라스틱 벽걸이</td><td>Everbilt 플라스틱 페그보드</td><td>모델 # 17961</td><td></td></tr><tr><td>전원 케이블</td><td>BNTECHGO 22 게이지 실리콘 와이어</td><td>B01K4RPE0Y</td><td></td></tr><tr><td>전원</td><td>Rapid LED</td><td>MOONLIGHT DRIVER (350MA)</td><td></td></tr><tr><td>조직 배양 플레이트</td><td>Fisherbrand</td><td>12-웰 (FB012928) 24-웰 (FB012929)</td><td></td></tr><tr><td>삼각대 볼 헤드</td><td>Demon DB-44</td><td>B00TQ54CZO</td><td>아마존 USB에서</td></tr><tr><td>구매 Hardrive</td><td>Seagate 3TB 백업</td><td>STDT3000100</td><td></td></tr><tr><td>USB 웹캠</td><td>Microsoft LifeCam</td><td>Q2F-00014</td><td>아마존에서 구매</td></tr><tr><td>카메라</td><td>LDR Industries 1/2" 스틸 파이프</td><td>307 12X36</td><td>벽에 플랜지 및 90&deg; 파이프 엘보우로 장착. 삼각대를 사용하여 카메라를 잡을 수도 있습니다.</td></tr></tbody></table>

수 면과 운동 활동 멕시코 cavefish에서의 자동화 된 측정

Automated Measurements of Sleep and Locomotor Activity in Mexican Cavefish

문의 전체 수 면 매우 보존된 행동 특성 포함 된 높은 흥분을 일으키는 임계값, 수 면 부족, 다음 반 등 기간 행동 부동의 통합 특징 이다. 멕시코 cavefish Astyanax mexicanus (A. mexicanus), 는 섭 동 환경에 대 한 응답 특성이 진화를 공부에 대 한 모델입니다. A. mexicanus 는 눈된 표면 주거 형태와 강력한 형태학과 행동의 차이 여러 장 님 동굴 주거 인구 존재 한다. 수 면 손실을 여러, 독립적으로 진화 cavefish 인구에서 발생 했습니다. 이 프로토콜 수 면과 표면 생선과 A. mexicanus 동굴에서 운동 활동을 측정 하는 방법론을 설명 합니다. 비용 효율적인 비디오 모니터링 시스템 1 주일 이상 기간에 대 한 개별적으로 보관 되어 애벌레 또는 성인 물고기의 행동 이미징 할 수 있습니다. 물고기 세 일 성인 기 통해 게시물 수정 시스템을 적용할 수 있습니다. 접근도 단일 분야에서 여러 물고기를 기록 하 여 수 면에 사회적 상호 작용의 효과 측정 하기 위한 적응 될 수 있다. 행동 기록, 다음 데이터 분석 사용 하 여 자동으로 소프트웨어를 추적 하 고 수 면 분석 기간, 가릴 길이 및 시 합 수를 포함 하 여 여러 수 면 변수를 계량 하는 사용자 지정된 스크립트를 사용 하 여 처리 됩니다. 이 시스템은 측정 자, circadian 동작 및 거의 모든 어 종 zebrafish, sticklebacks 등에서 운동 활동에 적용할 수 있습니다.

애벌레 연령대 4-30 dpf를 안정적으로 그림 1에 설명 된 사용자 지정 빌드 닫힌된 시스템에서 기록 될 수 있습니다. 시스템에는 적외선과 보이는 조명 조건 하에서 빛과 어둠, 다양 한 표시 빛 조건 (그림 1A)에서 녹음 수 있도록 포함 되어 있습니다. 동영상은 다음 추적 소프트웨어 (그림 1BC)를 사용 하 여 분석 하 고 이후 사용자 지정 수 면 매크로 (참조 추가 다운로드)를 사용 하 여 처리. 3 개의 독립적인 cavefish 인구에서 애벌레 생선 표면 물고기 (그림 1D)와 20 dpf에 비해 수 면에 상당한 감소를 표시 하 고 발달 단계에 걸쳐이 수 면 손실은. 물고기 수 면에 대 한 ...

이 프로토콜 운동 동작 및 멕시코 cavefish 수 면 측정 방법을 자세히 설명 합니다. 이전 분석은 사회적으로 지 내게 물고기에 이러한 행동을 측정 하기 위해 확장 됩니다. 이 시스템은 수 면과 다른 물고기 종에 있는 활동 연구에 널리 적용할 수 있습니다.

수 면과 운동 활동 멕시코 Cavefish에서의 자동화 된 측정

Across phyla, sleep is characterized by highly conserved behavioral characteristics that include elevated arousal threshold, rebound following sleep ...

이 프로토콜은 모든 물고기 집단에서 수면과 활동을 정량화하는 데 사용할 수 있으며 수면 조절을 연구하는 데 사용되는 모델 시스템의 수를 확장할 가능성이 있습니다. 이 기술의 장점은 유연성입니다. 예를 들어, 물고기는 다양한 경기장 크기 또는 노래가 보관된 또는 그룹 하우스 실험에서 추적할 수 있습니다.이 시스템에서 수면을 측정하는 강도는 높은 처리량 약물 또는 유전자 스크리닝을 위한 방법의 편의성입니다. 우리는 극적으로 다른 수면 표현형을 보여주는 동굴물고기의 두 개의 다른 인구에서 수면의 진화의 연구에이 방법을 적용했습니다. 행동 화상 진찰을 위한 시스템을 설치하는 것은 어려울 수 있더라도, 우리의 시스템은 애벌레와 성인 물고기를 공부하기 위한 비용 효과적인 방법을 제공합니다.larval A.mexicanus에서 수면과 circadian 리듬을 연구하기위한 운동 동작을 정확하게 추적하는 시스템을 구축하려면 0.33 센티미터 두께의 흰색 표지판 아크릴을 사용하여 애벌레 추적 시스템을위한 플랫폼을 구성하십시오. 동작 추적 실험 중에 물고기가 함유된 경기장이 있는 조명이 켜진 사각형 방열판 위에 레코딩 플랫폼을 배치하고, 동물 하우징의 조명 사이에 두 번째 아크릴을 배치하여 적외선을 확산하여 최적의 조명과 콘트라스트를 만듭니다. 전체 애벌레 추적 단계와 조명을 동봉 된 플라스틱 튜브 내에 설치합니다.로터리 도구를 사용하여 실험적으로 적합한 웹캠에서 렌즈를 제거합니다. 카메라 뒤쪽의 작은 나사를 제거하여 내부 하우징을 제거하고 카메라 본체 내부의 작은 나사를 제거하여 렌즈의 나머지 부분을 느슨하게 합니다. 작은 드라이버가 렌즈를 절단한 후 남은 렌즈 하우징의 일부를 제거합니다.그리고 충전 결합 장치 또는 CCD 하우징의 상단 부분에 파란색 발광 다이오드를 제거한다. 다음으로, 두 개의 외부 나사를 원래 위치로 다시 나사하기 전에 내부 하우징을 원래 방향으로 되돌려 보입니다. 작은 톱을 사용하여 카메라 내부를 라우팅하여 카메라가 렌즈 어댑터를 동반할 때까지 여분의 플라스틱을 부드럽게 하는 둥근 플라스틱 라우팅 비트가 장착될 수 있도록 합니다.카메라와 직접 접촉하지 않고 카메라 내부에 적외선 패스 필터를 설치하고 카메라 앞쪽에 있는 35mm 고정 렌즈의 어댑터를 렌즈 뒤쪽으로 나사로 고정합니다. 그런 다음 무대와 조명이 있는 튜브 상단의 뚜껑에 뚫은 구멍에 카메라와 렌즈를 넣고 동물이 기록될 컴퓨터에 USB를 부착합니다. 성인 물고기를위한 수면 시스템을 구성하기 위해 먼저 약 46 센티미터 간격으로 적외선 스트립을 잘라냅니다.그리고 적외선을 확산하기 위해 각 적외선 스트립 바로 앞에 흰색 사인 아크릴 시트를 46 by 5 ~ 0.32 센티미터 9 %의 라이트 패스. 그런 다음 모든 탱크를 후방 장착 적외선 조명을 지원하는 랙에 배치하고 불투명한 플라스틱 칸막이와 10리터 유리 탱크를 사용하여 개별 경기장을 만듭니다. 멕시코 테트라 어류장소의 운동 활성을 기록하기 위해 4일에서 6일 동안 수정 후 물고기를 24웰 티슈 플레이트의 개별 우물로 기록하고, 6웰 티슈 플레이트의 개별 우물에서 20~30일 후 수정을 기록한다.칸막이가 있거나 없는 10리터 탱크당 성인 5명까지 성인 테트라 수면과 활동을 기록합니다. 이 대표적인 실험에서 3개의 독립적인 동굴 물고기 집단에서 온 애벌레 물고기는 표면 물고기에 비해 수면의 현저한 감소를 나타냈다. 이 수면 생산은 수면이 또한 표면 물고기에 비해 성인 파촌, 몰리노 및 티나야 동굴 물고기에서 현저하게 감소했기 때문에 시험된 모든 연령대에 걸쳐 일관됩니다.특히, 사회 주택은 동굴 물고기 인구의 지하 효과로 인해 파초 동굴 물고기의 수면에 영향을 미치지 않고 표면 물고기의 수면을 강력하게 감소시다. 물고기주의를 녹음할 때 카메라 조명이 배경에 비해 물고기의 신호를 향상시키기 에 최적인지 확인하기 위해 주의를 기울여야 합니다. 텍스트에 완전히 설명되어 있고 모든 랩 설정에 따라 준수해야 하는 이 프로토콜에 대한 몇 가지 기본 명령줄 코딩이 필요합니다.이 프로토콜은 수면 진화에 대한 수많은 질문을 주도하고 현재 약물 화면에 사용되고있다, 수면 행동을 추적, 사회적 행동이 수면에 미치는 영향을 이해.

automated-measurements-sleep-locomotor-activity-mexican

Research

연구

JoVE Journal

Behavior

행동

우리는 매일 운전하는 활동 리듬을 녹음 절차를...

Circadian 리듬을 연구 및 매개 변수 잠을 전위의 활동 시금 Drosophila</em

절차는 뇌파, electromyogram, 그리고 뇌성 젖산 농도를 모니터링하는 동안 optogenetically 뇌성 대뇌 피질의 피라미드 뉴런의 활동을 조작하기위한 설명되어 있습니다. 사람들이 자연 수면 / 웨이크주기를 받아야 동안 실험 녹음 케이블 테 더링 마우스에 수행됩니다. Optogenetic 장비는 우리의 실험실에서 조립, 녹화 장비는 상업적으로 사용할 수 있습니다.

동시 Electroencephalography, 설치류 대뇌 피질의 젖산 농도와 Neuronal 활동 Optogenetic 조작의 실시간 측정

이 비디오는 마취된 마우스에 뇌파(EEG) 및 근전도(EMG) 전극 어셈블리를 이식하는 프로토콜을 보여줍니다. 이 프로세스에는 입체 프레임에 마우스를 고정하고, 두개골의 정중선을 절개하고, 전극을 위한 구멍을 뚫고, 신호 기록을 위해 전극 장치를 고정하는 작업이 포함됩니다. 복구 후 기록된 신호를 사용하여 마우스의 수면-절전 모드 해제 동작을 분석합니다.

뇌파 및 근전도 기록을 통한 마우스의 수면 행동 분석

여기, 음향 자극에 수면 반응을 조절하는 생쥐의 비 REM 수면의 신경 및 심장 변수의 시간적 역학을 설명하기위한 실험 및 분석 절차를 제시합니다.

수면 마우스의 스펙트럼 파워 및 심박수의 저속 역학 정량화

활동 기반 홈 케이지 모니터링 통해 수 면을 측정 하는 높은 처리량 방법을 설명 합니다. 이 방법은 전통적인 뇌 파 기반 방법에 비해 이점이 있습니다. 그것은 잘 총 수 면 기간 결정에 대 한 유효성을 검사 하 고 인간 질병의 설치류 모델에서 수 면을 모니터링 하는 강력한 도구가 될 수 있습니다.

수 면 기간 설치류의 비 침범 성, 높은 처리량 결정

이 기사 연속 기록과 대 심장 및 운동 활동의 분석에 대 한 비 침범 성 biomonitoring 시스템을 제공합니다. 근 적외선 광학 센서, 비디오 추적 모듈, 및 그것의 생리 적인 상태를 반영 하 고 심장 박동 변동 동안 대 동작 특징 대 하트 비트를 평가 하기 위한 소프트웨어가이 시스템에 의하여 이루어져 있다.

왕새우 심장 및 동작 활동의 지속적인 비 침범 성 측정

이 프로토콜에서 우리 Astyanax mexicanus 성인 사육, 애벌레, 인상 하는 방법을 보여 하 고 표면의 고기를 비교 하 여 morphotypes 동굴 후 애벌레 물고기에 전체 마운트 immunohistochemistry를 수행 합니다.

Post-larval 고기 분석 및 전체 마운트 Immunohistochemistry 멕시코 Tetra Astyanax mexicanus 를 높이

진화 모델 시스템 Astyanax mexicanus유전자의 조작 방법을 설명합니다. 세 가지 다른 기술 설명: 중재 하는 Tol2 transgenesis, CRISPR/Cas9, 및 morpholinos를 사용 하 여 식의 최저 사용 하 여 게놈의 타겟된 조작. 이 도구는 기본 표면 및 동굴 주거 형태 사이의 변형 유전자의 직접 조사를 용이 해야.

멕시코 Cavefish에서 유전자 기능 조작

여기, 선물이 멕시코 cavefish의 일련의 높은 처리량 연구 방법 행동 및 mechanosensory 시스템의 중요 한 얼룩. 이러한 방법 사용 무료 소프트웨어 및 맞춤 스크립트, 행동의 연구에 대 한 실용적이 고 비용 효율적인 방법을 제공 하.

행동 추적 및 멕시코 Cavefish의 Neuromast 이미징

전위의 활동 (LMA)는 생쥐의 행동을 간단하고 쉽게 수행 측정이다. 비디오 추적 소프트웨어 (VTS) 및 LMA의 커플 링 LMA 분석 설명서, 라인 교차 방식에 비해 특히, 특이성 및 감도 개선 할 수 있습니다. 또한 VTS 마우스 LMA의 장기 추적을 할 수 있습니다.

마우스의 단기 및 장기 전위의 활동은 영상 추적 소프트웨어에 의해 분석

학습하세요 멕시코 동굴어의 수면과 운동 활동을 자동화된 방법으로 정량화하는 기술을. 사회적 환경에서의 행동 변화를 분석하고 다양한 어류 종에 적용 가능한 연구 시스템을 활용하세요.

수 면과 운동 활동 멕시코 Cavefish에서의 자동화 된 측정

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