Name: 밀 곡물의 비표적 액체 크로마토그래피 질량 분광계 기반 대사체학 분석 (동영상) | JoVE Journal
Uploaded: 2020-03-13T12:00:00.000+00:00
Duration: 7 min 10 s
Description: 배우세요 밀 곡물의 비표적 대사체학 분석 방법을 통해 유전자, 환경, 관리 요인의 상호작용을 이해하고 수확량과 품질을 예측하는 기술을 습득하세요.

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저자는 서호주 프리미어의 농업 및 식품 펠로우십 프로그램 (일자리, 관광, 과학 및 혁신학과, 웨스턴 오스트레일리아 정부)과 프리미어 펠로우 인 사이먼 쿡 (센터 디지털 농업, 커튼 대학과 머독 대학). 현장 시험 및 곡물 샘플 수집은 서호주 의 지역 로열티 프로그램에 대한 정부의 지원을 받았습니다. 우리는 현장 시험에 기여한 그랜틀리 스테인러와 로버트 프랑스어를 인정합니다. NCRIS가 자금을 지원하는 바이오 플랫폼 오스트레일리아는 장비 자금 조달을 인정받고 있습니다.

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<li>Sangster, T., Major, H., Plumb, R., Wilson, A. J., Wilson, I. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+pragmatic+and+readily+implemented+quality+control+strategy+for+HPLC-MS+and+GC-MS-based+metabonomic+analysis%5BTitle%5D)+AND+%22Analyst%22%5BJournal%5D)">A pragmatic and readily implemented quality control strategy for HPLC-MS and GC-MS-based metabonomic analysis.</a> Analyst. 131 (10), 1075-1078 (2006).</li>
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<li>Shahaf, N., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+WEIZMASS+spectral+library+for+high-confidence+metabolite+identification%5BTitle%5D)+AND+%22Nature+Communications%22%5BJournal%5D)">The WEIZMASS spectral library for high-confidence metabolite identification.</a> Nature Communications. 7 (1), 12423(2016).</li>
</ol>

저자는 공개 할 것이 없다.

여기에서, 우리는 밀 곡물의 분석을 위한 LC-MS 기지를 둔 표적되지 않은 metabolomics 방법을 제시합니다. 이 방법은 4개의 획득 모드(역단계 및 지질-반응성 역위상과 양성 및 음수 이온화)를 두 가지 모드로 결합하여 제3 의 이동상을 역위상 구배로 도입한다. 결합된 접근은 밀 품종 사이 강렬에 있는 이의 대략 반을 가진 이온 극성 당 대략 500의 생물학적으로 관련있는 특징을 산출했습니다. 다른 밀 품종의 곡물에서 대사 산물 농도의 중요한 변화는 질병 저항, 스트레스 허용 오차 및 곡물 품질및 수율에 중요한 다른 자형질 특성에 연결 될 수있는 변경 된 생화학을 나타냅니다. 예를 들어, 대사체학 접근법은 새로운 방어 메커니즘12를 설명하고 가뭄 내성13에서대사 산물의 역할을 제안하는 데 사용되어 왔다. 이 프로토콜의 향후 응용 프로그램은 특정 품종의 생화학 적 프로파일을 특정 환경 및 관리 관행에 바람직한 유전 적 특성에 추가로 연...

농업의 유전자, 환경 및 관리 관행 간의 상호 작용을 이해하면 제품 수율과 품질을 보다 정확하게 예측하고 관리할 수 있습니다. 식물 대사 산물은 게놈, 환경 (기후, 강우 등)과 같은 요인에 의해 영향을 받고 농업 환경에서 작물을 관리하는 방식 (즉, 비료, 살균제 등의 적용)에 의해 영향을받습니다. 게놈과는 달리, 대사체는 이 요인 전부에 의해 영향을 받고 그러므로 metabolomics 데이터는 특정 시간에 이 상호 작용의 생화확적인 지문을 제공합니다. 일반적으로 대사체학 기반 연구에 대한 두 가지 목표 중 하나가 있습니다: 첫째, 유기체의 생화학에 대한 깊은 이해를 달성하고 생리학과 관련하여 섭동 (생체 또는 생체 스트레스)에 대한 반응 메커니즘을 설명하는 데 도움이됩니다. 둘째, 바이오마커를 연구 하에 섭동과 연관시다. 두 경우 모두 이러한 지식을 보유한 결과는 수율 크기와 품질 향상이라는 목표를 달성하기 위한 보다 정확한 관리 전략입니다.
식물 메타볼로메는 다양한 물리 화학적 특성을 가진 수천개의 작은 분자를 포함할 것으로 예측됩니다. 현재, 어떤 대사체학 플랫폼 (주로 질량 분광법 및 핵 자기 공명 분광법)은 단 하나 분석에서 전체 metabolome를 붙잡을 수 없습니다. 이러한 기술 개발 (샘플 준비, 대사 산물 추출 및 분석), 단일 분석 실행 내에서 가능한 한 대사 체의 큰 범위를 제공, 대사 체학 연구원에 대 한 주요 목표. 밀 곡물의 이전 비표적 대사체학 분석은 더 큰 대사체 범위를 위해 다중 크로마토그래피 분리 및 획득 극성 및/또는 계측에서 얻은 데이터를 결합했습니다. 그러나, 이것은 각 양식에 대해 별도로 준비하고 취득하는 견본을 요구했습니다. 예를 들어, Beleggia등 2는 비극성 분석물의 GC-MS 분석 이외에 극성 분석물의 GC-MS 분석을 위한 유도체 샘플을 제조하였다. Das etal.3은 GC- 및 LC-MS 방법을 모두 사용하여 분석에서 커버리지를 개선했습니다. 그러나, 이 접근법은 일반적으로 위에서 설명한 바와 같이 별도의 샘플 준비뿐만 아니라 두 개의 독립적인 분석 플랫폼이 필요합니다. GC-MS2,3,3,4 및 LC-MS33,5 플랫폼을 이용한 밀곡물의 이전 분석은 GC-MS에 대한 50 내지 412(55identified) 특징을 산출하였고, 409는 GC-MS 및 LC-MS를 결합하고 LC-MS 지질학 분석에 대해 수천 개의 특징을 산출하였다 5.5 단일 분석에 적어도 두 개의 모드를 결합하여 확장된 대사체 커버리지를 유지하여 생물학적 해석의 풍요로움을 높이는 동시에 시간과 비용을 모두 절감할 수 있습니다.
역상 크로마토그래피에 의해 광범위한 지질 종의 효율적인 분리를 허용하기 위해, 현대 지질학 방법론은 일반적으로 용출 용매6에서이소프로판올의 높은 비율을 사용하며, 그렇지 않으면 크로마토그래피에 의해 해결되지 않을 수 있는 지질 클래스에 대한 어플가능성을 제공한다. 효율적인 지질 분리를 위해, 시작 이동상은 또한 분자의 다른 클래스를 고려하는 전형적인 역상 크로마토그래피 방법보다 유기조성물 7에서 훨씬 더 높다. 그라데이션의 시작 부분에 높은 유기 조성물은 분자의 많은 다른 클래스에 이러한 방법을 덜 적합하게. 가장 주목할 만한, 역상 액체 크로마토그래피는 주로 수성 조성으로 시작하여 크로마토그래피의 용출 강도가 증가함에 따라 유기 함량이 증가하는 이진 용매 구배를 채용합니다. 이를 위해, 우리는 단일 분석 내에서 대사 산물의 지질 및 비 지질 클래스의 분리를 달성하기 위해 두 가지 접근법을 결합하고자했습니다.
여기에서는, 우리는 제 3 이상을 사용하고 단 하나 견본 준비 및 1개의 분석 컬럼을 사용하여 전통적인 반전상 및 lipidomics 적합한 크로마토그래피 방법을 결합하는 크로마토그래피 방법을 제시하는 것을 제시합니다. 당사는 주로 임상 대사체학 연구에서 이전에 구현된 많은 품질 관리 조치 및 데이터 필터링 단계를 채택했습니다. 이러한 접근법은 높은 기술적 재현성 및 생물학적 관련성을 가진 견고한 특징을 결정하는 데 유용하며 이러한 기준을 충족하지 않는 특징은 제외합니다. 예를 들어, 풀링된 QC 샘플8,QC 보정9,데이터 필터링9,,10 및 누락된 피처의대칭(11)의반복 분석을 설명합니다.

<table><tbody><tr><td>13C6-소르비톨</td>, <td>머크 시그마-알드리치</td><td>, 605514</td><td></td></tr><tr><td>2-아미노안트라센</td><td>, 머크 시그마-알드리치</td><td>A38800-1 g</td><td></td></tr>, <tr><td>아세토니트릴</td><td>ThermoFisher Scientific</td><td>FSBA955-4</td><td>Optima LC-MS 등급</td></tr><tr><td>포름암모늄</td>, <td>머크 시그마-알드리치</td><td>516961-100 mL</td><td>>99.995%</td></tr><tr><td>Analyst TF</td><td>Sciex</td><td></td><td>버전 1.7</td></tr><tr><td>AnalyzerPro 소프트웨어</td><td>SpectralWorks Ltd.</td><td></td><td>7.2단계에 사용되는 데이터 처리 소프트웨어. 버전 5.7</td></tr><tr><td>AnalyzerPro XD sortware</td><td>SpectralWorks Ltd.</td><td></td><td>7.5단계에 사용되는 데이터 처리 소프트웨어. 버전 1.4</td></tr><tr><td>밸런스</td><td>싸토리우스. 정밀 저울 Pty. Ltd.</td><td></td><td></td></tr><tr><td>d6-트랜스신남산</td><td>Isotec</td><td>513962-250 mg</td><td></td></tr><tr><td>포름산</td><td>Ajax Finechem Pty. Ltd.</td><td>A2471-500 mL</td><td>99%</td></tr><tr><td>동결 건조기 (Freezone 2.5 Plus)</td><td>Labconco</td><td>7670031</td><td></td></tr><tr><td>Glass Schott bottles (100 mL, 500 mL, 1 L)</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>유리 바이알 (2 mL) 및 스크류 캡 뚜껑 (프리 슬릿)</td><td>Velocity Scientific Solutions</td><td>VSS-913 (바이알), VSS-SC91191 (뚜껑)</td><td></td></tr><tr><td>Sciex TripleToF Sciex</td><td></td><td>p/n 4456736</td><td></td></tr> <tr><td>용 설치 키트이소프로판올</td><td>ThermoFisher Scientific</td><td>FSBA464-4</td><td>Optima LC-MS 등급</td></tr><tr><td>실험실 블렌더</td><td>Waring 상업용</td><td></td><td>모델 HGBTWTS3</td></tr><tr><td>Leucine-enkephalin</td><td>Waters</td><td>p/n 700008842</td><td>튜닝 솔루션</td></tr><tr><td>Metaboanalyst</td><td><a href="https://www.metaboanalyst.ca/MetaboAnalyst/faces/home.xhtml" target="_blank">https://www.metaboanalyst.ca/ 고처리량 대사체학을 위한 MetaboAnalyst/faces/home.xhtml</a></td><td></td><td>웹 기반 분석 파이프라인. 무료 웹 기반 도구입니다. 버전 4.0.</td></tr><tr><td>메탄올</td><td>, ThermoFisher Scientific</td><td>FSBA456-4</td>, <td>Optima LC-MS 등급</td></tr>, <tr><td>Miconazole</td>, <td>Merck Sigma-Aldrich</td>, <td>M3512-1 g</td><td></td></tr>, <tr><td>마이크로 원심분리기(Eppendorf 5415R)</td><td>Eppendorf(Crown Scientific Pty. Ltd.에서 배포)</td><td></td><td>5426 No. 0021716</td></tr><tr><td>마이크로 원심분리기 튜브(2mL)</td><td>SSIbio</td><td>1310-S0</td><td></td></tr><tr><td>Microsoft Office Excel</td><td>Microsoft</td><td></td><td></td></tr><tr><td>Peak View 소프트웨어</td><td>Sciex</td><td></td><td>버전 1.2(64비트)</td></tr><tr><td>피펫 팁(200 uL, 100 uL)</td><td>ThermoFisher Scientific</td><td>MBP2069-05-HR(200 uL), MBP2179-05-HR(1000 uL)</td><td></td></tr><tr><td>피펫(200 uL, 1000 uL)</td><td>ThermoFisher Scientific</td><td></td><td></td></tr><tr><td>플라스틱 원심분리기 튜브(15mL)</td><td>ThermoFisher Scientific</td><td>NUN339650</td><td></td></tr><tr><td>Progenesis QI</td><td>Nonlinear Dynamics</td><td></td><td>Samll 분자 발견 분석 소프트웨어. 버전 2.3 (64비트)</td></tr><tr><td>Sciex 5600 트리플 ToF 질량</td>분석기 <td>Sciex</td><td></td><td></td></tr><tr><td>스크류 캡 용해 튜브(2 mL), 세라믹 비드 포함</td><td>Bertin Technologies</td><td></td><td></td></tr><tr><td>포름산나트륨</td><td>Merck Sigma-Aldrich</td><td>456020-25 g</td><td></td></tr><tr><td>조직 용해기/균질기</td><td>Bertin Technologies</td><td></td><td>시리얼 0001620</td></tr><tr><td>용량 플라스크(10 mL, 50 mL, 100 mL, 200 mL, 1 L)</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>Vortex 믹서</td><td>IKA Works Inc. (Crown Scientific Pty. Ltd.에서 배포)</td><td></td><td>001722</td></tr><tr><td>Water</td><td>ThermoFisher Scientific</td><td>FSBW6-4</td><td>Optima LC-MS 등급</td></tr><tr><td>Water's Acquity LC 시스템, 4차 펌프가 장착된</td><td>Waters</td><td></td><td></td></tr><tr><td>Water의 Aquity UPLC 100mm HSST3 C18 컬럼</td>, <td>Waters</td><td>p/n 186005614</td><td></td></tr></tbody></table>

밀 곡물의 비표적 액체 크로마토그래피 질량 분광계 기반 대사체학 분석

Untargeted Liquid Chromatography-Mass Spectrometry-Based Metabolomics Analysis of Wheat Grain

유전자, 환경 및 농업 관행의 관리 사이의 상호 작용을 이해하면 제품 수율과 품질을 보다 정확하게 예측하고 관리 할 수 있습니다. Metabolomics 데이터는 주어진 순간에 이 상호 작용의 판독을 제공하고 유기체의 생화확적인 상태의 유익합니다. 또한, 개별 대사 산물 또는 대사 산물의 패널은 수율 및 품질 예측 및 관리를위한 정확한 바이오 마커로 사용될 수있다. 식물 메타볼로메는 생리적 특성과 바이오마커 발견에 대한 생화학적 통찰력을 제공하는 다양한 물리화학적 특성을 가진 수천 개의 소분자를 함유할 것으로 예측됩니다. 이를 악용하기 위해, 대사체학 연구원의 주요 목표는 단일 분석 내에서 가능한 한 많은 물리 화학적 다양성을 포착하는 것입니다. 여기에서 우리는 필드 성장한 밀 곡물의 분석을 위한 액체 크로마토그래피 질량 분광계 기지를 둔 표적으로 한 metabolomics 방법을 제시합니다. 이 방법은 액체 크로마토그래피 사분면 용매 관리자를 사용하여 제 3 의 이상을 소개하고 전통적인 역상 그라데이션과 지질 -amenable 그라데이션을 결합합니다. 곡물 준비, 대사 산물 추출, 도구 분석 및 데이터 처리 워크플로우에 대해 자세히 설명합니다. 양호한 질량 정확도 및 신호 재현성이 관찰되었고, 이 방법은 이온화 모드당 약 500개의 생물학적으로 관련된 특징을 산출하였다. 또한, 밀 품종 간의 현저하게 다른 대사 산물 및 지질 특징 신호를 결정했습니다.

식물 대사체는 게놈과 환경의 조합에 의해 영향을, 그리고 또한 농업 설정에서, 작물 관리 정권. 우리는 밀 품종 간의 유전적 차이가 대사 산물 수준에서 관찰 될 수 있음을 보여줍니다, 여기, 이상과 500 곡물 혼자 품종 사이의 상당히 다른 농도를 보여주는 측정 화합물. 양호한 질량 정확도(&lt;10 ppm 오차) 및 내부 표준의 신호 재현성(&lt;20% RSD)(그림2)은음극 및 양성 이온화 모드 모두에 대해 관찰되었다(표3). 기재된 시료 전처리 및 액체 크로마토그래피 질량 분광법 기반 분석은 음의 이온화 모드에서 &gt;900 데톤볼루트 피처와 &gt;1300 데톤볼루트 피처를 양성 이온화 모드에서 산출했습니다. 준비 블랭크(그림3)는시료 제제 및 분석 방법이 유물 특징을 도입했는지 여부를 결정하기 위해 포함되었고, 따라서 모...

밀 곡물 대사 산물 및 지질의 비표적 분석을위한 방법이 제시된다. 이 프로토콜에는 아세토니트릴 대사산물 추출 방법 및 역위상 액체 크로마토그래피 질량 분광법 방법이 포함되며, 양극 및 음전소 이온화 모드로 수집됩니다.

Understanding the interactions between genes, the environment and management in agricultural practice could allow more accurate prediction and management ...

대사 산물은 게놈 환경 및 관리 관행과 같은 요인에 의해 영향을 받습니다. 이러한 요소 간의 상호 작용을 이해하면 제품의 수율과 품질을 보다 정확하게 예측하고 관리할 수 있습니다. 전통적인 2개가 아닌 세 번째 이동 단계를 통합함으로써 이 기술은 더 넓은 범위의 대사 산물을 분리하고 검출할 수 있게 합니다.메타볼로믹스는 생물학의 모든 영역에 적용될 수 있었습니다. 첫째, 유기체의 생화학에 대한 깊은 이해를 달성하고 생리학과 관련하여 생체 내 또는 생물학적 스트레스에 대한 반응을 설명하는 데 도움이됩니다. 둘째, 바이오마커를 연구 하에 의기양양하게 연관짓는다.이소프로필 알코올은 점성 용매이기 때문에, 낮은 플레어 속도로 도입되어야 하며, 구성을 98%로 높이기 전에 충분한 평형 시간을 도입하여 이러한 단계는 색채 그래픽 시스템이 과압, 오류 반환 또는 잠재적으로 분석 열을 손상시키는 것을 방지할 것이다. 곡물의 준비를 시작하려면 실험실 블렌더를 사용하여 곡물을 갈아. 블렌더를 20초 동안 고속으로 실행한 다음 반복합니다.베이스에서 블렌더 항아리를 제거합니다. 믹서기 항아리의 측면을 탭하여 거친 접지 곡물을 샘플 표면에 가져옵니다. 거칠게 분쇄된 곡물은 폐기하거나 저장할 수 있습니다.블렌더에서 2밀리리터 플라스틱 마이크로 원심분리기 튜브로 미세하게 분쇄된 곡물을 전달합니다. 추출과 같은 날에, 원고에 설명된 대로 추출 용매를 준비한다. 다음으로, 2밀리리터 마이크로 원심분리기 튜브에 200 밀리그램의 미세 접그레인을 계량합니다.튜브의 곡물에 추출 용매 500 마이크로리터를 추가합니다. 또한 빈 튜브에 500 마이크로리터의 추출 용매를 추가하여 빈 공간을 준비합니다. 6, 500 RPM으로 설정된 균질화제를 사용하여 용매와 곡물을 20초 동안 혼합합니다.그런 다음 20초 동안 반복합니다. 그런 다음 튜브를 섭씨 4도, 100배, 5분간 원심분리합니다. 상체를 2밀리리터 플라스틱 튜브로 옮기고 펠릿을 유지합니다.펠릿에서 추출 과정을 두 번 반복합니다. 세 개의 수퍼나티를 결합하여 약 1.5 밀리리터의 총 추출물 볼륨을 산출하고 소용돌이에 섞습니다. 품질 관리에 사용되는 모든 곡물 추출물의 풀링된 샘플을 만들기 위해 각 곡물 추출물의 55마이크로리터를 2밀리리터 튜브와 소용돌이로 옮기십시오.그런 다음 이 풀이 된 샘플의 50 개의 마이크로 리터 알리쿼트를 유리 바이알로 옮기습니다. 각 곡물 샘플 추출물의 50 마이크로리터 알리쿼트를 유리 바이알로 옮기. 서면 원고에 설명된 바와 같이 액체 크로마토그래피 질량 분석법에 필요한 솔루션을 준비한다.LCMS 분석 당일, 밀리리터 류신 엔케팔린당 200 나노그램을 함유한 5%아세토닐릴100밀리리터를 준비합니다. 이 용액의 마이크로리터 950마이크로리터를 곡물 추출물의 50 마이크로리터 알리쿼트가 들어 있는 유리 바이알에 추가합니다. 소용돌이에 의해 유리병에 내용기를 혼합.먼저 원고와 제조업체의 사용자 가이드에 설명된 대로 계측기 교정을 설정합니다. 다음으로, LCMS 급성 용매를 사용하여 LC 유체 시스템을 제거하고 플러시합니다. LC 방법 시작 조건을 사용하여 LC 시스템을 평형화하여 열 압력이 안정화되도록 합니다.계측기 시퀀스 테이블을 설정합니다. 시료 시퀀스의 시작 부분에 나트륨 포메이트를 주입하여 계측기 교정을 확인합니다. 먼저 용매 및 전두엽 블랭크를 분석하고 시스템 컨디셔닝을 위한 풀링된 품질 관리 샘플과 무작위 샘플 목록을 분석합니다.기술 복제로 품질 관리 샘플을 정기적으로 실행합니다. 시퀀스의 끝에서 두 개의 품질 관리 샘플을 실행합니다. 시퀀스가 실행되는 동안 내부 표준 질량 정확도와 신호 재현성을 모두 포함하여 데이터 품질을 확인합니다.신호 재현성을 확인하려면 오버레이 스펙트럼의 육안 검사로 충분합니다. 곡물 추출물을 준비하는 데 사용되는 용액에 4개의 내부 표준이 포함되었다. LCMS 동안 양수 및 음의 이온화 모드 모두에서 양질량 정확도와 내부 표준의 단일 재현성이 관찰되었습니다.공백 의 분석에 따라, 음수 모드에서 421 신호와 양성 모드에서 835 신호는 유물로 판단되었다. 이러한 신호는 곡물 샘플의 평균 단일 강도의 5%와 같거나 큰 강도의 공백에 존재하였다. 아티팩트를 제거하고 데이터의 추가 필터링 후 음수 모드는 483개의 기능을 반환했으며 양수 모드는 523개의 기능을 반환했습니다.약 250개의 특징은 생물학적으로 관련이 있고 밀 품종에 걸쳐 강도가 크게 달랐습니다. 사전 공백, 내부 표준 및 풀링된 샘플의 포함과 같은 품질 관리 조치는 이 프로토콜에서 기억하는 것이 중요합니다.

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Research

연구

JoVE Journal

Biochemistry

생화학

질량분석법(UPLC-MS)과 결합된 초고성능 액체 크로마토그래피에 의한 비표적 대사 산물 프로파일링은 대사를 조사하는 강력한 기술입니다.  이 문서에서는 시료 조직 및 준비, 데이터 수집, 데이터 분석, 품질 관리 및 대사 산물 식별을 포함하여 혈청의 비표적 대사 산물 프로파일링에 사용되는 일반적인 워크플로우를 간략하게 설명합니다.

울트라 성능 액체 크로마토 그래피 - 질량 분석법 (UPLC-MS)에 의해 혈청 대규모 비 타겟 Metabolomic 프로파일

타겟이 불분명 한 대사는 대사 프로파일의 스냅 샷을 생성하는 가설을 제공합니다. 이 프로토콜은 혈청 세포 또는 조직에서 대사 산물의 추출 및 분석을 보여줍니다. 대사 산물의 범위는 액체 - 액체 상 추출을 사용하여 조사하는, 마이크로 ultraperformance 액체 크로마토 그래피 / 차동 분석 소프트웨어에 결합 고해상도 질량 분석법 (UPLC-HRMS).

Ultraperformance 액체 크로마토 그래피 고해상도 질량 분석 (UPLC-HRMS)를 사용하여 생물 소스에서 타겟이 불분명 한 대사

대사 산물 프로파일 링은 건강과 질병에있는 신진 대사의 연구에 소중한 자산이다. 극성 스위칭 및 급속한 듀티 사이클 고분해능 질량 분석법에 결합 통상 대별 액체 크로마토 그래피를 이용해서, 우리는 높은 감도, 정밀도 및 해상도를 가진 생물학적 물질의 극성 대사 조성을 분석하는 프로토콜을 기술한다.

민감한, 대규모 양적 대사 체학을위한 전략

우리는 효모 사카로미세스 세레바시아에있는 수용성 대사산물의 주요 클래스의 식별 그리고 양을 위한 프로토콜을 제시합니다. 설명된 방법은 다재다능하고 견고하며 민감합니다. 그것은 서로 수용성 대사 산물의 구조 이소목 및 고정 관형 형태의 분리를 허용한다.

탠덤 질량 분광과 결합 된 액체 크로마토그래피를 사용하여 사카로미세스 Cerevisiae의 정량적 Metabolomics

프로토콜은 복잡한 lysate 기반 세포 없는 시스템에서 대사 반응을 연구하기 위한 굴절 지수 또는 질량 분광 검출에 결합된 고성능 액체 크로마토그래피 방법을 설명합니다.

리자테 기반 세포 없는 시스템에서 대사산물 프로파일링을 위한 굴절률 또는 질량 분광 검출에 결합된 액체 크로마토그래피

여기에 제시된 것은 액체 크로마토그래피-탠덤 질량 분석법(LC-MS-MS)을 사용하여 수경 조건 하에서 밀에서 이미다클로프리드의 흡수, 전위 및 분포를 측정하기 위한 프로토콜입니다. 결과는 이미다클로프리드가 밀에 흡수될 수 있고 이미다클로프리드가 밀 뿌리와 잎 모두에서 검출된다는 것을 보여주었습니다.

밀에서 imidacloprid의 흡수, 전위 및 분포 측정

보리의 대사체 분석 방법이 제시됩니다. 이 방법은 대사 산물의 분별 및 유도체화와 가스 크로마토그래피/질량 분석법(GC/MS)에 의한 분석을 수반합니다. 대사체 분석은 곡물에 대한 간작 및 가뭄 스트레스의 영향을 결정하는 데 사용할 수 있습니다.

가스 크로마토그래피/질량 분석법을 통한 보리의 대사체학 분석

이 프로토콜은 최근 발표된 EU Commission Regulation 2023/915에 따라 식품 내 맥각 알칼로이드의 존재를 결정하기 위해 검증된 액체 크로마토그래피-이온 이동성-고분해능 질량 분석 방법을 제공합니다.

액체 크로마토그래피-트랩 이온 이동성 분광법-비행 시간 질량 분석법을 통한 식품 매트릭스에서 조절되는 맥각 알칼로이드 검출

여기서 우리는 액체 크로마토 그래피 및 질량 분석을 통해 황색 포도상 구균과 이후 분석에서 대사 물질의 추출을위한 프로토콜을 기술한다.

의 대사 산물 분석을위한 탠덤 액체 크로마토 그래피 - 질량 분석 기반 접근<em&gt; 포도상 구균</em

우리는 RNA 의무적인 단백질을 확인 하 고 중재 하는 UV photocrosslinking 및 질량 분석을 사용 하 여 라이브 셀에서 그들의 RNA 바인딩 영역 지도를 프로토콜을 설명 합니다.

질량 분석 기반 식별 RNA 바인딩 영역에 대 한 샘플 준비

배우세요 밀 곡물의 비표적 대사체학 분석 방법을 통해 유전자, 환경, 관리 요인의 상호작용을 이해하고 수확량과 품질을 예측하는 기술을 습득하세요.

밀 곡물의 비표적 액체 크로마토그래피 질량 분광계 기반 대사체학 분석

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