시냅스 가소성을 가진 수지상 척추의 3D 모델링

융합을 통한 화학종 반응의 전산 3D 기하학적 모델링. 수지상 척추 안팎에서 수용체 인신 매매의 메커니즘을 연구하는 데 유용한 방법은 시냅스 가소성을 하고 있다. 이 기술은 많은 수의 변수가 있는 비선형 시스템에 대한 가설과 프로젝션을 만들기 위한 풍부한 환경을 조성하는 장점이 있습니다.

변형된 구를 사용하여 척추 머리와 척추 목이 있는 단일 수지상 척추의 메쉬를 만듭니다. 첫 번째 오픈 블렌더. 셀 블렌더가 이미 설치되어 키패드에 5를 눌러 원근면에서 직교 보기로 변경합니다.

1을 눌러 앞면 보기로 변경하고 시프트 C를 눌러 커서를 중심으로 합니다. 척추 헤드를 만들려면 Shift A를 눌러 메시 팔레트를 열고 메시를 선택합니다. UV 구를 선택하고 UV 구를 추가하여 크기를 0.25로 설정하고 링을 32로 설정합니다.

헤드 의 상단을 평평하게 누르려면 탭을 눌러 블렌더를 오브젝트 모드에서 편집 모드로 전환합니다. B를 눌러 구의 상위 3분기를 선택하고 삭제를 누르고 정점을 선택하고 정점을 제거하려면 Enter를 입력합니다. B를 누르고 구의 상단을 선택합니다.

E, S, 0 및 Enter를 눌러 정점의 상단을 계속 선택합니다. 파란색 화살표를 아래로 이동하여 척추 머리 의 상단에 정렬합니다. 척추 상단의 메쉬 해상도를 높이려면 도구와 칼을 선택하고 칼을 사용하여 상단중앙의 원을 잘라냅니다.

그런 다음 도구 및 루프 절단을 선택하고 네 번 밀어 상단의 중앙 주위에 4 개의 동심 원을 만듭니다. 척추 목을 만들려면 B를 누르고 메시의 바닥을 선택합니다. 정점 및 B 삭제를 누르고 메시의 바닥을 선택합니다.

E와 Z를 누르고 마이너스 0.45를 선택하여 영하 0.45 마이크로 미터에서 Z 축 위치로 압출을 만듭니다. 메쉬를 M 셀 과 호환되도록 하려면 Ctrl T를 눌러 메시를 삼각측량하고 도구를 선택하고 두 배를 제거합니다. 여러 척추 덴드레트 프레스 Shift A를 작성하여 메시 팔레트를 열고 메시와 실린더를 선택합니다.

실린더 추가 메뉴에서 반경 0.3 마이크로미터와 깊이를 두 마이크로미터로 설정하고 Enter. Enter. R을 누르고 90을 입력하여 실린더 90도 회전하고 파란색 화살표를 사용하여 실린더를 척추 바닥으로 드래그합니다. 3을 눌러 실린더의 전면 보기를 얻고 Z를 눌러 메쉬를 투명하게 만듭니다.

파란색 일반 화살표를 사용하여 척추의 베이스를 원통 내부로 이동하고 오른쪽 단추를 클릭하여 Dendrite를 선택합니다. 수정자를 선택하고 수정자를 추가하고 부울, 작업 연합을 선택하고 오브젝트 척추를 선택합니다. 적용을 클릭하여 Dendrite와 척추의 조인트 메시를 만듭니다.

그런 다음 마우스를 사용하여 격리된 척추의 메시를 선택하고 위치와 각도를 변경하여 각 새로운 척추를 생리적 위치에 삽입합니다. AMPARs를 만들려면 분자를 선택하고 새로운 분자를 삽입합니다. 이름을 AMPAR로 변경하고 분자 유형을 표면 분자로 변경합니다.

그런 다음 확산 상수를 0.05배 10번 초당 8평방센티미터로 변경합니다. AMPA에 바인딩된 앵커를 플롯하려면 기초 상태 동안 PSD1에서 플롯 출력 설정을 열고 분자를 정의합니다. 그런 다음 분자를 Anchor_AMPAR, 물체를 원더라이트로 설정하고 영역을 PSD1로 설정합니다.

기초 조건 시뮬레이션을 실행하려면 실행 시뮬레이션을 선택합니다. 그리고 반복을 30, 000으로 설정하고 시간 단계를 10번에서 마이너스 3초로 설정합니다. 내보내기 및 실행을 클릭하고 시뮬레이션이 끝날 때까지 기다립니다.

시뮬레이션의 끝에서 시각화 데이터 재로드, 애니메이션 재생, 플롯 출력 설정 및 플롯을 선택하여 공간 시간 결과를 시각화합니다. 동종 성 전위 조건을 실행하려면 분자 배치 및 rel_anchorLTP_psd1 선택합니다. rel_anchorLTP_psd1 선택하고 릴리스수량을 200으로 변경합니다.

그런 다음 수량을 0으로 변경합니다. rel_anchor_psd1 선택합니다. 수량을 변경하여 릴리스를 0으로 변경하고 방금 설명한 대로 시뮬레이션을 실행합니다.

시냅스 가소성은 각 척추의 앵커에 바인딩 된 AMPARs종의 수의 변화를 통해 대략 확인할 수 있습니다. 시냅스 가소성의 발생의 정확한 계산을 위해. 시냅스에서 고정 및 무료 AMPAR의 총 수의 변동을 계산하는 것이 좋습니다.

AMPAR 균질성 전능성 및 우울증은 기초 상태에 비해 앵커에 의한 AMPARs의 선호도 변화에 기인하여 각각 고정된 AMPARs의 수의 증가 및 감소를 통해 확인할 수 있다. 예를 들어 단일 척추에서 균질성 장기 전능 유도는 이웃 척추에서 이종성 장기 우울증 효과를 만듭니다. 이 절차에 따라 모델을 확장하여 Dendritic 척추에서 LTP 및 LTD 유도 과정을 조사할 수 있습니다.

이 방법을 사용하면 많은 수의 변수가 있는 복잡한 비선형 시스템의 기능에 대한 가설을 테스트할 수 있습니다.