2D-HELS MS Seq: A General LC-MS-Based Method for Direct and de novo Sequencing of RNA Mixtures with Different Nucleotide Modifications

Ning Zhang; Shundi Shi; Barney Yoo; Xiaohong Yuan; Wenjia Li; Shenglong Zhang

doi:10.3791/61281

Journal

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유전학

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2D-HELS MS 염기서열분석(2D-HELS MS SEQ): 뉴클레오티드 변형이 다른 RNA 혼합물의 직접 및 새로운 염기서열분석을 위한 일반적인 LC-MS 기반 방법

2D-HELS MS Seq: A General LC-MS-Based Method for Direct and de novo Sequencing of RNA Mixtures with Different Nucleotide Modifications

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2D-HELS MS Seq: A General LC-MS-Based Method for Direct and de novo Sequencing of RNA Mixtures with Different Nucleotide Modifications

2D-HELS MS 염기서열분석(2D-HELS MS SEQ): 뉴클레오티드 변형이 다른 RNA 혼합물의 직접 및 새로운 염기서열분석을 위한 일반적인 LC-MS 기반 방법

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05:41 min

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July 10, 2020

DOI:

10.3791/61281-v

DOI:

10.3791/61281-v

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05:41 min

July 10, 2020

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Ning Zhang^1,2, Shundi Shi², Barney Yoo³, Xiaohong Yuan¹, Wenjia Li⁴, Shenglong Zhang¹

¹Department of Biological and Chemical Sciences,New York Institute of Technology ²Department of Chemical Engineering,Columbia University ³Department of Chemistry, Hunter College,City University of New York ⁴Department of Computer Science,New York Institute of Technology

Summary

여기에서는 cDNA 중간체 없이 짧은 RNA(실행당 <35nt)를 염기서열분석하는 직접 방법과 단일 염기 정밀도에서 단일 연구에서 다른 뉴클레오티드 변형을 염기서열분석하는 일반적인 방법으로 사용할 수 있는 LC-MS 기반 염기서열분석 방법에 대한 자세한 프로토콜에 대해 설명합니다.