Name: 미토콘드리아 멤브레인 역학 을 재구성하기위한 모델 멤브레인 플랫폼 (동영상) | JoVE Journal
Uploaded: 2020-09-02T15:00:00.000+00:00
Duration: 10 min 31 s
Description: 학습하세요 미토콘드리아 내막 융합 메커니즘을 연구하는 체외 재구성 플랫폼을 활용한 정량적 막 단백질 분석 방법. 이 기술은 세포 건강 및 미토콘드리아 역학 연구에 필수적인 도구를 제공합니다.

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저자는 찰스 H. 후드 재단 아동 건강 연구 상에서 지원과 매사추세츠 종합 병원에서 분자 생물학의 부서에서 관대 한 지원을 인정합니다.

1. 지질 혼합물의 준비
<ol><li>1,2-디오레오틸-센-글리페로-3포스포콜린(DOPC), 1-팔미토일-2-올레오일-센-글리케로-3-인포에탄올라민(교황), L-α-포스파디글리노이톨(간 PI), 카디오리핀, 카디오리핀, 카디오이티리노이톨(간 PI) 용액을 풀어 지질 스톡 용액을 준비 및 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoeolamine-N-[메톡시(폴리에틸렌 글리콜)-2000] (18:1 PEG2000 PE) 클로로폼으로 25 mg/mL의 농도. 형광염염수-공주지질(텍사스레드 DHPE 및 Cy5 DOPE) 클로로폼을 1 mg/mL 농도로 용해한다. 엽록소 내성 라이너가 있는 호박색 바이알에 지질 용액을 보관하고 폴리테트라플루오로틸렌 테이프로 밀봉합니다. 용액은 최대 6 개월 동안 -20 °C에서 보관 할 수 있습니다.</li>
	<li>솔루션 A와 B를 만듭니다.<ol>
<li>DOPC(52.8mol%), 교황(20mol%), 간PI(7mol%)를 함유한 솔루션 A(최종 농도 1 mg/mL)를 준비하려면 지질을 혼합합니다. 및 심폐소심(20mol%) 및 0.2 mol% 불소.</li>
		<li>DOPC(47.8mol%), 교황(20mol%), 간PI(7mol%), 카디오리핀(20mol%) 함유 솔루션 B(최종 농도 1 mg/mL)를 만듭니다. 도페-페그2000(5mol%) 및 0.2 mol% 불소호레.</li>
		<li>유리 주사기를 사용하여 호박색 바이알에 저장 용액의 계산된 볼륨을 추가하여 지질 혼합물을 생성합니다. 바이알에 클로로폼을 추가하여 최종 볼륨을 일치시합니다. 참고: FCS의 경우(형광 상관 분광법)의 경우 염료 공액 지질의 비율을 0.002 mol%로 줄이고 나머지는 DOPC에 의해 대체합니다.</li>
	</ol>
</li>
</ol>2. 지질 이중층의 제조
<ol><li>30 분 동안 520 °C에서 현미경 커버 유리 슬라이드를 굽습니다. 베이킹 후 커버 슬라이드를 실온으로 식힙니다.</li>
	<li>수산화 나트륨의 약 10 g의 무게와 교반하는 동안 메탄올의 500 mL에 추가합니다. 2시간 동안 저어주고, 침전이 나타나기 시작할 때까지 용액에 수산화 나트륨을 계속 추가하십시오. 전체 공정 중에 적절한 PPE를 착용해야 합니다.</li>
	<li>10% 나트륨 도데실 황산염 용액에 유리 슬라이드를 청소; 수산화 나트륨으로 포화 된 메탄올; 및 50mM 염산, 순차적으로(각 조건하에서 30분 동안 목욕 초음파 처리). 각 조건 사이에 10 분 동안 초순수 물로 유리 슬라이드를 청소하십시오. 참고: 유리 슬라이드 준비에 신선한 솔루션을 사용하는 것이 좋습니다만 각 솔루션은 최대 5배 또는 1개월 이내에 재사용할 수 있습니다. 각 사용하기 전에 솔루션을 교반해야 합니다.</li>
	<li>깨끗한 커버 글래스를 HCl 솔루션에 밀봉하여 최대 2주 동안 보관하여 양층 품질을 보장합니다. 초순수에 보관하면 1주일 이내에 슬라이드를 사용하십시오.</li>
	<li>클로로폼과 초순수를 사용하여 랑뮤어-블로젯 디핑 시스템의 폴리테트라플루오로틸렌 트로프를 청소하여 쓰루에 젖지 않을 때까지 청소하십시오. 쓰루 표면에 클로로폼을 스프레이하고 셀룰로오스 와이프 3배로 철저히 닦으십시오. 초순수물로 헹구고 흡입을 통해 물을 제거합니다. 3배 반복합니다.</li>
	<li>깨끗한 초순수물로 쓰루 표면을 덮습니다.</li>
	<li>세정 용액 또는 초순수물에서 표면 처리 커버 유리 2개를 가져 와서 유리 슬라이드를 약 30 초순수물로 헹구십시오.</li>
	<li>커버 글래스를 백투백 방식으로 배치합니다. 기판 클램프를 사용하여 유리 슬라이드를 잡습니다. Langmuir 제어 소프트웨어에서 수동으로 "디퍼 다운"을 클릭하여 수면 아래 유리 슬라이드를 침지하십시오.</li>
	<li>필름 밸런스를 제로, 조심스럽게 확산 솔루션 B 는 공기 물 인터페이스(그림 2A)에서드롭에 의해 드롭. 폴리테트라플루오로틸렌 표면의 바닥으로 가라앉는 클로로폼과 지질 방울이 없는 공기물 인터페이스에서만 지질이 확산되고 있는지 확인하십시오.  이를 보장하지 못하면 지질 "채널"이 생성되고 단층 형성을 방지할 수 있습니다.</li>
	<li>~ 15-20 mN/m 주위의 필름 밸런스 판독까지 지질 을 추가 중지하고 ~ 10-15 분 기다립니다. 37 mN/m까지 필름 밸런스 판독까지 "실험 시작"을 클릭하여 표면적을 변경하는 배리어 컨트롤러를 시작합니다. ~20~30분(그림2B)에대한 압력을 유지합니다.</li>
	<li>37 mN/m의 표면 장력을 유지하면서 22mm/min의 속도로 커버 글래스를 올립니다. 폴리머 테더링을 갖춘 지질 단층은 Blodgett 디핑공정(도 2C)을통해 커버 글래스 표면으로 공기-물 인터페이스에서 전송됩니다. 이것은 지질 이중 층의 하단 전단지를 형성한다.</li>
	<li>흡입에 의해 공기 물 인터페이스를 청소하고, 초순수물로 트로프를 헹구는 다.</li>
	<li>사용하기 전에 클로로폼, 에탄올 및 초순수물을 사용하여 한 웰드 글라스 슬라이드(예: 쉐퍼 슬라이드)를 청소하십시오. 물 층 아래에 초순수물로 트로프에 깨끗한 유리 슬라이드를 설정합니다. 우물이 공기 물 인터페이스를 향하고 있는지 확인하고 유리 슬라이드가 완전히 덮일 때까지 신선한 초순수물을 부어 줍니다. 2.8 단계를 반복합니다.</li>
	<li>실리콘 흡입 컵을 사용하여 2.4 단계에서 지질 단층으로 커버 글래스를 잡고 (단층 측이 흡입 컵에서 떨어져 있는지 확인), 부드럽게 공기 물 인터페이스에 지질 단층을 밀어, 인터페이스에서 ~ 2-3 s에 대한 커버 유리를 잡고, 슬라이드에 대한 커버 유리를 밀어(도 2D). 커버 슬라이드로 슬라이드를 꺼내십시오. 참고: 지질 이중층은 두슬라이드(그림 2E)사이의 끼어있는 영역을 향한 커버 글래스의 표면에서 개최됩니다.</li>
	<li>이중 층으로 커버 유리를 피의 불피 현미경으로 가져 가라. 지질 이중 층을 이미지합니다. 지질염의 균일한 분포가 관찰되면, 30초 동안 바이레이어의 작은 면적을 광표백하고, ~30 s-1분 동안 광원을 끄고, 다시 영상을 사용하여 회복을 관찰한다. 지질 이중층은 형광 회복을 보여줍니다. 참고: 결함이 있거나 형광 회복이 나쁜 멤브레인은 추가 실험에 사용해서는 안 됩니다.</li>
</ol><img alt="Figure 2" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/61620/61620fig2v2.jpg"> 그림 2: 폴리머 테더지질 이중층을 만드는 단계. 랭뮤어-블로젯디핑(A-C)및 랭뮤어-쉐퍼 트랜스퍼(D) 기술을D사용하여 지질 이중층을 만드는 단계. (E)지질 이중층을 포함하는 최종 "샌드위치". <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/61620/61620fig2v2large.jpg" target="_blank">이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.</a>
3. 폴리머 테더지질 이중층으로 단백질 재구성
<ol><li>초순수가 함유된 결정화 접시를 준비한다. 깨끗한 현미경 이미지 링을 준비하고 접시 아래에 놓습니다.</li>
	<li>쉐퍼 슬라이드의 "샌드위치"를 침지하고 물 아래에 지질 이중 층을 포함하는 커버 유리를 담그고 쉐퍼 슬라이드와 커버 유리를 부드럽게 분리하고, 하단에서 커버 유리 슬라이드를 잡고, 이중 레이어 측면에서 멀리, 이미지 링으로 커버 유리를 전송합니다. 참고: 지질 이중층이 있는 커버 글래스가 항상 물에 있고 링이 잘 밀봉되어 있는지 확인하십시오.</li>
	<li>이미지 링의 초순수수를 비스-트리스 NaCl 버퍼로 교체하고 지질 이중층이 기포에 노출되지 않았는지 확인합니다. 지질 이중층에 1.1 x 10-9 M n-옥틸-β-D-글루카피라노사이드를 넣습니다. 즉시 DDM의 1.2 x 10-9 M과 1.3 x 10-12 mol 정제 l-Opa136의 혼합물을 이미지 링에 추가합니다. 2 시간(그림 3)에대한 저속으로 벤치 탑 셰이커에 샘플을 배양한다. 참고: 세제는 재구성할 단백질에 따라 달라질 수 있습니다.</li>
	<li>SM-2 수지 구슬 30 mg을 비스 트리스 버퍼와 쉐이크3mL로 나누어 적용하기 전에 흔들어 줍니다. 플라스틱 파이펫을 사용하여 SM-2 수지 구슬의 5~10 μL을 이미지 링에 추가하고 10분 동안 배양하고 헹구어 수지 구슬을 제거합니다. 이미지 링의 버퍼의 마지막 볼륨은 1.5mL입니다.</li>
</ol><img alt="Figure 3" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/61620/61620fig3v2.jpg"> 그림 3: l-Opa1을 폴리머 테더지질 이중층으로 재구성하는 절차. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/61620/61620fig03large.jpg" target="_blank">이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.</a>
4. 프로테올리포좀 준비
<ol><li>클로로폼 용액으로 지질 혼합물 A 1 mg을 준비합니다. 질소 흐름 하에서 20분 동안 엽록소포형을 증발시키고 밤새 진공 상태에서 유지하여 지질 필름을 형성합니다.</li>
	<li>15.56g의 칼세인을 1.5mL로 용해시켜 1.5mL의 1.5몰 NaOH 용액을 녹여서 50mMM의 칼세인을 준비하고, 칼신이 완전히 용해될 때까지 실온에서 저어주며, 12.5mM 비스-트리스와 초순수수를 500mL의 최종 부피에 첨가한다. pH를 7.5로 조정합니다.</li>
	<li>충완을 포함하는 칼세인에서 지질 필름을 중단하고, 65°C에서 20분 동안 서스펜션을 가열하여 지질을 완전히 수화한다. 200nm 리포솜은 폴리카보네이트 멤브레인을 사용하여 압출을 통해 형성된다.</li>
	<li>l-Opa1 2 μg를 0.5 μM DDM에 0.2 mg 리포솜에 넣고 4°C에서 1.5h의 인큐베이션을 넣습니다. 25m 비스트리스의 250ml, 150mM MM NaCl 및 50mM 칼세인 버퍼를 4°C에서 2°C로 3.5kDa 투석 카세트를 사용하여 투석에 의한 계면활성제를 제거하여 버퍼를 2회 변경한다.</li>
	<li>PD-10 탈염 열을 사용하여 여분의 칼세인을 제거합니다.</li>
</ol>5. 이미징 및 데이터 분석
<ol><li>100x 오일 침지 목표(N.A 1.4)를 사용하여 TIRF 이미지를 획득합니다. 사용 543 nm 레이저와 488 nm 레이저 텍사스레드-PE 라벨 리포솜과 칼세인캡슐화 의 분석을 위한 nm 레이저. 평면 지질 이중층에 내장된 Cy5-PE 분석을 위해 633 nm 레이저를 사용하십시오.</li>
	<li>지질 이중층을 사용하여 TIRF 각도를 정렬하여 최대 방출을 얻습니다. 25°C에서 100x 오일 목표를 사용하여 재구성 후 지질 이중층의 품질이 관찰된다. 인지질 및 재구성된 이중레이어의 확산 계수는 다른37을설명하는 프로토콜을 가진 FCS를 사용하여 결정된다.</li>
	<li>이미지 링에 2 mg/mL 프로테올리포좀의 10 μL을 추가하고 이미지 전에 10분 동안 설정합니다. GTP, GMPPCP, 또는 GDP는 뉴클레오티드의 1 mM MgCl2 및 1 mMM와 반응 링에 추가됩니다.</li>
	<li>멤브레인 융합에서 s-Opa1의 영향을 결정하기 위해 s-Opa1을 l-Opa1을 포함하는 프로테오올리푸좀/지원 된 바이레이어 샘플로 적시하고 융합 이벤트를 기록합니다.</li>
	<li>텍사스레드-DHPE 및 칼신의 동시 이미징은 빔 분할 시스템을 통해 달성됩니다. 488 nm와 543 nm 레이저는 모두 동시에 밀가루 발광 소스로 샘플에 적용됩니다. 그런 다음 방출 광은 560 nm 빔 스플리터를 사용하여 분할됩니다. 분할 방출 광은 42 nm의 대역폭과 40 nm의 대역폭이있는 510 nm 필터와 40 nm의 대역폭을 가진 609 nm 필터로 필터링됩니다. 여과된 빔은 카메라 칩의 두 개의 인접 영역으로 투사됩니다.</li>
	<li>형광 방출은 40 nm의 대역폭을 가진 609 배출 필터와 70 nm의 대역폭을 가진 698 방출 필터를 통해 동시에 기록됩니다. 현미경 시스템에는 -10 °C에서 유지되는 CMOS 카메라가 장착되어 있습니다.</li>
	<li>리포솜의 입자 식별은 가우시안 기반 입자 인식 알고리즘을 사용하여 수행될 수 있다. 입자 분포와 강도는 채널별 분석됩니다. 지질 이중층 신호는 입자를 분리하는 마스크로 사용됩니다.</li>
</ol>

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</ol>

시험관 내 모델 멤브레인 시스템은 잘 정의된 조건하에서 복잡한 멤브레인 프로세스를 설명할 수 있습니다. 이러한 시스템은 분자 메커니즘6,15,,20,,38을드러내기 위해 복잡한 분자 공정에 필요한 최소한의 구성 요소를 구별할 수 있다., 막 단백질의 경우, 리포솜과 평면 지원 이중층은 일반적인 재구성 시스템입니다. 고체 지원 지질 양층과는 달리, 폴리머 테더바이층의 기판과 지지막 사이의 폴리머 쿠션은 대형 멤브레인 단백질의 자유로운 이동성을 허용하고, 막 단백질은 자유롭게 확산및조립34를허용한다. 이러한 특징은 우리가 미토콘드리아 내막 융합36의운동학을 조사하는 데 도움이.
우리는 랭뮤어-블로젯/랭뮤어 셰퍼(LB/LS) 기술을 사용하여 폴리머 테더지질 바이레이어를 준비했습니다. 이를 통해 비대칭 지질 성분이 있는 바이레이어를 준비할 수 있습니다. 세포막은 비대칭 전단지 조성물을 가지며, LB/LS 접근법은 이러한 이중층의 연구를 허용한다. 쉐퍼 전달을 사용하면 전체 유리 기판이 지질 이중 층으로 덮을 수 있습니다. 이중 레이어 준비를 위해 깨끗한 표면을 준비하는 것이 중요합니다. 또한 쉐퍼 전송을 올바르게 수행하는 연습이 필요합니다. 실패한 쉐퍼 전송은 지질 이중 층에서 원치 않는 결함을 만들 수 있습니다. 이 프로토콜에서 필름 밸런스에 첨가된 압력은 20% 심폐진을 함유하는 이중층에 적용됩니다. 다른 구성 요소와 이중 레이어의 경우 주요 구성 요소의 표면 압력 영역 이더렘을 참조하십시오. 다른 방법은 Langmuir-Blodgett/소포 융합(LB/VF) 방법으로, 하부 지질 단층이 랭뮤어 트로프의 공기-물 인터페이스에서 깨끗한 기판으로 옮겨진 다음, 리포솜이 지원되는 지질 단층의 상부로 융합되어 최종이중층(39)을형성한다. LB/VF 방법을 사용하는 멤브레인 단백질의 재구성은 프로테오폴좀의 융합을 통해 재구성이 수행될 수 있기 때문에 LB/LS보다 더 간단하다. 그러나, 소포 융합은 과잉 리포좀의 추가를 요구합니다, 이는 농도 의존적인 단백질 단백질 상호 작용에 의존하는 막 사건의 연구를 복잡하게 할 수 있습니다.
바람직한 기능성 방향에서 폴리머 테더지질 이중층과 리포솜으로 막 이상 단백질의 성공적인 재구성은 중요하지만 시행하기어렵다. 이를 설명하기 위해서는 실험 컨트롤이 필요합니다. 폴리머 테더지질 이중층의 경우, 재구성 하는 동안 지질 이중 층의 무결성을 유지 하는 것이 중요 하다. 계면활성제 농도는 지질 이중층을 용해시키는 것을 방지하기 위해 상대적으로 낮게 유지되어야 하지만, 관심 있는 단백질의 저하를 방지할 수 있을 만큼 충분히높음(37,,40). 여기에서 기술된 방법은 단 하나 분자 연구를 위한 막 단백질을 재구성하는 데 이상적이지만 대규모 연구를 위해 반드시 확장가능한 것은 아닙니다. 계면 활성제 선택은 또 다른 중요한 고려 사항입니다. 정제 및 보관에 사용되는 계면활성제는 좋은 출발점이 되는 경우가 있습니다. 계면활성제의 최대 농도는 일반적으로CMC(36)의200배 이하이며, 계면활성제가 단백질 안정성을 유지하고 단백질 응집을 방지하는 범위에서멤브레인(36)의무결성을 유지한다. 계면활성제 2개 또는 3개가 함유된 칵테일을 고려할 수 있습니다. 리포솜으로 재구성하기 위해서는 계면활성제의 낮은 농도가 필요하지 않습니다. 그러나, CMC 이하의 계면활성제 농도는 리포솜에 대한 균일한 크기 및 형태 분포를 유지하는 것이 바람직하다. 내용 염료의 누출을 방지하기 위해 염료 함유 버퍼에 대해 투석할 필요가 있습니다.
리포솜 기반 융합 분석과는 달리, 우리가 설립한 플랫폼은 멤브레인 융합의 각 단계의 운동학을 조사하는 접근 방식을 제공합니다. 이 방법은 거의 네이티브 조건하에서 막 간 융합 단백질을 연구하는 기능을 제공합니다. 모델 멤브레인 플랫폼은 미토콘드리아 내막과 같은 세포 외 환경에서 막 단백질 조립 및 올리고머화, 멤브레인 "조각"및 단백질 지질 상호 작용을 연구하기 위해 적용될 수 있습니다. 이 방법은 또한 이중층 조성 비대칭과 같은 막 단백질 상호 작용에서 중요한 생리적 조건을 탐구할 수 있게 합니다. 리포솜과 폴리머 지원 이중층의 이중층 특성에서 주요 미토콘드리아 지질, 심막의 역할은 정의되어야 한다. 이온 강도, 막 두께, 막 강성, 멤브레인 곡률 및 멤브레인 탄성 점도 특성과 같은 특성은 모두 단백질이 특정 기능 상태로 조립하는 능력에 영향을 미칠 수 있습니다. 모형 막 시스템을 창의적으로 적용하는 미래 연구는 막 단백질 조직 및 기능의 새로운 양상을 밝힐 가능성이 있습니다.

막 구획화는 진핵 세포 1(도 1A)의특징입니다.1 생물학적 멤브레인은 2차원 용매 이상으로 점점 더 인식되고 있으며, 단백질 기능 및 거시 분자 복합 조립2,,3을조절하는 데 중요한 역할을 하는 환경으로 간주됩니다. 네이티브 지질은 막 단백질 활성3,,4를조절하는 리간드입니다. 멤브레인 공간 조직과 다양한 모양으로 조각되는 멤브레인의 능력은 새로운 함수3,,5를선택하는 데 중요한 물리적 특성입니다.
모델 멤브레인 플랫폼은 세포막 구조, 역학 및,기능6,7,78을이해하는 데 도움이 되는 생체 모방 시스템입니다. 모델 멤브레인은 전형적으로 정의된 생체 물리학적 특성(강성, 두께 및 탄력)을 가진 잘 정의된 조성물의 지질 혼합물을 포함한다. 형광 이미징에 결합된 모델 멤브레인 플랫폼은 멤브레인 구조 및 기능9,,10,,11의정량적 분석을 허용합니다. 지질 이중층 재구성 전략은 SNARE 매개 막 융합9,,10,DNA 매개 막 융합12,바이러스 융합11,,13을연구하기 위해 사용되어 왔다. 이러한 방법의 장점은 관찰 가능한 반응이벤트(14)에앞서 중간 단계에 대한 운동 정보를 얻을 수 있는 가능성이있다.
플라즈마 멤브레인은 모델 멤브레인을 사용하여 광범위하게 연구되었습니다. 지질상 분리를 갖는 쌍층은 세포 신호11,,15,,16에서중요한 지질 뗏목 구조를 연구하기 위해 개발되었다. 마이크로패턴 지질 평면 이중층17,,18세포 수용체의 조직을 조사하는 데 사용되어 왔다. 중합체 또는 겔 지원 멤브레인은 막 세포골격 조직을 연구하기 위해 생체 모방 시스템으로 사용되어 왔으며, 세포 신호 화 시 막 단백질 분할, 세포-세포접촉(19)에서의이주로 사용되었다.
인공 멤브레인 시스템은 또한 세포 외 세포 세포기관을 연구하기 위해 적용되고있다(20). 소기관은 고유한 하위 환경을 만드는 특징적인 형태를 특징으로 합니다. 내풍술 망막(ER) 네트워크는 한 가지 예입니다. 리포솜으로 망상을 재구성하면 세포 ER과 유사한 특성을 가진 관 막 구조가형성된다 21. ER 융합 단백질인 아틀라스틴을 첨가하면 리포솜으로부터 지질 튜블러를 유도하여네트워크(20)를형성할 수 있다. 이것은 proteoliposomes가 세포구 형태학 및 역학에 대한 기능적 통찰력을 제공하는 방법에 대한 한 가지 예입니다.
미토콘드리아 막 융합 및 핵분열은 미토콘드리아 인구22,,23,,24,,25의건강에 필수적이다. 다이너마이가족 GTPases세트는 미토콘드리아 막 융합을 촉매합니다. Mfn 1/2는 외부 막 융합을 촉매합니다. Opa1은 내부 막융합(26)을 중재한다(도1B). Opa1은 두 가지 형태를 가지고 있습니다: 긴 형태 (l-Opa1), 미토콘드리아 내막에 고정된 막 막, 및 막 간 공간에 존재하는 '용해성' 짧은 형태 (s-Opa1)가 있습니다. 두 Opa1 형태의 비율은 두 프로테아제, Oma1 및 Yme1L27,,28,,29,,30의활성에 의해 조절된다. Opa1 규정의 중요한 질문은 다음과 같습니다 : Opa1의 두 가지 형태, (짧고 긴) 중도 막 융합 및 규제 상호 작용28,,29,,31,,32,,33.
여기서 우리는 성공적으로 내부 막 융합에서 l-와 s-Opa1의 역할을 명확히 미토콘드리아 내부 막 융합을 조사하기 위해 적용 된 재구성 전략을 설명합니다. 우리는 폴리머 테더지질 바이레이어와 200 nm unilamellar 소포를 사용하여 미토콘드리아 내막을 모방하는 플랫폼을 개발했습니다. 지질 이중층 아래에 있는 폴리머 밧줄의 이점은 다음을 포함한다. 첫째, 재구성된 막 단백질을 보존하며, 이는 유리슬라이드(34)에근접하여 중단될 수 있다. 둘째, 지질 이중층과 유리 기판 사이의 두꺼운 물층을 제공하며, 이는 공공 개방9의연구를 용이하게 하며, 제3페 폴리머의 점탄성 특성으로 막 곡률변화(35)를허용한다. 우리는 멤브레인 융합(도 1C-F)의단계를 특성화하기 위해 3 색 형광 이미징을 사용했습니다.
<img alt="Figure 1" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/61620/61620fig1v2.jpg"> 그림 1: 미토콘드리아 막 융합 모니터링. (A)세포기관은 세포막 구획이다. (B)미토콘드리아 막 융합의 순차적 단계. 미토콘드리아의 외부 막의 융합은 Mfn1 및/또는 Mfn2에 의해 촉매화되고, 내막 융합은 Opa1에 의해 중재된다. (C-F) 미토콘드리아 막 융합을 연구하기 위해 체외 재구성 플랫폼의 회로도. 이 플랫폼에는 프로테오올리포솜과 폴리머 테더드 지질 이중레이어, 재구성된 l-Opa1의 두 가지 부분이 포함되어 있습니다. 두 개의 다른 형광막 염료와 함량 마커를 포함한 형광 라벨은 멤브레인 융합 중 단계를 구별하는 데 도움이됩니다. 두 개의 멤브레인 마커 (Cy5-PE (빨간색) 및 텍사스레드 PE (주황색)는 가까운 멤브레인 도킹에 대해보고 할 수있는 FRET 쌍을 만듭니다. proteoliposome 라벨 텍사스Red-PE의 확산은 지질 디믹싱의 지표입니다 (혈류). 콘텐츠 릴리스는 칼신 신호의 해수를 통해 모니터링됩니다(녹색으로 표시됨). 바이오렌더를 사용하여 만든 패널 A와 B. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/61620/61620fig01large.jpg" target="_blank">이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.</a>

<table><tbody><tr><td>1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine-N-(Cyanine 5)</td><td>Avanti 극성 지질</td><td>Cat #: 810335C1mg</td><td>멤브레인 형광 마커</td></tr><tr><td>1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine-N-[methoxy(polyethylene glycol)-2000](암모늄 염)</td><td>Avanti polar lipids</td><td>Cat #: 880130P</td><td>지질 분자</td></tr><tr><td>1',3'-bis[1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phospho]-glycerol(sodium salt)</td><td>Avanti 극성 지질</td><td>Cat #: 710335P</td><td>지질 분자</td></tr><tr><td>18:1 (&Delta; 9-CIS) PC (DOPC)</td><td>Avanti 극성 지질</td><td>Cat #: 850375P</td><td>지질 분자</td></tr><tr><td>1-palmitoyl-2-oleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine</td><td>Avanti 극성 지질</td><td>Cat #: 850757P</td><td>지질 분자</td></tr><tr><td>Alexa Fluor 488 항체 라벨링 키트</td><td>ThermoFisher Scientific</td><td>A20181</td><td></td></tr><tr><td>PTFE 라이너가 있는 앰버 바이알</td><td>Fisher scientific</td> 지질 유지를 위한 <td>14-955-332</td><td>샘플 바이알 솔루션</td></tr><tr><td>Calcein</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>Cat #: C0875; PubChem 물질 ID : 24892279</td><td>형광 염료</td></tr><tr><td>클로로포름</td><td>Fisher Scientific</td><td>298-500 / C295-4</td><td>Fisher 브랜드 클로로포름은 일반적으로 지질 작업에 매우 신뢰할 수 있습니다.</td></tr><tr><td>오목한 슬라이드 (1 well)</td> <td>전자 현미경 과학</td><td>71878-05</td><td>Schaefer Slide</td></tr><tr><td>FCS 분석 도구로</td> 적용 <td>Smith Lab, University of Akron</td><td></td><td>소프트웨어 도구</td></tr><tr><td>피지 / ImageJ</td><td>피지</td><td>SCR_002285</td><td>소프트웨어 도구</td></tr><tr><td>Fisherbrand Cover Glasses :</td><td>Circles Fisher Scientific</td><td>12-545-102</td><td>고체 지지 지질 이중층을 위한 커버 유리, 이 항목은 저자가 원고를 준비함에 따라 현재 중단되었습니다. 대안은 카탈로그 번호: 12-548-5M</td></tr><tr><td>GTP 디소듐 염</td><td>SIGMA-ALDRICH INC</td><td>Cat #: 10106399001</td><td></td></tr><tr><td>Langmuir & Langmuir-Blodgett Trough</td><td>Biolin Scientifc</td><td>KN2002</td><td></td></tr><tr><td>L-&alpha;-lysophosphatidylinositol (Liver, Bovine) (sodium salt)</td><td>Avanti Polar lipids</td><td>Cat #: 850091P</td><td>지질 분자</td></tr><tr><td>Mini Extruder</td><td>Avanti Polar lipids</td><td>610020</td><td></td></tr><tr><td>n-Dodecyl-&beta;-D-Maltopyranoside</td><td>Anatrace</td><td>Cat #: D310</td><td></td></tr> <tr><td>25 GM 계면활성제 재구성n-Octyl-&alpha;-D-Glucopyranoside</td><td>Anatrace</td><td>Cat #: O311HA 25 GM</td><td>계면활성제 재구성</td></tr><tr><td>PC 막 0.2&mu; m</td><td>Avanti Polar Lipids</td><td>610006</td><td></td></tr><tr><td>Rabbit Anti-Opa1 항체</td><td>NOVUS BIOLOGICALS</td><td>Cat #: NBP2-59770</td><td>Opa1 C-terminal 검출용 항체</td></tr><tr><td>슬라이드북</td><td>지능형 이미징</td><td>RRID: SCR_014300</td><td>소프트웨어 도구</td></tr><tr><td>테프론 나사산 밀봉 테이프</td><td>Fisher Scientific</td><td></td><td>NC0636085 시료 보관</td></tr><tr><td>용 타프론 테이프Texas Red 1,2-Dihexadecanoyl-sn-Glycero-3-Phosphoethanolamine, Triethylammonium Salt (Texas Red DHPE)</td><td>ThermoFisher Scientific</td><td>Cat #: T1395MP</td><td>membrane 형광 마커</td></tr></tbody></table>

미토콘드리아 멤브레인 역학 을 재구성하기위한 모델 멤브레인 플랫폼

A Model Membrane Platform for Reconstituting Mitochondrial Membrane Dynamics

미토콘드리아 역학은 세포기관의 다양한 기능과 세포 반응에 필수적입니다. 혼잡하고 공간적으로 복잡한 미토콘드리아 멤브레인은 규제 요인을 구별하는 어려운 환경입니다. 단백질과 지질 성분의 실험적 제어는 규제의 특정 질문에 대답하는 데 도움이 될 수 있습니다. 그러나 이러한 요인의 정량적 조작은 세포 분석에서 어렵습니다. 미토콘드리아 내막 융합의 분자 메커니즘을 조사하기 위해 미토콘드리아 내막의 지질 환경을 모방한 체외 재구성 플랫폼을 도입했습니다. 여기에서 우리는 지질 이중층을 준비하고 미토콘드리아 막 단백질을 재구성하기 위한 상세한 단계를 설명합니다. 이 플랫폼은 미토콘드리아 내막 융합및 개별 전이를 위한 운동학의 중간체분석을 정량적 방식으로 분석할 수 있었습니다. 이 프로토콜은 비대칭 지질 조성을 가진 이중층의 제조를 설명하고 완충된 양층으로 막음 단백질을 재구성하기위한 일반적인 고려 사항을 설명합니다. 이 방법은 다른 멤브레인 시스템을 연구하기 위해 적용될 수 있다.

재구성된 막 단백질은 자유롭게 확산되고 멤브레인에 균질하게 분포됩니다.
지질 이중층및 그 지질 유동성의 예는 피겨에피언경화 현미경 검사법에 의해 검증된다 4. 사진 표백 전후의 이중층에서지질 분포가 도 4A, B에표시됩니다. 지질 이중층의 균질성은 재구성 전후의 상피현미경을 사용하여 시각화하였다(도Figure 44D, E). 지질 이중층에서 재구성된 l-Opa1은 형광 상관 분광법(FCS)에 의해 검증되었다. 우리는 염료 공액 지질을 사용하여 양층의 지질 확산도를 평가합니다. 재구성된 Opa1은 형광 태그된 항-Opa1 C-말단 항체를 사용하여 표지되었다. 이중층 지질 확산은 1.46 ±0.12 μm22/s로 측정되었으며, 이중층 재구성l-Opa1의 확산 계수는 0.88 ± 0.10 μm 2/s였다.2 FCS 곡선의 강도 판독값은 l-Opa1의 75%가 지질 이중층(그림4G, H)으로재구성된 것으로 나타났다. 이러한 결과는 l-Opa1이 고분자 테더지질 이중층에서 자유롭게 확산되어 기능성 복합체로 자가 조립할 수 있음을 시사합니다.
<img alt="Figure 4" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/61620/61620fig04.jpg"> 그림 4: 모델 멤브레인에서 지질 및 재구성된 단백질의 분포. (A-C) 지질 이중층과 그 지질 유동성의 예 이미지는 과민성 현미경 검사법에 의해 검증됩니다. (A)광표백 전에 이중층에서 균일한 지질 분포. (B)포토블리싱 직후 스냅샷. (C)형광 회복 후 이미지화된 이중층은 재구성 에 따른 멤브레인의 양호한 지질 유동성을 나타낸다. (D,E) 지질 분포의 대표적인 이미지는(D)및 그 후(E)l-Opa1 재구성은 재구성 과정이 이중층에서 결함을 생성하지 않았음을 나타낸다. 알렉사 488 공조항체(F)로표기된 l-Opa1의 대표적인 TIRF 이미지는 재구성시 Opa1의 균질분포를 보여준다. G. 형광 상관 분광학에 의한 l-Opa1 신호의 대표적인 원시 광자 수. 대조군에서는 l-Opa1이 이중층에서 재구성되지 않았으며 항체가 첨가되고 헹구었다. l-Opa1의 확산은 막에 있는 지질 보다는 현저하게 느립니다, transmembrane l-Opa1의 성공적인 재구성과 일치합니다(H). 스케일 바: 10 μm. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/61620/61620fig04large.jpg" target="_blank">이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.</a>
형광 단계 표백은 l-Opa1의 평균 2-3 사본이 주어진 리포솜(그림 5Figure 5A, B)으로재구성되었다는 것을 나타냈다. Opa1 재구성 된 프로테오폴좀의 크기 분포는 DLS(도 5C)를사용하여 재구성 한 후 테스트되었습니다. 프로테오올리푸좀에서 Opa1의 재구성은 FCS를 사용하여 검증되었습니다. 자유 항체의 확산 계수는 164 ± 222μm 2/s; 지질염으로 표시된 리포솜용 확산 계수는 2.22 ± 0.33 μm22/s였으며, 텍사스레드 표지된 항체는 2.12±0.36 μm2/s로텍사스레드 라벨에 묶여 있는 l-Opa1 프로테오리포좀에 대한 확산 계수였다.
<img alt="Figure 5" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/61620/61620fig05.jpg"> 그림 5: 프로테오폴좀의 제조 및 특성화. (A)캡슐화, 담금질 칼세인 프로테올리포솜을 제조하는 단계. (B)형광 단계 표백의 대표적인 데이터는 리포솜에 내장된 l-Opa1의 평균 2-3사본을 보여준다. (C)GTP 인큐베이션(green) 후 뉴클레오티드 1h 없이 프로테오올리포좀(red)의 대표적인 크기 분포. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/61620/61620fig05large.jpg" target="_blank">이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.</a>
형광 현미경 검사법에 의한 막 테더링, 지질 분해/혈전 및 모공 개구부를 검출합니다.
멤브레인 테더링은 TIRF현미경(도 6A)을사용하여 지질 이중층의 표면에 TexasRed의 신호를 관찰하여 모니터링된다. 막 지질 디믹스 (hemifusion) 행동은 지질 이중 층으로 지질에서 염료 확산으로 텍사스레드를 통해 모니터링되었다. 칼세인 디커닝은 전체 퓨전 모공 형성을 지질 디믹스와 구별하는 데 도움이 됩니다. 이를 통해 입자가 혈중(도 6B)에서 정지되는 조건과 전체융합(도 6C)으로진행되는 입자 간의 비교를 가능하게 한다.
멤브레인 테더링은 지질성으로부터 의 안정적인 지질 신호로 표시됩니다. 거리는 두멤브레인(36)의라벨 사이의 FRET 신호를 기반으로 평가될 수 있다. 헤미퓨전 신호는 칼세인신호(도 6B,하부 행)에 해금되지 않지만, 텍사스레드 신호의 급격한 붕괴는 지질 이중층(도6B 상부 행)으로 염료의 확산을 나타낸다. 전체 융합(모공 개구부)은 지질 부패와 내용 물자발매(도 6C)를모두 특징으로 합니다. 텍사스레드 강도 및 칼신 강도는 멤브레인융합(36)의운동에 대한 정량적 세부 사항을 제공하기 위해 시간에 따라 추적될 수 있다.
<img alt="Figure 6" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/61620/61620fig06.jpg"> 그림 6: 입자 테더링(A, 스케일 바 10 μm), 헴퓨전(B, 스케일 바 0.5 μm), 융합(C, 스케일 바 0.5 μm)을 나타내는 대표적인 결과. (A)프로테올리포솜은 GTP 첨가 전에 Opa1 재구성지질 이중층에 묶여 있다. (B)혈중의 예. B의 상부 행은 지질 디믹스(TexasRed 신호, 빨간색) B의 하부 행은 이러한 조건 하에서 콘텐츠 방출(calcein signal, green)을 나타내지 않는다. (C)지질 이중층과 융합된 프로테오올리포종의 대표적인 흔적. 콘텐츠 릴리스는 칼세인(하부 행, 녹색)의 해제를 보여주는 하부 행의 이미지에서 관찰할 수 있습니다. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/61620/61620fig06large.jpg" target="_blank">이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.</a>

미토콘드리아 융합은 미토콘드리아 역학의 근본적인 중요한 정동성 반응입니다. 여기에 설명된 시험관 내 재통합 시스템은 막 테더링, 도킹, 혈전 및 모공 개방을 해결할 수 있는 미토콘드리아 내막 융합을 연구한다. 세포막 시스템을 탐구하는 이 접근의 다양성은 토론됩니다.

Mitochondrial dynamics is essential for the organelle&#8217;s diverse functions and cellular responses. The crowded, spatially complex, mitochondrial ...

이 입자에서는 미토콘드리아 내막의 지질 환경을 모방한 체외 재구성 플랫폼을 소개합니다. 이 플랫폼은 미토콘드리아 내막 융합의 분자 메커니즘을 조사하는 데 사용할 수 있습니다. 이 기술의 주요 장점은 거의 네이티브 환경에서 일체형 막 단백질과 막 관련 단백질의 정량적 조사를 허용한다는 것입니다.시작하려면 원고 방향에 따라 솔루션 A와 B를 혼합한 다음, 유리 주사기로 호박색 바이알에 저장 용액의 계산된 볼륨을 추가하여 지질 혼합물을 생성합니다. 바이알에 클로로폼을 추가하여 최종 볼륨을 일치시합니다. 현미경 커버글래스 슬라이드를 섭씨 520도에서 30분간 굽습니다.베이킹 후 실온으로 식힙니다. 교반하는 동안 수산화 나트륨 약 10 그램을 메탄올 500 밀리리터에 추가합니다. 2시간 동안 저어서 침전이 나타날 때까지 수산화나트륨을 용액에 계속 추가합니다.유리 슬라이드를 10% 나트륨 도데실 황산염 용액, 수산화나트륨으로 포화된 메탄올, 50밀리머 염산으로 청소하여 각 조건하에서 슬라이드를 30분 동안 순차적으로 초음파 처리합니다. 유리 슬라이드를 초순수 물로 청소하여 각 조건 사이에 10분 간 청소합니다. 깨끗한 커버글래스를 염산 용액에 밀봉하여 최대 2주 동안 보관하여 양층 품질을 보장합니다.젖지 않을 때까지 클로로폼과 초순수를 사용하여 랑뮤어-블로젯 디핑 시스템의 폴리테트라플루오로틸렌 트로프를 청소하십시오. 클로로폼을 쓰루 표면에 뿌리고 셀룰로오스 물티슈로 세 번 철저히 닦은 다음 초순수물로 3번 헹구고 흡입을 통해 물을 제거합니다. 완료되면, 깨끗한 초순수물로 쓰루의 표면을 덮습니다.세정 용액에서 표면 처리 된 커버 글래스 두 조각을 가져 와서 약 30 초 동안 초순수물로 헹구십시오. 커버글래스를 기판 클램프를 사용하여 유리 슬라이드를 고정하는 방식으로 앞뒤로 놓습니다. Langmuir 제어 시스템에서 디퍼를 수동으로 클릭하여 수면 아래유리 슬라이드를 담급하십시오.필름 밸런스를 제로하고 조심스럽게 확산 솔루션 B 는 공기 물 인터페이스에서 드롭하여 드롭. 지질채널이 형성되고 단층 형성을 방지하는 폴리테트라플루오로틸렌 표면의 바닥으로 가라앉는 클로로폼과 지질 방울이 없는 공기물 인터페이스에서만 지질이 확산되고 있는지 확인하십시오. 필름 밸런스 판독이 미터당 약 15~20밀리리터일 때 지질 추가를 중단하십시오.10~15분 기다린 다음 배리어 컨트롤러를 시작하여 시작 실험을 클릭하여 표면적을 변경합니다. 필름 밸런스 판독이 미터당 37밀리뉴턴으로 증가할 때까지 기다렸다가 약 20~30분 동안 압력을 유지합니다. 미터당 37밀리톤의 표면 장력을 유지하면서 분당 22밀리미터의 속도로 커버글래스를 올립니다.폴리머 테더링을 하는 지질 단층은 공기물 인터페이스에서 블로젯 디핑 공정을 통해 커버글래스 표면으로 옮겨지질 이중층의 하단 리플렛을 형성한다. 흡입에 의해 공기 물 인터페이스를 청소하고 초순수물로 트로프를 헹구는 다. 클로로폼, 에탄올 및 초순수로 한 웰드 글라스 슬라이드를 청소한 후 물 층 아래 의 트로프에 놓습니다.우물이 공기 물 인터페이스를 향해 향하고 있는지 확인하고 유리 슬라이드가 완전히 덮여 때까지 신선한 초순수물을 부어, 다음 이전에 설명한 대로 수면 아래에 유리 슬라이드를 담급. 실리콘 흡입 컵을 사용하여 지질 모노 레이어로 커버 글래스를 잡고 지질 단층을 공기 물 인터페이스로 부드럽게 밀어 넣습니다. 인터페이스에서 2~3초 동안 커버 글래스를 누은 다음 슬라이드에 밀어 넣습니다.커버글래스로 슬라이드를 꺼내십시오. 표지유리와 이중층을 상피 현미경으로 가져 가서 텍스트 원고 지침에 따라 지질 이중 층을 이미지화하십시오. 초순수가 함유된 결정화 접시를 준비하고 깨끗한 현미경 이미지 링을 접시 아래에 놓습니다.물 밑에 지질 이중 층이 들어있는이 슬라이드와 커버 글래스를 담급하십시오. 슬라이드와 커버글래스를 부드럽게 분리하고 커버글래스 슬라이드를 바닥에서 잡고 커버글래스를 이미지 링으로 옮습니다. 이미지 링의 초순수수를 비스트리스 염화나트륨 버퍼로 교체하여 지질 이중층이 기포에 노출되지 않도록 합니다.지질 이중층에 1.1 나노몰라 n-옥틸 베타 글루카피라노사이드를 추가한 다음 즉시 1.2 나노몰러 DDM과 1.3개의 정제된 L-OPA1의 혼합물을 이미지 링에 추가합니다. 샘플을 벤치 탑 셰이커에 2시간 동안 저속으로 배양합니다. 30 밀리그램 SM-2 수지 구슬을 비스 트리스 버퍼 및 쉐이크의 3밀리리터에 분배합니다.플라스틱 파이펫을 사용하여 SM-2 수지 구슬의 5~10마이크로리터를 이미지 링에 추가하고 10분 동안 배양한 다음 수지 구슬을 헹구습니다. 이미지 링의 버퍼의 마지막 볼륨은 1.5 밀리리터여야 합니다. 엽록소용액으로 지질 혼합물 A 1밀리그램을 준비한 다음 질소 흐름 하에서 클로로폼을 20분 동안 증발시다.지질 필름을 형성하기 위해 밤새 진공 상태에서 혼합물을 유지합니다. 1.5 개의 어금니 나트륨 수산화 용액의 50 밀리리터에서 15.56 그램의 칼신을 용해하여 완충액을 함유 한 50 밀리마일칼슘을 준비하십시오. 칼신이 완전히 녹을 때까지 실온에서 혼합물을 저어줍니다.12.5 밀리몰러 비스 트리스와 초순수수를 추가하여 500밀리리터의 최종 부피를 추가하고 pH를 7.5로 조정합니다. 완충액을 함유한 칼신에 지질 필름을 분배한 다음, 20분 동안 섭씨 65도에서 서스펜션을 가열하여 지질을 완전히 수화합니다. 폴리카보네이트 멤브레인을 통해 압출을 통해 200 나노미터 리포솜을 형성합니다.0.5 마이크로몰라 DDM에 L-OPA1 2마이크로그램을 추가하고, 2.2 밀리그램 리포솜을 넣고 1.5시간 동안 섭씨 4도에서 용액을 배양합니다. 3.5킬로달톤 투석 카세트로 투석하여 계면활성제를 제거하여 25밀리리터 250밀리리터, 150밀리머 나트륨 염화나트륨, 50밀리알라 칼슘 완충제를 하룻밤 사이에 섭씨 4도에서 제거하여 완충제를 두 번 변경합니다. PD10 탈염 열을 사용하여 여분의 calcein을 제거한 다음 텍스트 원고에 설명된 대로 이미징 및 데이터 분석을 진행합니다.지질 이중층과 지질 유동성의 상피 현미경 현미경 이미지는 여기에 표시됩니다. 지질 분포는 사진 표백 전후에 표시되며, 균질성은 재구성 전후에 나타난다. L-OPA1 재구성 및 지질 이중층은 형광 상관 분광법 또는 FCS에 의해 검증되었다.FCS 곡선은 L-OPA1의 75%가 지질 이중층으로 재구성되어 L-OPA1이 중합체 테더지질 이중층에서 자유롭게 확산되어 기능성 복합체로 자가 조립할 수 있음을 시사했습니다. 형광 단계 표백은 L-OPA1의 평균 2 ~ 3 사본이 주어진 리포솜에서 재구성되었다는 것을 표시했습니다. L-OPA1 재구성 프로테오이포좀의 크기 분포는 DLS를 사용하여 재구성한 후 테스트되었으며 FCS로 검증되었습니다.멤브레인 테더링은 TIRF 현미경 을 사용하여 지질 이중 층의 표면에 텍사스 레드의 신호를 관찰하여 모니터링하였다. 막 지질 탈혼합 또는 혈전은 지질 두 층으로 확산된 지질 마커로서 텍사스 레드를 통해 모니터링되었다. Calcein de-quenching은 전체 융합 모공 형성을 지질 드믹싱과 구별하는 데 도움을 주었으며, 입자가 혈중 혈중으로 정체되는 조건과 전체 융합으로 진행되는 입자 간의 비교를 가능하게 했습니다.멤브레인 테더링은 지질 및 유출 신호로부터 의 안정적인 지질 신호로 칼세인 신호에 담금질이 없음을 특징으로 하지만, 텍사스 적신호의 급속한 붕괴는 지질 이중층으로 염료의 확산을 나타냈다. 전체 융합은 지질 부패와 콘텐츠 릴리스를 모두 특징으로합니다. 이 입자를 시도할 때는 높은 품질의 이중 층이 제작되도록 커버글래스와 랭뮤어 트로프를 모두 철저히 청소해야 합니다.우수한 공기 질은 또한 이중 층의 결함을 방지하기 위해 중요합니다. 이 기술은 미토콘드리아 막 역학 및 조직에서 새로운 질문을 탐구할 수 있는 길을 열어줍니다. 흥미로운 미래 실험은 미토콘드리아 내막 역학에서 이중 층 비대, 막 잠재력 및 질병 관련 돌연변이의 영향을 탐구하는 것을 포함합니다.

a-model-membrane-platform-for-reconstituting-mitochondrial-membrane

Research

연구

JoVE Journal

Biochemistry

생화학

이 논문은 지질-근위 환경에서 다양한 파트너 인자와 함께 in vitro에서 일체형 막 단백질의 상호 작용 및 어셈블리를 평가하는 방법을 설명합니다.

비계 리포좀을 사용하여 근위 지질 단백질 - 단백질 상호 작용을 재구성 체외

많은 단백질이 막 표면에 부착될 때 기능을 수행합니다. 나노 디스크 막에 대한 외인성 단백질의 결합은 투과 전자 현미경에 의해 간접적으로 이미지화될 수 있습니다. 우리는 음성 염색 인산 텅스텐 산 나트륨에 의해 유도 된 나노 디스크의 특징적인 적층 (rouleau)이 외인 단백질의 결합에 의해 방지된다는 것을 보여줍니다.

방법은 시각화 및 투과 전자 현미경에 의해 막 상호 작용하는 단백질을 분석하는

우리 제공 프로토콜 시험관에 마음과 나의 자기 조직 분석 오픈 챔버에 지원된 지질 bilayer에. 또한, 우리는 vivo에서 조건 반응 감 금에 의해 모방 PDMS microcompartments 지질 입은에 분석 결과 포함 하는 방법을 설명 합니다.

생체 외에서 자가 지원된 지질 Bilayers에 단백질 패턴 구성의 재구성

솔리드-지원, 단백질-무료, 이중 인지질 bilayer 막 (DLBM) 복잡 하 고 동적 지질 나노튜브 네트워크로 변형 될 수 있다 고 바인딩과 그물의 2D 상향식 모델로 사용할 수 있습니다.

자발적인 형성 및 바인딩과 그물에 대 한 상향식 모델로 인공 지질 나노튜브 네트워크의 재배치

무세포 재구성은 세포 골격 어셈블리를 이해하는 핵심 도구였으며, 지난 십 년 동안의 연구는 최소한의 시스템에서 셉틴 역학을 연구하는 접근법을 확립했습니다. 여기에 제시된 것은 서로 다른 막 맥락에서 셉틴 어셈블리를 관찰하는 세 가지 보완적인 방법입니다 : 평면 이중층, 구형 지지대 및 막대 지지대.

생체 물리학 적 특성과 기능을 연구하기 위해 멤브레인에서 Septin 어셈블리의 재구성

이 프로토콜은 TIRF 현미경을 사용하여 개별 이온 채널을 추적하고 지지된 지질막에서 그 활성을 결정하여 측면 막 이동과 채널 기능 간의 상호 작용을 정의하는 방법을 설명합니다. 멤브레인을 준비하고, 데이터를 기록하고, 결과를 분석하는 방법을 설명합니다.

TIRF(Total Internal Reflection Fluorescence) 현미경을 사용한 지질 이중층의 측면 이동성 및 이온 채널 활성에 대한 단일 분자 이미징

이 프로토콜은 STED(Stimulated Emission Depletion) 현미경을 사용한 미토콘드리아 초미세 구조 시각화 및 분석을 위해 배양된 SH-SY5Y 세포 및 일차 쥐 해마 뉴런의 증식, 분화 및 염색을 위한 워크플로우를 제시합니다.

신경 세포 모델에서 미토콘드리아 내막 초세구조를 시각화하기 위한 라이브 셀 STED 이미징 사용

구조와 구성의 막 지질 다양성은 세포 과정에 중요한 기여를 하며 질병의 표지자가 될 수 있습니다. 분자 역학 시뮬레이션을 통해 원자 분해능에서 멤브레인과 생체 분자와의 상호 작용을 연구할 수 있습니다. 여기에서는 복잡한 멤브레인 시스템을 구축, 실행 및 분석하기 위한 프로토콜을 제공합니다.

시뮬레이션 연구에서 복잡한 지질 혼합물을 사용한 사실적인 막 모델링

그라마시딘 A-도핑된 액상 계면 이중층을 조립, 전기자극, 분석하는 실험 프로토콜이 제시됩니다. 지질-단백질 구조-기능 관계는 막 면적, 이온 플럭스, 단일 채널 전도도 변화를 측정하고, 이러한 반응을 전기 시냅스에서 영감을 받은 막 모델에서 이온 전도의 가소성 유사 변화와 연관하여 정량화합니다.

액상 인터페이스 이중층을 이용한 지질-단백질 막 구조-기능 특성 분석

다양한 응용 분야에 걸쳐 구현하기 위해 향상된 효소 안정성을 제공하는 효소 포장 외막 소포체(OMV)의 생산, 정제 및 사용을 위한 프로토콜이 제시됩니다.

에서 외부 막 소포 내에서 감독 단백질 포장<em&gt; 대장균</em&gt; : 디자인, 생산 및 정제

학습하세요 미토콘드리아 내막 융합 메커니즘을 연구하는 체외 재구성 플랫폼을 활용한 정량적 막 단백질 분석 방법. 이 기술은 세포 건강 및 미토콘드리아 역학 연구에 필수적인 도구를 제공합니다.

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