Tile/SED/Array 인터페이스를 사용하여 Multiplexed Ion Beam Imaging Microscope에서 조직 마이크로어레이 및 Tiled Area Imaging의 신속한 설정
September 15th, 2023
MIBI(Multiplexed Ion Beam Imaging)는 조직 마이크로어레이와 바둑판식으로 배열된 인접 조직 영역을 이미징하는 데 자주 사용되지만, 이러한 실험을 설정하기 위한 현재 소프트웨어는 번거롭습니다. 타일/SED/어레이 인터페이스는 MIBI 실행 설정을 획기적으로 단순화하고 가속화하기 위해 개발된 직관적인 대화형 그래픽 도구입니다.
다중화 이온 빔 이미징(MIBI)은 수십 개의 단백질에 걸쳐 조직학적 조직의 단백질 발현을 동시에 이미지화하는 기술입니다. MIBI를 사용하여 연구자들은 본래 조직 환경에서 세포를 식별, 위치 파악 및 특성화할 수 있습니다. MIBI 기기 작동의 주요 병목 현상은 이미징을 위한 시야(FOV)를 설정하는 것입니다.
FOV는 슬라이드의 200 x 200 미크론에서 800 x 800 미크론 영역으로, 사용자는 관심 조직 영역을 커버하기 위해 배치합니다. 조직의 큰 인접 영역과 큰 조직 마이크로어레이에 대한 FOV를 배치하는 것은 제조업체의 인터페이스를 사용하여 다루기 어렵습니다. 우리는 사용자가 직관적인 대화형 그래픽 인터페이스를 사용하여 많은 수의 FOV를 빠르게 배치할 수 있도록 타일/SED/어레이 인터페이스를 개발했습니다.
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개요
이 연구는 조직 마이크로어레이 및 인접한 조직 영역에 대한 다중 이온 빔 이미징(MIBI)의 영상화 필드 오브 뷰(FOV) 설정 과제를 다룹니다. 이 연구는 타일 형 SED 어레이 인터페이스라고 하는 직관적인 그래픽 도구를 소개하며, 이는 MIBI 실행 설정 프로세스를 크게 단순화하고 가속화합니다.
주요 연구 구성 요소
연구 영역
- 다중 이온 빔 이미징(MIBI)
- 조직 마이크로어레이
- 이미징 설정 최적화
배경
- 조직 학적 조직에서 단백질 발현 이해
- 이미징을 위한 FOV 효과적 위치 지정 필요성
- MIBI를 위한 기존 인터페이스의 과제
사용된 방법
- 타일 형 SED 어레이 인터페이스(TSAI) 개발
- FOV 위치 지정을 위한 그래픽 사용자 인터페이스
- 코레지스트레이션 및 이미지 조작을 위한 웹 기반 도구
주요 결과
- 조직 이미징을 위한 FOV 설정의 효율성 향상
- 이미지 획득 중 사용자 오류 감소
- 조직학적 조직의 시각화 향상
결론
- 이 연구는 MIBI 실행 설정을 최적화하는 새로운 접근법을 보여줍니다
- 생물학적 이미징 연구를 발전시키는 데 있어 직관적인 도구의 중요성을 강조합니다
