2023년 9월 15일
MIBI(Multiplexed Ion Beam Imaging)는 조직 마이크로어레이와 바둑판식으로 배열된 인접 조직 영역을 이미징하는 데 자주 사용되지만, 이러한 실험을 설정하기 위한 현재 소프트웨어는 번거롭습니다. 타일/SED/어레이 인터페이스는 MIBI 실행 설정을 획기적으로 단순화하고 가속화하기 위해 개발된 직관적인 대화형 그래픽 도구입니다.
다중화 이온 빔 이미징(MIBI)은 수십 개의 단백질에 걸쳐 조직학적 조직의 단백질 발현을 동시에 이미지화하는 기술입니다. MIBI를 사용하여 연구자들은 본래 조직 환경에서 세포를 식별, 위치 파악 및 특성화할 수 있습니다. MIBI 기기 작동의 주요 병목 현상은 이미징을 위한 시야(FOV)를 설정하는 것입니다.
FOV는 슬라이드의 200 x 200 미크론에서 800 x 800 미크론 영역으로, 사용자는 관심 조직 영역을 커버하기 위해 배치합니다. 조직의 큰 인접 영역과 큰 조직 마이크로어레이에 대한 FOV를 배치하는 것은 제조업체의 인터페이스를 사용하여 다루기 어렵습니다. 우리는 사용자가 직관적인 대화형 그래픽 인터페이스를 사용하여 많은 수의 FOV를 빠르게 배치할 수 있도록 타일/SED/어레이 인터페이스를 개발했습니다.
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본 연구는 조직 마이크로어레이 및 인접 조직 영역에 대한 다중 이온 빔 이미징(MIBI)의 이미징 시야(FOV) 설정 문제를 다룹니다. 본 연구에서는 타일형 SED 어레이 인터페이스라는 직관적인 그래픽 도구를 도입하였으며, 이를 통해 MIBI 런 설정 과정을 크게 단순화하고 속도를 높였습니다.
다중 이온 빔 이미징(multiplexed ion beam imaging, MIBI) 시야의 효율적인 설정은 고처리량 조직 마이크로어레이 분석 및 발견 단계의 바이오 제약 R&D 내 공간 프로테오믹스에 있어 매우 중요합니다. 타일/SED/어레이 인터페이스(tile/SED/array Interface, TSAI)는 신속하고 재현 가능하며 확장 가능한 이미징 영역 선택을 가능하게 하여, 대규모 조직 프로파일링 워크플로의 병목 현상을 직접적으로 해결합니다. 이러한 기능은 중개 및 전임상 연구 파이프라인의 주요 변곡점에서 예측 신뢰도와 운영 처리량을 향상시킵니다.
TSAI 이미징 설정은 초기 발견부터 리드 화합물 도출 및 전임상 연구에 이르기까지 재현 가능하고 확장 가능하며 사용자 친화적인 단계로 구축되었습니다.