2023년 12월 22일
single-cell/single-nuclei transcriptomics 및 multi-omics의 성공은 세포/핵의 품질에 크게 좌우됩니다. 따라서 조직에서 세포/핵을 분리하고 정제하는 것은 고도로 표준화되어야 합니다. 이 프로토콜은 다운스트림 단일 핵 다중체 분석을 위해 뇌와 골수에서 핵을 준비하는 방법을 설명합니다.
세포분석 및 바이오마커 기술 부서는 단일 세포 분해능을 갖춘 세포 표현형 분석 및 분자 프로파일링을 위한 최첨단 기술과 파이프라인을 통해 생물의학 프로젝트를 지원합니다. 이러한 맥락에서 우리는 건강과 질병의 유전자 발현 및 유전자 조절에 대한 통찰력을 얻기 위해 단일 세포 멀티오믹 분석을 위한 다양한 도구를 사용합니다. 유세포 분석은 고유한 특성을 기반으로 개별 세포를 식별하고 소싱합니다.
최근에는 고처리량 이미지 기반 스펙트럼 분류기가 발전했으며, 이러한 기술은 패널 설계에 유연성을 제공하고 유사한 염료를 동시에 사용하며 자가형광을 관리할 수 있습니다. 최첨단 단일 세포 기술을 사용할 때 주요 실험 과제는 특히 취약하거나 희귀한 세포 집단을 다루는 것입니다. 각 조직 또는 세포 유형은 고품질 염기서열 분석 데이터로 변환되는 생존율이 높은 세포를 충분히 얻기 위해 미세 조정된 프로토콜 최적화를 거쳐야 합니다.
당사의 수정된 단일 핵 준비 프로토콜은 핵 회수율을 개선하고 핵에 가해지는 스트레스를 최소화합니다. 특히 뇌 및 골수 조직에 최적화되어 있으며 시료 해리에서 핵 정제에 이르는 모든 단계를 다룹니다.
본 연구는 다운스트림 단일 핵 멀티옴 분석을 위해 뇌 및 골수 조직으로부터의 핵 분리 최적화에 중점을 둡니다. 고품질의 핵 추출은 단일 세포 전사체학 및 멀티오믹스 분석에 직접적인 영향을 미치므로 매우 중요합니다.
뇌와 골수로부터 고품질의 핵을 준비하는 것은 견고한 단일 핵 멀티옴 분석의 기초가 되며, 초기 탐색 단계에서 전사체 및 후성유전체 프로파일링의 신뢰도에 직접적인 영향을 미칩니다. 표준화된 핵 분리 프로토콜은 일관된 데이터 생성을 가능하게 하여, 복잡한 조직 연구에서 예측 신뢰도를 높이고 메커니즘적 리스크를 완화하는 데 기여합니다. 이러한 역량은 질환 관련 모델을 발전시키고 신경생물학 및 혈액학 연구의 포트폴리오 의사결정을 가속화하는 데 매우 중요합니다.
본 핵 분리 프로토콜은 조직 처리와 단일 핵 멀티옴 시퀀싱의 접점에 통합되어, 초기 발견부터 전임상 연구에 이르는 워크플로우를 지원합니다.