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마우스 근모세포 연구에서 Cleavage Under Targets and Tagmentation(CUT&Tagmentation) 분석 사용
마우스 근모세포 연구에서 Cleavage Under Targets and Tagmentation(CUT&Tagmentation) 분석 사용
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JoVE Journal Developmental Biology
Using Cleavage Under Targets and Tagmentation (CUT&Tag) Assay in Mouse Myoblast Research

마우스 근모세포 연구에서 Cleavage Under Targets and Tagmentation(CUT&Tagmentation) 분석 사용

Full Text
1,389 Views
07:09 min
March 1, 2024

DOI: 10.3791/66066-v

Yuefeng Li1,2, Xiaofen Wu1,2, Ping Hu1,2

1Guangzhou Laboratory, 2The Key Laboratory of Biological Targeting Diagnosis, Therapy and Rehabilitation of Guangdong Higher Education Institutes,The Fifth Affiliated Hospital of Guangzhou Medical University

AI Banner

Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

후성유전학 분야를 처음 접하는 연구자들은 CUT&Tag가 ChIP 분석에 대한 훨씬 더 쉬운 대안임을 알게 될 것입니다. CUT&Tag는 희귀 및 원발성 세포 집단에 대한 후성유전학 연구에 큰 도움을 주어 극소수의 세포에서 고품질 데이터를 생성했습니다. 이 프로토콜은 마우스 뒷다리 근육에서 분리된 마우스 근아세포에 대해 H3K4me1 CUT&Tag 분석을 수행하는 방법을 설명합니다.

우리 그룹의 연구는 성인 골격근 줄기 세포의 게놈 구조 및 전사가 특히 줄기 세포 헌신, 분화 및 티나시스와 같은 황산염 변화 중에 어떻게 조절되고 유지되는지에 중점을 둡니다. 근육 조직에서 단핵 세포의 1%만을 구성하는 성체 골격근 줄기 세포는 근육 소화에서 얻은 단일 세포 현탁액이 부족하기 때문에 High-C, ChIP 및 ATAC 염기서열을 사용하는 염색질 기능 연구에 대한 과제를 제시합니다. 염색질 면역 침전(ChIP)은 게놈 특징을 프로파일링하기 위한 핵심 도구였습니다.

스티븐 헤니코프(Steven Henikoff) 박사가 개발한 더 간단하고 효율적인 cut&tag 기법은 특히 희귀 세포 집단의 후성유전학을 연구할 때 ChIP를 능가하는 경우가 많습니다. 사용 편의성은 후성유전학 전문가가 아닌 사람들을 포함한 연구자들의 접근성을 넓혀줍니다.

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키워드 : CUT&Tag Cleavage Under Targets And tagmentation 마우스 근 아세포 근육 줄기 세포 염색질 결합 인자 히스톤 마크 히스톤 변이체 ChIP 염색질 면역 침전 가교 ChIP 천연 ChIP 미세 구균 뉴클레아제 시퀀싱 게놈 위치

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