Name: 완전 자동화된 시스템을 사용한 재조합 단백질의 신속한 Glyco-Qualitative Assessment of recombinant proteins with a fully automated system (완전 자동화된 시스템을 사용한 재조합 단백질의 신속한 Glyco-Qualitative Assessment of recombinant proteins using a fully automated system) (동영상) | JoVE Journal
Uploaded: 2024-06-28T13:00:00.000+00:00
Duration: 5 min 19 s
Description: 배우세요 완전 자동화 시스템을 사용한 재조합 단백질의 글리코정성 분석 방법입니다. 렉틴 기반 기술로 당단백질 구조를 신속하게 평가하고 질병 특이성 바이오마커를 발굴하는 데 활용할 수 있습니다.

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<meta charset="utf8"></head><body>BIST(Bead Array in a Single Tip)를 사용한 자동화된 렉틴 기반 글라이칸 프로파일링

<ol><li>Butler, M., Reichl, U. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Animal+cell+expression+systems%5BTitle%5D)+AND+%22Adv+Biochem+Eng+Biotechnol%22%5BJournal%5D)">Animal cell expression systems.</a> Adv Biochem Eng Biotechnol. 175, 1-36 (2021).</li>
<li>Silva, M. L. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Chapter+One+-+Lectin+biosensors+in+cancer+glycan+biomarker+detection%5BTitle%5D)+AND+%22Adv+Clin+Chem%22%5BJournal%5D)">Chapter One - Lectin biosensors in cancer glycan biomarker detection.</a> Adv Clin Chem. 93, 1-61 (2019).</li>
<li>Hiono, T., Nagai-Okatani, C., Kuno, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((4.07+-+Application+of+glycan-related+microarrays%5BTitle%5D)+AND+%22Comprehensive+Glycoscience+%28Second+Edition%29%22%5BJournal%5D)">4.07 - Application of glycan-related microarrays.</a> Comprehensive Glycoscience (Second Edition). , 134-148 (2021).</li>
<li>Shimazaki, H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Lectin+bead+array+in+a+single+tip+facilitates+fully+automatic+glycoprotein+profiling%29%5BTitle%5D)+AND+%22Anal+Chem%22%5BJournal%5D)">Lectin bead array in a single tip facilitates fully automatic glycoprotein profiling).</a> Anal Chem. 91 (17), 11162-11169 (2019).</li>
<li>Shimazaki, H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((GlycoBIST%3A+A+System+for+automatic+glycan+profiling+of+a+target+protein+using+milli-bead+array+in+a+tip%5BTitle%5D)+AND+%22Curr+Protoc+Protein+Sci%22%5BJournal%5D)">GlycoBIST: A System for automatic glycan profiling of a target protein using milli-bead array in a tip.</a> Curr Protoc Protein Sci. 99 (1), e103(2020).</li>
<li>Mahmood, T., Yang, P. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Western+blot%3A+Technique%2C+theory%2C+and+trouble+shooting%5BTitle%5D)+AND+%22N+Am+J+Med+Sci%22%5BJournal%5D)">Western blot: Technique, theory, and trouble shooting.</a> N Am J Med Sci. 4 (9), 429-434 (2012).</li>
<li>Bojar, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+useful+guide+to+lectin+binding%3A+machine-learning+directed+annotation+of+57+unique+lectin+specificities%5BTitle%5D)+AND+%22ACS+Chem+Biol%22%5BJournal%5D)">A useful guide to lectin binding: machine-learning directed annotation of 57 unique lectin specificities.</a> ACS Chem Biol. 17 (11), 2993-3012 (2022).</li>
<li>Nagai-Okatani, C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((2.0%3A+An+integrated+visualization+for+lectin+microarray-based+mouse+tissue+glycome+mapping+data+with+lectin+histochemistry%5BTitle%5D)+AND+%22J+Proteome+Res%22%5BJournal%5D)">2.0: An integrated visualization for lectin microarray-based mouse tissue glycome mapping data with lectin histochemistry.</a> J Proteome Res. 20 (4), 2069-2075 (2021).</li>
<li>Geisler, C., Jarvis, D. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Effective+glycoanalysis+with+Maackia+amurensis+lectins+requires+a+clear+understanding+of+their+binding+specificities%5BTitle%5D)+AND+%22Glycobiology%22%5BJournal%5D)">Effective glycoanalysis with Maackia amurensis lectins requires a clear understanding of their binding specificities.</a> Glycobiology. 21 (8), 988-993 (2011).</li>
<li>Noro, E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((N+-glycan+structures+of+Wisteria+floribunda+agglutinin-positive+Mac2+binding+protein+in+the+serum+of+patients+with+liver+fibrosis%5BTitle%5D)+AND+%22Glycobiology%22%5BJournal%5D)">N -glycan structures of Wisteria floribunda agglutinin-positive Mac2 binding protein in the serum of patients with liver fibrosis.</a> Glycobiology. 31 (10), 1268-1278 (2021).</li>
<li>Rawitch, A. B., Pollock, H. G., Yang, S. X. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Thyroglobulin+glycosylation%3A+Location+and+nature+of+the+N-Linked+oligosaccharide+units+in+bovine+thyroglobulin%5BTitle%5D)+AND+%22Arch+Biochem+Biophys%22%5BJournal%5D)">Thyroglobulin glycosylation: Location and nature of the N-Linked oligosaccharide units in bovine thyroglobulin.</a> Arch Biochem Biophys. 300 (1), 271-279 (1993).</li>
<li>Dang, K., Zhang, W., Jiang, S., Lin, X., Qian, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Application+of+lectin+microarrays+for+biomarker+discovery%5BTitle%5D)+AND+%22Chemistry+Open%22%5BJournal%5D)">Application of lectin microarrays for biomarker discovery.</a> Chemistry Open. 9 (3), 285-300 (2020).</li>
<li>Chen, S., Qin, R., Mahal, L. K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Sweet+systems%3A+Technologies+for+glycomic+analysis+and+their+integration+into+systems+biology%5BTitle%5D)+AND+%22Crit+Rev+Biochem+Mol+Biol%22%5BJournal%5D)">Sweet systems: Technologies for glycomic analysis and their integration into systems biology.</a> Crit Rev Biochem Mol Biol. 56 (3), 301-320 (2021).</li>
<li>Dwivedi-Agnihotri, H., Srivastava, A., Shukla, A. K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Reversible+biotinylation+of+purified+proteins+for+measuring+protein-protein+interactions%5BTitle%5D)+AND+%22Methods+Enzymol%22%5BJournal%5D)">Reversible biotinylation of purified proteins for measuring protein-protein interactions.</a> Methods Enzymol. 633, 281-294 (2020).</li>
<li>Shimazaki, H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Auto-lectin+dotcoding+by+two+octopuses%3A+Rapid+analysis+of+fluorescence-labeled+glycoproteins+by+an+8-channel+fully-automatic+bead+array+scanner+with+a+rolling-circle+detector%5BTitle%5D)+AND+%22Anal+Chem%22%5BJournal%5D)">Auto-lectin dotcoding by two octopuses: Rapid analysis of fluorescence-labeled glycoproteins by an 8-channel fully-automatic bead array scanner with a rolling-circle detector.</a> Anal Chem. 95 (32), 11868-11873 (2023).</li>
</ol>

<table><tbody><tr><td>0.2 mL 8 PCR 튜브 + 플랫 캡</td><td>FastGene</td><td>FG-0028FC/SE</td><td>비오틴 라벨링 시약의 분배 및 보관용</td></tr><tr><td>2.0 mL SC 마이크로 튜브 단백질 LB</td><td>SARSTEDT, AG&Co. KG</td><td>72.694.600</td><td>LuBEA-VIII 분석 소프트웨어에서 시료 로딩,</td></tr><tr><td></td><td>SAS, Institute, Inc.</td><td>JMP 17</td><td></td></tr><tr><td>정전기 방지 이온화 장치. 110 볼트</td><td>Plas-Labs</td><td>800-AS/SPI</td><td>BIST 팁에 비드를 삽입하는 동안 사용합니다.</td></tr><tr><td>정전기 방지 핀셋 NK2A</td><td>루비스&nbsp;</td><td>9-5681-01</td><td>BIST Tip에 비드를 삽입하면서 사용합니다.</td></tr><tr><td>자동 반응 측정 장치</td><td>정밀 시스템 사이언스 주식회사</td><td>LuBEA</td><td>이 연구의 모든 데이터는 LuBEA-VIII를 사용하여 얻은 것입니다. LuBEA는 상용화되고 있지만 LuBEA-VIII는 현재 개발 단계에 있습니다. LuBEA 및 LuBEA-VIII의 제품 세부 정보는 다음 URL(https://www.pss.co.jp/english/technology/apit/bist02.html)에서 확인할 수 있습니다.</td></tr><tr><td>비오틴-(AC5)2 Sulfo-Osu</td><td>Dojindo</td><td>341-06801</td><td>비오틴화 시약으로</td></tr><tr><td>BIST 스페이서 비드- V-11</td><td>Precision System Science Co., Ltd.</td><td>F4938000</td><td>직경: 1mm</td></tr><tr><td>BIST 팁 및 피복</td><td>정밀 시스템 과학 주식회사</td><td>F4930-000</td><td>이 빈 팁을 구슬로 채우십시오.</td></tr><tr><td>염화칼슘</td><td>Wako</td><td>039-00475</td><td>완충 용액 제조를 위해</td></tr><tr><td>신호 용액 2를 얻을 수 있습니다</td><td>TOYOBO</td><td>NKB-301</td><td>이 차단 시약은이 방법에 적합합니다</td></tr><tr><td>CentriVap 벤치 탑 진공 농축기</td><td>Labconco</td><td>7810010</td><td>biotinilation 시약의 건조. 타사에서 제공하는 대체가 가능합니다.</td></tr><tr><td>Clarity 웨스턴 ECL 기판&nbsp;</td><td>Bio-Rad</td><td>1705060</td><td>LuVEA VIII</td></tr><tr><td>Cold trap CentriVap 시리즈</td><td>Labconco</td><td>7460040</td>에 의한 시료 측정용 <td>biotinilation 시약 건조용. 타사에서 제공하는 대체가 가능합니다.</td></tr><tr><td>글리신</td><td>Wako</td><td>077-00735</td><td>완충 용액 준비용</td></tr><tr><td>망간(II) 염화물 테트라하이드레이트</td><td>Wako</td><td>139-00722</td><td>완충 용액 준비용</td></tr><tr><td>Milli-Q 참조</td><td>MERCK</td><td>ZIQ7000T0C</td><td>시약 및 완충액 희석용 탈이온수</td></tr><tr><td>PBS</td><td>Wako</td><td>162-19321</td><td>완충 용액</td></tr><tr><td>과산화효소 준비용 스트렙타비딘</td><td>잭슨</td><td>016-030-084</td><td>이 항체는 글리코비스트(GlycoBIST) 분석에 좋습니다. 웨스턴 블로팅(western blotting)을 감지하는 데 유용하지만 다른 회사에서 대체물을 제공할 수 있습니다.</td></tr><tr><td>공급자:Probe bead</td><td>Precision System Science Co., Ltd.</td><td>FP4936000</td><td>렉틴 고정 비드를 준비하기 위해. 자세한 내용은 Shimazaki, H. et al., Current Protocols in Protein Science, 2020의 참조 섹션을 참조하십시오.</td></tr><tr><td>Protein LoBind Tubes 1.5 mL</td><td>Eppendorf</td><td>0030108442</td><td>비오틴화와 같은 시료 전처리 중에 사용하십시오.</td></tr><tr><td>실리카겔 (건조수용)</td><td>Kanto chemical</td><td>37039-02</td><td>GlycoBIST 팁과 건조된 비오틴화(biotinylation) 시약을 보관하면서 사용하십시오.</td></tr><tr><td>정전기 제거 시트 M</td><td>TRUSCO NAKAYAMA</td><td>SD5050</td><td>BIST Tip에 비드를 삽입하면서 사용하십시오.</td></tr><tr><td>SV Cartridge II</td><td>Daido Chemical Industry</td><td>ED041</td><td>LuVEA VIII</td></tr><tr><td>Table Microcentrifuge-CAPSULEFUGE</td><td>TOMY</td><td>PMC-060</td><td>각 공정에서 혼합물의 스핀 다운 용</td></tr><tr><td>Triton X-100</td><td>Nacalai tesque</td><td>35501-15</td><td>버퍼 용액 준비</td></tr></tbody></table> 용

완전 자동화된 시스템을 사용한 재조합 단백질의 신속한 glyco-qualitative assessment of recombinant proteins with a fully automated system (완전 자동화된 시스템을 사용한 재조합 단백질의 신속한 glyco-qualitative assessment of recombinant proteins using a fully automated system)

Rapid Glyco-Qualitative Assessment of Recombinant Proteins Using a Fully Automated System

완전 자동화된 시스템을 사용한 재조합 단백질의 신속한 Glyco-Qualitative Assessment of recombinant proteins with a fully automated system (완전 자동화된 시스템을 사용한 재조합 단백질의 신속한 Glyco-Qualitative Assessment of recombinant proteins using a fully automated system)

Protein glycosylation, a critical post-translational modification, influences the stability, efficacy, and immunogenicity of recombinant proteins, ...

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연구

JoVE Journal

Biochemistry

생화학

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우리는 소규모로 미생물 외다당류의 식별 및 특성화를 위한 자동화된 모듈식 고처리량 방법을 제시합니다. 이 방법은 빠른 사전 선택을 결합하여 분비된 다당류의 총량을 상세한 탄수화물 지문과 결합하여 새로 분리된 박테리아 균주 또는 전체 균주 수집을 빠르게 스크리닝할 수 있습니다.

자동화 모​​듈 높은 처리량 엑소 폴리 사카 라이드 심사 플랫폼은 매우 민감한 탄수화물 지문 분석과 결합

고처리량 프로토콜은 단백질체학 및 글리코믹스 정제와 혈장에서 LC-MS/MS 정량화를 결합하기 위해 개발되었습니다. N-linked glycosylation motifs의 탈아미드화 분석은 탈glycosylated 부위에 특이적이었습니다. N-글리칸의 정확한 정량화는 글리칸 히드라지드 태그 전략으로 라벨링할 때 필터 지원 N-글라이칸 분리를 개별성 정규화에 결합함으로써 달성되었습니다.

양적 글리코 믹스와 단백질 체학 복합 정제 전략

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세포 외 기질의 Glycoproteomics : 질량 분석을 사용하여 본래 글리코 펩타이드 분석을위한 방법

이 작은 동물에 반대로 탄수화물 항 체 순환의 분석에 대 한 인쇄 glycan 배열 (PGA) 기술의 잠재력을 보여줍니다.

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자동화된 미생물체 시스템을 사용하여 중국 햄스터 난소 세포의 단일 클론 항체의 정화 및 분석

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재조합 인간 SLFN14 리보뉴클레아제의 신속 생성 및 질량 광도계를 통한 화학양론 분석

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