October 11th, 2024
여기에 제시된 프로토콜은 리보솜과 관련된 mRNA인 translatome을 자당 밀도 구배 원심분리 를 통해 애기장대 에서 비폴리솜 및 폴리솜 RNA로 분리하기 위한 폴리솜 프로파일링을 포함합니다. 이 방법은 열 스트레스 애기장대(heat-stressed Arabidopsis)의 번역 효율성을 보여줍니다.
우리의 연구는 식물의 열 스트레스 동안 병진 조절을 조사합니다. non-polysome-bound 및 polysome-bound RNA를 분석함으로써 식물이 translational control을 통해 스트레스 내성을 조절하는 방법을 연구하는 것을 목표로 합니다. 그래서 여기에서는 열 스트레스 하에서 애기장대(Arabidopsis)의 번역 효율성을 조사하기 위한 폴리솜 프로파일링 및 폴리솜 RNA 분리 프로토콜을 제공합니다.
이 프로토콜에서는 보다 심층적인 translatomic 분석에 필수적인 spike-in normalization을 사용하여 번역 효율성을 계산하기 위한 포괄적이고 표준화된 방법을 제공합니다. 당사의 프로토콜은 더 적은 부피의 유기 완충액을 사용하면서 더 높은 RNA 수율을 달성함으로써 폴리솜 RNA를 분리하는 더 쉽고 효율적인 방법을 제공합니다.
이 연구는 열 스트레스 중 Arabidopsis의 번역 조절을 탐구하기 위해 비다중체 결합 및 다중체 결합 RNA를 분석합니다. 주요 결과는 스트레스 조건 하에서 번역 효율성을 연구하기 위한 효과적인 다중체 프로파일링 방법을 보여줍니다.