Name: 대변 정량적 중합효소 연쇄 반응 분석을 통한 헬리코박터 파일로리 감염 및 항생제 내성 검출 (동영상) | JoVE Journal
Uploaded: 2025-05-16T13:00:00.000+00:00
Duration: 4 min 56 s
Description: 학습하세요 대변 qPCR 분석을 통한 Helicobacter pylori 감염 및 항생제 내성 검출 방법을. 이 비침습적 기술은 세균 배양 없이 3주에서 1일로 진단 시간을 단축하여 맞춤형 치료와 집단 수준의 근절률 향상에 기여합니다.

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<ol><li>Yuan, C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+global+prevalence+of+and+factors+associated+with+Helicobacter+pylori+infection+in+children%3A+a+systematic+review+and+meta-analysis%5BTitle%5D)+AND+%22Lancet+Child+Adolesc+Health%22%5BJournal%5D)">The global prevalence of and factors associated with Helicobacter pylori infection in children: a systematic review and meta-analysis.</a> Lancet Child Adolesc Health. 6 (3), 185-194 (2022).</li>
<li>Watari, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Helicobacter+pylori+associated+chronic+gastritis%2C+clinical+syndromes%2C+precancerous+lesions%2C+and+pathogenesis+of+gastric+cancer+development%5BTitle%5D)+AND+%22World+J+Gastroenterol%22%5BJournal%5D)">Helicobacter pylori associated chronic gastritis, clinical syndromes, precancerous lesions, and pathogenesis of gastric cancer development.</a> World J Gastroenterol. 20 (18), 5461-5473 (2014).</li>
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<li>Wang, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((cross-sectional+surveillance+of+Helicobacter+pylori+prevalence+and+antibiotic+resistance+to+clarithromycin+and+levofloxacin+in+urban+China+using+the+string+test+coupled+with+quantitative+PCR%5BTitle%5D)+AND+%22Lancet+Microbe%22%5BJournal%5D)">cross-sectional surveillance of Helicobacter pylori prevalence and antibiotic resistance to clarithromycin and levofloxacin in urban China using the string test coupled with quantitative PCR.</a> Lancet Microbe. 5 (6), e512-e513 (2024).</li>
<li>Ho, J. J. C., Navarro, M., Sawyer, K., Elfanagely, Y., Moss, S. F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Helicobacter+pylori+antibiotic+resistance+in+the+United+States+between+2011+and+2021%3A+A+systematic+review+and+meta-analysis%5BTitle%5D)+AND+%22American+J+Gastroenterol%22%5BJournal%5D)">Helicobacter pylori antibiotic resistance in the United States between 2011 and 2021: A systematic review and meta-analysis.</a> American J Gastroenterol. 117 (8), 1221-1230 (2022).</li>
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<li>Rotimi, O., Cairns, A., Gray, S., Moayyedi, P., Dixon, M. F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Histological+identification+of+Helicobacter+pylori%3A+Comparison+of+staining+methods%5BTitle%5D)+AND+%22J+Clin+Pathol%22%5BJournal%5D)">Histological identification of Helicobacter pylori: Comparison of staining methods.</a> J Clin Pathol. 53 (10), 756-759 (2000).</li>
<li>Lim, L. L., Ho, K. Y., Ho, B., Salto-Tellez, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Effect+of+biopsies+on+sensitivity+and+specificity+of+ultra-rapid+urease+test+for+detection+of+Helicobacter+pylori+infection%3A+A+prospective+evaluation%5BTitle%5D)+AND+%22World+J+Gastroenterol%22%5BJournal%5D)">Effect of biopsies on sensitivity and specificity of ultra-rapid urease test for detection of Helicobacter pylori infection: A prospective evaluation.</a> World J Gastroenterol. 10 (13), 1907-1910 (2004).</li>
<li>Hortelano, I., Moreno, Y., Vesga, F. J., Ferrús, M. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Evaluation+of+different+culture+media+for+detection+and+quantification+of+H.+pylori+in+environmental+and+clinical+samples%5BTitle%5D)+AND+%22Int+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Evaluation of different culture media for detection and quantification of H. pylori in environmental and clinical samples.</a> Int Microbiol. 23 (4), 481-487 (2020).</li>
<li>Wang, Y. K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Diagnosis+of+Helicobacter+pylori+infection%3A+Current+options+and+developments%5BTitle%5D)+AND+%22World+J+Gastroenterol%22%5BJournal%5D)">Diagnosis of Helicobacter pylori infection: Current options and developments.</a> World J Gastroenterol. 21 (40), 11221-11235 (2015).</li>
<li>Gisbert, J. P., Pajares, J. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Review+article%3A+13C-Urea+breath+test+in+the+diagnosis+of+Helicobacter+pylori+infection+--+a+critical+review%5BTitle%5D)+AND+%22Aliment+Pharmacol+Ther%22%5BJournal%5D)">Review article: 13C-Urea breath test in the diagnosis of Helicobacter pylori infection -- a critical review.</a> Aliment Pharmacol Ther. 20 (10), 1001-1017 (2004).</li>
<li>Laheij, R. J., Straatman, H., Jansen, J. B., Verbeek, A. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Evaluation+of+commercially+available+Helicobacter+pylori+serology+kits%3A+A+review%5BTitle%5D)+AND+%22J+Clin+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Evaluation of commercially available Helicobacter pylori serology kits: A review.</a> J Clin Microbiol. 36 (10), 2803-2809 (1998).</li>
<li>Gisbert, J. P., Pajares, J. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Stool+antigen+test+for+the+diagnosis+of+Helicobacter+pylori+infection%3A+A+systematic+review%5BTitle%5D)+AND+%22Helicobacter%22%5BJournal%5D)">Stool antigen test for the diagnosis of Helicobacter pylori infection: A systematic review.</a> Helicobacter. 9 (4), 347-368 (2004).</li>
<li>Benigno, T. G. D. S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((pylori+primary+strains+and+virulence+genotypes+in+the+Northeastern+region+of+Brazil%5BTitle%5D)+AND+%22Rev+Inst+Med+Trop+Sao+Paulo%22%5BJournal%5D)">pylori primary strains and virulence genotypes in the Northeastern region of Brazil.</a> Rev Inst Med Trop Sao Paulo. 64, e47(2022).</li>
<li>Savoldi, A., Carrara, E., Graham, D. Y., Conti, M., Tacconelli, E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Prevalence+of+antibiotic+resistance+in+Helicobacter+pylori%3A+A+systematic+review+and+meta-analysis+in+World+Health+Organization+regions%5BTitle%5D)+AND+%22Gastroenterology%22%5BJournal%5D)">Prevalence of antibiotic resistance in Helicobacter pylori: A systematic review and meta-analysis in World Health Organization regions.</a> Gastroenterology. 155 (5), 1372-1382.e17 (2018).</li>
<li>Kalach, N., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Usefulness+of+gastric+biopsy-based+real-time+polymerase+chain+reaction+for+the+diagnosis+of+Helicobacter+pylori+infection+in+children%5BTitle%5D)+AND+%22J+Pediatr+Gastroenterol+Nutr%22%5BJournal%5D)">Usefulness of gastric biopsy-based real-time polymerase chain reaction for the diagnosis of Helicobacter pylori infection in children.</a> J Pediatr Gastroenterol Nutr. 61 (3), 307-312 (2015).</li>
<li>Han, X., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Quantitative+PCR+of+string-test+collected+gastric+material%3A+A+feasible+approach+to+detect+Helicobacter+pylori+and+its+resistance+against+clarithromycin+and+levofloxacin+for+susceptibility-guided+therapy%5BTitle%5D)+AND+%22Helicobacter%22%5BJournal%5D)">Quantitative PCR of string-test collected gastric material: A feasible approach to detect Helicobacter pylori and its resistance against clarithromycin and levofloxacin for susceptibility-guided therapy.</a> Helicobacter. 28 (4), e12985(2023).</li>
<li>Zhong, Z., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+retrospective+study+of+the+antibiotic-resistant+phenotypes+and+genotypes+of+Helicobacter+pylori+strains+in+China%5BTitle%5D)+AND+%22Am+J+Cancer+Res%22%5BJournal%5D)">A retrospective study of the antibiotic-resistant phenotypes and genotypes of Helicobacter pylori strains in China.</a> Am J Cancer Res. 11 (10), 5027-5037 (2021).</li>
<li>Hussein, R. A., Al-Ouqaili, M. T. S., Majeed, Y. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Detection+of+Helicobacter+pylori+infection+by+invasive+and+non-invasive+techniques+in+patients+with+gastrointestinal+diseases+from+Iraq%3A+A+validation+study%5BTitle%5D)+AND+%22PloS+One%22%5BJournal%5D)">Detection of Helicobacter pylori infection by invasive and non-invasive techniques in patients with gastrointestinal diseases from Iraq: A validation study.</a> PloS One. 16 (8), e0256393(2021).</li>
<li>Bang, C. S., Lee, J. J., Baik, G. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Artificial+intelligence+for+the+prediction+of+Helicobacter+pylori+infection+in+endoscopic+images%3A+Systematic+review+and+meta-analysis+of+diagnostic+test+accuracy%5BTitle%5D)+AND+%22J+Med+Internet+Res%22%5BJournal%5D)">Artificial intelligence for the prediction of Helicobacter pylori infection in endoscopic images: Systematic review and meta-analysis of diagnostic test accuracy.</a> J Med Internet Res. 22 (9), e21983(2020).</li>
<li>Liu, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Rapid+and+multi-target+genotyping+of+Helicobacter+pylori+with+digital+microfluidics%5BTitle%5D)+AND+%22Biosens+Bioelectron%22%5BJournal%5D)">Rapid and multi-target genotyping of Helicobacter pylori with digital microfluidics.</a> Biosens Bioelectron. 256, 116282(2024).</li>
<li>Liu, H., Wang, J., Hu, X., Tang, X., Zhang, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+rapid+and+high-throughput+Helicobacter+pylori+RPA-CRISPR%2FCas12a-based+nucleic+acid+detection+system%5BTitle%5D)+AND+%22Clin+Chim+Acta%22%5BJournal%5D)">A rapid and high-throughput Helicobacter pylori RPA-CRISPR/Cas12a-based nucleic acid detection system.</a> Clin Chim Acta. 540, 117201(2023).</li>
<li>Fan, C. J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Diagnostic+accuracy+of+a+real-time+PCR+assay+for+detection+of+Helicobacter+pylori+and+resistance+to+clarithromycin+and+levofloxacin+directly+from+stool%5BTitle%5D)+AND+%22Eur+Rev+Med+Pharmacol+Sci%22%5BJournal%5D)">Diagnostic accuracy of a real-time PCR assay for detection of Helicobacter pylori and resistance to clarithromycin and levofloxacin directly from stool.</a> Eur Rev Med Pharmacol Sci. 28 (12), 3836-3840 (2024).</li>
<li>Patel, S. K., Pratap, C. B., Jain, A. K., Gulati, A. K., Nath, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Diagnosis+of+Helicobacter+pylori%3A+what+should+be+the+gold+standard%5BTitle%5D)+AND+%22World+J+Gastroenterol%22%5BJournal%5D)">Diagnosis of Helicobacter pylori: what should be the gold standard.</a> World J Gastroenterol. 20 (36), 12847-12859 (2014).</li>
<li>Celiberto, F., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+state+of+the+art+of+molecular+fecal+investigations+for+Helicobacter+pylori+%28H.+pylori%29+antibiotic+resistances%5BTitle%5D)+AND+%22Int+J+Mol+Sci%22%5BJournal%5D)">The state of the art of molecular fecal investigations for Helicobacter pylori (H. pylori) antibiotic resistances.</a> Int J Mol Sci. 24 (5), 4361(2023).</li>
<li>Yang, H., Hu, B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Diagnosis+of+Helicobacter+pylori+infection+and+recent+advances%5BTitle%5D)+AND+%22Diagnostics%22%5BJournal%5D)">Diagnosis of Helicobacter pylori infection and recent advances.</a> Diagnostics. 11 (8), 1305(2021).</li>
</ol>

<table><tbody><tr><td>BSC-1500IIA2-X</td><td>BIOBASE</td><td>SEDA</td> 20143222263 <td>생물안전 캐비닛</td></tr><tr><td>일회용 대변 수집 및 저장 튜브</td><td>두더지</td><td></td> 대<td>변 검체 수집</td></tr><tr><td>E-원심분리기</td><td>WEALTEC</td><td></td><td>튜브 벽에서 잔류 액체 원심분리기</td></tr><tr><td>헬리코박터 파일로리 핵산, 클라리트로마이신 및 퀴놀론 내성 돌연변이 검출 키트</td><td>두더지</td><td></td><td>헬리코박터 파일로리 감염 및 항생제 내성 검출; 동결 건조 H. pylori 시약(프라이머, 프로브, Taq 중합효소, UNG 효소, dNTP 등 함유), H. pylori에 대한 양성 대조군(헬리코박터 파일로리 및 인간 &beta;-액틴 표적 유전자 함유) 및 H. pylori에 대한 음성 대조군(인간 &beta;-액틴 표적 유전자 함유)</td></tr> <tr><td>Mole 96M 자동 핵산 추출기</td><td>DNA 추출</td><td></td>용 Mole <td></td></tr><tr><td>핵산 추출 키트</td><td>Mole</td><td></td> 핵<td>산을 추출합니다. 용해 완충액(구아니딘 염, 트리스 하이드록시메틸 아미노메탄, Tween-20, 염화나트륨), 세척 완충액 1(염화나트륨), 세척 완충액 2(트리스 하이드록시메틸 아미노메탄, Tween-20), 세척 완충액 3(마그네틱 비드, Tween-20), 세척 완충액 4(뉴클레아제가 없는 물) 및 용출 완충액(트리스 하이드록시메틸 아미노메탄)과 마그네틱 랙 SLAN 전</td></tr><tr><td>자동 의료용 PCR 분석 시스템</td><td>HONGSHI</td><td></td><td>데이터 분석</td></tr><tr><td>SLAN-96S 실시간 PCR 기계</td><td>HONGSHI</td><td></td><td>형광 정량 PCR 증폭</td></tr> 초<tr><td>저온 냉동고(DW-YL450)</td> <td>MELING</td><td>SEDA</td> <td>20172220091-20 > 시약 보관용 C</td></tr><tr><td>Vortex-5</td><td>Kylin-bell</td><td></td><td>시약 혼합용</td></tr></tbody></table>

대변 정량적 중합효소 연쇄 반응 분석을 통한 헬리코박터 파일로리 감염 및 항생제 내성 검출

Detection of Helicobacter pylori Infection and Antibiotic Resistance via Stool Quantitative Polymerase Chain Reaction Analysis

대변 샘플에서 헬리코박터 파일로리 감염 및 항생제 내성 검출을 위한 qPCR의 적용 우리는 Helicobacter pylori의 보존된 유전자와 23S rRNA 유전자 및 gyrA 유전자의 점 돌연변이를 기반으로 프라이머와 프로브를 설계했습니다. 이러한 프라이머와 프로브는 서로 다른 형광 염료로 라벨링된 다음 qPCR 검출에 사용되었습니다. qPCR 실험에 대한 품질 관리 결과는 권장 범위 내에 있었으며, 이는 신뢰할 수 있는 검출 결과를 나타냅니다(그림 1). 본 연구에서는 실험 프로토콜의 신뢰성을 특성화하기 위해 5개의 대표 샘플(S1-S5)을 선택했습니다(그림 2 및 표 1). S1은 ...

Helicobacter pylori (H. pylori) is widely prevalent worldwide, with approximately 50% of the global population having a history of H. pylori infection. In ...

detection-helicobacter-pylori-infection-antibiotic-resistance-via

Research

연구

JoVE Journal

Immunology and Infection

면역학 및 감염학

이 프로토콜은 스트링 테스트를 통해 헬리코박터 파일로리 위 감염의 신속한 진단을 위한 비침습적 방법을 제시하고 정량적 중합효소 연쇄 반응(qPCR)을 사용하여 클래리스로마이신 및 레보플록사신에 대한 항생제 내성을 결정합니다.

정량적 중합효소연쇄반응(qPCR) 기반 헬리코박터 파일로리 감염 및 항생제 내성 신속 진단

헬리코박터 파일로리균 검출 및 약물 내성 검사를 위한 빠르고 정확한 방법은 임상 실습에서 헬리코박터 파일로리균을 효율적으로 박멸하는 데 매우 중요합니다. 이 프로토콜은 H. pylori 및 항생제 내성의 신속한 검출을 위해 위 점막 정량적 중합효소 연쇄 반응(qPCR)과 관련된 특정 방법론을 제시하는 것을 목표로 합니다.

헬리코박터 파일로리균 및 항생제 내성 검출을 위한 위 점막 정량적 중합효소 연쇄 반응 분석

헬리코박터 파일로리(Helicobacter pylori)에 대한 수많은 진단 방법 중 양자점 면역형광법은 헬리코박터 파일로리균을 신속하게 유형화하고 검출할 수 있어 임상 치료 결정의 기초를 제공합니다. 이 기사는 Helicobacter pylori의 유형 및 검출에서 양자점 기술의 응용 가치에 대한 자세한 소개를 제공합니다.

Quantum Dot Labeling Technology를 사용한 Helicobacter pylori 독성 및 타이핑의 신속한 검출

본 연구에서는 헬리코박터 파일로리균에 감염된 대변 항원을 신속하게 검출할 수 있도록 이중 항체를 기반으로 한 샌드위치 검출 기법을 개발하였다.

Double Antibody Sandwich Detection 기술을 기반으로 Helicobacter pylori 감염의 대변 항원을 신속하게 검출

플라즈마 및 시퀀싱에서 HIV - 1 RNA 수준을 Quantifying하면 단일 HIV - 1 검출 한계 (50-75 사본 / ML) 아래 바이러스성로드와 개인의 genomes가 어렵습니다. 여기 우리는 안정적으로 0.3 복사 / ML에 HIV - 1 RNA를 측정하고 매우 낮은 바이러스성로드와 샘플에서 단일 게놈 시퀀싱에 의해 바이러스 genomes를 증폭하는 방법을 실시간 PCR 분석을 사용하여 플라즈마 바이러스 RNA를 추출하고 계량하는 방법에 대해 설명합니다.

표준 임상 Assays에 의해 탐지의 한도 이하 바이러스성로드와 HIV 감염된 개인의 확장 및 HIV - 1 RNA를 Quantifying

항생제에 취득한 저항은 중요한 공중 보건 문제이며 현재 인간의 삶에 가장 큰 위협의 하나로서 WHO에 의해 평가된다. 여기에 우리가 내성 박테리아를 약제에 대한 소설과 강력한 대리인의 발견에 중요한 항균 저항을 정량화하는 캔틸레버 기술의 사용을 설명합니다.

약물 타겟 상호 작용 및 항균 저항 검출 Nanomechanics

여기에서 우리는 세포 독성을 설명하고 화합물의 신속하고 정확한 검사를 허용 한 라운드 감염의 분석은 세포 독성 (CC 50)을 결정하고, WT 및 약물 HIV-1 저항에 대한 IC 50 값.

HIV 역전사 및 인테그라 제 억제제의 빠른 검사

여기에서는 Cag Type IV 분비 시스템(Cag-T4SS)으로 알려진 발암성 박테리아 소기관을 시각화하는 방법을 설명합니다.  우리는 Cag-T4SS가 다양한 철 가용성 조건에 반응하여 H. pylori의 표면에서 차등적으로 생성된다는 것을 발견했습니다.

고해상도 전자 현미경 헬리코박터 파이로리 CAG 유형 IV 분비 시스템 필리

줄기세포 유래 배양은 감염병을 모델링할 수 있는 엄청난 잠재력을 가지고 있습니다. 여기에서는 성체 줄기 세포에서 유래한 마우스 및 인간 위 오가노이드의 배양에 대해 설명합니다. 오가노이드에는 위 병원균인 헬리코박터 파일로리(Helicobacter pylori)가 미세주입됩니다.

감염증에 대한 모델로 Organoids : 헬리코박터 파이로리의 인간의 문화와 쥐 위장 Organoids 및 미세 주입

재조합 헬리코박터의 원스텝 제외 정제 고 수율 방법에 대하여 설명한다 배치 모드에서 디 에틸 아미노 에틸 수지를 이용하여 대장균에서 과발현 호중구 - 활성화 단백질 (HP-NAP) 파이로리. 이 방법에 의해 정제 HP-NAP는 H. 백신, 약물, 또는 진단의 발전을 위해 도움이됩니다 파이로리는 질병을 -associated.

한 단계의 부정적인 크로마토 그래피 정제<em&gt; 헬리코박터 파이로리</em&gt; 호중구 - 활성화 단백질 과발현<em&gt; 대장균</em&gt; 배치 모드에서

학습하세요 대변 qPCR 분석을 통한 Helicobacter pylori 감염 및 항생제 내성 검출 방법을. 이 비침습적 기술은 세균 배양 없이 3주에서 1일로 진단 시간을 단축하여 맞춤형 치료와 집단 수준의 근절률 향상에 기여합니다.

대변 정량적 중합효소 연쇄 반응 분석을 통한 헬리코박터 파일로리 감염 및 항생제 내성 검출

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