Name: 암에서 단일 세포 염기서열 분석의 글로벌 및 현재 연구 동향: 서지 측정 및 시각화 연구 (동영상) | JoVE Journal
Uploaded: 2025-04-18T13:50:00.000+00:00
Duration: 7 min 50 s
Description: 학습하세요 암 연구에서 단일 세포 염기서열 분석의 글로벌 동향과 서지 측정 방법을. 중국과 미국의 연구 주도권 및 종양 내 이질성, 클론 진화 같은 새로운 연구 방향을 파악하여 연구자와 정책 결정자에게 실행 가능한 통찰을 제공합니다.

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<ol><li>Kocarnik, J. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Cancer+incidence%2C+mortality%2C+years+of+life+lost%2C+years+lived+with+disability%2C+and+disability-adjusted+life+years+for+29+cancer+groups+from+2010+to+2019%3A+A+systematic+analysis+for+the+global+burden+of+disease+study+2019%5BTitle%5D)+AND+%22JAMA+Oncol%22%5BJournal%5D)">Cancer incidence, mortality, years of life lost, years lived with disability, and disability-adjusted life years for 29 cancer groups from 2010 to 2019: A systematic analysis for the global burden of disease study 2019.</a> JAMA Oncol. 8 (3), 420-444 (2022).</li>
<li>Soerjomataram, I., Bray, F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Planning+for+tomorrow%3A+Global+cancer+incidence+and+the+role+of+prevention+2020-2070%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Rev+Clin+Oncol%22%5BJournal%5D)">Planning for tomorrow: Global cancer incidence and the role of prevention 2020-2070.</a> Nat Rev Clin Oncol. 18 (10), 663-672 (2021).</li>
<li>Bray, F., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Global+cancer+statistics+2022%3A+Globocan+estimates+of+incidence+and+mortality+worldwide+for+36+cancers+in+185+countries%5BTitle%5D)+AND+%22CA+Cancer+J+Clin%22%5BJournal%5D)">Global cancer statistics 2022: Globocan estimates of incidence and mortality worldwide for 36 cancers in 185 countries.</a> CA Cancer J Clin. 74 (3), 229-263 (2024).</li>
<li>Zhang, Y., Zhang, Z. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+history+and+advances+in+cancer+immunotherapy%3A+Understanding+the+characteristics+of+tumor-infiltrating+immune+cells+and+their+therapeutic+implications%5BTitle%5D)+AND+%22Cell+Mol+Immunol%22%5BJournal%5D)">The history and advances in cancer immunotherapy: Understanding the characteristics of tumor-infiltrating immune cells and their therapeutic implications.</a> Cell Mol Immunol. 17 (8), 807-821 (2020).</li>
<li>Xu, X., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Metabolic+reprogramming+and+epigenetic+modifications+in+cancer%3A+From+the+impacts+and+mechanisms+to+the+treatment+potential%5BTitle%5D)+AND+%22Exp+Mol+Med%22%5BJournal%5D)">Metabolic reprogramming and epigenetic modifications in cancer: From the impacts and mechanisms to the treatment potential.</a> Exp Mol Med. 55 (7), 1357-1370 (2023).</li>
<li>Hanahan, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Hallmarks+of+cancer%3A+New+dimensions%5BTitle%5D)+AND+%22Cancer+Discov%22%5BJournal%5D)">Hallmarks of cancer: New dimensions.</a> Cancer Discov. 12 (1), 31-46 (2022).</li>
<li>Kashyap, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Quantification+of+tumor+heterogeneity%3A+From+data+acquisition+to+metric+generation%5BTitle%5D)+AND+%22Trends+Biotechnol%22%5BJournal%5D)">Quantification of tumor heterogeneity: From data acquisition to metric generation.</a> Trends Biotechnol. 40 (6), 647-676 (2022).</li>
<li>Vredevoogd, D. W., Peeper, D. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Heterogeneity+in+functional+genetic+screens%3A+Friend+or+foe%5BTitle%5D)+AND+%22Front+Immunol%22%5BJournal%5D)">Heterogeneity in functional genetic screens: Friend or foe.</a> Front Immunol. 14, 1162706(2023).</li>
<li>Jovic, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Single-cell+RNA+sequencing+technologies+and+applications%3A+A+brief+overview%5BTitle%5D)+AND+%22Clin+Transl+Med%22%5BJournal%5D)">Single-cell RNA sequencing technologies and applications: A brief overview.</a> Clin Transl Med. 12 (3), e694(2022).</li>
<li>Hong, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((RNA+sequencing%3A+New+technologies+and+applications+in+cancer+research%5BTitle%5D)+AND+%22J+Hematol+Oncol%22%5BJournal%5D)">RNA sequencing: New technologies and applications in cancer research.</a> J Hematol Oncol. 13 (1), 166(2020).</li>
<li>Moed, H. F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((New+developments+in+the+use+of+citation+analysis+in+research+evaluation%5BTitle%5D)+AND+%22Arch+Immunol+Ther+Exp+%28Warsz%29%22%5BJournal%5D)">New developments in the use of citation analysis in research evaluation.</a> Arch Immunol Ther Exp (Warsz). 57 (1), 13-18 (2009).</li>
<li>Ninkov, A., Frank, J. R., Maggio, L. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Bibliometrics%3A+Methods+for+studying+academic+publishing%5BTitle%5D)+AND+%22Perspect+Med+Educ%22%5BJournal%5D)">Bibliometrics: Methods for studying academic publishing.</a> Perspect Med Educ. 11 (3), 173-176 (2022).</li>
<li>Li, X., Wang, L., Wang, L., Feng, Z., Peng, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Single-cell+sequencing+of+hepatocellular+carcinoma+reveals+cell+interactions+and+cell+heterogeneity+in+the+microenvironment%5BTitle%5D)+AND+%22Int+J+Gen+Med%22%5BJournal%5D)">Single-cell sequencing of hepatocellular carcinoma reveals cell interactions and cell heterogeneity in the microenvironment.</a> Int J Gen Med. 14, 10141-10153 (2021).</li>
<li>Li, Y., Jin, J., Bai, F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Cancer+biology+deciphered+by+single-cell+transcriptomic+sequencing%5BTitle%5D)+AND+%22Protein+Cell%22%5BJournal%5D)">Cancer biology deciphered by single-cell transcriptomic sequencing.</a> Protein Cell. 13 (3), 167-179 (2022).</li>
<li>Bai, X., Li, Y., Zeng, X., Zhao, Q., Zhang, Z. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Single-cell+sequencing+technology+in+tumor+research%5BTitle%5D)+AND+%22Clin+Chim+Acta%22%5BJournal%5D)">Single-cell sequencing technology in tumor research.</a> Clin Chim Acta. 518, 101-109 (2021).</li>
<li>Zhang, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Worldwide+research+trends+on+tumor+burden+and+immunotherapy%3A+A+bibliometric+analysis%5BTitle%5D)+AND+%22Int+J+Surg%22%5BJournal%5D)">Worldwide research trends on tumor burden and immunotherapy: A bibliometric analysis.</a> Int J Surg. 110 (3), 1699-1710 (2024).</li>
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<li>Chen, C. M., Leydesdorff, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Patterns+of+connections+and+movements+in+dual-map+overlays%3A+A+new+method+of+publication+portfolio+analysis%5BTitle%5D)+AND+%22J+Assoc+Inf+Sci+Technol%22%5BJournal%5D)">Patterns of connections and movements in dual-map overlays: A new method of publication portfolio analysis.</a> J Assoc Inf Sci Technol. 65 (2), 334-351 (2014).</li>
<li>Shen, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Analyzing+and+mapping+the+research+status%2C+hotspots%2C+and+frontiers+of+biological+wound+dressings%3A+An+in-depth+data-driven+assessment%5BTitle%5D)+AND+%22Int+J+Pharm%22%5BJournal%5D)">Analyzing and mapping the research status, hotspots, and frontiers of biological wound dressings: An in-depth data-driven assessment.</a> Int J Pharm. 629, 122385(2022).</li>
<li>Small, H., Sweeney, E., Greenlee, E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Clustering+the+science+citation+index+using+co-citations+.2.+Mapping+science%5BTitle%5D)+AND+%22Scientometrics%22%5BJournal%5D)">Clustering the science citation index using co-citations .2. Mapping science.</a> Scientometrics. 8 (5-6), 321-340 (1985).</li>
<li>Butler, A., Hoffman, P., Smibert, P., Papalexi, E., Satija, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Integrating+single-cell+transcriptomic+data+across+different+conditions%2C+technologies%2C+and+species%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Biotechnol%22%5BJournal%5D)">Integrating single-cell transcriptomic data across different conditions, technologies, and species.</a> Nat Biotechnol. 36 (5), 411-420 (2018).</li>
<li>Stuart, T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Comprehensive+integration+of+single-cell+data%5BTitle%5D)+AND+%22Cell%22%5BJournal%5D)">Comprehensive integration of single-cell data.</a> Cell. 177 (7), 1888-1902.e21 (2019).</li>
<li>Baysoy, A., Bai, Z., Satija, R., Fan, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+technological+landscape+and+applications+of+single-cell+multi-omics%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Rev+Mol+Cell+Biol%22%5BJournal%5D)">The technological landscape and applications of single-cell multi-omics.</a> Nat Rev Mol Cell Biol. 24 (10), 695-713 (2023).</li>
<li>Macosko, E. Z., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Highly+parallel+genome-wide+expression+profiling+of+individual+cells+using+nanoliter+droplets%5BTitle%5D)+AND+%22Cell%22%5BJournal%5D)">Highly parallel genome-wide expression profiling of individual cells using nanoliter droplets.</a> Cell. 161 (5), 1202-1214 (2015).</li>
<li>Tirosh, I., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Dissecting+the+multicellular+ecosystem+of+metastatic+melanoma+by+single-cell+RNA-seq%5BTitle%5D)+AND+%22Science+%28New+York%2C+N.Y.%29%22%5BJournal%5D)">Dissecting the multicellular ecosystem of metastatic melanoma by single-cell RNA-seq.</a> Science (New York, N.Y.). 352 (6282), 189-196 (2016).</li>
<li>Martinez-Simon, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Covid-19+publications+in+anaesthesiology+journals%3A+A+bibliometric+analysis%5BTitle%5D)+AND+%22Br+J+Anaesth%22%5BJournal%5D)">Covid-19 publications in anaesthesiology journals: A bibliometric analysis.</a> Br J Anaesth. 128 (3), e239-e241 (2022).</li>
<li>Wen, L., Tang, F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Single-cell+sequencing+in+stem+cell+biology%5BTitle%5D)+AND+%22Genome+Biol%22%5BJournal%5D)">Single-cell sequencing in stem cell biology.</a> Genome Biol. 17, 71(2016).</li>
<li>Zhang, Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Single-cell+RNA+sequencing+in+cancer+research%5BTitle%5D)+AND+%22J+Exp+Clin+Cancer+Res%22%5BJournal%5D)">Single-cell RNA sequencing in cancer research.</a> J Exp Clin Cancer Res. 40 (1), 81(2021).</li>
<li>Tang, F., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((MRNA-seq+whole-transcriptome+analysis+of+a+single-cell%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Methods%22%5BJournal%5D)">MRNA-seq whole-transcriptome analysis of a single-cell.</a> Nat Methods. 6 (5), 377-382 (2009).</li>
<li>Navin, N., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Tumour+evolution+inferred+by+single-cell+sequencing%5BTitle%5D)+AND+%22Nature%22%5BJournal%5D)">Tumour evolution inferred by single-cell sequencing.</a> Nature. 472 (7341), 90-94 (2011).</li>
<li>Tang, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Single-cell+exome+sequencing+reveals+multiple+subclones+in+metastatic+colorectal+carcinoma%5BTitle%5D)+AND+%22Genome+Med%22%5BJournal%5D)">Single-cell exome sequencing reveals multiple subclones in metastatic colorectal carcinoma.</a> Genome Med. 13 (1), 148(2021).</li>
<li>Song, H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Single-cell+analysis+of+human+primary+prostate+cancer+reveals+the+heterogeneity+of+tumor-associated+epithelial+cell+states%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Commun%22%5BJournal%5D)">Single-cell analysis of human primary prostate cancer reveals the heterogeneity of tumor-associated epithelial cell states.</a> Nat Commun. 13 (1), 141(2022).</li>
<li>Zheng, X., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Single-cell+transcriptomic+profiling+unravels+the+adenoma-initiation+role+of+protein+tyrosine+kinases+during+colorectal+tumorigenesis%5BTitle%5D)+AND+%22Signal+Transduct+Target+Ther%22%5BJournal%5D)">Single-cell transcriptomic profiling unravels the adenoma-initiation role of protein tyrosine kinases during colorectal tumorigenesis.</a> Signal Transduct Target Ther. 7 (1), 60(2022).</li>
<li>Chan, T. J., Zhang, X., Mak, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Biophysical+informatics+reveals+distinctive+phenotypic+signatures+and+functional+diversity+of+single-cell+lineages%5BTitle%5D)+AND+%22Bioinformatics%22%5BJournal%5D)">Biophysical informatics reveals distinctive phenotypic signatures and functional diversity of single-cell lineages.</a> Bioinformatics. 39 (1), btac833(2023).</li>
<li>Chen, Y. P., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Single-cell+transcriptomics+reveals+regulators+underlying+immune+cell+diversity+and+immune+subtypes+associated+with+prognosis+in+nasopharyngeal+carcinoma%5BTitle%5D)+AND+%22Cell+Res%22%5BJournal%5D)">Single-cell transcriptomics reveals regulators underlying immune cell diversity and immune subtypes associated with prognosis in nasopharyngeal carcinoma.</a> Cell Res. 30 (11), 1024-1042 (2020).</li>
<li>Small, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Co-citation+in+scientific+literature+-+new+measure+of+relationship+between+2+documents%5BTitle%5D)+AND+%22J+Am+Soc+Inf+Sci%22%5BJournal%5D)">Co-citation in scientific literature - new measure of relationship between 2 documents.</a> J Am Soc Inf Sci. 24 (4), 265-269 (1973).</li>
<li>Villani, A. -C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Single-cell+RNA-seq+reveals+new+types+of+human+blood+dendritic+cells%2C+monocytes%2C+and+progenitors%5BTitle%5D)+AND+%22Science+%28New+York%2C+N.Y.%29%22%5BJournal%5D)">Single-cell RNA-seq reveals new types of human blood dendritic cells, monocytes, and progenitors.</a> Science (New York, N.Y.). 356 (6335), eaah4573(2017).</li>
<li>Sun, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Identifying+phenotype-associated+subpopulations+by+integrating+bulk+and+single-cell+sequencing+data%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Biotechnol%22%5BJournal%5D)">Identifying phenotype-associated subpopulations by integrating bulk and single-cell sequencing data.</a> Nat Biotechnol. 40 (4), 527-538 (2022).</li>
<li>Pe'er, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Tumor+heterogeneity%5BTitle%5D)+AND+%22Cancer+Cell%22%5BJournal%5D)">Tumor heterogeneity.</a> Cancer Cell. 39 (8), 1015-1017 (2021).</li>
<li>Liu, X., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Single-cell+transcriptomics+links+malignant+T+cells+to+the+tumor+immune+landscape+in+cutaneous+T-cell+lymphoma%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Commun%22%5BJournal%5D)">Single-cell transcriptomics links malignant T cells to the tumor immune landscape in cutaneous T-cell lymphoma.</a> Nat Commun. 13 (1), 1158(2022).</li>
<li>Yan, Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Clonal+phylogeny+and+evolution+of+critical+cytogenetic+aberrations+in+multiple+myeloma+at+single-cell+level+by+qm-fish%5BTitle%5D)+AND+%22Blood+Adv%22%5BJournal%5D)">Clonal phylogeny and evolution of critical cytogenetic aberrations in multiple myeloma at single-cell level by qm-fish.</a> Blood Adv. 6 (2), 441-451 (2022).</li>
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<table><tbody><tr><td>bibliometrix 패키지</td><td>CRAN(Comprehensive R Archive Network)</td><td>bibliometrix 4.3.0</td><td>행당 여러 신뢰 구간, 각 텍스트 요소에 대한 사용자 정의 글꼴, 사용자 정의 신뢰 구간, 표현식과 혼합된 텍스트 등을 허용하는 포레스트 플롯입니다.</td></tr><tr><td>CiteSpace</td><td>Chaomei Chen, Drexel University</td><td>CiteSpace 6.2.R4(64비트) 베타 Basic</td><td>&zwnj; 인용공간&zwnj; 과학 문헌 분석 도구입니다. 주요 기능은 과학 문헌의 기본 지식을 시각적 수단을 통해 분석하여 과학 지식의 구조, 규칙 및 분포를 보여주는 것입니다. CiteSpace의 주요 기능에는 연구 협력 분석&zwnj;, 중요 저널 판단&zwnj;, 핵심 주제 마이닝 등이 포함됩니다.</td></tr><tr><td>dplyr</td><td>CRAN(종합 R 아카이브 네트워크)</td><td>dplyr 1.1.4</td><td>dbplyr은 dplyr의 데이터베이스 백엔드입니다. dplyr 코드를 SQL로 자동 변환하여 원격 데이터베이스 테이블을 메모리 내 데이터 프레임인 것처럼 사용할 수 있습니다.</td></tr><tr><td>esquisse</td><td>CRAN(Comprehensive R Archive Network)</td><td>esquisse 2.0.1</td><td>이 애드인을 사용하면 ggplot2 패키지로 데이터를 시각화하여 대화형으로 데이터를 탐색할 수 있습니다. 막대 그림, 곡선, 산점도, 히스토그램, 상자 그림 및 sf 개체를 그린 다음 그래프를 내보내거나 코드를 검색하여 그래프를 재현할 수 있습니다.</td></tr><tr><td>forcats</td><td>CRAN(종합 R 아카이브 네트워크)</td><td>forcats 1.0.0</td><td>R은 요인을 사용하여 범주형 변수, 즉 고정되고 알려진 가능한 값 집합이 있는 변수를 처리합니다. 요인은 표시를 개선하기 위해 문자 벡터를 재정렬하는 데에도 유용합니다. forcats 패키지의 목표는 레벨 순서 또는 값 변경을 포함하여 요인과 관련된 일반적인 문제를 해결하는 도구 모음을 제공하는 것입니다.&nbsp;</td></tr><tr><td>ggplot2</td><td>CRAN(Comprehensive R Archive Network)</td><td>ggplot2 3.5.1</td><td>ggplot2는 The Grammar of Graphics를 기반으로 선언적으로 그래픽을 만드는 시스템입니다. 데이터를 제공하고 ggplot2에 변수를 미학에 매핑하는 방법, 사용할 그래픽 프리미티브를 지시하면 세부 사항을 처리합니다.</td></tr><tr><td>ggpmisc</td><td>CRAN(종합 R 아카이브 네트워크)</td><td>ggpmisc 0.6.1</td><td>패키지 ' ggpmisc' ('에 대한 기타 확장 ggplot2') R 패키지 '에 대한 확장 집합입니다. ggplot2' (>= 3.0.0) 적합 모델과 관련된 주석 및 플로팅에 중점을 둡니다. 모델 적합 객체의 추정치는 ggplots에 텍스트, 표 또는 방정식으로 표시될 수 있습니다. 예측값, 잔차, 편차 및 가중치는 다양한 모델 적합 함수에 대해 플롯될 수 있습니다.</td></tr><tr><td>ggsci</td><td>CRAN(Comprehensive R Archive Network)</td><td>ggsci 3.2.0</td><td>ggsci는 과학 저널, 데이터 시각화 라이브러리, 공상 과학 영화 및 TV 프로그램에서 영감을 받은 ggplot2 색상 팔레트 모음을 제공합니다.</td></tr><tr><td>openxlsx</td><td>CRAN(Comprehensive R Archive Network)</td><td>openxlsx 4.2.7.1</td><td>이 R 패키지는 워크시트 작성, 스타일 지정 및 편집에 대한 높은 수준의 인터페이스를 제공하여 .xlsx 파일 생성을 단순화합니다. Rcpp를 사용하면 읽기/쓰기 시간이 xlsx 및 XLConnect 패키지와 비슷하며 Java에 대한 종속성을 제거하는 추가 이점이 있습니다.</td></tr><tr><td>readxl</td><td>CRAN(Comprehensive R Archive Network)</td><td>readxl 1.4.3</td><td>readxl 패키지를 사용하면 Excel에서 R로 데이터를 쉽게 가져올 수 있습니다. 많은 기존 패키지(예: gdata, xlsx, xlsReadWrite)와 비교할 때 readxl에는 외부 종속성이 없으므로 ' 모든 운영 체제에서 쉽게 설치하고 사용할 수 있습니다. 표 형식 데이터로 작업하도록 설계되었습니다.</td></tr><tr><td>reshape2</td><td>CRAN(Comprehensive R Archive Network)</td><td>reshape2 1.4.4</td><td>Reshape2는 reshape 패키지의 재부팅입니다. reshape가 처음 출시된 지 5년이 넘었고, 그 기간 동안 R 프로그래밍과 R에서 데이터 작업 방법에 대해 엄청난 양을 배웠습니다. Reshape2는 이러한 지식을 사용하여 훨씬 더 집중적이고 훨씬 더 빠른 데이터 재구성을 위한 새로운 패키지를 만듭니다.</td></tr><tr><td>stringr</td><td>CRAN(Comprehensive R Archive Network)stringr</td> <td>1.5.1</td><td>문자열은 화려하고 세간의 이목을 끄는 R의 구성 요소는 아니지만 많은 데이터 정리 및 준비 작업에서 큰 역할을 합니다. stringr 패키지는 문자열 작업을 가능한 한 쉽게 할 수 있도록 설계된 응집력 있는 함수 세트를 제공합니다.</td></tr><tr><td>깔끔한</td> 텍스트 <td>CRAN(종합 R 아카이브 네트워크)</td><td>깔끔한 텍스트 0.4.2</td><td>깔끔한 데이터 원칙을 사용하면 많은 텍스트 마이닝 작업을 더 쉽고 효과적으로 만들 수 있으며 이미 널리 사용되는 도구와 일관성을 유지할 수 있습니다. 깔끔한 데이터 프레임을 사용한 텍스트 마이닝에 필요한 인프라의 대부분은 이미 dplyr, broom, tidyr 및 ggplot2와 같은 패키지에 존재합니다. 이 패키지에서는 텍스트를 깔끔한 형식으로 변환하고 깔끔한 도구와 기존 텍스트 마이닝 패키지 간에 원활하게 전환할 수 있는 기능과 지원 데이터 세트를 제공합니다. 깔끔한 데이터 원칙을 사용한 텍스트 마이닝에 대해 자세히 알아보려면 책을 확인하세요.</td></tr><tr><td>tidyverse</td><td>CRAN(Comprehensive R Archive Network)</td><td>tidyverse 2.0.0</td><td>tidyverse는 데이터 과학을 위해 설계된 R 패키지의 독단적인 컬렉션입니다. 모든 패키지는 기본 디자인 철학, 문법 및 데이터 구조를 공유합니다.</td></tr><tr><td>VennDiagram</td><td>CRAN(Comprehensive R Archive Network)</td><td>VennDiagram 1.7.3</td><td>VennDiagram은 최대 4세트의 고해상도 맞춤형 벤 다이어그램과 최대 3세트의 오일러 다이어그램을 생성하기 위한 R 패키지입니다. 2케이스 스케일링을 포함한 여러 가지 특수 사례에 대한 처리, 플롯 모양 및 구조의 광범위한 사용자 정의가 포함됩니다.</td></tr><tr><td>VOS뷰어</td><td>&nbsp; 네덜란드 라이덴 대학교 과학 기술 연구 센터</td><td>VOSviewer 버전 1.6.19</td><td>VOSviewer는 서지 네트워크를 구성하고 시각화하기 위한 소프트웨어 도구입니다. 이러한 네트워크에는 예를 들어 저널, 연구자 또는 개별 출판물이 포함될 수 있으며 인용, 서지 결합, 공동 인용 또는 공동 저자 관계를 기반으로 구성될 수 있습니다. VOSviewer는 또한 과학 문헌에서 추출한 중요한 용어의 동시 발생 네트워크를 구성하고 시각화하는 데 사용할 수 있는 텍스트 마이닝 기능을 제공합니다.</td></tr></tbody></table>

암에서 단일 세포 염기서열 분석의 글로벌 및 현재 연구 동향: 서지 측정 및 시각화 연구

Global and Current Research Trends of Single-Cell Sequencing in Cancer: A Bibliometric and Visualization Study

출판물 및 인용의 연간 성장 추세 2010년부터 2023년까지 WoSCC 데이터베이스에서 암의 단세포 염기서열 분석과 관련된 총 6,767개의 출판물이 확인되었습니다. 2010년에서 2023년 사이에 발표된 총 602건의 연구가 분석에서 제외되었으며, 영어로 출판되지 않은 5건의 연구가 제외되었습니다. 또한, 사전 정의된 제외 기준에 따라 480개의 논문이 제외되었으며, 이 중 361개의 회의 초록, 83개의 편집 자료 및 기타 범주로 분류된 36개의 논문으로 구성되었습니다. 최종적으로 본 연구에는 5,090편의 연구 논문과 590편의 리뷰 논문으로 구성된 5,680편의 논문이 포함되었다.
WoSCC 인용 보고서에 따르면 이러한 문서의 누적 인용 횟수는 162,233회였으며 기사당 평균 인용 횟수는 28.56회였습니다. 연간 성장률은 40.26%로 계산되어 전반적인 상승 추세를 보였습니다. <strong ...

Cancer poses a significant challenge to human health due to its complex biological systems, necessitating in-depth analysis. Single-cell sequencing has ...

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단일 셀의 순서는 고해상도 게놈 변화를 해결하기위한 점점 인기 액세스 도구입니다. 우리는 하나의 셀에 복사 번호 변경을 식별하기 위해 단일 셀 시퀀싱을 사용하는 프로토콜을 제공합니다.

단일 셀 시퀀싱을 사용하여 복사 번호 수선의 검출

단일 셀 시퀀싱 생물 학적 시스템, genotypic이 보여 하지만 현재 기술 커뮤니티 구성 및 기능의 깊은 프로 파일링에 필요한 처리량 부족. 여기, 우리는 미세 워크플로 시퀀싱에 대 한 설명 &gt; 다양 한에서 50000 단일 셀 게놈 세포 인구.

단일 셀 게놈 시퀀싱 초고 처리량 미세 플랫폼

종양 내 이질성은 진모를 포함한 종양의 내재된 특징입니다. 우리는 단일 핵 RNA 및 ATAC 염기서열 분석 연구를 위한 신선한 동결 신경교종 조직에서 단 하나 핵을 격리하기 위하여 완충과 그라데이션 원심분리의 조합을 이용하는 간단하고 효율적인 프로토콜을 개발했습니다.

단일 핵 RNA-seq 및 ATAC-seq를 위한 신선한 냉동 뇌 종양에서 핵 절연

여기에서, 저자들은 망막에서 전사체 및 크로마틴 접근성 프로파일을 특성화하는데 있어서 표현형 및 후속 쌍을 이룬 scRNA-seq 및 scATAC-seq 에 대한 MULTI-seq 의 유용성을 보여준다.

scRNA-Seq 및 scATAC-Seq 를 이용한 망막 유전자 발현 및 크로마틴 접근성의 다중화 분석

여기에서는 암에서 TMEM200A 의 생물학적 기능을 연구하기 위해 여러 생물 정보학 도구를 결합한 프로토콜을 제시합니다. 또한 생물정보학 예측을 실험적으로 검증합니다.

범암 바이오마커로서의 TMEM200A 의 멀티오믹스 분석

이 프로토콜은 단일 세포 RNA 염기서열 분석을 위해 인간 및 마우스 종양 샘플을 빠르게 해리하는 절차를 간략하게 설명합니다.

single-cell RNA sequencing을 위한 인간 및 생쥐 종양 조직 샘플의 해리

이 프로토콜은 체외/생체 내 기능 분석, 전사체학 및 컴퓨터 분석을 포함하여 쥐 CAF를 배양, 조작 및 분석하는 방법을 간략하게 설명합니다. 또한, 인간 유방암 종양 컬렉션에서 레이저 캡처 미세 절개 기질 및 상피 구성 요소의 공개적으로 사용 가능한 전사체를 분석하기 위해 개발된 웹 기반 플랫폼에 대해 설명합니다.

Cancer-Associated Fibroblasts from Mouse Mammary Tumors as Tools for Molecular and Computational Studies(분자 및 컴퓨터 연구를 위한 도구로서의 마우스 유방 종양에서 유래한 암 관련 섬유아세포)

순환 종양 세포(CTC)는 암 진행 및 전이 연구에 매우 중요합니다. 이 기사에서는 CTC 농축 및 단일 CTC 시퀀싱을 위한 고처리량 통합 프로토콜을 제시하여 포획 효율성과 CTC 순도를 개선하는 동시에 오염 및 시퀀싱 비용을 줄여 정밀 종양학 연구 및 임상 응용을 발전시킵니다.

미세유체공학 기반 고처리량 순환 종양 세포 분류 및 단일 세포 시퀀싱 기술

이 프로토콜은 건강한 쥐 및 종양이 있는 쥐 폐 조직 모두에서 고품질 단세포 현탁액을 분리하는 상세한 방법을 제시합니다. 이 프로토콜은 scRNA-seq, 유세포분석 및 1차 세포 분리에 적용할 수 있습니다.

플로우 사이토메트리 및 단세포 RNA 시퀀싱을 위한 전체 쥐 종양 탑재 폐 조직의 최적화 준비

이 원고는 두 개의 차세대 염기서열분석 패널에 대한 임상 프로토콜을 설명합니다. 한 패널은 혈액학적 악성 종양을 조사하고 다른 패널은 고형 종양에서 일반적으로 돌연변이가 발생하는 유전자를 대상으로 합니다. 인간 악성 종양에서 드라이버 돌연변이의 분자 분류는 귀중한 예후 및 예측 정보를 제공합니다.

고체 및 액체 종양에서 실행 가능한 돌연변이의 검출을위한 차세대 시퀀싱

학습하세요 암 연구에서 단일 세포 염기서열 분석의 글로벌 동향과 서지 측정 방법을. 중국과 미국의 연구 주도권 및 종양 내 이질성, 클론 진화 같은 새로운 연구 방향을 파악하여 연구자와 정책 결정자에게 실행 가능한 통찰을 제공합니다.

암에서 단일 세포 염기서열 분석의 글로벌 및 현재 연구 동향: 서지 측정 및 시각화 연구

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