Name: Real-time PCR을 이용한 SNP 유전형 분석에 의한 Caenorhabditis elegans 감수분열의 교차 빈도 및 분포 (동영상) | JoVE Journal
Uploaded: 2025-07-11T15:30:00.000+00:00
Duration: 6 min 18 s
Description: 학습하세요 Caenorhabditis elegans 감수분열에서 교차 빈도 및 분포를 측정하는 실시간 PCR 기반 SNP 유전형 분석 방법을. 이 단순화된 qPCR 접근법은 유전자형 분석의 정확성을 높여 유전학 연구의 신뢰성을 향상시킵니다.

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<ol><li>Jones, G., Kleckner, N., Zickler, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Meiosis+through+three+centuries%5BTitle%5D)+AND+%22Chromosoma%22%5BJournal%5D)">Meiosis through three centuries.</a> Chromosoma. 133 (2), 93-115 (2024).</li>
<li>Hassold, T. J., Hunt, P. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Missed+connections%3A+Recombination+and+human+aneuploidy%5BTitle%5D)+AND+%22Prenat+Diagn%22%5BJournal%5D)">Missed connections: Recombination and human aneuploidy.</a> Prenat Diagn. 41 (5), 584-590 (2021).</li>
<li>Barnes, T. M., Kohara, Y., Coulson, A., Hekimi, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Meiotic+recombination%2C+noncoding+DNA+and+genomic+organization+in+caenorhabditis+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22Genetics%22%5BJournal%5D)">Meiotic recombination, noncoding DNA and genomic organization in caenorhabditis elegans.</a> Genetics. 141 (1), 159-179 (1995).</li>
<li>Lim, J. G., Stine, R. R., Yanowitz, J. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Domain-specific+regulation+of+recombination+in+Caenorhabditis+elegans+in+response+to+temperature%2C+age%2C+and+sex%5BTitle%5D)+AND+%22Genetics%22%5BJournal%5D)">Domain-specific regulation of recombination in Caenorhabditis elegans in response to temperature, age, and sex.</a> Genetics. 180 (2), 715-726 (2008).</li>
<li>Rockman, M. V., Kruglyak, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Recombinational+landscape+and+population+genomics+of+Caenorhabditis+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+Genet%22%5BJournal%5D)">Recombinational landscape and population genomics of Caenorhabditis elegans.</a> PLoS Genet. 5 (3), e1000419(2009).</li>
<li>Brenner, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+genetics+of+Caenorhabditis+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22Genetics%22%5BJournal%5D)">The genetics of Caenorhabditis elegans.</a> Genetics. 77 (1), 71-94 (1974).</li>
<li>Li, W., Yanowitz, J. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Atm+and+atr+influence+meiotic+crossover+formation+through+antagonistic+and+overlapping+functions+in+Caenorhabditis+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22Genetics%22%5BJournal%5D)">Atm and atr influence meiotic crossover formation through antagonistic and overlapping functions in Caenorhabditis elegans.</a> Genetics. 212 (2), 431-443 (2019).</li>
<li>Rose, A. M., Baillie, D. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+effect+of+temperature+and+parental+age+on+recombination+and+nondisjunction+in+Caenorhabditis+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22Genetics%22%5BJournal%5D)">The effect of temperature and parental age on recombination and nondisjunction in Caenorhabditis elegans.</a> Genetics. 92 (2), 409-418 (1979).</li>
<li>Villeneuve, A. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+cis-acting+locus+that+promotes+crossing+over+between+X+chromosomes+in+Caenorhabditis+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22Genetics%22%5BJournal%5D)">A cis-acting locus that promotes crossing over between X chromosomes in Caenorhabditis elegans.</a> Genetics. 136 (3), 887-902 (1994).</li>
<li>Youds, J. L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Rtel-1+enforces+meiotic+crossover+interference+and+homeostasis%5BTitle%5D)+AND+%22Science%22%5BJournal%5D)">Rtel-1 enforces meiotic crossover interference and homeostasis.</a> Science. 327 (5970), 1254-1258 (2010).</li>
<li>Emmons, S. W., Yesner, L., Ruan, K. S., Katzenberg, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Evidence+for+a+transposon+in+Caenorhabditis+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22Cell%22%5BJournal%5D)">Evidence for a transposon in Caenorhabditis elegans.</a> Cell. 32 (1), 55-65 (1983).</li>
<li>Williams, B. D., Schrank, B., Huynh, C., Shownkeen, R., Waterston, R. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+genetic+mapping+system+in+Caenorhabditis+elegans+based+on+polymorphic+sequence-tagged+sites%5BTitle%5D)+AND+%22Genetics%22%5BJournal%5D)">A genetic mapping system in Caenorhabditis elegans based on polymorphic sequence-tagged sites.</a> Genetics. 131 (3), 609-624 (1992).</li>
<li>Hillers, K. J., Villeneuve, A. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Chromosome-wide+control+of+meiotic+crossing+over+in+C.+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22Curr+Biol%22%5BJournal%5D)">Chromosome-wide control of meiotic crossing over in C. elegans.</a> Curr Biol. 13 (18), 1641-1647 (2003).</li>
<li>Wicks, S. R., Yeh, R. T., Gish, W. R., Waterston, R. H., Plasterk, R. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Rapid+gene+mapping+in+Caenorhabditis+elegans+using+a+high-density+polymorphism+map%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Genet%22%5BJournal%5D)">Rapid gene mapping in Caenorhabditis elegans using a high-density polymorphism map.</a> Nat Genet. 28 (2), 160-164 (2001).</li>
<li>Campos, T. L., Korhonen, P. K., Sternberg, P. W., Gasser, R. B., Young, N. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Predicting+gene+essentiality+in+Caenorhabditis+elegans+by+feature+engineering+and+machine-learning%5BTitle%5D)+AND+%22Comput+Struct+Biotechnol+J%22%5BJournal%5D)">Predicting gene essentiality in Caenorhabditis elegans by feature engineering and machine-learning.</a> Comput Struct Biotechnol J. 18, 1093-1102 (2020).</li>
<li>Fay, D., Bender, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Snps%3A+Introduction+and+two-point+mapping%5BTitle%5D)+AND+%22WormBook%22%5BJournal%5D)">Snps: Introduction and two-point mapping.</a> WormBook. , (2008).</li>
<li>Hwang, H. Y., Wang, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Fast+genetic+mapping+using+insertion-deletion+polymorphisms+in+Caenorhabditis+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22Sci+Rep%22%5BJournal%5D)">Fast genetic mapping using insertion-deletion polymorphisms in Caenorhabditis elegans.</a> Sci Rep. 11 (1), 11017(2021).</li>
<li>Davis, M. W., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Rapid+single+nucleotide+polymorphism+mapping+in+C.+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22BMC+Genomics%22%5BJournal%5D)">Rapid single nucleotide polymorphism mapping in C. elegans.</a> BMC Genomics. 6, 118(2005).</li>
<li>Livak, K. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Allelic+discrimination+using+fluorogenic+probes+and+the+5%27+nuclease+assay%5BTitle%5D)+AND+%22Genet+Anal%22%5BJournal%5D)">Allelic discrimination using fluorogenic probes and the 5' nuclease assay.</a> Genet Anal. 14 (5-6), 143-149 (1999).</li>
<li>Li, Q., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+tumor+suppressor+BRCA1-BARD1+complex+localizes+to+the+synaptonemal+complex+and+regulates+recombination+under+meiotic+dysfunction+in+Caenorhabditis+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+Genet%22%5BJournal%5D)">The tumor suppressor BRCA1-BARD1 complex localizes to the synaptonemal complex and regulates recombination under meiotic dysfunction in Caenorhabditis elegans.</a> PLoS Genet. 14 (11), e1007701(2018).</li>
<li>Saito, T. T., Lui, D. Y., Kim, H. M., Meyer, K., Colaiacovo, M. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Interplay+between+structure-specific+endonucleases+for+crossover+control+during+Caenorhabditis+elegans+meiosis%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+Genet%22%5BJournal%5D)">Interplay between structure-specific endonucleases for crossover control during Caenorhabditis elegans meiosis.</a> PLoS Genet. 9 (7), e1003586(2013).</li>
<li>Saito, T. T., Youds, J. L., Boulton, S. J., Colaiacovo, M. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Caenorhabditis+elegans+him-18%2Fslx-4+interacts+with+slx-1+and+xpf-1+and+maintains+genomic+integrity+in+the+germline+by+processing+recombination+intermediates%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+Genet%22%5BJournal%5D)">Caenorhabditis elegans him-18/slx-4 interacts with slx-1 and xpf-1 and maintains genomic integrity in the germline by processing recombination intermediates.</a> PLoS Genet. 5 (11), e1000735(2009).</li>
<li>Longo, M. C., Berninger, M. S., Hartley, J. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Use+of+uracil+DNA+glycosylase+to+control+carry-over+contamination+in+polymerase+chain+reactions%5BTitle%5D)+AND+%22Gene%22%5BJournal%5D)">Use of uracil DNA glycosylase to control carry-over contamination in polymerase chain reactions.</a> Gene. 93 (1), 125-128 (1990).</li>
<li>Kutyavin, I. V., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((3%27-minor+groove+binder-DNA+probes+increase+sequence+specificity+at+pcr+extension+temperatures%5BTitle%5D)+AND+%22Nucleic+Acids+Res%22%5BJournal%5D)">3'-minor groove binder-DNA probes increase sequence specificity at pcr extension temperatures.</a> Nucleic Acids Res. 28 (2), 655-661 (2000).</li>
<li>Hammarlund, M., Davis, M. W., Nguyen, H., Dayton, D., Jorgensen, E. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Heterozygous+insertions+alter+crossover+distribution+but+allow+crossover+interference+in+Caenorhabditis+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22Genetics%22%5BJournal%5D)">Heterozygous insertions alter crossover distribution but allow crossover interference in Caenorhabditis elegans.</a> Genetics. 171 (3), 1047-1056 (2005).</li>
<li>Hodgkin, J., Horvitz, H. R., Brenner, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Nondisjunction+mutants+of+the+nematode+Caenorhabditis+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22Genetics%22%5BJournal%5D)">Nondisjunction mutants of the nematode Caenorhabditis elegans.</a> Genetics. 91 (1), 67-94 (1979).</li>
<li>Meneely, P. M., Farago, A. F., Kauffman, T. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Crossover+distribution+and+high+interference+for+both+the+X+chromosome+and+an+autosome+during+oogenesis+and+spermatogenesis+in+Caenorhabditis+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22Genetics%22%5BJournal%5D)">Crossover distribution and high interference for both the X chromosome and an autosome during oogenesis and spermatogenesis in Caenorhabditis elegans.</a> Genetics. 162 (3), 1169-1177 (2002).</li>
<li>Nabeshima, K., Villeneuve, A. M., Hillers, K. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Chromosome-wide+regulation+of+meiotic+crossover+formation+in+Caenorhabditis+elegans+requires+properly+assembled+chromosome+axes%5BTitle%5D)+AND+%22Genetics%22%5BJournal%5D)">Chromosome-wide regulation of meiotic crossover formation in Caenorhabditis elegans requires properly assembled chromosome axes.</a> Genetics. 168 (3), 1275-1292 (2004).</li>
<li>Phillips, C. M., Dernburg, A. F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+family+of+zinc-finger+proteins+is+required+for+chromosome-specific+pairing+and+synapsis+during+meiosis+in+C.+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22Dev+Cell%22%5BJournal%5D)">A family of zinc-finger proteins is required for chromosome-specific pairing and synapsis during meiosis in C. elegans.</a> Dev Cell. 11 (6), 817-829 (2006).</li>
<li>Mancera, E., Bourgon, R., Brozzi, A., Huber, W., Steinmetz, L. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((High-resolution+mapping+of+meiotic+crossovers+and+non-crossovers+in+yeast%5BTitle%5D)+AND+%22Nature%22%5BJournal%5D)">High-resolution mapping of meiotic crossovers and non-crossovers in yeast.</a> Nature. 454 (7203), 479-485 (2008).</li>
<li>Qi, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Characterization+of+meiotic+crossovers+and+gene+conversion+by+whole-genome+sequencing+in+Saccharomyces+cerevisiae%5BTitle%5D)+AND+%22BMC+Genomics%22%5BJournal%5D)">Characterization of meiotic crossovers and gene conversion by whole-genome sequencing in Saccharomyces cerevisiae.</a> BMC Genomics. 10, 475(2009).</li>
<li>Miller, D. E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+whole-chromosome+analysis+of+meiotic+recombination+in+Drosophila+melanogaster%5BTitle%5D)+AND+%22G3+%28Bethesda%29%22%5BJournal%5D)">A whole-chromosome analysis of meiotic recombination in Drosophila melanogaster.</a> G3 (Bethesda). 2 (2), 249-260 (2012).</li>
<li>Carlton, P. M., Farruggio, A. P., Dernburg, A. F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+link+between+meiotic+prophase+progression+and+crossover+control%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+Genet%22%5BJournal%5D)">A link between meiotic prophase progression and crossover control.</a> PLoS Genet. 2 (2), e12(2006).</li>
<li>Tsai, C. J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Meiotic+crossover+number+and+distribution+are+regulated+by+a+dosage+compensation+protein+that+resembles+a+condensin+subunit%5BTitle%5D)+AND+%22Genes+Dev%22%5BJournal%5D)">Meiotic crossover number and distribution are regulated by a dosage compensation protein that resembles a condensin subunit.</a> Genes Dev. 22 (2), 194-211 (2008).</li>
<li>Bhalla, N., Wynne, D. J., Jantsch, V., Dernburg, A. F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Zhp-3+acts+at+crossovers+to+couple+meiotic+recombination+with+synaptonemal+complex+disassembly+and+bivalent+formation+in+C.+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+Genet%22%5BJournal%5D)">Zhp-3 acts at crossovers to couple meiotic recombination with synaptonemal complex disassembly and bivalent formation in C. elegans.</a> PLoS Genet. 4 (10), e1000235(2008).</li>
<li>Yokoo, R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Cosa-1+reveals+robust+homeostasis+and+separable+licensing+and+reinforcement+steps+governing+meiotic+crossovers%5BTitle%5D)+AND+%22Cell%22%5BJournal%5D)">Cosa-1 reveals robust homeostasis and separable licensing and reinforcement steps governing meiotic crossovers.</a> Cell. 149 (1), 75-87 (2012).</li>
<li>Almanzar, D. E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Meiotic+DNA+exchanges+in+C.+elegans+are+promoted+by+proximity+to+the+synaptonemal+complex%5BTitle%5D)+AND+%22Life+Sci+Alliance%22%5BJournal%5D)">Meiotic DNA exchanges in C. elegans are promoted by proximity to the synaptonemal complex.</a> Life Sci Alliance. 6 (4), e202301906(2023).</li>
<li>De Los Santos, T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+mus81%2Fmms4+endonuclease+acts+independently+of+double-holliday+junction+resolution+to+promote+a+distinct+subset+of+crossovers+during+meiosis+in+budding+yeast%5BTitle%5D)+AND+%22Genetics%22%5BJournal%5D)">The mus81/mms4 endonuclease acts independently of double-holliday junction resolution to promote a distinct subset of crossovers during meiosis in budding yeast.</a> Genetics. 164 (1), 81-94 (2003).</li>
<li>Saito, T. T., Colaiacovo, M. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Regulation+of+crossover+frequency+and+distribution+during+meiotic+recombination%5BTitle%5D)+AND+%22Cold+Spring+Harb+Symp+Quant+Biol%22%5BJournal%5D)">Regulation of crossover frequency and distribution during meiotic recombination.</a> Cold Spring Harb Symp Quant Biol. 82, 223-234 (2017).</li>
<li>Zalevsky, J., Macqueen, A. J., Duffy, J. B., Kemphues, K. J., Villeneuve, A. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Crossing+over+during+Caenorhabditis+elegans+meiosis+requires+a+conserved+mutS-based+pathway+that+is+partially+dispensable+in+budding+yeast%5BTitle%5D)+AND+%22Genetics%22%5BJournal%5D)">Crossing over during Caenorhabditis elegans meiosis requires a conserved mutS-based pathway that is partially dispensable in budding yeast.</a> Genetics. 153 (3), 1271-1283 (1999).</li>
</ol>

<table><tbody><tr><td>101-1000&무; l 피펫 팁</td><td>QSP</td><td>111-N-Q</td><td></td></tr><tr><td>0.5mol/I-EDTA 용액(pH 8.0)</td><td>나칼라이 테스크</td><td>14347-21</td><td></td></tr><tr><td>10mol/I-수산화나트륨 용액</td><td>나칼라이 테스크</td><td>94611-45</td><td></td></tr><tr><td>10X DreamTaq 그린 버퍼</td><td>써모 피셔 사이언티픽&nbsp;</td><td>EP0713</td><td></td></tr><tr><td>10&무; L, 긴 팁, 그랜듀엣</td><td>후카카세이, 왓슨</td><td>110-207C</td><td></td></tr><tr><td>200&무; L, 표준 팁, 눈금</td><td>후카카세이, 왓슨</td><td>110-705C</td><td></td></tr><tr><td>한천 분말</td><td>나칼라이 테스크</td><td>01028-14</td><td></td></tr><tr><td>아가로스</td><td>PH 일본</td><td>PH108</td><td></td></tr><tr><td>오토클레이브 TOMY 모델 ES-215 고압 증기 살균기</td><td>토미 세이코</td><td>ES-215</td><td></td></tr><tr><td>Bacto Peptone 단백질의 효소 분해</td><td>써모 피셔 사이언티픽&nbsp;</td><td>211677</td><td></td></tr><tr><td>붕산</td><td>나칼라이 테스크</td><td>05215-05</td><td></td></tr><tr><td>Caenorhabditis elegans 브리스톨 야생형&nbsp;</td><td>Caenorhabditis 유전학 센터</td><td>N2</td><td></td></tr><tr><td>Caenorhabditis elegans 하와이 야생형</td><td>Caenorhabditis 유전학 센터</td><td>CB4856</td><td></td></tr><tr><td>염화칼슘</td><td>나칼라이 테스크</td><td>06729-55</td><td></td></tr><tr><td>ccIs4251 [(pSAK2) myo-3p::GFP::LacZ::NLS + (pSAK4) myo-3p::미토콘드리아 GFP + dpy-20(+)] I</td><td>사이토 연구실</td><td>TTS24</td><td>원래 PD4251에서</td></tr><tr><td>콜레스테롤</td><td>나칼라이 테스크</td><td>08721-62</td><td></td></tr><tr><td>맞춤형 TaqMan SNP 유전형 분석</td><td>써모 피셔 사이언티픽&nbsp;</td><td>4332077</td><td></td></tr><tr><td>데옥시뉴클레오티드(dNTP) 용액 혼합물</td><td>뉴잉글랜드 바이오랩스</td><td>N04470</td><td></td></tr><tr><td>DigPrint Doc 태블릿 DP-T130z</td><td>바이오 도구</td><td>DP-T130z</td><td></td></tr><tr><td>인산수소이칼륨</td><td>나칼라이 테스크</td><td>28726-05</td><td></td></tr><tr><td>해부 현미경</td><td>니콘</td><td>SMZ-745 C-DS</td><td></td></tr><tr><td>Dream Taq DNA 중합효소</td><td>써모 피셔 사이언티픽&nbsp;</td><td>EP0713</td><td></td></tr><tr><td>에티듐 브로마이드 용액</td><td>나칼라이 테스크</td><td>14631-94</td><td></td></tr><tr><td>WBVar01973670용 포워드 프라이머</td><td>IDT</td><td>103988736</td><td>atgtctcacccaaggttgaa</td></tr><tr><td>젤라틴</td><td>나칼라이 테스크</td><td>166-31</td><td></td></tr><tr><td>Gilson PIPETMAN 클래식 피펫</td><td>써모 피셔 사이언티픽&nbsp;</td><td></td><td></td></tr><tr><td>이지팔 CA-630</td><td>시그마-알드리치</td><td>18896</td><td></td></tr><tr><td>황산마그네슘 칠수화물</td><td>나칼라이 테스크</td><td>21003-75</td><td></td></tr><tr><td>MicroAmp 광학 96웰 반응자 플레이트</td><td>써모 피셔 사이언티픽&nbsp;</td><td>N8010560</td><td></td></tr><tr><td>MicroAmp 광학 접착 필름</td><td>써모 피셔 사이언티픽&nbsp;</td><td>4311971</td><td></td></tr><tr><td>미니앰프&nbsp; 열 순환기</td><td>써모 피셔 사이언티픽&nbsp;</td><td>미니앰프</td><td></td></tr><tr><td>Mini-Sub Cell GT 수평 전기영동 시스템, 7 x 10 cm 트레이</td><td>바이오 래드 연구소</td><td>1704466</td><td></td></tr><tr><td>니치펫 EXII</td><td>니치료</td><td>00-NPX2-2</td><td></td></tr><tr><td>니치펫 EXII MULTI</td><td>니치료</td><td>00-NPM-12VP</td><td></td></tr><tr><td>피펫 메이트 NEO</td><td>니치료</td><td>오후 00시네오</td><td></td></tr><tr><td>염화칼륨</td><td>나칼라이 테스크</td><td>285-38</td><td></td></tr><tr><td>인산이수소칼륨</td><td>나칼라이 테스크</td><td>28720-65</td><td></td></tr><tr><td>프로테이나제 K</td><td>써모 피셔 사이언티픽&nbsp;</td><td>EO0491</td><td></td></tr><tr><td>QuantStudio 1 Real-Time PCR 시스템, 96-well, 0.2 mL</td><td>써모 피셔 사이언티픽&nbsp;</td><td>A40426</td><td></td></tr><tr><td>Quick-Load Purple 1kb Plus DNA 사다리</td><td>뉴잉글랜드 바이오랩스</td><td>N0550S</td><td></td></tr><tr><td>WBVar01973670용 리버스 프라이머</td><td>IDT</td><td>103988737</td><td>tggctactcctagtcactga</td></tr><tr><td>염화나트륨</td><td>나칼라이 테스크</td><td>31319-45</td><td></td></tr><tr><td>TaqPath ProAmp 마스터 믹스</td><td>써모 피셔 사이언티픽&nbsp;</td><td>A30866</td><td></td></tr><tr><td>TC 접시 35, 표준</td><td>사르슈테트</td><td>83.3900</td><td></td></tr><tr><td>트리스(하이드록시메틸) 아미노메탄</td><td>나칼라이 테스크</td><td>35406-75</td><td></td></tr><tr><td>트리즈마 베이스</td><td>시그마-알드리치</td><td>&nbsp; 티1503-1KG</td><td></td></tr><tr><td>트윈 20</td><td>요네야마 시약</td><td>03706</td><td></td></tr><tr><td>웜스터프 웜 픽</td><td>제네시 사이언티픽</td><td>59-AWP</td><td></td></tr><tr><td>웜스터프 웜 픽 팁(90/10% Pt/Ir, 30 게이지)</td><td>제네시 사이언티픽</td><td>59-30PI36</td><td></td></tr></tbody></table>

real-time pcr을 이용한 snp 유전형 분석에 의한 caenorhabditis elegans 감수분열의 교차 빈도 및 분포

Frequency and Distribution of Crossovers in Caenorhabditis elegans Meiosis by SNP Genotyping using Real-time PCR

우리는 SNP 유전형 분석 분석을 통해 예쁜꼬마선충 의 염색체 II에 있는 4개의 SNP 부위를 검출하여 염색체의 전체 길이, 왼팔, 중앙 영역 및 오른팔의 교차 형성을 정량화했습니다. SNP 검출은 제조업체의 지침에 따라 수행됩니다. 마스터 믹스에는 Taq DNA 중합효소, 열에 불안정한 우라실-N-글리코실라제(UNG), dNTP with dUTP 및 수동 참조 ROX 염료가 포함되어 있습니다. Taq DNA 중합효소는 95°C에서 활성화되어 저온에서 비특이적 증폭을 억제할 수 있습니다. UNG 및 dUTP는 이전에 증폭된 PCR 산물의 분해를 허용하여 캐리오버 오염 및 잠재적인 위양성을 방지합니다23.
SNP 부위를 포함하는 1kb의 게놈 DNA 염기서열을 기반으로 Thermo Fisher Scientific에서 SNP 특이적 프로브 및 PCR 프라이머 세트를 생성했습니다(표 1). Br...

Real-time PCR을 이용한 SNP 유전형 분석에 의한 Caenorhabditis elegans 감수분열의 교차 빈도 및 분포

Caenorhabditis elegans is an excellent model organism for studying meiosis. In addition to general advantages, such as a short reproductive cycle, many ...

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Research

연구

JoVE Journal

Genetics

유전학

이 비디오는 PCR 스크리닝을 통해 단일 선충에서 유전자 마커를 빠르게 스크리닝하는 기술을 설명합니다. 예시 프로토콜에서는 CRISPR 기반 게놈 편집을 스크리닝합니다.

Single Worm PCR: 게놈 DNA를 추출하고 증폭하는 방법

이 프로토콜은 자외선(UV) 조사를 사용하여 형질전환 염색체 외 배열을 Caenorhabditis elegans 게놈에 통합하기 위한 빠르고 낮은 재료 소모 절차를 설명합니다. 또한, 이 프로토콜은 염색체 외 어레이를 높은 비율로 전송하는 형질전환 라인에 특히 적합합니다.

높은 투과 속도를 가진 염색체 외 배열을 예쁜꼬마선충 게놈에 통합하기 위한 빠른 프로토콜

유전자 인코딩 히스톤 - miniSOG는 푸른 빛 의존적으로 게놈 전체의 유전 변이를 유도한다. 이 돌연변이 유발 방법은 빠르고 간단 독성 화학 물질의 자유, 앞으로 유전자 검사 및 유전자 통합에 적합합니다.

히스톤 - miniSOG에서 사용 Optogenetic 무작위 돌연변이 유발<em&gt; C. 엘레</em

이 메서드는 모든 2 중 부담에서 tetraploid 및 triploid 꼬마 선 충의 세대에 대 한 수 있습니다. 이다 긴장이이 메서드에 의해 생성 된 meiotic 의향에서 염색체 상호 작용을 공부 하는 데 사용 되었습니다 그리고이 메서드는 셀을 개발, 진화, 그리고 암 생물학에서 중요 한 기본적인 질문을 검토 하는 데 유용.

꼬마 선 충 에 Ploidy의 조작

여기, 우리는 CRISPR-Cas9 ribonucleoproteins 및 homology 종속 복구 서식 파일을 사용 하 여 C. 선 충 의 게놈을 엔지니어링 하는 방법 제시.

빠른 고 손쉬운 파이프라인 C. 선 충 을 사용 하 여 CRISPR/Cas9 Ribonucleoproteins에서 게놈 포인트 돌연변이 생성에 대 한

여기, 우리 남부 럽 그리고/또한 PCR를 사용 하 여 마우스 배아 줄기 세포에서 발생 하는 동종 재결합 이벤트를 식별 하는 데 자세한 프로토콜 제시. 이 메서드는 nonmuscle myosin II 유전자 대체 마우스 모델 기술을 사용 하 여 전통적인 배아 줄기 세포 기반 동종 재결합 중재 대상의 세대에 의해 exemplified입니다.

마우스 배아 줄기 세포 사용 하 여 남부 럽 연쇄 반응에서에서 동종 재결합 이벤트의 식별

이 문서에서는 단일 또는 벌크 C. elegans 샘플에서 유전자 발현 수준의 빠르고 신뢰할 수 있는 측정을 위한 고처리량 프로토콜이 설명되어 있다. 이 프로토콜은 RNA 절연을 필요로하지 않으며 샘플에서 직접 cDNA를 생성합니다. 고처리량 멀티플렉션 나노유체 실시간 qPCR 플랫폼과 함께 사용할 수 있습니다.

단일 및 벌크 C.의 고처리량 정량적 RT-PCR. 나노 유체 기술을 사용하여 샘플

이 프로토콜은 자아 Caenorhabditis 선충류의 대규모 생태 조사를 수행하는 데 사용할 수 있습니다. 이 방법의 주요 장점은 자연에서 수집 된 선충류와 관련된 생태 및 분자 데이터의 효율적인 조직 및 분석입니다.

Selfing caenorhabditis 선충류의 생태 조사를 수행하기위한 고도로 확장 가능한 접근법

RNA 시퀀싱을 위해 개별 선충류 조직을 분리하기 위해 레이저 미세 해부를 사용하는 프로토콜이 기술되어 있습니다. 이 프로토콜은 종 특이적 유전자 툴킷을 필요로하지 않으므로 단일 조직 샘플 수준에서 다른 종간에 유전자 발현 프로필을 비교할 수 있습니다.

종에 구애받지 않는 단일 조직 응용 분야를 위한 레이저 미세 해부

이것은 항체 염색을 통해 면역형광을 위한 생식계열 샘플을 생성하거나 DNA를 시각화하기 위한 간단한 DAPI 염색을 위해 C. elegans 생식선 해부 후 동결 균열에 일반적으로 사용되는 방법입니다. 이 프로토콜은 연구실과 과정 기반 학부 연구 경험의 학부생에게 성공적이었습니다.

C. 엘레 간스 면역형광 및 DAPI 염색을 위한 생식선 해부 및 동결 균열

여기서는 30 μL 벌레 펠릿만을 사용하여 L4 단계 Caenorhabditis elegans 전체충에 구현할 수 있는 빠르고 간단한 ATAC-seq 프로토콜을 제시합니다.

Caenorhabditis Elegans L4 유충 전체에서의 염색질 접근성 프로파일링

학습하세요 Caenorhabditis elegans 감수분열에서 교차 빈도 및 분포를 측정하는 실시간 PCR 기반 SNP 유전형 분석 방법을. 이 단순화된 qPCR 접근법은 유전자형 분석의 정확성을 높여 유전학 연구의 신뢰성을 향상시킵니다.

Real-time PCR을 이용한 SNP 유전형 분석에 의한 Caenorhabditis elegans 감수분열의 교차 빈도 및 분포

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