Name: 고처리량 형식을 이용한 미생물 2차 대사산물에 대한 잎 반응 평가 (동영상) | JoVE Journal
Uploaded: 2025-12-05T13:00:00.000+00:00
Duration: 5 min 51 s
Description: 배우세요 고처리량 형식을 이용한 미생물 2차 대사산물에 대한 잎 반응 평가 방법을. 이 프로토콜은 이온 누출, 퍼옥시다제 활성, 칼로스 생성을 동시에 측정하여 식물-미생물 상호작용 연구의 효율성을 높입니다.

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<ol><li>Yu, X., Feng, B., He, P., Shan, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((From+chaos+to+harmony%3A+responses+and+signaling+upon+microbial+pattern+recognition%5BTitle%5D)+AND+%22Annu+Rev+Phytopathol%22%5BJournal%5D)">From chaos to harmony: responses and signaling upon microbial pattern recognition.</a> Annu Rev Phytopathol. 55 (1), 109-137 (2017).</li>
<li>Brauer, E. K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+cyclic+lipopeptide+from+Fusarium+graminearum+targets+plant+membranes+to+promote+virulence%5BTitle%5D)+AND+%22Cell+Rep%22%5BJournal%5D)">A cyclic lipopeptide from Fusarium graminearum targets plant membranes to promote virulence.</a> Cell Rep. 43 (7), 114384(2024).</li>
<li>Thoms, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Innate+immunity+can+distinguish+beneficial+from+pathogenic+rhizosphere+microbiota%5BTitle%5D)+AND+%22bioRxiv%22%5BJournal%5D)">Innate immunity can distinguish beneficial from pathogenic rhizosphere microbiota.</a> bioRxiv. , (2023).</li>
<li>Nishiuchi, T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Fusarium+phytotoxin+trichothecenes+have+an+elicitor-like+activity+in+Arabidopsis+thaliana%2C+but+the+activity+differed+significantly+among+their+molecular+species%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Plant+Microbe+Interact%22%5BJournal%5D)">Fusarium phytotoxin trichothecenes have an elicitor-like activity in Arabidopsis thaliana, but the activity differed significantly among their molecular species.</a> Mol Plant Microbe Interact. 19 (5), 512-520 (2006).</li>
<li>Schellenberger, R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Apoplastic+invasion+patterns+triggering+plant+immunity%3A+plasma+membrane+sensing+at+the+frontline%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Plant+Pathol%22%5BJournal%5D)">Apoplastic invasion patterns triggering plant immunity: plasma membrane sensing at the frontline.</a> Mol Plant Pathol. 20 (11), 1602-1616 (2019).</li>
<li>Henry, G., Deleu, M., Jourdan, E., Thonart, P., Ongena, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+bacterial+lipopeptide+surfactin+targets+the+lipid+fraction+of+the+plant+plasma+membrane+to+trigger+immune-related+defence+responses%5BTitle%5D)+AND+%22Cell+Microbiol%22%5BJournal%5D)">The bacterial lipopeptide surfactin targets the lipid fraction of the plant plasma membrane to trigger immune-related defence responses.</a> Cell Microbiol. 13 (11), 1824-1837 (2011).</li>
<li>Pršić, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Mechanosensing+and+sphingolipid-docking+mediate+lipopeptide-induced+immunity+in+Arabidopsis%5BTitle%5D)+AND+%22bioRxiv%22%5BJournal%5D)">Mechanosensing and sphingolipid-docking mediate lipopeptide-induced immunity in Arabidopsis.</a> bioRxiv. , (2023).</li>
<li>Crouzet, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Biosurfactants+in+plant+protection+against+diseases%3A+rhamnolipids+and+lipopeptides+case+study%5BTitle%5D)+AND+%22Front+Bioeng+Biotechnol%22%5BJournal%5D)">Biosurfactants in plant protection against diseases: rhamnolipids and lipopeptides case study.</a> Front Bioeng Biotechnol. 8, 1014(2020).</li>
<li>Khan, P., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Luminol-based+chemiluminescent+signals%3A+clinical+and+non-clinical+application+and+future+uses%5BTitle%5D)+AND+%22Appl+Biochem+Biotechnol%22%5BJournal%5D)">Luminol-based chemiluminescent signals: clinical and non-clinical application and future uses.</a> Appl Biochem Biotechnol. 173, 333-355 (2014).</li>
<li>Schenk, S. T., Schikora, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Staining+of+callose+depositions+in+root+and+leaf+tissues%5BTitle%5D)+AND+%22Bio-protoc%22%5BJournal%5D)">Staining of callose depositions in root and leaf tissues.</a> Bio-protoc. 5 (6), e1429(2015).</li>
<li>Mott, G. A., Desveaux, D., Guttman, D. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+high-sensitivity%2C+microtiter-based+plate+assay+for+plant+pattern-triggered+immunity%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Plant+Microbe+Interact%22%5BJournal%5D)">A high-sensitivity, microtiter-based plate assay for plant pattern-triggered immunity.</a> Mol Plant Microbe Interact. 31 (5), 499-504 (2018).</li>
<li>Hatsugai, N., Katagiri, F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Quantification+of+plant+cell+death+by+electrolyte+leakage+assay%5BTitle%5D)+AND+%22Bio-protoc%22%5BJournal%5D)">Quantification of plant cell death by electrolyte leakage assay.</a> Bio-protoc. 8 (5), e2758(2018).</li>
<li>Zhang, X. H., Yu, X. Z., Yue, D. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Phytotoxicity+of+dimethyl+sulfoxide+%28DMSO%29+to+rice+seedlings%5BTitle%5D)+AND+%22Int+J+Environ+Sci+Technol%22%5BJournal%5D)">Phytotoxicity of dimethyl sulfoxide (DMSO) to rice seedlings.</a> Int J Environ Sci Technol. 13, 607-614 (2016).</li>
<li>Mannan, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((DMSO+triggers+the+generation+of+ROS+leading+to+an+increase+in+artemisinin+and+dihydroartemisinic+acid+in+Artemisia+annua+shoot+cultures%5BTitle%5D)+AND+%22Plant+Cell+Rep%22%5BJournal%5D)">DMSO triggers the generation of ROS leading to an increase in artemisinin and dihydroartemisinic acid in Artemisia annua shoot cultures.</a> Plant Cell Rep. 29, 143-152 (2010).</li>
<li>Felix, G., Duran, J. D., Volko, S., Boller, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Plants+have+a+sensitive+perception+system+for+the+most+conserved+domain+of+bacterial+flagellin%5BTitle%5D)+AND+%22Plant+J%22%5BJournal%5D)">Plants have a sensitive perception system for the most conserved domain of bacterial flagellin.</a> Plant J. 18 (3), 265-276 (1999).</li>
<li>Jourdan, E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Insights+into+the+defense-related+events+occurring+in+plant+cells+following+perception+of+surfactin-type+lipopeptide+from+Bacillus+subtilis%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Plant+Microbe+Interact%22%5BJournal%5D)">Insights into the defense-related events occurring in plant cells following perception of surfactin-type lipopeptide from Bacillus subtilis.</a> Mol Plant Microbe Interact. 22 (4), 456-468 (2009).</li>
<li>Raaijmakers, J. M., De Bruijn, I., Nybroe, O., Ongena, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Natural+functions+of+lipopeptides+from+Bacillus+and+Pseudomonas%3A+more+than+surfactants+and+antibiotics%5BTitle%5D)+AND+%22FEMS+Microbiol+Rev%22%5BJournal%5D)">Natural functions of lipopeptides from Bacillus and Pseudomonas: more than surfactants and antibiotics.</a> FEMS Microbiol Rev. 34 (6), 1037-1062 (2010).</li>
<li>vábová, L., Lebeda, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((In+vitro+selection+for+improved+plant+resistance+to+toxin-producing+pathogens%5BTitle%5D)+AND+%22J+Phytopathol%22%5BJournal%5D)">In vitro selection for improved plant resistance to toxin-producing pathogens.</a> J Phytopathol. 153 (1), 52-64 (2005).</li>
<li>Mousa, W. K., Raizada, M. N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+diversity+of+antimicrobial+secondary+metabolites+produced+by+fungal+endophytes%3A+an+interdisciplinary+perspective%5BTitle%5D)+AND+%22Front+Microbiol%22%5BJournal%5D)">The diversity of antimicrobial secondary metabolites produced by fungal endophytes: an interdisciplinary perspective.</a> Front Microbiol. 4, 65(2013).</li>
<li>Bektas, Y., Eulgem, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Synthetic+plant+defense+elicitors%5BTitle%5D)+AND+%22Front+Plant+Sci%22%5BJournal%5D)">Synthetic plant defense elicitors.</a> Front Plant Sci. 5, 804(2015).</li>
<li>Saeed, B., Trujillo, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Analysis+of+immunity-related+oxidative+bursts+by+a+luminol-based+assay%5BTitle%5D)+AND+%22Environ+Responses+Plants%3A+Methods+Protoc%22%5BJournal%5D)">Analysis of immunity-related oxidative bursts by a luminol-based assay.</a> Environ Responses Plants: Methods Protoc. , 339-346 (2022).</li>
<li>Brauer, E. K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Transcriptional+and+hormonal+profiling+of+Fusarium+graminearum-infected+wheat+reveals+an+association+between+auxin+and+susceptibility%5BTitle%5D)+AND+%22Physiol+Mol+Plant+Pathol%22%5BJournal%5D)">Transcriptional and hormonal profiling of Fusarium graminearum-infected wheat reveals an association between auxin and susceptibility.</a> Physiol Mol Plant Pathol. 107, 33-39 (2019).</li>
<li>Taylor, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+wetting+of+leaf+surfaces%5BTitle%5D)+AND+%22Curr+Opin+Colloid+Interface+Sci%22%5BJournal%5D)">The wetting of leaf surfaces.</a> Curr Opin Colloid Interface Sci. 16 (4), 326-334 (2011).</li>
<li>Mika, A., Boenisch, M. J., Hopff, D., Lüthje, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Membrane-bound+guaiacol+peroxidases+from+maize+%28Zea+mays+L.%29+roots+are+regulated+by+methyl+jasmonate%2C+salicylic+acid%2C+and+pathogen+elicitors%5BTitle%5D)+AND+%22J+Exp+Bot%22%5BJournal%5D)">Membrane-bound guaiacol peroxidases from maize (Zea mays L.) roots are regulated by methyl jasmonate, salicylic acid, and pathogen elicitors.</a> J Exp Bot. 61 (3), 831-841 (2010).</li>
<li>Brauer, E. K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Transcriptional+profiling+and+genetic+mapping+of+barley+responses+to+bacterial+flagellin%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Plant+Microbe+Interact%22%5BJournal%5D)">Transcriptional profiling and genetic mapping of barley responses to bacterial flagellin.</a> Mol Plant Microbe Interact. 38 (2), 344-352 (2025).</li>
<li>Takáč, T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((TALEN-based+HvMPK3+knock-out+attenuates+proteome+and+root+hair+phenotypic+responses+to+flg22+in+barley%5BTitle%5D)+AND+%22Front+Plant+Sci%22%5BJournal%5D)">TALEN-based HvMPK3 knock-out attenuates proteome and root hair phenotypic responses to flg22 in barley.</a> Front Plant Sci. 12, 666229(2021).</li>
<li>Kim, M. G., Macoy, D. M., Lee, J. Y., Cha, J. Y., Kim, W. Y. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Interactions+between+plant+immunity%2C+temperature%2C+light%2C+and+circadian+rhythm%5BTitle%5D)+AND+%22J+Plant+Biochem+Physiol%22%5BJournal%5D)">Interactions between plant immunity, temperature, light, and circadian rhythm.</a> J Plant Biochem Physiol. 9, 260(2021).</li>
<li>Bahadoor, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Gramillin+A+and+B%3A+cyclic+lipopeptides+identified+as+the+nonribosomal+biosynthetic+products+of+Fusarium+graminearum%5BTitle%5D)+AND+%22J+Am+Chem+Soc%22%5BJournal%5D)">Gramillin A and B: cyclic lipopeptides identified as the nonribosomal biosynthetic products of Fusarium graminearum.</a> J Am Chem Soc. 140 (48), 16783-16791 (2018).</li>
</ol>

<table><tbody><tr><td>5-아미노살리실산</td><td>밀리포어 시그마와 nbsp;</td><td>A79809</td><td></td></tr><tr><td>바나트 진공 펌프</td><td>장인 기술 그룹</td><td>400-3910</td><td></td></tr><tr><td>COND-905 미세 전도도 탐침</td><td>라자르 연구소 주식회사</td><td></td><td></td></tr><tr><td>FLG22 펩타이드</td><td>아나스펙</td><td>AS-62633</td><td></td></tr><tr><td>인피니트 200PRO F</td><td>테칸 그룹 주식회사</td><td>30190086</td><td></td></tr><tr><td>서팩틴</td><td>시그마-올드리치</td><td>S3523</td><td></td></tr><tr><td>T-2 독소</td><td>케이맨 케미컬 컴퍼니 주식회사</td><td>20433</td><td></td></tr></tbody></table>

고처리량 형식을 이용한 미생물 2차 대사산물에 대한 잎 반응 평가

Evaluating Leaf Responses to Microbial Secondary Metabolites Using A High-Throughput Format

Microbes secrete structurally diverse secondary metabolites during plant infection, some of which are detected by plant cells, which trigger stress ...

evaluating-leaf-responses-to-microbial-secondary-metabolites-using

Research

연구

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Biology

생물학

우리는 사는 박테리아에 stomatal 응답을 액세스하는 간단하고 재현성 프로토콜을 개발했습니다. 이 방법은 표피 껍질의 사용에 비해 잎사귀의 입힐 수있는 총알과 조작​​은 이전에 보고된 최소화합니다.

전체 리프 이미징을 사용하여 박테리아 세포를 라이브 Stomatal 응답을 평가

출처: 알리, I. 외. 세골부리아티 스 엘레간 스 건강에 영향을 미치는 미생물 분리물의 고처리량 스크리닝. J. Vis. 경험 (2022)이 영상은 장내 세균이 Caenorhabditis elegans 에서 스트레스 회복력에 미치는 영향을 평가하는 고처리량 형광 검사를 시연합니다. 파열된 장 과립에서 나오는 청색 형광을 추적함으로써, 검사 박테리아에 노출된 벌레의 초기 사망 신호를 밝혀냅니다.

미생물-벌레 상호작용을 연구하기 위한 고처리량 형광 분석법

식물 세포벽 구조 및 화학적 특성을 평가하여 바이오 연료 및 바이오 재료에 이상적인 공급 원료를 식별합니다. 표준 방법은 대규모 데이터 세트에 적용할 때 제한이 있습니다. 이러한 고처리량 전처리, 효소 당화 및 열분해 분자 빔 질량 분석 방법은 많은 수의 바이오매스 샘플을 비교하여 실험 시간과 비용을 줄입니다.

총 리그닌, 리그닌 단량체, 및 효소 설탕 자료 : 리그 노 셀룰로오스 바이오 매스의 반항의 변화의 높은 처리량 검열

이 원고는 쌍떡잎 잡초에서 절제된 잎으로 제초제 대사율을 효과적으로 정량화하여 변동성을 줄이고 전체 식물 분석에서 일반적으로 관찰되는 제초제 흡수 또는 전좌의 가능한 교란 효과를 제거하는 방법을 설명합니다.

절제 잎 분석과 쌍자엽 잡초의 제초제 대사의 요금을 측정

여기서 우리는 액체 크로마토 그래피 및 질량 분석을 통해 황색 포도상 구균과 이후 분석에서 대사 물질의 추출을위한 프로토콜을 기술한다.

의 대사 산물 분석을위한 탠덤 액체 크로마토 그래피 - 질량 분석 기반 접근<em&gt; 포도상 구균</em

간단 하 고, 다재 다능 한, 고 저가 생체 외에서 수경 시스템 성공적으로, 메 마른 조건 하에서 대규모 실험을 수 있도록 최적화 되었다. 이 시스템 솔루션 및 분자, 생화학, 생리 적 연구에 대 한 뿌리에 의해 그들의 효율적인 흡수 화학 물질의 응용 프로그램을 지원합니다.

유연한 저비용 수경 시스템 살 균 조건에서 작은 분자에 식물 응답을 평가 하기 위한

잎 스프레이 질량 분석 샘플 준비를 최소화 하 고 착 색 인쇄기, 식물 조직에서 작은 분자의 급속 한 탐지에 대 한 수를 제거 하는 직접적인 화학 분석 기술 이다.

잎 스프레이 질량 분석: 식물 조직에서 대사를 직접 평가 하는 급속 한 대기 이온화 기술

이 프로토콜 자연 유기 물질과 다른 생태계에서 미생물 단백질의 완전 한 쌍 특성에 culminating 보완 분석 및 omics 기술에 대 한 단일 처리량을 설명 합니다. 이 이렇게 강력한 비교 대사 경로 및 변환을 설명 하는 온실 가스 생산 및 환경 변화에 대 한 응답을 예측에 대 한 중요 한 식별 수 있습니다.

복잡 한 자연 유기 물질 혼합물을 특성화에 대 한 단일 처리량 보완 고해상도 분석 기법

제시 된 방법은 감자의 분리 된 잎에 만두카 sexta 애벌레의 응용 프로그램을 통해 자연 초식 동물 손상된 식물 조직을 만듭니다. 식물 조직은 곤충 허브에 대한 초기 반응에 관여하는 6개의 전사 인자 호몰로그의 발현을 위해 분석된다.

분리 된 잎 어설아는 곤충 만두카 sexta를 츄잉에 의해 감염 하는 동안 감자에 유전자 발현 연구를 단순화 하기 위해

이 프로토콜에 제시된 공동 문화 상호 작용 분석은 저렴하고 높은 처리량이며 간단합니다. 이 계산은 공동 배양에 있는 미생물 상호 작용을 관찰하고, 상호 작용 패턴을 확인하고, 인간과 환경 병원체에 대하여 관심있는 미생물 긴장의 억제 잠재력을 특성화하기 위하여 이용될 수 있습니다.

미생물 상호 작용의 조사를 위한 높은 처리량 공동 문화 애세서

질량 분광법 유도 게놈 마이닝 프로토콜이 확립되고 여기에 설명되어 있습니다. 그것은 게놈 순서 정보 및 LC-MS/MS 분석을 기반으로 하고 복잡한 미생물 및 식물 추출물에서 분자의 식별을 용이하게 하는 것을 목표로 합니다.

새로운 천연 제품을 발견하는 도구로 질량 분광법 유도 게놈 채굴

배우세요 고처리량 형식을 이용한 미생물 2차 대사산물에 대한 잎 반응 평가 방법을. 이 프로토콜은 이온 누출, 퍼옥시다제 활성, 칼로스 생성을 동시에 측정하여 식물-미생물 상호작용 연구의 효율성을 높입니다.

고처리량 형식을 이용한 미생물 2차 대사산물에 대한 잎 반응 평가

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