Name: 디지털 액상 PCR(ddPCR)을 이용한 토양 내 미생물 바이오매스 측정 (동영상) | JoVE Journal
Uploaded: 2026-04-24T14:20:00.000+00:00
Duration: 7 min 46 s
Description: 배우세요 ddPCR을 이용한 토양 내 세균과 균류의 절대 정량 방법을. 16S 및 18S rRNA 유전자를 표적으로 하여 미생물 바이오매스 탄소를 정확히 측정하고 토양 건강 평가를 위한 생태학적 지표를 분석합니다.

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<ol><li>Jobbágy, E. G., Jackson, R. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+vertical+distribution+of+soil+organic+carbon+and+its+relation+to+climate+and+vegetation%5BTitle%5D)+AND+%22Ecol+Appl%22%5BJournal%5D)">The vertical distribution of soil organic carbon and its relation to climate and vegetation.</a> Ecol Appl. 10 (2), 423-436 (2000).</li>
<li>Sanderman, J., Hengl, T., Fiske, G. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Soil+carbon+debt+of+12%2C000+years+of+human+land+use%5BTitle%5D)+AND+%22Proc+Natl+Acad+Sci+U+S+A%22%5BJournal%5D)">Soil carbon debt of 12,000 years of human land use.</a> Proc Natl Acad Sci U S A. 114 (36), 9575-9580 (2017).</li>
<li>He, Y., Li, J., Siemann, E., Li, B., Xu, Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Plant+invasion+increases+soil+microbial+biomass+carbon%3A+meta-analysis+and+empirical+tests%5BTitle%5D)+AND+%22Glob+Change+Biol%22%5BJournal%5D)">Plant invasion increases soil microbial biomass carbon: meta-analysis and empirical tests.</a> Glob Change Biol. 31 (3), e70109(2025).</li>
<li>de Menezes, A. B., Richardson, A. E., Thrall, P. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Linking+fungal-bacterial+co-occurrences+to+soil+ecosystem+function%5BTitle%5D)+AND+%22Curr+Opin+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Linking fungal-bacterial co-occurrences to soil ecosystem function.</a> Curr Opin Microbiol. 37, 135-141 (2017).</li>
<li>Wang, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((ddPCR+surpasses+classical+qPCR+technology+in+quantitating+bacteria+and+fungi+in+the+environment%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Ecol+Resour%22%5BJournal%5D)">ddPCR surpasses classical qPCR technology in quantitating bacteria and fungi in the environment.</a> Mol Ecol Resour. 22 (7), 2587-2598 (2022).</li>
<li>Djemiel, C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Biogeographical+patterns+of+the+soil+fungal%3Abacterial+ratio+across+France%5BTitle%5D)+AND+%22mSphere%22%5BJournal%5D)">Biogeographical patterns of the soil fungal:bacterial ratio across France.</a> mSphere. 8 (5), e0036523(2023).</li>
<li>Bailey, V. L., Smith, J. L., Bolton, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Fungal-to-bacterial+ratios+in+soils+investigated+for+enhanced+C+sequestration%5BTitle%5D)+AND+%22Soil+Biol+Biochem%22%5BJournal%5D)">Fungal-to-bacterial ratios in soils investigated for enhanced C sequestration.</a> Soil Biol Biochem. 34 (7), 997-1007 (2002).</li>
<li>Vance, E. D., Brookes, P. C., Jenkinson, D. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Microbial+biomass+measurements+in+forest+soils%3A+the+use+of+the+chloroform+fumigation-incubation+method+in+strongly+acid+soils%5BTitle%5D)+AND+%22Soil+Biol+Biochem%22%5BJournal%5D)">Microbial biomass measurements in forest soils: the use of the chloroform fumigation-incubation method in strongly acid soils.</a> Soil Biol Biochem. 19 (6), 697-702 (1987).</li>
<li>Frostegård, Å, Bååth, E., Tunlio, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Shifts+in+the+structure+of+soil+microbial+communities+in+limed+forests+as+revealed+by+phospholipid+fatty+acid+analysis%5BTitle%5D)+AND+%22Soil+Biol+Biochem%22%5BJournal%5D)">Shifts in the structure of soil microbial communities in limed forests as revealed by phospholipid fatty acid analysis.</a> Soil Biol Biochem. 25 (6), 723-730 (1993).</li>
<li>Cao, Z., Li, D., Han, X. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+fungal+to+bacterial+ratio+in+soil+food+webs%2C+and+its+measurement%5BTitle%5D)+AND+%22Acta+Ecol+Sin%22%5BJournal%5D)">The fungal to bacterial ratio in soil food webs, and its measurement.</a> Acta Ecol Sin. 31 (20), 6050-6058 (2011).</li>
<li>Frossard, A., Hammes, F., Gessner, M. O. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Flow+cytometric+assessment+of+bacterial+abundance+in+soils%2C+sediments+and+sludge%5BTitle%5D)+AND+%22Front+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Flow cytometric assessment of bacterial abundance in soils, sediments and sludge.</a> Front Microbiol. 7, 903(2016).</li>
<li>Joergensen, R. G., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+hitchhiker%E2%80%99s+guide%3A+Estimates+of+microbial+biomass+and+microbial+gene+abundance+in+soil%5BTitle%5D)+AND+%22Biol+Fertil+Soils%22%5BJournal%5D)">A hitchhiker’s guide: Estimates of microbial biomass and microbial gene abundance in soil.</a> Biol Fertil Soils. 60 (4), 457-470 (2024).</li>
<li>Fierer, N., Wood, S. A., Bueno de Mesquita, C. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((How+microbes+can%2C+and+cannot%2C+be+used+to+assess+soil+health%5BTitle%5D)+AND+%22Soil+Biol+Biochem%22%5BJournal%5D)">How microbes can, and cannot, be used to assess soil health.</a> Soil Biol Biochem. 153, 108111(2021).</li>
<li>Laine, M. B., Taipale, S. J., Tiirola, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Comparison+of+methods+for+assessing+fungi-to-bacteria+ratio+of+soil%5BTitle%5D)+AND+%22Biol+Fertil+Soils%22%5BJournal%5D)">Comparison of methods for assessing fungi-to-bacteria ratio of soil.</a> Biol Fertil Soils. 61 (5), 941-954 (2025).</li>
<li>De Filippis, F., Laiola, M., Blaiotta, G., Ercolini, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Different+amplicon+targets+for+sequencing-based+studies+of+fungal+diversity%5BTitle%5D)+AND+%22Appl+Environ+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Different amplicon targets for sequencing-based studies of fungal diversity.</a> Appl Environ Microbiol. 83 (17), e00905-e00917 (2017).</li>
<li>Liu, C. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((FungiQuant%3A+A+broad-coverage+fungal+quantitative+real-time+PCR+assay%5BTitle%5D)+AND+%22BMC+Microbiol%22%5BJournal%5D)">FungiQuant: A broad-coverage fungal quantitative real-time PCR assay.</a> BMC Microbiol. 12, 255(2012).</li>
<li>Lofgren, L. A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Genome-based+estimates+of+fungal+rDNA+copy+number+variation+across+phylogenetic+scales+and+ecological+lifestyles%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Ecol%22%5BJournal%5D)">Genome-based estimates of fungal rDNA copy number variation across phylogenetic scales and ecological lifestyles.</a> Mol Ecol. 28 (4), 721-730 (2019).</li>
<li>Angly, F. E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((W.+CopyRighter%3A+A+rapid+tool+for+improving+the+accuracy+of+microbial+community+profiles+through+lineage-specific+gene+copy+number+correction%5BTitle%5D)+AND+%22Microbiome%22%5BJournal%5D)">W. CopyRighter: A rapid tool for improving the accuracy of microbial community profiles through lineage-specific gene copy number correction.</a> Microbiome. 2 (1), 11(2014).</li>
<li>Kembel, S. W., Wu, M., Eisen, J. A., Green, J. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Incorporating+16S+gene+copy+number+information+improves+estimates+of+microbial+diversity+and+abundance%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+Comput+Biol%22%5BJournal%5D)">Incorporating 16S gene copy number information improves estimates of microbial diversity and abundance.</a> PLoS Comput Biol. 8 (10), e1002743(2012).</li>
<li>Pan, P., Gu, Y., Sun, D. L., Wu, Q. L., Zhou, N. Y. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Microbial+diversity+biased+estimation+caused+by+intragenomic+heterogeneity+and+interspecific+conservation+of+16S+rRNA+genes%5BTitle%5D)+AND+%22Appl+Environ+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Microbial diversity biased estimation caused by intragenomic heterogeneity and interspecific conservation of 16S rRNA genes.</a> Appl Environ Microbiol. 89 (5), e0210822(2023).</li>
<li>Chacón-Vargas, K., Torres, J., Giles-Gómez, M., Escalante, A., Gibbons, J. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Genomic+profiling+of+bacterial+and+fungal+communities+and+their+predictive+functionality+during+pulque+fermentation+by+whole-genome+shotgun+sequencing%5BTitle%5D)+AND+%22Sci+Rep%22%5BJournal%5D)">Genomic profiling of bacterial and fungal communities and their predictive functionality during pulque fermentation by whole-genome shotgun sequencing.</a> Sci Rep. 10 (1), 15115(2020).</li>
<li>Bahram, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Metagenomic+assessment+of+the+global+diversity+and+distribution+of+bacteria+and+fungi%5BTitle%5D)+AND+%22Environ+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Metagenomic assessment of the global diversity and distribution of bacteria and fungi.</a> Environ Microbiol. 23 (1), 316-326 (2021).</li>
<li>Smith, C. J., Osborn, A. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Advantages+and+limitations+of+quantitative+PCR+%28Q-PCR%29-based+approaches+in+microbial+ecology%3A+Application+of+Q-PCR+in+microbial+ecology%5BTitle%5D)+AND+%22FEMS+Microbiol+Ecol%22%5BJournal%5D)">Advantages and limitations of quantitative PCR (Q-PCR)-based approaches in microbial ecology: Application of Q-PCR in microbial ecology.</a> FEMS Microbiol Ecol. 67 (1), 6-20 (2009).</li>
<li>Hindson, B. J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((High-throughput+droplet+digital+PCR+system+for+absolute+quantitation+of+DNA+copy+number%5BTitle%5D)+AND+%22Anal+Chem%22%5BJournal%5D)">High-throughput droplet digital PCR system for absolute quantitation of DNA copy number.</a> Anal Chem. 83 (22), 8604-8610 (2011).</li>
<li>Le Geay, M., Mayers, K., Küttim, M., Lauga, B., Jassey, V. E. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Development+of+a+digital+droplet+PCR+approach+for+the+quantification+of+soil+micro-organisms+involved+in+atmospheric+CO2+fixation%5BTitle%5D)+AND+%22Environ+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Development of a digital droplet PCR approach for the quantification of soil micro-organisms involved in atmospheric CO2 fixation.</a> Environ Microbiol. 26 (6), e16666(2024).</li>
<li>Hansen, P. M., Semenova-Nelsen, T. A., Platt, W. J., Sikes, B. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Recurrent+fires+do+not+affect+the+abundance+of+soil+fungi+in+a+frequently+burned+pine+savanna%5BTitle%5D)+AND+%22Fungal+Ecol%22%5BJournal%5D)">Recurrent fires do not affect the abundance of soil fungi in a frequently burned pine savanna.</a> Fungal Ecol. 42, 100852(2019).</li>
<li>Ovreås, L., Forney, L., Daae, F. L., Torsvik, V. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Distribution+of+bacterioplankton+in+meromictic+Lake+Saelenvannet%2C+as+determined+by+denaturing+gradient+gel+electrophoresis+of+PCR-amplified+gene+fragments+coding+for+16S+rRNA%5BTitle%5D)+AND+%22Appl+Environ+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Distribution of bacterioplankton in meromictic Lake Saelenvannet, as determined by denaturing gradient gel electrophoresis of PCR-amplified gene fragments coding for 16S rRNA.</a> Appl Environ Microbiol. 63 (9), 3367-3373 (1997).</li>
<li>Whitman, W. B., Coleman, D. C., Wiebe, W. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Prokaryotes%3A+The+unseen+majority%5BTitle%5D)+AND+%22Proc+Natl+Acad+Sci+U+S+A%22%5BJournal%5D)">Prokaryotes: The unseen majority.</a> Proc Natl Acad Sci U S A. 95 (12), 6578-6583 (1998).</li>
<li>Cheng, J. Y. W., Chan, C. K., Lee, C. T., Lau, A. P. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Carbon+content+of+common+airborne+fungal+species+and+fungal+contribution+to+aerosol+organic+carbon+in+a+subtropical+city%5BTitle%5D)+AND+%22Atmos+Environ%22%5BJournal%5D)">Carbon content of common airborne fungal species and fungal contribution to aerosol organic carbon in a subtropical city.</a> Atmos Environ. 43 (17), 2781-2787 (2009).</li>
<li>Wood, D. E., Lu, J., Langmead, B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Improved+metagenomic+analysis+with+Kraken+2%5BTitle%5D)+AND+%22Genome+Biol%22%5BJournal%5D)">Improved metagenomic analysis with Kraken 2.</a> Genome Biol. 20 (1), 257(2019).</li>
<li>Rousk, J., Brookes, P. C., Bååth, E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Contrasting+soil+pH+effects+on+fungal+and+bacterial+growth+suggest+functional+redundancy+in+carbon+mineralization%5BTitle%5D)+AND+%22Appl+Environ+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Contrasting soil pH effects on fungal and bacterial growth suggest functional redundancy in carbon mineralization.</a> Appl Environ Microbiol. 75 (6), 1589-1596 (2009).</li>
<li>Xie, Z., Canalda-Baltrons, A., d’Enfert, C., Manichanh, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Shotgun+metagenomics+reveals+interkingdom+association+between+intestinal+bacteria+and+fungi+involving+competition+for+nutrients%5BTitle%5D)+AND+%22Microbiome%22%5BJournal%5D)">Shotgun metagenomics reveals interkingdom association between intestinal bacteria and fungi involving competition for nutrients.</a> Microbiome. 11 (1), 275(2023).</li>
<li>Větrovský, T., Baldrian, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+variability+of+the+16S+rRNA+gene+in+bacterial+genomes+and+its+consequences+for+bacterial+community+analyses%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+One%22%5BJournal%5D)">The variability of the 16S rRNA gene in bacterial genomes and its consequences for bacterial community analyses.</a> PLoS One. 8 (2), e57923(2013).</li>
<li>Doyle, B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Absolute+quantification+of+prokaryotes+in+the+microbiome+by+16S+rRNA+qPCR+or+ddPCR%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Protoc%22%5BJournal%5D)">Absolute quantification of prokaryotes in the microbiome by 16S rRNA qPCR or ddPCR.</a> Nat Protoc. 20, 3471-3476 (2025).</li>
<li>Frostegård, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Quantification+of+bias+related+to+the+extraction+of+DNA+directly+from+soils%5BTitle%5D)+AND+%22Appl+Environ+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Quantification of bias related to the extraction of DNA directly from soils.</a> Appl Environ Microbiol. 65 (12), 5409-5420 (1999).</li>
<li>Lee, E., Lim, H. J., Son, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Discrepancies+in+qPCR-based+gene+quantification+and+their+dependencies+on+soil+properties%2C+inhibitor+presence%2C+and+DNA+extraction+kit+types%5BTitle%5D)+AND+%22RSC+Adv%22%5BJournal%5D)">Discrepancies in qPCR-based gene quantification and their dependencies on soil properties, inhibitor presence, and DNA extraction kit types.</a> RSC Adv. 15 (25), 19656-19664 (2025).</li>
<li>Buell, Z. W., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Interrelationships+among+methods+of+estimating+microbial+biomass+across+multiple+soil+orders+and+biomes%5BTitle%5D)+AND+%22Soil+Biol+Biochem%22%5BJournal%5D)">Interrelationships among methods of estimating microbial biomass across multiple soil orders and biomes.</a> Soil Biol Biochem. 208, 109844(2025).</li>
<li>Carini, P., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Relic+DNA+is+abundant+in+soil+and+obscures+estimates+of+soil+microbial+diversity%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Relic DNA is abundant in soil and obscures estimates of soil microbial diversity.</a> Nat Microbiol. 2 (3), 16242(2016).</li>
<li>Child, H. T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Automated+environmental+metagenomics+using+Oxford+nanopore+sequencing%5BTitle%5D)+AND+%22BMC+Genomics%22%5BJournal%5D)">Automated environmental metagenomics using Oxford nanopore sequencing.</a> BMC Genomics. 26 (1), 835(2025).</li>
<li>Paliaga, S., Laudicina, V. A., Muscarella, S. M., Said-Pullicino, D., Badalucco, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Comparison+of+different+methods+for+estimating+microbial+biomass+in+biochar-amended+soils%5BTitle%5D)+AND+%22Soil+Biol+Biochem%22%5BJournal%5D)">Comparison of different methods for estimating microbial biomass in biochar-amended soils.</a> Soil Biol Biochem. 203, 109733(2025).</li>
<li>Setia, R., Verma, S. L., Marschner, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Measuring+microbial+biomass+carbon+by+direct+extraction%3A+comparison+with+chloroform+fumigation-extraction%5BTitle%5D)+AND+%22Eur+J+Soil+Biol%22%5BJournal%5D)">Measuring microbial biomass carbon by direct extraction: comparison with chloroform fumigation-extraction.</a> Eur J Soil Biol. 53, 103-106 (2012).</li>
</ol>

<table><tbody><tr><td>베터사이즈 S3 플러스&nbsp;</td><td>베터사이즈, 중국</td><td>BT-803</td><td></td></tr><tr><td>원심분리기</td><td>열과학 및 nbsp;</td><td>SL16&nbsp;</td><td></td></tr><tr><td>클로로포름 &nbsp;</td><td>열과학</td><td>L14759. AU&nbsp;</td><td></td></tr><tr><td>ddPCR 96-웰 플레이트</td><td>바이오-래드, 왓포드, 영국</td><td>12001925</td><td></td></tr><tr><td>ddPCR 드롭렛 리더 오일 &nbsp;</td><td>바이오-래드, 왓포드, 영국</td><td>1863004</td><td></td></tr><tr><td>데시케이터&nbsp;</td><td>데이비실</td><td></td><td></td></tr><tr><td>DG8 카트리지 홀더</td><td>바이오-래드, 왓포드, 영국</td><td>1863051</td><td></td></tr><tr><td>QX200/QX100 드롭렛 제너레이터용 DG8 카트리지</td><td>바이오-래드, 왓포드, 영국</td><td>1864008</td><td></td></tr><tr><td>QX200/QX100 액자 발생기용 DG8 가스켓</td><td>바이오-래드, 왓포드, 영국</td><td>Q33265</td><td></td></tr><tr><td>DNeasy Power Soil 프로 키트 &nbsp;</td><td>치아겐, 독일</td><td>47017</td><td></td></tr><tr><td>이중 가닥(dsDNA) 광범위(BR) 분석 키트</td><td>인비트로젠, 독일</td><td>Q33230</td><td></td></tr><tr><td>FastPrep-24 5G &nbsp;</td><td>영국 의원 생의학</td><td>116005500</td><td></td></tr><tr><td>그리드온&nbsp;</td><td>옥스퍼드 나노포어 테크놀로지스, 영국</td><td>GRD-MK1CAPX</td><td></td></tr><tr><td>K2SO4</td><td>머크, 영국</td><td>7778-80-5</td><td></td></tr><tr><td>마그네그틱 바인드 자기 비즈</td><td>오메가 바이오텍, 미국</td><td>M1378-01</td><td></td></tr><tr><td>MinION 플로우 셀</td><td>옥스퍼드 나노포어 테크놀로지스, 영국</td><td>플로-민114</td><td></td></tr><tr><td>묵직한 용광로</td><td>탄산화물 &nbsp;</td><td>AAF1100</td><td></td></tr><tr><td>네이티브 바코드 키트 24</td><td>옥스퍼드 나노포어 테크놀로지스, 영국</td><td>SQK-NBD114.24</td><td></td></tr><tr><td>PCR 플레이트 히트 씰, 호일, 피어서블 &nbsp;</td><td>바이오-래드, 왓포드, 영국</td><td>1814040</td><td></td></tr><tr><td>PX1 PCR 플레이트 실러</td><td>바이오-래드, 왓포드, 영국</td><td>1814000</td><td></td></tr><tr><td>큐비트 형광도계</td><td>인비트로젠, 독일</td><td>Q33226</td><td></td></tr><tr><td>QX200 액적 디지털 PCR 시스템</td><td>바이오-래드, 왓포드, 영국</td><td>1864001</td><td></td></tr><tr><td>QX200 ddPCR 에바그린 슈퍼믹스</td><td>바이오-래드, 왓포드, 영국</td><td>186-4033</td><td></td></tr><tr><td>QX200 방울 생성 오일(EvaGreen &nbsp);</td><td>바이오-래드, 왓포드, 영국</td><td>1864005</td><td></td></tr><tr><td>QXDx 액적 발생기&nbsp;</td><td>바이오-래드, 왓포드, 영국</td><td>12001049</td><td></td></tr><tr><td>센소퀘스트 LABCYCLER&nbsp;</td><td>Geneflow, 독일</td><td>1120280125</td><td></td></tr></tbody></table>

디지털 액상 pcr(ddpcr)을 이용한 토양 내 미생물 바이오매스 측정

Determination of Microbial Biomass in Soil using Digital Droplet PCR (ddPCR)

디지털 액상 PCR(ddPCR)을 이용한 토양 내 미생물 바이오매스 측정

Soil represents the largest terrestrial pool of organic carbon, yet more than 133 Gt of carbon has been lost from soils over the past two centuries. ...

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우리는 단순화된 (아날로그) 판독으로 핵산을 정량화하기 위한 종말점 디지털 분석을 설명합니다. 당사는 특수 기기가 아닌 표준 qPCR 기계를 사용하여 액적 기반 디지털 분석의 벌크 형광을 측정하고 현미경 검사로 결과를 확인합니다.

디지털 핵산 정량 분석​​ 실험의 단순 대량 판독

이 원고를 동시에 엔테로 종을 정량화하는 데 사용할 수있는 이중 디지털 PCR 분석. 레크리에이션 바다에서 일반과 인간의 관련 분변 오염의 지표로 HF183 유전자 마커를 설명합니다.

동시 정량을위한 이중 디지털 PCR 분석<em&gt; 엔테로 종.</em&gt;과 바다에서 인간 방패 관련 HF183 마커

염료 기반 화학 및 액적 디지털 PCR 기술을 사용한 cell-free microRNA 정량화를 위한 민감하고 정확한 방법에 대해 설명합니다.

마이크로 RNA 정량는 DNA 결합 염료 화학, 물방울 디지털 PCR을 사용하여 순환

식물 병원 체 현장, 특히 토양을 매개로 병원 균의 신속 하 고 정확한 검색은 추가 inoculum 생산 및 공장 분야에서 질병의 확산을 방지 하기 위해 중요 합니다. 여기 휴대용 실시간 PCR 탐지 시스템을 사용 하 여 개발 메서드 필드 조건에서 현장 진단이 있습니다.

휴대용 실시간 PCR 시스템을 사용 하 여 토양 품 어진 Phytopathogens의 현장 분자 검출

여기, 우리는 토양, rhizosphere, 및 루트 endosphere microbiomes amplicon 시퀀스 데이터를 얻기 위해 프로토콜을 설명 합니다. 이 정보 구성 및 플랜트 관련 미생물 커뮤니티의 다양성을 조사 하는 데 사용할 수 있습니다 그리고 다양 한 종의 식물 사용에 적합.

루트 미생물 탐색: 토양, Rhizosphere, 및 루트 Endosphere에서 세균성 지역 사회 데이터 추출

여기에 설명된 16S rRNA 메타게놈 시퀀싱 및 자유롭게 사용할 수 있는 도구를 사용하여 분석하는 미생물군유전체 프로파일링을 위한 간소화된 표준 작동 절차입니다. 이 프로토콜은 미생물군유전체 분야를 새로운 연구자뿐만 아니라 더 높은 해상도에서 박테리아 프로파일링을 달성하기 위한 방법에 대한 업데이트를 요구하는 연구자들에게 도움이 될 것입니다.

2단계 PCR 및 차세대 16S rRNA 유전자 시퀀싱을 사용한 미생물 분석

여기에서는 단일 세포에서 절대 미토콘드리아(mt)DNA 복제 수와 mtDNA 결실 이형질 수준을 측정하기 위한 프로토콜을 제시합니다.

디지털 액적 중합효소 연쇄반응을 이용한 단세포 미토콘드리아 DNA 복제 수 및 이형질 측정

여기에서 우리는 유전자 치료 벡터의 임상 개발을 지원하기 위해 액적 디지털 중합효소 연쇄 반응에 의한 인간 눈물에서 아데노 관련 바이러스 벡터의 규정 준수 검출에 대한 우수 실험실 관행의 개발 및 검증을 위한 프로토콜을 제시합니다.

눈물의 바이오셰딩 연구에서 아데노 관련 바이러스 벡터의 검출을 위한 검증 가능한 액적 디지털 중합효소 연쇄 반응 분석

아데노 관련 바이러스(AAV) 벡터 게놈 복제의 정확한 정량화는 매우 중요하지만 표준화된 프로토콜은 아직 확립되지 않았습니다. 이 프로토콜은 바이러스 게놈 역가를 신뢰성 있게 정량화하기 위해 정제된 AAV 샘플을 준비하고 디지털 액적 중합효소 연쇄 반응(dd_PCR)을 수행하기 위한 검증된 방법을 설명합니다.

Digital Droplet Polymerase Chain Reaction에 의한 정제된 벡터 샘플의 Adeno-Associated Viral Genomes 정량화

신뢰할 수 있고 정확한 현장 배치 가능한 DNA 분석은 많은 산업에서 매우 중요합니다. 본 논문은 현장에서 환경 미생물 분석을 위한 두 가지 방법을 제시합니다: 1) 생물학적 추출 필드 키트를 이용한 환경 샘플에서 미생물 DNA를 분리하는 방법, 2) 현장 qPCR 유닛을 통한 DNA 분석.

생물학적 추출 필드 키트와 현장 qPCR 유닛을 이용한 현장 내 미생물 DNA 분석

배우세요 ddPCR을 이용한 토양 내 세균과 균류의 절대 정량 방법을. 16S 및 18S rRNA 유전자를 표적으로 하여 미생물 바이오매스 탄소를 정확히 측정하고 토양 건강 평가를 위한 생태학적 지표를 분석합니다.

디지털 액상 PCR(ddPCR)을 이용한 토양 내 미생물 바이오매스 측정

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