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</ol>

<table><tbody><tr><td>Agar</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>01916-500G</td><td>LB agar 배지의 구성 성분; 15 g/L.</td></tr><tr><td>오토클레이브</td><td>Lab1st&nbsp;</td><td>SV120H</td><td>도구/재료를 멸균하거나 무균 처리를 검증하는 데 사용.</td></tr><tr><td>박테리아 DNA 추출 키트</td><td>Promocell</td><td>PK-MB708-206-100</td><td>DNA 추출&nbsp;</td></tr><tr><td>콜로니 카운팅/기록 설정</td><td>OCS</td><td>B079Y5W57N</td><td>CFU, 형태 유형 및 플레이트 차이를 기록하는 데 필요; 원고에는 카운터/모델이 명시되어 있지 않음.</td></tr><tr><td>극저온 저장 바이알</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>Z359033</td><td>글리세롤 스톡을 -80 &deg;C에서 저장하는 데 필요; 명시적으로 이름이 지정되지 않았으나 보존 단계에 필요.</td></tr><tr><td>디지털 분리주 기록 시스템</td><td>원고에 지정되지 않음</td><td>해당 없음</td><td>분리주 메타데이터 기록에 사용: 기원, 복제, 조건, 무균 처리, 분리 날짜, 플레이트 배지, 형태, 식별 상태.</td></tr><tr><td>에탄올</td><td>VWR</td><td>83813440</td><td>종자 표면 멸균에 70% v/v 에탄올 용액을 준비하는 데 사용.</td></tr><tr><td>필터 페이퍼</td><td>Fisher Scientific</td><td>11718772</td><td>선택적 대체 발아 지원.</td></tr><tr><td>포셉/핀셋</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>930229</td><td>종자를 이동하고 발아된 묘목을 수집하는 데 사용.</td></tr><tr><td>게놈 DNA 추출 키트</td><td>PromoCell</td><td>PK-MB708-206-100</td><td>정제된 박테리아 배양물에서 게놈 DNA를 추출하는 데 사용; 정확한 키트/방법은 지정되지 않음.</td></tr><tr><td>글리세롤, 무균 80%</td><td>VWR</td><td>24388364</td><td>액체 배양물과 1:1 v/v 비율로 혼합하여 극저온 저장 준비.</td></tr><tr><td>라미나 플로우 후드 Bio48</td><td>Faster</td><td>LAB-CAP-22</td><td>무균 종자 취급, 무균 전달 및 무균 재료 준비에 필요.</td></tr><tr><td>LB 아가 배지</td><td>VWR</td><td>846495000</td><td>비교 배양에 사용되는 표준 배지; 1리터당: 트립톤 10g, 효모 추출물 5g, NaCl 10g, 아가 15g.</td></tr><tr><td>마이크로센트리퓨지 튜브</td><td>Ratiolab</td><td>RATI5615000</td><td>종자 멸균 및 샘플 처리에 사용.</td></tr><tr><td>MS 배지</td><td>Sigma</td><td>M0404-10L</td><td>무균 발아를 위한 멸균 발아 지원으로 언급됨.</td></tr><tr><td>NZYTaq II 2&times; 마스터 믹스</td><td>Nzytech</td><td>MB35803</td><td>PCR 증폭용 믹스</td></tr><tr><td>파라필름</td><td>Parafilm/Merck</td><td>HS234526A</td><td>발아 플레이트를 밀봉하면서 오염을 줄이는 데 사용.</td></tr><tr><td>페트리 접시</td><td>Labbox</td><td>PDIP-E9N-500</td><td>발아 설정, 플레이팅 및 무균 종자 취급에 사용.</td></tr><tr><td>파이토아가</td><td>Duchefa Biochemie</td><td>9002-18-0</td><td>선택적 대체 무균 발아 지원으로 언급됨.</td></tr><tr><td>파이펫 세트 및 팁</td><td>Merck</td><td>EP3123000918-1EA</td><td>멸균 용액을 제거하고, 세척, 희석 및 플레이팅하는 데 사용.</td></tr><tr><td>R2A 아가 배지</td><td>HI-MEDIA</td><td>M1743-500G</td><td>확장된 배양 워크플로우에 대한 선택적 추가 배지.</td></tr><tr><td>나트륨 클로라이드, NaCl</td><td>Fisher Chemical</td><td>10040460</td><td>균질화 및 연속 희석을 위한 무균 0.45% NaCl을 준비하는 데 사용; LB 배지의 일부이기도 함.</td></tr><tr><td>나트륨 하이포클로라이트</td><td>Carlo Erba</td><td>370323</td><td>종자 표면 멸균을 위해 20% v/v 나트륨 하이포클로라이트 용액을 준비하는 데 사용. 부식성; PPE 필요.</td></tr><tr><td>무균 일회용 피스틀</td><td>Eppendorf</td><td>EP0030120973</td><td>건조 종자 및 발아 묘목의 균질화에 사용.</td></tr><tr><td>보텍스 믹서</td><td>Fisher Scientific</td><td>15901137</td><td>균질화물에서 미생물 세포를 재현하는 데 사용.</td></tr></tbody></table>

통제된 발아 및 비교 배양을 통한 토마토 씨앗 관련 미생물군 분리

Isolation of Tomato Seed-Associated Microbiota Through Controlled Germination and Comparative Culturing

Surface sterilization is a critical yet frequently under-optimized step in studies aiming to isolate seed-associated microorganisms, as excessively harsh ...

isolation-tomato-seed-associated-microbiota-through-controlled

Research

연구

JoVE Journal

Biology

생물학

출처: Hassan, JA, et al. Pseudomonas syringae pv에 대한 내성의 고처리량 식별.  묘목 홍수 분석을 사용한 토마토의 토마토. J. Vis. 경험. (2020).이 비디오는 박테리아 현탁액을 접종한 10일 된 묘목을 사용하여 다양한 토마토 균주에서 박테리아 내성을 스크리닝하는 방법을 보여줍니다. 박테리아가 기공을 통해 침입하고, 식물 면역을 억제하기 위해 이펙터 단백질을 전달하는 방법, 감수성 균주와 내성 균주 간에 식물 반응이 어떻게 다른지 설명합니다. 결과는 눈에 보이는 성장 차이를 관찰하여 평가되며, 저항성 식물은 건강하게 유지되고 취약한 식물은 조직 손상을 보입니다.

토마토의 박테리아 내성 스크리닝을 위한 묘목 홍수 분석

출처: Nathoo, N., et al. 식물/미생물 분자 상호 작용 및 신호 전달의 동시 및 체계적 분석을 위한 수경 공동 재배 시스템. J. Vis. 경험. (2017).이 비디오는 멸균 조건에서 식물-박테리아 상호 작용을 연구하기 위한 수경 공동 재배 시스템을 보여줍니다. 식물 묘목은 멸균된 산성 성장 배지로 옮겨져 배양되고 Agrobacterium을 접종하기 전에 오염 여부를 검사합니다. 활성화된 박테리아는 식물 뿌리에 부착되어 T-DNA를 식물 세포로 전달하며 박테리아 집락화를 강화하는 분자 변화를 촉진합니다.

식물 숙주와 상호 작용하는 박테리아의 분자 반응을 연구하기 위한 공동 배양 시스템

내생 박테리아는 식물 조직에 서식하고 식물 성장을 촉진합니다.염분 스트레스 하에서 토마토 식물 성장에 미치는 영향을 연구하려면 잎과 뿌리가 발달하는 무균 묘목부터 시작하십시오.실험 묘목의 뿌리를 내생 박테리아의 현탁액에 담그십시오. 대조군은 접종하지 않은 상태로 두십시오.외부 미생물 간섭을 방지하기 위해 두 그룹을 멸균된 토양으로 옮기고 성장 챔버에서 배양합니다.토양에서 박테리아는 일시적인 뿌리 구멍을 통해 들어가 내부 조직에 식민지를 형성하고 다른 식물 부분으로 퍼집니다. 집락화를 강화하기 위해 박테리아 현탁액을 다시 바르십시오.두 그룹 모두에서 점진적인 염분 스트레스를 유도하기 위해 격일로 염화나트륨 용액을 적용합니다.염분 스트레스는 식물 세포를 손상시키는 활성 산소종(ROS) 생성을 유발합니다.내생균은 ROS 소거 효소를 생산하고 식물 성장을 위한 식물 호르몬과 미량 영양소를 공급하여 스트레스를 완화합니다.배양 후 실험 묘목은 성장을 유지하는 반면 대조군은 발달이 멈춥니다.

내생 박테리아 집락화를 통한 토마토 식물의 염분 스트레스 내성 향상

출처: Matthysse, A. G. 실험실에서 측정한 박테리아의 식물 표면 부착 현상. J. 비스캐스트 익스피스, (2018)이 영상은 야생형 및 셀룰로오스 결핍 병원성 박테리아에 의한 토마토 묘목의 뿌리 정착 측정 프로토콜을 시연합니다. 밀착된 박테리아의 유효한 개체 수는 야생형 균주에 의한 더 높은 부착력과 미세군집 형성을 보여주며, 셀룰로오스가 안정적인 뿌리 집락화에서 역할을 함을 강조합니다.

생존 세포 수를 이용한 병원성 박테리아에 의한 토마토 묘목의 뿌리 정착 평가

측정 및 식물, 특히 뿌리와 콩나물, 세균성 접착을 위한 쉬운 방법이이 문서에 설명 되어 있습니다.

공장 실험실에서 측정 하는 표면에 박테리아의 부착

여기에서, 우리는 세균성 wilt 질병의 연구 연구를 위한 간단한 유전 분석을 능력을 발휘하기 위하여 랄스토니아 solanacearum를 가진 접종에 선행된 토마토 뿌리 변환을 위한 다재다능한 방법을 제시합니다.

세균성 윌트 질병의 간단한 유전 분석을 위한 랄스토니아 솔라나세아룸에 의한 접종에 이어 토마토 뿌리 변환

모종 홍수 분석은 슈도모나스 주사기 박테리아에 대한 저항성을 위한 야생 토마토 접근물의 신속한 스크리닝을 용이하게 한다. 이 분석법은, 모종 세균 성장 분석과 함께, 박테리아에 대한 근본적인 저항성을 더욱 특성화하는 데 도움을 줄 수 있으며, 저항의 유전적 기초를 결정하기 위해 매핑 인구를 스크리닝하는데 사용될 수 있다.

슈도모나스 주사기 pv에 대한 저항의 높은 처리량 식별. 모종 홍수 분석을 사용하여 토마토토마토

도끼 곤충을 얻기 위해 달걀 표면을 살균하고 부화 한 유충은 도끼 잎을 사용하여 사육됩니다. 이 방법은 항생제를 투여하거나 다른 잎을 먹는 곤충에도 적용 할 수있는 인공 식단을 개발하지 않고도 축산 곤충 준비를위한 효율적인 방법을 제공합니다.

잎 딱정벌레의 숙주 - 장 microbiota 상호 작용 연구를위한 조직 배양 묘목으로 축 곤충 준비 및 사육

이 프로토콜은 식물 뿌리에 토양 매개 미생물을 접종하는 전략에 대한 자세한 요약을 제공합니다. 진균 Verticillium longisporum 및 Verticillium dahliae에 대해 예시된 세 가지 상이한 뿌리 감염 시스템이 기술된다. 잠재적 응용 분야와 가능한 다운스트림 분석이 강조되고 각 시스템에 대한 장단점이 논의됩니다.

식물 뿌리를 토양 매개 미생물로 감염시키는 접종 전략

이 프로토콜은 균근 진균으로 발아된 식물 조직 및 종자에서 진균 집락을 연구하기 위해 주사 및 투과 전자 현미경, 빛, 공초점 및 형광 현미경과 같은 다양한 현미경 기술을 적용하여 진균종속영양 식물 샘플을 수집, 고정 및 유지하기 위한 자세한 절차를 제공하는 것을 목표로 합니다.

균종속영양 식물 조직의 곰팡이 집락화 및 종자의 공생 발아를 해석하기 위한 현미경 기술

토마토 씨앗은 식물 생식 중 유전학 및 발생 생물학을 연구하는 중요한 모델입니다. 이 프로토콜은 더 미세한 배아 구조를 관찰하기 위해 다양한 발달 단계에서 토마토 씨앗을 제거하는 데 유용합니다.

토마토의 종자 개발 연구를위한 효율적인 청산 프로토콜 (Solanum lycopersicum L.)

iPlantMicro Lab..  이 프로토콜은 표준화된 종자 표면 멸균과 통제된 발아를 결합하여 씨앗에서 묘목으로 전환하는 동안 토마토 씨앗 관련 미생물군을 재현 가능하게 합니다. 이 접근법은 건조 씨앗에서 과소대표되는 배양 가능한 미생물의 회수를 높이고, 초기 묘목 발달 중 비교 배양 연구를 지원합니다.

통제된 발아 및 비교 배양을 통한 토마토 씨앗 관련 미생물군 분리

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