8.5
During DNA replication, complementary base pairing dictates the sequence of nucleotides added to the new strand — adenine pairs with thymine and guanine pairs with cytosine.
However, nucleotides can sometimes be incorrectly paired, for instance, adenine with cytosine. Such errors are prevented or repaired by the proofreading properties of DNA polymerases carried out during DNA synthesis.
First, DNA polymerase has a high affinity for complementary nucleotides, which improves the accuracy of selecting the correct incoming nucleotide to pair with the template strand.
Second, as the nucleotides start pairing, the DNA polymerase undergoes a conformational change that makes the mispaired nucleotides more likely to dissociate but retains the correctly paired nucleotides.
Third, if an incorrect nucleotide is somehow added to the growing 3' end, the structural deviation caused by this incorrect pairing causes the DNA polymerase to pause.
In a process called exonucleolytic proofreading, the 3' end is then transferred to the exonuclease site of the DNA polymerase. The polymerase subsequently removes the incorrect nucleotide in a 3' to 5' direction, replaces it with the correct nucleotide, and resumes DNA synthesis.
De synthese van nieuwe DNA-moleculen wordt uitgevoerd door het enzym DNA-polymerase, dat nucleotiden aan de dochterstreng toevoegt die complementair zijn aan de template-DNA-streng. DNA-polymerase heeft een hogere affiniteit om de juiste base toe te voegen en zorgt voor betrouwbaarheid tijdens DNA-replicatie. Bovendien vertoont het proefleesactiviteit tijdens replicatie, waarbij gebruik wordt gemaakt van een exonucleasedomein dat onjuiste nucleotiden uit de ontluikende DNA-streng afsnijdt.
Fouten tijdens de replicatie worden gecorrigeerd door het DNA-polymerase-enzym
Genomisch DNA wordt gesynthetiseerd in de richting van 5’ naar 3’. Elke cel bevat een aantal DNA-polymerasen die verschillende rollen spelen bij het synthetiseren en corrigeren van fouten in het DNA. DNA-polymerase delta en epsilon beschikken bijvoorbeeld over proefleesvermogen bij het repliceren van nucleair DNA. Deze polymerasen ‘lezen’ elke base nadat deze aan de nieuwe streng is toegevoegd. Als de nieuw toegevoegde base onjuist is, keert het polymerase de richting om (van 3’ naar 5’) en gebruikt het een exonucleolytisch domein om de onjuiste base af te snijden. Vervolgens wordt de weggesneden basis vervangen door de juiste basis.
Mutaties in het exonucleasedomein van DNA-polymerase zijn gekoppeld aan kankers
Proeflezen is belangrijk om te voorkomen dat mutaties optreden in nieuw gesynthetiseerd DNA, maar wat gebeurt er als het proefleesmechanisme faalt? Wanneer een mutatie het exonucleasedomein van DNA-polymerase verandert, verliest het het vermogen om onjuiste nucleotiden te verwijderen. Als gevolg hiervan kunnen mutaties zich snel in het hele genoom ophopen. Dit type mutatie is in verband gebracht met verschillende soorten kanker.
Low-fidelity DNA-polymerase kan gemuteerde DNA-sequenties genereren
Gemodificeerde DNA-polymerasen worden in de laboratoriumwetenschap gebruikt voor polymerasekettingreactie (PCR), een in vitro techniek voor het maken van veel kopieën van specifieke DNA-fragmenten. Hoewel hifi-polymerasen worden gebruikt als het belangrijk is dat het eindproduct perfect is, proberen sommige technieken, zoals foutgevoelige PCR, met opzet mutaties in een stuk DNA te genereren. Deze technieken maken gebruik van polymerasen die het proefleesvermogen in gevaar brengen.
During DNA replication, complementary base pairing dictates the sequence of nucleotides added to the new strand — adenine pairs with thymine and guanine pairs with cytosine.
However, nucleotides can sometimes be incorrectly paired, for instance, adenine with cytosine. Such errors are prevented or repaired by the proofreading properties of DNA polymerases carried out during DNA synthesis.
First, DNA polymerase has a high affinity for complementary nucleotides, which improves the accuracy of selecting the correct incoming nucleotide to pair with the template strand.
Second, as the nucleotides start pairing, the DNA polymerase undergoes a conformational change that makes the mispaired nucleotides more likely to dissociate but retains the correctly paired nucleotides.
Third, if an incorrect nucleotide is somehow added to the growing 3' end, the structural deviation caused by this incorrect pairing causes the DNA polymerase to pause.
In a process called exonucleolytic proofreading, the 3' end is then transferred to the exonuclease site of the DNA polymerase. The polymerase subsequently removes the incorrect nucleotide in a 3' to 5' direction, replaces it with the correct nucleotide, and resumes DNA synthesis.
From Chapter 8:
Now Playing
DNA Replication and Repair
8.6K Views
DNA Replication and Repair
67.3K Views
DNA Replication and Repair
24.5K Views
DNA Replication and Repair
16.8K Views
DNA Replication and Repair
11.6K Views
DNA Replication and Repair
22.1K Views
DNA Replication and Repair
16.8K Views
DNA Replication and Repair
7.4K Views
DNA Replication and Repair
8.0K Views
DNA Replication and Repair
4.6K Views
DNA Replication and Repair
5.1K Views
DNA Replication and Repair
5.9K Views
DNA Replication and Repair
3.7K Views
DNA Replication and Repair
2.6K Views
DNA Replication and Repair
7.5K Views
See More