Een abonnement op JoVE is vereist om deze inhoud te bekijken. Log in of start vandaag met uw gratis proefperiode.

Methodenartikel

Optische Scatter Microscopie op basis van twee-dimensionale Gabor filters

9.3K weergaven

⸱

DOI:

10.3791/1915

⸱

2 juni 2010

 ,  , 

In dit artikel

Samenvatting

We zien een donker veld microscopie op basis van Gabor-achtige filter om subcellulaire dynamiek maatregel binnen enkele levende cellen. De techniek is gevoelig voor veranderingen in de structuur van de organellen, zoals mitochondriën fragmentatie.

Samenvatting

Demonstreren we een instrument dat microscopisch kleine subcellulaire structuur die voortvloeien uit organel morfologie en de organisatie binnen onbesmet levende cellen kunnen meten. Het voorgestelde instrument breidt de gevoeligheid van de label-free optische microscopie op nanoschaal veranderingen in organel grootte en vorm en kan gebruikt worden om de studie van de structuur-functie relatie met betrekking tot organel dynamiek onderliggende fundamentele biologische processen, zoals de geprogrammeerde celdood of cellulaire versnellen differentiatie. De microscoop kan eenvoudig worden toegepast op de bestaande microscopie platforms, en kan dus worden verspreid aan de individuele laboratoria, waar wetenschappers kunnen implementeren en het gebruik maken van de voorgestelde methoden met onbeperkte toegang.

De voorgestelde techniek is in staat om subcellulaire structuur karakteriseren door het observeren van de cel door middel van twee-dimensionale optische Gabor filters. Deze filters kunnen worden afgestemd op gevoel met nanoschaal (10 van nm) gevoeligheid, specifieke morfologische kenmerken met betrekking tot de grootte en oriëntatie van niet-sferische subcellulaire organellen. Terwijl op basis van contrast gegenereerd door elastische verstrooiing, is de techniek niet op een gedetailleerd inverse verstrooiing model of op de Mie theorie morfometrische metingen te extraheren. Deze techniek is dus van toepassing op niet-bolvormige organellen die een nauwkeurige theoretische beschrijving scatter niet gemakkelijk gegeven, en biedt onderscheidende morfometrische parameters die kunnen worden verkregen binnen onbesmet levende cellen om hun functie te beoordelen. De techniek is voordelig in vergelijking met digitale beeldverwerking in die zin dat direct werkt op het veld van het object te transformeren in plaats van de intensiteit van de gediscretiseerde object. Het is niet afhankelijk van hoge beeld-sampling rates en kan dus worden gebruikt om de morfologische activity snel scherm binnen honderden cellen in een tijd, dus sterk de studie van de structuur organel vergemakkelijken dan individuele organel segmentatie en wederopbouw met behulp van fluorescentie confocale microscopie van de sterk vergrote digitale beelden van beperkte gezichtsveld.

In deze demonstratie laten we de gegevens van een mariene diatomeeën de methodiek illustreren. We laten ook zien voorlopige gegevens verzameld van levende cellen om een ​​idee van hoe de methode kan worden toegepast in een relevante biologische context te geven.

Protocol

1. Aan de cellen klaar

  1. De cellen die werden uitgeplaat op de dag voor moeten worden gemerkt met Mitotracker groen voor fluorescentie beeldvorming van de mitochondriën.
  2. Verwijder de 100 uM stockoplossing van Mitotracker groen in DMSO eerder gemaakte uit de 4 ° C vriezer, en op kamertemperatuur met de hand. Neem ook uit runderen aorta endotheelcellen (BAEC) celkweekmedium ook eerder bereid en warm tot 37 ° C in de stationaire waterbad.
  3. Zodra de Mitotracker en de cultuur medium worden opgewarmd, plaats deze in de motorkap en zorg dat uw handschoenen en alle buitenkant van de containers met 70% ethanol-oplossing te steriliseren. Draai niet ....

Toegang beperkt. Log in of start een proefperiode om deze inhoud te bekijken.

Discussie

De hierboven beschreven methode levert morfometrische kaarten van het object dat deeltjesgrootte of oriëntatie voor bijvoorbeeld kunnen coderen. Deze structurele informatie kan worden gebruikt op verschillende manieren:

  1. Het kan gebruikt worden als een eerste scherm om weefsel of cel-regio's die zijn veranderd in een specifieke behandeling en dan verder deze regio's te analyseren met een specifieke moleculaire en biochemische assays te identificeren.
  2. Het kan worden gebruikt in combinatie me.......

Toegang beperkt. Log in of start een proefperiode om deze inhoud te bekijken.

Openbaarmakingen

Sommige aspecten van de methoden zijn opgenomen in en invention disclosure, Rutgers University Docket # 09-049.

Dankbetuigingen

De micro-mirror-apparaat in dit onderzoek werd gefinancierd door Whitaker Foundation subsidie ​​RG-02 tot 0.682 naar N. Boustany. Lopende werkzaamheden wordt gefinancierd door subsidie ​​NSF-DBI-0852857 naar N. Boustany. RM Pasternack werd gedeeltelijk ondersteund door een Rutgers presidentiële Graduate Fellowship. Wij zouden ook graag dr. E. White bedanken voor de iBMK cellen die in onze studies en dr. DN Metaxas voor nuttige discussie over optische filtering strategieën.

....

Toegang beperkt. Log in of start een proefperiode om deze inhoud te bekijken.

Materialen

Lijst van materialen gebruikt in dit artikel
NaamBedrijfCatalogusnummerOpmerkingen
DMEMInvitrogenDMEM met lage glucoseconcentratie
Liebowitz L15 mediumInvitrogenZonder fenolrood
L-glutamineInvitrogen
Mitotracker GreenInvitrogen
Bovien breinextractClonetics
Foetaal runderserumGemini Bio Products
HeparineSigma-Aldrich
StaurosporineSigma-Aldrich
DimethylsulfoxideSigma-Aldrich
InverteermicroscoopCarl Zeiss, Inc.Axiovert 200M
DMDTexas InstrumentsTI 0.7 XGA DMD 1100
CCDRoper ScientificCascase 512BCCD met hoog (16 bit) dynamisch bereik
CCDRoper ScientificCoolsnap cf

Referenties

  1. Pasternack, R. M., Qian, Z., Zheng, J. -Y., Metaxas, D. N., White, E., Boustany, N. N. Measurement of Subcellular Texture by Optical Gabor-Like Filtering with a Digitial Micromirror Device. Optics Letters. 33 (19), 2209-2211 (2008).
  2. Pasternack, R. M., Qian, Z., Zheng, J. -Y., Metaxas, D. N., Boustany, N. N.

Toegang beperkt. Log in of start een proefperiode om deze inhoud te bekijken.

Herprints en machtigingen

Meer artikelen verkennen

Mitochondriële fragmentatiedetectie van apoptosesubcellulaire structuurlabelvrije beeldvormingorganelmorfologiedarkfield-beeldvormingfluorescentievalidatieanalyse van diatomeeën