1. Constructie van een geconcentreerd lentivirus-packagingsysteem voor transcriptiefactoren
- Productie van het geconcentreerde virus (Figuur 1A, B)
- Zaai 1,5 × 106 HEK (human embryonic kidney)-293T-cellen uit in een schaal van 60 mm en kweek deze cellen in normaal medium (zie Tabel 1) bij 37 °C in een bevochtigde incubator met 5% CO2.
OPMERKING: Als het virus in batches moet worden verpakt, kan een celkweekschaal van 100 mm worden gebruikt (voor details, zie Tabel 2). - Controleer na 24 u op de dag van transductie of de HEK-293T-cellen een confluentie van 80-90% hebben bereikt en vervang het medium door 3,5 mL DMEM (Dulbecco’s modified eagle medium) (150 µL DMEM per 1 cm2). Laat de cellen 2 u bij 37 °C in een bevochtigde incubator met 5% CO2 staan.
OPMERKING: Het vervangingsmedium moet serumvrij zijn, zodat de cellen kunnen worden "uitgehongerd" voor een betere plasmidtransfectie. - Bereid het mengsel van plasmiden (mix A) voor, bestaande uit 3 µg van de doelplasmiden van Mitf, Sox10, Pax3, Sox2, Sox9 of Snai2; 1 µg van het verpakkingsplasmid PMD2.G en 2 µg van het verpakkingsplasmid PSPAX2. Vul het volume van mix A aan tot 150 µL met serumvrij DMEM. Bereid het mengsel van het transfectiereagens (mix B) voor door 12 µL van het transfectiereagens toe te voegen (het volume is twee keer de totale massa van alle plasmiden) en vul het volume van mix B aan tot 150 µL met serumvrij DMEM.
OPMERKING: Bij het bereiden van de mengsels is het belangrijk om de vloeistof langzaam toe te voegen om luchtbellen te voorkomen. - Combineer mix A en mix B nadat deze 5 min op kamertemperatuur hebben gestaan. Incubeer het mengsel 20-30 min op kamertemperatuur om het transfectiecomplex te vormen.
- Haal de HEK-293T-cellen uit de incubator, vervang het medium door DMEM + 2% FBS (fetal bovine serum), voeg het mengsel uit stap 1.1.4 druppelsgewijs toe en meng de vloeistof voorzichtig.
- Vervang na 8 u het medium door 3,5 mL normaal medium. Verzamel na het vervangen van het medium het virussupernatans na 24 u en 48 u.
- Meng de virussupernatansen die op twee verschillende tijdstippen zijn verzameld. Centrifugeer 5 min bij 200 × g bij 4 °C. Filtreer het supernatant door 0,45 µm filters en verzamel het in een steriele conische buis van 50 mL.
OPMERKING: Het virus dat na 24 u is verzameld, kan worden bewaard bij 4 °C en gemengd worden met het virus dat na 48 u is verzameld. - Concentreer het virussupernatans door overnacht (~16 u) te centrifugeren bij 6000 × g bij 4 °C. Controleer of de viruspellet onderin de conische buis zichtbaar is na het centrifugeren.
- Giet het supernatant langzaam af. Los de viruspellet op in een volume normaal medium dat 1/100e deel is van het volume van het virussupernatans. Pipetteer met een P1000-micropipet voorzichtig op en neer totdat een homogeen mengsel is verkregen. Verdeel het geconcentreerde virus naar behoefte in microcentrifugebuisjes. Bewaar bij −80 °C.
OPMERKING: Met deze methode wordt het virus 100x geconcentreerd. Het geconcentreerde virus (100x) kan >1 jaar worden bewaard bij −80 °C. Vermijd herhaaldelijk invriezen en ontdooien van het virus.
Tabel 1: Componenten van normale en herprogrammeringsmedia.
| | Componenten | Dosis (concentratie, volume) | Eindconcentratie |
| Normaal medium (100 mL) | DMEM/HOGE GLUCOSE | 89 mL | |
| Hitte-geïnactiveerd FBS | 10 mL | |
| Antibiotica (Pen/Strep) | 10000 U/mL, 1 mL | 100 U/mL |
| Herprogrammeringsmedium (100 mL) | RPMI-1640 | 88 mL | |
| Hitte-inactieverdunnend FBS | 10 mL | |
| Recombinant menselijk SCF | 200 μg/mL, 50 μL | 100 ng/mL |
| Recombinant humaan bFGF | 4 μg/mL, 250 μL | 10 ng/mL |
| Recombinant menselijke insuline | 10 mg/mL, 50 μL | 5 μg/mL |
| menselijk EDN3 | 100 μM, 100 μL | 0.1 μM |
| choleratoxine | 0,3 mg/mL, 0.56 μL | 20 pM |
| Phorbol-12-myristaat-13-acetaat (TPA) | 1 mM, 20 μL | 200 nM |
| Hydrocortison | 100 μg/mL, 500 μL | 0.5 μg/mL |
| Adenine | 40 mg/mL, 60 μL | 24 μg/mL |
Tabel 2: Details van het lentivirus-verpakkingssysteem.
| Kweekschaal | Zaaidichtheid (cellen/schaal) | Medium (mL) | Plasmidensysteem | Transfectiereagens (µL) |
| Doelplasmide (μg) | PMD2.G (μg) | PSPAX2 (μg) |
| 35 mm | 6 ×105 | 1.5 | 1.5 | 0.5 | 1 | 6 |
| 60 mm | 1.5 × 106 | 3.5 | 3 | 1 | 2 | 12 |
| 100 mm | 4 × 106 | 8 | 8 | 3 | 6 | 34 |