Methodenartikel

Dit oktober in Jupiter

9.3K weergaven

DOI:

10.3791/3957

1 oktober 2011

In dit artikel

Samenvatting

Het oktober 2011-nummer van het Journal of Visualized Experiments (JoVE) presenteert de eerste poging van het tijdschrift om oceanografische fysica en techniek te onderzoeken. Onderzoekers aan het Woods Hole Oceanographic Institute demonstreren het gebruik van een zelfstandig onderwater snelheidsmeetapparaat, of SCUVA. Belangrijke componenten van dit instrument zijn een HD-camera en laser, die, wanneer uitgelijnd met een optische lens, een verticale lichtstraal produceert. Na uitlijning en testen op een waterdichte afdichting, zoeken deze onderzoekers naar bewoners van de waterkolom voor analyse. Nachtelijke experimenten zijn noodzakelijk, zodat natuurlijk licht de laserstroom niet verstoort. SCUVA is specifiek ontworpen om de beweging van deeltjes in het water vast te leggen, zodat de snelheidsvelden - een vectorveld dat de beweging van vloeistof beschrijft - kunnen worden bepaald rond een organisme in hun natuurlijke omgeving.

In Klinische en Translationele Geneeskunde bepalen orthodontische onderzoekers van de Universiteit van Graz de samenstelling van de orale biofilms - een oppervlakte-aangehecht aggregaat van micro-organismen - die zich vormen op de palatale expanders van hun patiënten. Deze auteurs gebruiken fluorescente in situ hybridisatie gecombineerd met confocale microscopie om specifieke bacteriën binnen de biofilm te detecteren en ook zijn 3-dimensionale structuur te visualiseren.

JoVE bezoekt ook Graz voor Immunologie en Infectie, waar onderzoekers aan de Universiteit van Graz en het Graz instituut voor technologie transmissie-elektronenmicroscopie, of TEM, gebruiken om de ultrastructurele veranderingen te analyseren die plaatsvinden in het plantenblad als gevolg van virale infectie. Kleine secties van bladeren worden uit de plant gesneden en onderworpen aan een door microgolf ondersteunde fixatieprocedure, die de bereidingstijd van monsters voor TEM drastisch vermindert. Na inbedding en sectie worden monsters in de elektronenmicroscoop geladen en geïmager. Met behulp van beeldanalysesoftware kunnen deze auteurs de afmetingen van virusdeeltjes berekenen en ook de ultrastructurele veranderingen in het plantenblad beoordelen, wat cruciaal is voor het identificeren van het infecterende virus.

In de neurowetenschappen presenteren onderzoekers van de Universiteit van Californië, Irvine, een reeks gedragsparadigma's die zijn bedoeld om de mate van cognitieve stoornis te meten bij knaagdieren die zijn behandeld met cranale radiotherapie. Deze auteurs demonstreren een nieuwe plaatsherkenningstaak (voor ruimtelijk herkenningsgeheugen), een verhoogde plus-doolhoftaak (voor meting van angst), een angstconditioneringstaak (leren en geheugen), en de Morris Water Maze (voor ruimtelijk leren). De cognitieve tekorten bij knaagdieren lijken op die welke zich manifesteren bij kankeroverlevenden na cranale radiotherapie, en daarom is standaardisatie van dergelijke cognitieve gedragsparadigma's cruciaal om therapie te beoordelen. Een potentiële therapie is stamceltransplantatie in de hippocampus, wat de auteurs in een apart video-artikel in oktober demonstreren.

Over het onderwerp stamcellen, demonstreren onderzoekers van de Universiteit van Californië, Riverside, methoden voor genetische manipulatie van humane geïnduceerde pluripotente stamcellen. Geïnduceerde pluripotente stamcellen, iPSC's, kunnen worden afgeleid van somatische cellen, zoals de fibroblasten die u hier ziet, na geforceerde expressie van bepaalde transcriptiefactoren, die ervoor zorgen dat de cellen worden getransformeerd in een pluripotente toestand. Deze auteurs laten zien hoe iPSC's kunnen worden gekweekt in feeder-vrije omstandigheden en geven nuttige tips voor het optillen en zaaien van de cellen in concentraties die optimaal zijn voor transfectie en nucleofectie.

Naast deze aanbevolen publicaties presenteert JoVE methoden voor het nemen van fysiologische metingen bij personen onder psychosociale stress, het volgen van bacteriële lysis na infecties met fagen, beeldvorming in de olfactorische bulb via een cranale venster, en tientallen meer video-artikelen van complexe methoden.

Openbaarmakingen

Geen belangenconflicten verklaard.

Herprints en machtigingen

Tags

Oceanographic PhysicsSCUVAUnderwater VelocimetryHD CameraLaser AlignmentWater Column AnalysisOral BiofilmsFluorescent In Situ HybridizationConfocal MicroscopyTransmission Electron MicroscopyViral Infection AnalysisSample PreparationCognitive Impairment MeasurementBehavioral Paradigms