$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
1. Immunofluorescentie
Het volgende protocol wordt uitgevoerd op vriescoupes coronale hersenen verkregen transcardiale perfusie muizen (20 ml PBS, 0,1 mol / l, pH 7,4, gevolgd door 50 ml koud 4% paraformaldehyde in PBS). Na perfusie worden hersenen zorgvuldig verwijderd en overgebracht naar 30% sucrose in PBS bij 4 ° C overnacht voor cryobescherming. De hersenen worden vervolgens snel bevroren door onderdompeling in isopentaan bij - 45 ° C gedurende 3 min voordat ze verzegeld in flesjes en opgeslagen bij -70 ° C tot gebruik. Coronale hersenen cryosecties (20 micrometer) worden serieel gesneden en onderworpen aan immunofluorescentie protocol 11, 6.
Breng alle reagentia en monsters op kamertemperatuur voor gebruik. Houd er rekening mee dat de gepresenteerde werken verdunningen van antilichamen en het serum het gevolg van proeven gedaan om de beste prestatie te verkrijgen. Wanneer verschillende antilichamen en serum wordt gebruikt, dit protocol moet worden gevalideerd.
Merk op dat omdat zowel anti-CD11b en anti-CD68 primaire antilichamen worden gemaakt in de rat, om cross-signaal te voorkomen door anti-rat Alexa 546, gebruikten we een sterke verdunning van anti-CD11 b gevolgd door fluorescerend signaalversterking met TSA kit (Cy5 tyramide). Wij hebben opgezet optimaal werkverdunning voor anti-CD 11 b na door de protocol behalve stap 1,17 en met ten minste 7 verschillende verdunningen van anti-CD 11 b volgens tabel 1. Hierdoor is 1:30.000 gekozen als enige verdunning bereiken: 1) zichtbaar signaal met Cy5 aan excitatiegolflengte 646 nm, 2) geen signaal met Alexa 546 in excitatiegolflengte 532 nm. Zo wordt Alexa 546 fluorescentiesignaal selectief verbonden CD68 expressie.
De optimale verdunningen voor anti-CD 11 en anti-CD68 antilichamen kunnen variëren afhankelijk van het soort weefsel en moeten vóór de co-labeling protocol beginnen gedefinieerd.
- Was hersenen vriescoupes tweemaal met PBS.
- Incubate cryosecties gedurende 5 min in PBS met 1% H 2 O 2 (stap nodig omdat de fluorescerende versterking nodig heeft incubatie met mierikswortelperoxidase, streptavidine-HRP, zie stap 1.12).
- Was vriescoupes 2x met PBS.
- Incubeer cryosecties gedurende 60 min in PBS bevattende 10% NGS en 0,3% Triton.
- Incubeer vriescoupes bij 4 ° C geïncubeerd in PBS die primaire Ab Rat anti-CD 11 b [1:30.000], 10% NGS en 0,3% Triton.
- Wash vriescoupes 2x (5 min) met PBS.
- Incubeer cryosecties gedurende 60 min in PBS met gebiotinyleerde secundaire anti-rat Ab [1:200] en 1% NGS.
- Was vriescoupes 2x met PBS.
- Was cryosecties met TNT (Tris-HCl, NaCl, Tween: 0.1 M TRIS-HCl, pH 7,4, 0,15 M NaCl, 0,05% Tween 20).
- Incubeer cryosecties gedurende 1,5 uur in TNB (Tris-HCl-NaCl-Blocking buffer: 0,1 M TRIS-HCl, pH 7,4, 0,15 M NaCl, 0,5% blokkeren van geschikte reagens kit (zie tabel reagentia)).
- Wassen cryosecties 3x keer met TNT.
- Incubeer cryosecties in TNB met streptavidine-HRP [1:100].
- Wassen cryosecties 3x met TNT.
- Incubeer cryosecties gedurende 8 min in Amplification Diluent met Cyanine 5 tyramide [1:300].
- Wassen cryosecties 3x met PBS.
- Incubeer cryosecties gedurende 60 min in PBS bevattende 10% NGS en 0,1% Triton.
- Incubeer vriescoupes bij 4 ° C geïncubeerd in PBS die primaire Ab Rat anti-CD68 [1:200], 3% NGS en 0,3% Triton.
- Wassen cryosecties 3x met PBS.
- Incubeer cryosecties gedurende 60 min in PBS met fluorconjugated secundaire Ab Alexa 546 anti-rat [1:500] en 1% NGS.
- Wassen cryosecties 3x met PBS.
- Incubeer cryosecties gedurende 10 min in PBS bevattende Hoechst 1 ug / ml.
- Wassen cryosecties 3x met PBS.
- Monteer cryosecties in Prolong Gold.
2. Overname van driedimensionale beelden door confocale microscopie
De microscoop hier gebruikte was een IX81 microscoop uitgerust met een confocale scan unit FV500 met 3 laserlijnen: Ar-Kr (488nm), He-Ne rood (646nm), en He-Ne groen (532nm) en UV diode.
- Selecteer de excitatie lasers afhankelijk van de golflengte van de fluorescente kleurstoffen te worden opgewekt (He-Ne rood voor Cy5, CD 11 b, He-Ne groen voor Alexa546, CD68 en UV diode Hoechst, kernen).
- Selecteer de beste dichroïsche spiegel combinatie voor lichte collectie signaal.
- Opgezet beeldresolutie met een minimum van 800 x 600 pixels.
- Identificeer een gebied van belang met behulp van epi-fluorescentie en geleidelijk verhogen van de vergroting van de 40X doelstelling.
- Schakel over naar laser scanning microscopie (LSM) modaliteit.
- Run herhaalde scans om de photomultiplier (PMT) en de versterking voor elk kanaal. Lasers kunnen afzonderlijk worden ingeschakeld om de set-up te vergemakkelijken. Houd versterking zo laag mogelijk ongewenste niet-specifieke signalen te voorkomen.
- Met Repeonderhevige scan uitgevoerd, verplaats de focusbesturing lagere en hogere uitersten van de z-as (totale lengte z-as = 10 pm) te definiëren.
- Stop repetitieve scan.
- Definieer stapgrootte. Het moet zo dicht mogelijk bij pixelgrootte (0.225 urn) een standaard formaat 01:01 verhouding te verkrijgen over de z-as zijn.
- Activeer Kalman filter minstens 2 keer.
- Activeer sequentiële scan mode te bloeden-through effecten te vermijden.
- Ga halverwege langs de z-as en uitvoeren van een xy sequentiële scan. Controleer de set-up van PMT en versterking (goede signaal / ruisverhouding). Zo niet bevredigend is, herhaal dan stap 2.6.
- Run xyz overname.
- Gegevens als multitiff bestand exporteren. Elke multitiff bestand bevat meestal 3 kleurkanalen (blauw, groen en rood) en 44 focale vliegtuigen.
3. Drie-dimensionaal beeld van confocale Acquisities en Driedimensionale Rendering
Upload multitiff bestanden naar Imaris software en verwerken ze als volgt:
- Open software.
- Selecteer het overtreffen uitzicht.
- Upload het multitiff bestand.
- Selecteer de gewenste kleur voor elk kanaal.
- Verwijder ruis uit de achtergrond door het verhogen van de minimale waarde op het scherm aanpassen. Stel elk kanaal afzonderlijk.
- Ga naar de doorsnede. Bewegen langs de z-as zoekt co-lokalisatie (geel pixels).
- Klik op een geel gebied te zien of de colocalization onderhavige langs de z-as (dus behoort tot een voorwerp) is. Z-as projecties zijn zichtbaar in de rechter-en onderkant van de figuur.
- Neem een momentopname.
- Ga terug naar de weergave overtreffen.
- Gewas 3D een cel of een cluster van cellen te isoleren.
- Selecteer een kanaal op het scherm aanpassen.
- Selecteer het overtreffen / oppervlakken algoritme bouwer. Algoritme stappen:
- Selecteer kanaal.
- Definieer drempel (gebruik van dezelfde minimale waarde in thij aanpassing paneel weer te geven).
- Definieer resizen.
- Definieer smoothing (best = 0,200).
- Definieer kleurweergave.
- Eindigen algoritme.
- Herhaal stap 3.12 voor elk kanaal.
- Deselecteer fluorescentie kanalen op het scherm aanpassen en selecteer alle drie vlakken.
- Beweeg de volumeregelaar om het beste uitzicht te vinden.
- Neem een momentopname.