1. Arenavirus Rescue Transfection
Ons rescue was gebaseerd op het gebruik van zowel polymerase II eiwit expressieplasmiden die coderen voor de nucleoproteïne (NP) en RNA-afhankelijke RNA-polymerase (L), de virale trans-werkende factoren nodig zijn voor RNA-replicatie en genexpressie van de arenavirus genoom 7, 19 en plasmiden staat om directe intracellulaire synthese, via het cellulair RNA-polymerase I (pol-I), van de S en L antigenoom RNA species 7. In onze studies gebruiken we de pCAGGS eiwitexpressie plasmide, dat de kip β-actine promoter en polyadenylanation (pA) signaalsequenties gebruikt en de menselijke pol I-plasmide, dat het menselijke polymerase I promotor gebruikt en murine terminatorsequenties (figuur 2) . De S en L RNA segmenten worden gekloneerd in het plasmide HPOL-I in een antigenome oriëntatie om voor het genereren van genomische RNA segmenten bij transcriptie bij HPOL-I. Voor de redding van wild-type recombinant LCMV (rLCMV) en Candid # 1 (rCandid nr. 1) de pCAGGS NP en L van elk virus gecotransfecteerd met hun respectievelijke humane pol I-S en L RNA segmenten (Figuur 3). Generatie van recombinant trisegmented LCMV (r3LCMV) en Candid # 1 (r3Candid nr. 1) was dezelfde protocol maar de S segment werd opgesplitst in twee verschillende pol-I S plasmiden, coderen elk een onderscheidende reportergen: in een, de NP open reading frame (ORF) werd vervangen door het Green Fluorescent Protein (GFP) reporter gen (HPOL-I S GFP / GP) en, in de andere, de virale glycoproteïne precursor (GPC) ORF wordt vervangen Gaussia luciferase (Gluc) reportergen (HPOL-I S NP / Gluc). Een schematische weergave van het protocol is geïllustreerd in figuur 4. De volgende transfectie en infectie-protocol is vastgesteld voor 6-well-platen.
- OptiMEM-Lipofectamine 2000 (LPF2000) mengsel: Bereid 250 ul OptiMEM media en, afhankelijkhet virus te redden, 10-12 ug LPF2000 (1 ug / ul) per transfectie (tabel 1). Een verhouding van 2,5 ug LPF2000 per ug DNA wordt aanbevolen. Incubeer gedurende 5-10 minuten bij kamertemperatuur. Bereid ondertussen het plasmide transfectie mengsel in een aparte microcentrifugebuis (stap 1.2).
- Plasmide-DNA transfectie mengsel: Bereid de plasmide transfectie cocktail in een microcentrifugebuis met de aanbevolen hoeveelheden voor elk virus rescue (zie tabel 1). Breng het uiteindelijke volume tot 50 pi met OptiMEM.
- OptiMEM-LPF2000 plasmide-DNA mengsel Voeg 250 ul van de OptiMEM-LPF2000 mengsel (stap 1.1) in het plasmide DNA transfectie mengsel (stap 1.2). Incubeer het mengsel gedurende 20-30 minuten bij kamertemperatuur. Ondertussen bereiden en tel 1 x 10 6 Vero-cellen per transfectie reactie. Vero-cellen worden getransfecteerd in suspensie.
- Bereiding van Vero cellen: Vero cells worden gekweekt in 100 mm gerechten. Breng alvorens te beginnen de 1x PBS, DMEM 10% FBS 1% PS media, en trypsine-EDTA mengsel tot 37 ° C.
- Was de cellen tweemaal met 5 ml 1x PBS.
- Trypsinize cellen met 1 ml trypsine-EDTA en wacht tot cellen detach (ca. 5 min). Zacht tikken misschien nodig om volledig te verwijderen van de cellen van de gerechten.
- Voorzichtig resuspendeer de cellen in 10 ml DMEM 10% FBS 1% PS in een 15 ml centrifugebuis.
- Centrifugeer de cellen gedurende 5 minuten bij 1000 rpm in een centrifuge.
- Resuspendeer de cellen in 10 ml DMEM 10% FBS en 1% PS tellen van de cellen met een hemocytometer en concentratie passen aan 1 x 10 6 cellen / ml. Er werd waargenomen dat 0,5-1 x 10 6 cellen per transfectie Vero de beste resultaten.
- Meng LPF2000/DNA en cellen: Na 20 - 30 minuten incubatie bij kamertemperatuur (stap 1.3), voeg 1 ml van Vero-cellen (1 x 10 6) (stap 1.4) naarde OptiMEM-LPF2000 plasmide-DNA mengsel en incubeer gedurende 5 minuten bij kamertemperatuur.
- Seed LPF2000/DNA-cell mengsel in 6-well-platen: Voeg de DNA-LPF2000 Vero-mengsel (stap 1.5) in de putjes van de 6-well plaat. Schud de 6-well-plaat en laat de transfectie incubeer overnacht in de incubator bij 37 ° C en 5% CO 2.
- Wijzig transfectiemedium: Ongeveer 16-24 uur na transfectie, verwijder de transfectie media, voeg 2 ml van de infectie media en incubeer getransfecteerde cellen voor een extra 48 uur.
- Celpassage: Na 48 uur incubatie in infectie media, verwijder de weefselkweeksupernatant (TCS) en passeren de getransfecteerde cellen in een 100 mm schaal. De TCS bevat zelden besmettelijk virus, omdat de getransfecteerde cellen nodig aanvullende incubatie om virusdeeltjes te genereren. Voor de passage cel:
- Was de cellen tweemaal met 2 ml 1x PBS.
- Trypsinize cellen w ide 0,5 ml trypsine-EDTA en wacht tot cellen los.
- Resuspendeer de cellen in 1 ml DMEM 10% FBS 1% PS in een 1,5 ml microcentrifugebuis.
- Centrifugeer de cellen gedurende 5 minuten bij 5000 rpm, 4 ° C in een microcentrifuge.
- Resuspendeer voorzichtig de cellen in 1 ml van infectie media en overbrengen van de cellen naar een 100 mm schaal. Breng het totale volume van de plaat, met besmettelijke media, 8 ml, voldoende volume om uitdroging te voorkomen van de cellen en voor het concentreren van het virus.
- Schud de 100 mm schaal en verder het incuberen van Vero-cellen in de incubator bij 37 ° C en 5% CO2 gedurende 72 uur.
- Collectie van TCS: Na 72 uur incubatie, het verzamelen van de TCS in een 15 ml centrifugebuis. Verwijder celresten door centrifugeren gedurende 5 min bij 2500 rpm in een centrifuge. Infectieuze arenavirus wordt gevonden in de TCS, zodat uit de celresten pellet en opslaan TCS bij -80 ° C.
le ". Bevestiging van Recombinant arenavirus Rescue> 2
Detectie van een succesvolle redding van rLCMV en rCandid # 1 geschiedt via een focus-vormende eenheid (FFU) immunofluorescentie assay (IFA). Voor wild-type virus rescue gebruiken we antilichamen specifiek voor de virale NP. De r3LCMV en r3Candid nr.1 coderen twee reportergenen (GFP en Gluc), waardoor virale detectie en titratie zonder de noodzaak van antilichamen door fluorescentiemicroscopie (GFP) en / of luminescentie (Gluc).
- Bevestig wild-type recombinante arenavirus rescue: De dag vóór titratie, wassen Vero-cellen tweemaal met PBS, trypsinize en bereiden 96-well platen tot 80 te bereiken - 90% samenvloeiing volgende dag (4 x 10 4 cellen / putje). Schud de platen met de hand om een geüniformeerde verdeling van de cellen te krijgen. Cultuur van de cellen een nacht in de 37 ° C incubator met 5% CO2. Controleer de cellen onder de microscoop om een monolaag te bevestigen, alvorens verder te gaan met de infectie:
- Serieel verdund (10 voudige verdunningen) de virus-bevattende TCS gewonnen uit de getransfecteerde cellen in de 100 mm schaal (stap 1.10) in OptiMEM.
- Verwijder het afdrukmateriaal uit de gezaaide Vero-cellen, wassen tweemaal met 50 pi 1x PBS, en infecteren cellen met 50 ul van de serieel verdund virus (stap 2.1). Infecteren cellen gedurende 1,5 uur bij 37 ° C en 5% CO2.
- Na infectie, verwijder de virusinoculum, voeg 100 ul van infectie media / putje en incubeer de cellen voor 16 - 18 uur. Virale re-infectie kan optreden na 18 uur incubatie, wat kan leiden tot overschatting van de virale titers.
- Bij 16 - 18 uur na infectie, verwijder de TCS van elk putje en zet de cellen met 4% formaldehyde opgelost in 1 x PBS, gedurende 15 minuten bij kamertemperatuur.
- Vervolgens verwijdert de fixeeroplossing en doorlaatbaar de cellen met 0,1% triton X-100 verdund in 1 x PBS, gedurende 10 minuten bij kamertemperatuur.
- Zuig het permeabilisatie oplossing, daarna wassen cellen 3 maal with 1x PBS.
- Blokkeer de cellen met 2,5% runderserum albumine (BSA) in 1x PBS (blokkerende oplossing) gedurende 1 uur bij kamertemperatuur. Als alternatief kunnen de cellen worden overnacht bij 4 ° C geblokkeerd en voortgezet met antilichaam incubatie de volgende dag.
- Maak ondertussen het primaire antilichaam. Verdun de LCMV-en Candid # 1-specifieke primaire antilichamen in blockingbuffer en centrifugeer de antilichaam / blokkerende oplossing gedurende 15 minuten bij 3.500 rpm. De monoklonale anti-LCMV NP antilichaam kloon 1.1.3 (1:30 verdunning) 16 en de monoklonale anti-JUNV NP antilichaam SA02-BG12 van BEI Resources (1:500 verdunning) kan worden gebruikt voor de detectie van rLCMV en rCandid nr.1 respectievelijk.
- Na 1 uur incubatie, zuigen de blockingbuffer en voeg 50 ul van het primaire antilichaam aan de cellen en incubeer 1 uur bij 37 ° C.
- Op dit moment Verdun het secundaire antilichaam in blockingbuffer en centrifugeer de antilichaam / blokkerende oplossing gedurende 15 minuten bij 3.500 rpm. De polyklonale konijn anti-muis IgG FITC tweede antilichaam voor de detectie van primaire monoklonale antilichamen werd gebruikt om beelden waargenomen in figuur 5 te verkrijgen.
- Na 1 uur incubatie zuig het primaire antilichaam, was 3 maal met 1 x PBS en voeg het secundaire antilichaam gedurende 30 minuten bij 37 ° C.
- Na 30 min incubatie, zuig het secundaire antilichaam en was 3 keer met 1x PBS. De cellen zijn nu klaar om te worden waargenomen met behulp van fluorescentie microscopie aan beide bepalen het succes van virale redding en titratie door het tellen van de focus eenheden per ml (FFU / ml).
- r3LCMV en r3Candid # 1 viral rescue: Omdat deze virussen uiten twee reporter genen, hun reddingen kunnen worden gecontroleerd met behulp van fluorescentie microscopie om GFP expressie of Gluc expressie in TCS detecteren. Rescue kan ook worden bevestigd door expressie van Gluc in TCS. Om de trisegmented virussen titreren, volgen we de stappen 2.1 tot en met 2.1.4, echter cellen hoeven niet te be bevestigd aan een succesvolle virale redding door GFP-expressie te bepalen. De titratie van het virus wordt bepaald door het tellen van de FFU / ml. Om succesvolle virale redding bepalen door Gluc expressie Gluc expressie van TCS kunnen worden gemeten met een Gluc assay kit (Biolux Gaussia Luciferase Assay kit, New England Biolabs). Daartoe:
- Pipet 100 ul van TCS in een 96-well witte plaat (Platbodem microtiterplaten, Fisher Scientific).
- Stel de lichtmeter (LumiCount, Packard Biosciences).
- Voeg 50-100 ul Gluc Assay oplossing (zoals aanbevolen door de fabrikant) aan elk monster en meet de Gluc reportergenexpressie met de luminometer. Als negatieve controle werd Gluc expressie van de TCS van de wildtype virussen geïnfecteerde cellen gemeten.
3. Passage van Tissue Culture Supematanten
Virale redding is afhankelijk van transfectie efficiëntie. Vero-cellen is aangetoondtot lagere transfectie efficiëntie dan andere cellijnen 14 hebben. Als virustiters in de TCS zijn laag, infecteren verse Vero-cellen bij een multipliciteit van infectie (MOI) van 0,01 (LCMV) of 0.1 (Spontaan # 1) voor 72 uur om het virus te versterken.