De meeste pathogene bacteriën zijn in staat om biofilms te vormen tijdens infectie, maar vanwege de moeilijkheid van het manipuleren en beoordelen van biofilms, wordt het overgrote deel van het laboratoriumwerk uitgevoerd met planktonische cellen. Hier beschrijven we een peg plate-biofilm-assay zoals uitgevoerd met Staphylococcus aureus. Bacteriële biofilms worden gekweekt op pinnen bevestigd aan een 96-wells microtiterplaatdeksel, gewassen door middel van zachte onderdompeling in buffer, en geplaatst in een drug challenge-plaat. Na verdere incubatie worden ze opnieuw gewassen en verplaatst naar een laatste herstelplaat, waarin de fluorescerende kleurstof resazurin dient als levensvatbaarheidsindicator. Deze assay biedt een veel grotere gebruiksgemak, betrouwbaarheid en reproduceerbaarheid, evenals een schat aan gegevens wanneer het wordt uitgevoerd als een kinetische lezing. Bovendien kan deze assay worden aangepast aan een medium-throughput drug screening-benadering waarbij een eindfluorescentie-uitlezing wordt gemaakt, wat een pad biedt voor drug discovery-inspanningen.