Een abonnement op JoVE is vereist om deze inhoud te bekijken. Log in of start vandaag met uw gratis proefperiode.

Methodenartikel

Gericht op biofilm geassocieerde

13.2K weergaven

DOI:

10.3791/53925

5 mei 2016

In dit artikel

Samenvatting

De meeste bacteriële infecties produceren een biofilm. Vanwege hun omgeving zijn biofilm-geassocieerde bacteriën vaak fenotypisch resistent tegen geneesmiddelen. Nieuwe antibacteriële moleculen die bacteriën in biofilms doden, hebben dus een hoge prioriteit. We stellen een test op om snel te screenen op antimicrobiële verbindingen die effectief zijn bij het uitroeien van biofilms.

Samenvatting

De meeste pathogene bacteriën zijn in staat om biofilms te vormen tijdens infectie, maar vanwege de moeilijkheid van het manipuleren en beoordelen van biofilms, wordt het overgrote deel van het laboratoriumwerk uitgevoerd met planktonische cellen. Hier beschrijven we een peg plate-biofilm-assay zoals uitgevoerd met Staphylococcus aureus. Bacteriële biofilms worden gekweekt op pinnen bevestigd aan een 96-wells microtiterplaatdeksel, gewassen door middel van zachte onderdompeling in buffer, en geplaatst in een drug challenge-plaat. Na verdere incubatie worden ze opnieuw gewassen en verplaatst naar een laatste herstelplaat, waarin de fluorescerende kleurstof resazurin dient als levensvatbaarheidsindicator. Deze assay biedt een veel grotere gebruiksgemak, betrouwbaarheid en reproduceerbaarheid, evenals een schat aan gegevens wanneer het wordt uitgevoerd als een kinetische lezing. Bovendien kan deze assay worden aangepast aan een medium-throughput drug screening-benadering waarbij een eindfluorescentie-uitlezing wordt gemaakt, wat een pad biedt voor drug discovery-inspanningen.

Inleiding

Pathogene bacteriën kunnen biofilms in vivo leidt tot niet-acute chronische infecties 1 vormen. Biofilm geassocieerde infectie is een ernstige risicofactor van medische procedures die de implantatie van vreemde voorwerpen (bijvoorbeeld kunstbot vervangingen, borstimplantaten) of de installatie van tracheale buizen of urine-katheters 2 te betrekken. In deze context, anti-infectieuze therapie is vrijwel altijd nodig als biofilm-gebaseerde infecties zelden gewist als zodanig, zelfs bij immuuncompetente individuen. Staphylococcus aureus is een van de meest voorkomende pathogenen betrokken in biofilm-gerelateerde complicati....

Toegang beperkt. Log in of start een proefperiode om deze inhoud te bekijken.

Protocol

1. Biofilm Initiatie

  1. Grow een cultuur van biofilm produceren organisme in een voedselrijke medium. Inoculeer Staphylococcus aureus stam Newman in 10 ml Mueller-Hinton medium uit een glycerol voorraad. Voer alle werkzaamheden waarbij het ​​hanteren van S. aureus met handschoenen en binnen een bioveiligheid kast.
  2. Incubeer gedurende 16 uur bij 37 ° C op een roterende schudinrichting (100-200 rpm).
  3. Bepaal de OD 600 van de cultuur met behulp van een spectrofotometer en een standaard cuvette (weglengte: 1 cm).
  4. Bereken het volume (V) van de cultuur om voorbereidende 20 ml inoculum bij OD 600 (entmate....

Toegang beperkt. Log in of start een proefperiode om deze inhoud te bekijken.

Resultaten

De resazurin test is gevoelig genoeg om zeer weinig levensvatbare cellen kan repliceren in drug vrij medium na challenge betrouwbaar detecteren. In deze methode, definiëren we de minimale biofilm uitroeiing concentratie als de laagste concentratie waarbij geen resazurin conversie waargenomen binnen 24 uur. De resazurin assay berust op oxidatieve moleculen gevonden in metabolisch actieve cellen die de kleurstof kleur omzetten van blauw naar roze. Kleurstof conversie is dus een indicatie v.......

Toegang beperkt. Log in of start een proefperiode om deze inhoud te bekijken.

Discussie

Hier beschrijven we een gemodificeerde biofilm gekwantificeerd door activiteit van geteste remmers op S. aureus biofilms gericht op de metabole toestand van biofilm geassocieerde cellen. Terwijl de beschreven biofilm initiatie en beroepsprocedures veelal nagebootste aanbevelingen van de fabrikant, het gebruik van Resazurin kleurstof-biofilm geassocieerde cellen die een 24-uurs-remmer uitdaging overleven detecteren en te kwantificeren vereenvoudigt volgens de methode van de cel herstel (via waterbad sonificatie).......

Toegang beperkt. Log in of start een proefperiode om deze inhoud te bekijken.

Openbaarmakingen

De auteurs hebben niets te onthullen.

Dankbetuigingen

We danken Saran Kupul voor de technische assistentie. Dit werk werd gedeeltelijk ondersteund door NIH-subsidie R01-AI104952 aan FW. Verdere ondersteuning werd verleend door het University of Alabama at Birmingham (UAB) Center for AIDS Research (CFAR), een door NIH gefinancierd programma (P30 AI027767) dat mogelijk werd gemaakt door de volgende NIH-instituten: NIAID, NIMH, NIDA, NICHD, NHLBI, NIA.

....

Toegang beperkt. Log in of start een proefperiode om deze inhoud te bekijken.

Materialen

Lijst van materialen gebruikt in dit artikel
NaamBedrijfCatalogusnummerOpmerkingen
 Mueller-Hinton MediumOxoidCM0405Volg de aanbevelingen van de fabrikant
RPMI-mediumCorning 17-105-CV
CRPMIRef 9RPMI-1640 medium chelexed gedurende 1 uur met Chelex 100 resin en vervolgens aangevuld met 10% onchelexed RPMI-1640
Chelex 100 ResinBio Rad142-2822
MBEC-platenInnovotech19111
Resazurin Sodium SaltSigmaR7017800 µg/ml in DI water     Filter steriel
Micro Plate Shaking Platform Heidolph Titramax 1000
Cytation 3 Plate ReaderBiotek
Gen5 softwareBiotekOpname en analyse van resazurin conversie
NeocuproineSigmaN1501 bereid 10 mM stock in 100% Ethanol, bewaar bij -80 ºC
Copper sulfateAcros Organics7758-99-8bereid een 100 mM stockoplossing in water, bewaar bij 4 ºC
Cu-NeocuproineZelf gemaaktGegenereerd door gelijke molariteiten van neocuproine en kopersulfaat te mengen. Mix werd verdund in CRPMI medium tot de gewenste concentratie.
GentamicinSigmaG3632-1G

Referenties

  1. Bjarnsholt, T., Ciofu, O., Molin, S., Givskov, M., Hoiby, N. Applying insights from biofilm biology to drug development - can a new approach be developed. Nat Rev Drug Discov. 12, 791-808 (2013).
  2. Song, Z., et al.

Toegang beperkt. Log in of start een proefperiode om deze inhoud te bekijken.

Herprints en machtigingen

Trefwoorden

Biofilmanalyseresazurine levensvatbaarheidpeg plaatmethodeantibioticasensitiviteitCRPMI mediumkinetische fluorescentiedrug challenge plaatbiofilmherstelmicroplaatlezer