Een abonnement op JoVE is vereist om deze inhoud te bekijken. Log in of start vandaag met uw gratis proefperiode.

Methodenartikel

Een hele berg

8.7K weergaven

DOI:

10.3791/53968

15 maart 2016

In dit artikel

Samenvatting

Het doel van dit protocol is om gebruikers een reeks methoden te bieden voor de hoogwaardige decapsulatie van Lymnaea stagnalis embryo's en larven ter voorbereiding op gehele berging in situ hybridisatie, en voor daaropvolgende pre- en post-hybridisatie behandelingen.

Samenvatting

Ganse berg in situ hybridisatie (WMISH) is een techniek die het mogelijk maakt voor de ruimtelijke resolutie van nucleïnezuurmoleculen (vaak mRNA) binnen een 'hele mount' het prepareren van weefsels of ontwikkelingsstadium (zoals een embryo of larve) van belang. WMISH is zeer krachtig omdat het aanzienlijk kunnen bijdragen tot de functionele karakterisatie van complexe metazoïsche genomen, een uitdaging die steeds meer een knelpunt wildgroei aan volgende generatie sequentiegegevens. Ondanks de conceptuele eenvoud van de techniek veel tijd vaak nodig om de verschillende parameters die inherent zijn aan WMISH experimenten nieuwe model te optimaliseren; subtiele verschillen in de cellulaire en biochemische eigenschappen tussen soorten weefsels en ontwikkelingsstadia dat één WMISH methode niet voor alle situaties. We hebben een set van WMISH methoden voor het opnieuw opkomende gastropod model poelslak die consistent genereren en ontwikkeldduidelijke WMISH signalen voor een reeks van genen, en in alle ontwikkelingsstadia. Deze werkwijzen zijn het inbrengen van larven van onbekende chronologische leeftijd een ontogenetische venster, het effectief verwijderen van embryo's en larven uit hun ei capsules, de toepassing van een geschikte proteïnase-K behandeling voor elk ontogenetische raam en hybridisatie, post-hybridisatie en immunodetectie stappen. Deze werkwijzen verschaffen een basis van waaruit het resulterende signaal voor een bepaald RNA-transcript verder verfijnd met probe specifieke aanpassingen (voornamelijk probe concentratie en hybridisatietemperatuur zijn).

Inleiding

Weekdieren zijn een groep van dieren die het belang van een brede diversiteit aan wetenschappelijke disciplines te houden. Ondanks hun morfologische diversiteit 1, soortenrijkdom (tweede alleen voor de geleedpotigen in termen van soorten nummer 2) en relevantie voor een breed scala aan commerciële 3, 4 medische en wetenschappelijke kwesties 5-8, zijn er relatief weinig weekdieren soorten die aanspraak kunnen maken op zowel goed uitgerust wetenschappelijke modellen en onderhoudsvriendelijk in een laboratoriumomgeving. Een weekdier dat veel wordt gebruikt door disciplines zoals de neurobiologie 9, ecotoxicologie 10 en meer recentelijk de evolutionaire biologie 11,12, is poelslak, vooral vanwege de grote verspreiding en extreme gemak van onderhoud. Ondanks zijn populariteit als een 'model' organisme en zijn lange geschiedenis van gebruik door ontwikkelingsstoornissen biologen 13-19, het bereik en de kracht van moleculaire technieken beschikbaar om de L. stagnalis wetenschappelijke gemeenschap ligt ver achter bij die van de meer traditionele diermodellen (Drosophila, muis, zee-egels, nematoden).

Onze wens om Lymnaea ontwikkelen als een moleculair model komt voort uit een belang in de moleculaire mechanismen die shell vorming leiden. Dit motiveerde ons om een reeks technieken die het mogelijk maken voor de efficiënte, consistente en gevoelige visualisatie van genexpressie tijdens de ontwikkeling Lymnaea 's te verfijnen. Ganse berg in situ hybridisatie (WMISH) wordt op grote schaal gebruikt voor een verscheidenheid van model organismen en is in gebruik voor meer dan 40 jaar 20. In de verschillende gedaanten kan ISH worden gebruikt om ruimtelijk lokaliseren specifieke loci op chromosomen, rRNA, mRNA en micro-RNAs.

Een van de uitdagingen die we nodig hadden aan te pakken voorafgaand aan het verfijnen van een WMISH methode voor L. stagnalis was de kwestie van voorzichtig en efficiënt extraheren van embryo's en larven van verschillende stadia van tHij eikapsels waarin ze zijn gesteld. Deze extractie of "decapsulation", efficiënt moet worden bereikt om voldoende materiaal te verzamelen voor een bepaald experiment in situ, terwijl tegelijkertijd handhaven morfologische en cellulaire integriteit. Terwijl andere model organismen ook ingekapselde ontwikkeling ondergaan, in onze handen geen van de gerapporteerd voor deze soorten methoden kunnen worden met succes toegepast bij L. stagnalis.

De algemene doelstellingen van deze methode zijn dan ook: te extraheren L. stagnalis embryo's en larven van de capsules in een high-throughput fashion, pre-hybridisatie behandelingen die de WMISH signaal optimaliseren, embryo's en larven te bereiden met bevredigende WMISHsignals voor beeldvorming toegepast.

Toegang beperkt. Log in of start een proefperiode om deze inhoud te bekijken.

Protocol

LET OP: De volgende stappen schets onze methode voor het uitvoeren van een in situ experiment op de embryonale en larvale stadia van L. stagnalis. Wanneer een stap omvat het gebruik van een gevaarlijk chemisch dit wordt aangegeven door het woord 'LET OP' en de nodige veiligheidsprocedures moeten worden aangenomen. Links naar representatieve MSDS sheets voor gevaarlijke chemische stoffen zijn opgenomen in aanvullend bestand 1. Recepten voor alle reagentia zijn aanwezig bij het ​​tweede Aanvullend File 2.

1. Vergadering van decapsulation Apparatus

  1. Hiertoe sluit een 20 ml wegwerpspuit te siliconenslang (met een binnendiameter van 1 mm en een buitendiameter van 3 mm) met een P1,000 tip gesneden tot een geschikte lengte zoals getoond in figuur 2A.
  2. Tape een standaard microscoop dia naar een omgekeerde grote petrischaal. Tape de siliconenslang direct naast het microscoopglaasje zie figuur60; 2C en 2D.
  3. Rusten getrokken glas naald op de microscoop glijbaan en steekt hem voorzichtig in het silicium slang totdat de punt van de naald steekt ongeveer 20% van de weg over de binnendiameter van de buis (zie figuur 2C en 2D). Zodra de naald in positie tape het naar beneden naar de petrischaal.
  4. Laat het vrije uiteinde van de siliconenslang te rusten in een petrischaal die de decapsulated materiaal verzamelt.

2. Sample Collection, Fixatie en decapsulation

LET OP: Alle stappen worden uitgevoerd bij kamertemperatuur uitgevoerd, tenzij anders vermeld.

  1. Verzamel zorgvuldig ei strings van de muren van een aquarium. Om dit te doen, gebruik dan een vlak stuk van flexibele kunststof als een spatel om het ei koord uit de ondergrond te schrapen, en gebruik een plastic theezeefje naar de drijvende ei snaar te vissen uit het water. Fase en het materiaal onder een microscoop met de geleider verschaft in figuur sorteren1.
  2. Leg het ei koord op een papieren handdoek en maken een longitudinale incisie langs het ei massa met behulp van de vedergewicht tang. Rol het ei capsules uit het ei string en verwijder zoveel mogelijk van de jelly materiaal mogelijk uit elke capsule door ze rond de papieren handdoek met behulp van de vedergewicht tang.
  3. Met de vedergewicht tang, overdracht van de eikapsels in een petrischaal met 5 ml leidingwater. Doorgaan met-de jellied ei capsules van de gewenste ontwikkelingsstadia verzamelen in dit gerecht. Verzamel genoeg capsules uit alle ontwikkelingsstadia van de geplande WMISH experiment ga dan naar de volgende stap.
  4. Bij het werken met meer ontwikkelde larven (5 dagen na de eerste splitsing (dpfc) en ouder) verdoven hen voorafgaand aan de fixatie.
    OPMERKING: Hiermee wordt voorkomen dat de spieren van de aanbestedende waarvan de interpretatie van in situ kleurpatronen erg moeilijk maakt.
    1. Relax larven (terwijl ze nog in hun capsules) in een 2% w / v oplossing van MgCl2 • 6H 2 O 30 minuten voor fixatie.
    2. Beoordeel de mate van ontspanning na 30 min door onderdompeling een aantal larven terwijl nog in hun ei capsules in fixerende oplossing en het toezicht op hun reactie onder een microscoop. Onvolledig ontspannen larven in te schuiven in hun schelpen, terwijl volledig ontspannen larven niet zullen reageren. Zodra deze larven zijn versoepeld doorgaan naar de volgende stap.
  5. Breng de eikapsels met een wijde boring plastic pipet in een afsluitbare buis die 10 maal het volume van eikapsels verschaft (bijv., Zou 1 ml van vaste capsules een 10+ ml tube vereist).
  6. Aspireren zoveel mogelijk vloeistof uit de buis en vervangen door een volume fixatief oplossing die 10x de hoeveelheid vaste eikapsels. Voorzichtig zwenken de eikapsels in fixeermiddel bij kamertemperatuur gedurende de geschikte tijd voor elke ontwikkelingsfase (zie figuur 1).
  7. Discontinue rotatie en laat de capsules te zinken en zuig de fixerende oplossing in een geschikte afvalcontainer.
  8. Was het ei capsules door vervanging van de fixeeroplossing met fosfaat gebufferde zoutoplossing met 0,1% Tween-20 (PBTw) en roteren bij kamertemperatuur gedurende 5 min. Zuig het PBTw en tweemaal herhalen.
  9. Verwijderen embryo's en larven van de capsules met de inrichting (zie paragraaf 1 voor details) getoond in figuur 2. Trek de capsules tot in de 20 ml spuit, sluit de buis en verdrijven de capsules door de buis en voorbij de glazen naald uit in de collectie schotel.
    OPMERKING: Normaal moet de meerderheid (> 90%) van alle capsules slechts één doorgang door de inrichting nodig. In veel gevallen is de capsule membraan beschadigd maar embryo's en larven blijven in de gescheurde capsule. Opnieuw verwerken van dit materiaal door simpelweg het opstellen ervan in de spuit en opnieuw wegnemen het.
  10. Verzamel de decapsulated embryo's en larven in een 1,5 ml buis met behulp van een microfoonropipette (een P20 voor 0-3 dagen oude larven, en een P200 voor oudere larven met het einde van de tip afgesneden).
    OPMERKING: Een pauze (tot enkele maanden) het protocol kan in dit stadium. Indien dit vereist is, dient de decapsuled materiaal worden verzameld in een 1,5 ml buis voor opslag (verder met de volgende stap). Anders onmiddellijk blijven Protocol 3.
  11. Toestaan ​​embryo's en larven zinken naar de bodem van de buis en zuig de supernatant. Vervang met 33% ethanol (EtOH) in PBTw en laat zitten voor 5-10 min. Herhaal dit met 66% EtOH in PBTw en 100% EtOH. Wassen larven tweemaal in 100% EtOH bij kamertemperatuur. Bewaar het materiaal bij -20 ° C in 100% EtOH.
  12. Als u klaar bent om verder te gaan, opnieuw te hydrateren de monsters door het verwijderen van de 100% EtOH en te vervangen door 66% EtOH in PBTw, laat zitten voor 5-10 min. Herhaal dit met 33% EtOH in PBTw, laat zitten voor 5-10 min. Tot slot was met 3x 5 minuten wassen van PBTw te zorgen dat alle EtOH wordt verwijderd.

3. Proteinase-K, TEA en Post-fixation

LET OP: Wij vinden het uitvoeren van de volgende stappen in kleine manden met een maaswijdte vloer de meest efficiënte en zachte methode voor het snel uitwisselen van tijdkritische oplossingen. Hoewel deze woning kan worden gemaakt, maken we gebruik van manden (middelgroot) die compatibel zijn met de Intavis InSituPro -Vsi vloeistof handlingrobot (www.intavis.de/products/automated-ish-and-ihc) zijn. Dergelijke korven kunnen snel en gemakkelijk worden verplaatst tussen de putjes van een 12 putjes weefselkweekplaat (TCD), teneinde de uitwisseling oplossingen of de oplossing kan worden weggezogen uit de put met een pipet. Als alternatief kunnen alle oplossing beurzen worden uitgevoerd zonder deze manden door simpelweg de bovenstaande vloeistof uit de larven opzuigen. In dit geval zal een zachte draaibeweging alle embryo's en larven geconcentreerd naar het midden van de schaal waardoor de bovenstaande vloeistof van de rand van de put te verwijderen. De volgende gaat uit van de gebruiker is het gebruik van manden voor oplossing uitwisselingen.

  1. Met behulp van een pipet, Overdracht van embryo's en larven in een mandje zitten in een 12 goed TCD met 2 ml PBTw.
    Opmerking. Het aantal embryo's en / of larven die kan worden toegevoegd is afhankelijk van het ontwikkelingsstadium onderzocht, maar een algemene vuistregel is ten minste 25% van het vloeroppervlak zonder embryo / larven (dwz handhaven, niet overladen het mandje).
  2. Bereid een aangrenzend goed met 2 ml van het geschikte proteïnase-K-oplossing (zie figuur 1) en een 2 wells met 2 ml 0,2% Glycine elk. Beweeg elke mand in de put met de juiste concentratie van Proteïnase-K en meteen beginnen met timing.
  3. Na 10 min bewegen elk mandje in een putje met 0,2% glycine en incubeer gedurende 5 min. Ga dan elke mand in de tweede put met 0,2% Glycine en incubeer gedurende 5 min. Spoel de Glycine met 3x 5 min uitwisseling van 3 ml PBTw.
  4. Verwijder de PBTw oplossing en eenmaal de behandeling van de monsters met vers bereide Triethanolamine (TEA) solution gedurende 5 minuten LET OP! Niet schudden. Vervangen door 3 ml vers bereide TEA-oplossing gedurende 5 min. Niet schudden. Zuig het merendeel van de TEA-oplossing uit de monsters. Voeg de vers bereide Triethanolamine met azijnzuuranhydride (TEAAA) oplossing en incubeer gedurende 5 min. LET OP! Niet schudden.
  5. OPTIE - Terwijl de bovenstaande stap incubatie, bereiden een verse partij van TEAAA oplossing en herhaal de bovenstaande stap.
    LET OP: Deze tweede behandeling met TEAAA is optioneel, maar kan helpen om alle achtergrond met sondes gevoelig zijn voor het genereren van de achtergrond volledig te elimineren.
  6. Verwijder de TEAAA oplossing opzuigen uit de put en vervangen door 3 ml PBTw. Niet schudden. Verwijder de PBTw en 3 ml 3,7% formaldehyde toepassing PBTw. Zwenk af en toe tijdens een 30 minuten incubatie.
  7. Verwijder het fixeermiddel door opzuigen uit de put en vervangen door 3 ml PBTw. Breng het materiaal in een 1,5 ml buis. RVervang het PBTw de hybridisatie buffer en incubeer gedurende 5 minuten bij kamertemperatuur - Pas.
  8. Plaats de buizen in een heet blok bij kamertemperatuur en de temperatuur op de gewenste hybridisatietemperatuur.
    OPMERKING: De hybridisatietemperatuur is probe specifiek en moet empirisch worden geoptimaliseerd, maar vinden we 55 ° C een goede temperatuur initieel proces zijn. Laat het blok naar de hybridisatietemperatuur komen en laat de monsters vooraf hybridiseren gedurende ongeveer 15 minuten (dat wil zeggen, de tijd die nodig is om de riboprobes bereiden, langer is niet nodig). Bereid voldoende volumes (normaal 100 pl) van de verdunde riboprobes. Wij doorgaans proef probe concentraties van 100 en 500 ng / ml als een eerste reeks. We bereiden riboprobes volgens 12.
  9. Verwijder de hybridisatiebuffer uit de monsters en voeg de probe in hybridisatiebuffer aan de monsters. Overlay met 100 ui (of een voldoende volume om een ​​fase boven de hybridisatie buffe vormenr) minerale olie.
    OPMERKING: De minerale olie voorkomt uitgebreide condenswater dat tijdens de langdurige hybridisatiestap vormen. Uitgebreide condensatie aanzienlijk veranderen zowel de chemie van de hybridisatie oplossing en de concentratie van de probe.
  10. Denatureren de probe en het doel-RNA door het verwarmen van de monsters tot 75 ° C gedurende 10 minuten, dan het vuur de gewenste hybridisatietemperatuur. Sta hybridisatie doorgaan gedurende minimaal 12 uur (O / N) of meer (24-48 uur).
  11. Tijdens hybridisatie verwijderen van een enkele buis van de hitte blok, draai het snel tussen duim en wijsvinger aan de larven te schorten zonder de oliefase te verstoren, en te vervangen in de hitte blok. Herhaal dit eenmaal per 6-12 uur of zo.

4. Hot wast en Immunodetectie

LET OP: Terwijl we een vloeistof handlingrobot gebruiken voor de volgende stappen, kunnen deze ook gemakkelijk met de hand worden gedaan. In dit geval, embryo's en larven shoULD in 1,5 ml buisjes ze werden gehybridiseerd in bewaard. Alle volgende oplossing uitwisselingen worden opgezogen en toegevoegd met een pipet P1,000. Bij het handmatig uitgevoerd elk van de volgende stappen 1 ml van elke oplossing moet gebruiken.

  1. Warmte adequate volumina (3 ml elk per monster) van de 4x, 2x en 1x wasoplossingen de hybridisatietemperatuur.
  2. Was alle monsters driemaal 4x wasbuffer gedurende 15 min elk bij de hybridisatietemperatuur. Was alle monsters driemaal 2x wasbuffer gedurende 15 min elk bij de hybridisatietemperatuur. Was alle monsters driemaal in 1 x wasbuffer gedurende 15 min elk bij de hybridisatietemperatuur.
  3. Was alle monsters één keer met 1x natriumchloride Natriumcitraat buffer + 0,1% Tween (SSC + 0,1% Tween) aan de hybridisatie temperatuur. Sta monsters afkoelen tot kamertemperatuur.
  4. Was alle monsters tweemaal in 1x SSC + 0,1% Tween gedurende 15 min Vervang dit 1x SSC oplossing met maleïnezuur Buffer (MAB) en laat zitten voor 10 min Herhaal de MAB was. Vervang MAB met blok-oplossing en incubeer gedurende 1,5 uur.
  5. Wisselen het blok oplossing antilichaamoplossing (1: 10.000 verdunning van antilichaam in blokkeeroplossing) en incubeer 12 uur (O / N) bij kamertemperatuur onder zacht schudden.

5. Kleur Ontwikkeling en Montage

  1. Zuig het antilichaamoplossing en was 15 maal met PBTw gedurende 10 minuten elk. Vervang PBTw met 1x alkalisch fosfatase Buffer (AP) en incubeer gedurende 10 min.
  2. Terwijl de bovenstaande incubatie stap verloopt, de voorbereiding van de AP kleuroplossing (zie aanvullende File 2) - LET OP. Transfer van het materiaal in een TCD goed en vervang de 1x AP oplossing AP kleuroplossing. Noteer de tijd zodat de tijd dat de kleurreactie plaats te kunnen worden opgenomen. Bewaken van de ontwikkeling van het kleurpatroon tot de signaal achtergrond verhouding optimaal.
  3. Om kleur ontwikkeling te stoppen, verwijder de 1x AP kleuroplossing (afvoeren in de daarvoor bestemde waste container), en pas 2 ml PBTw en noteer de tijd. Spoel tweemaal met PBTw gedurende 5 minuten elk. Een van deze spoelingen om het materiaal in een 1,5 ml buis.
  4. Verwijder de PBTw en 1 ml 3,7% formaldehyde toepassing PBTw en schudden of roteren gedurende ten minste 30 minuten bij kamertemperatuur (dit kan ook O / N).
  5. Spoel het fixeermiddel met 3 wasbeurten van PBT (gooi het afval fixeermiddel in een geschikte afvalcontainer). Was de monsters 3 keer bij 50 ° C in gedeïoniseerd water.
    LET OP: Deze wasbeurten elimineren het neerslaan van zouten die tijdens het opruimen en visualisatie stappen zichtbaar kunnen worden.
  6. Beslis of de monsters in benzylbenzoaat worden gemonteerd Benzylalcohol (BB: BA, ook bekend als Murray wissen) of glycerol.
    LET OP: Wij verkiezen de meer krachtige clearing-agent BB: BA als L. stagnalis embryo's zijn enigszins ondoorzichtig. Monsters in BB worden gemonteerd: BA zal eerst moeten worden ontwaterd door middel van een ethanol-serie. Monsters 60% te monterenglycerol kunnen direct worden gemonteerd.
  7. Breng de monsters in de bevestigingsoplossing (BB: BA of 60% glycerol) met een pipet.
    LET OP: Bij montage in BB: BA dit moet gebeuren in een glazen goed (BB: BA zal polycarbonaat plastic smelten).
  8. Laat de monsters vrij te maken voor 5-10 min, en vervolgens zet ze op een dia met behulp van een geschikt aantal gestapelde dekglaasjes als afstandhouders (1 dekglaasje voor monsters <1 dpfc, 2 dekglaasjes voor monsters> 1 dpfc).
    LET OP: Whole mounts kan nu worden afgebeeld met behulp van een samengestelde microscoop met DIC optiek.

Toegang beperkt. Log in of start een proefperiode om deze inhoud te bekijken.

Resultaten

De representatieve WMISH kleurpatronen figuur 3 werden gegenereerd met behulp van de hierboven beschreven techniek, en geven verschillende ruimtelijke expressiepatronen van genen betrokken bij diverse moleculaire processen gaande van shell formatie (nieuw gen 1, 2, 3 en 4), tot cel-cell signaling (Dpp) om transcriptie regulatie (Brachyury) in een heel scala van ontwikkelingsstadia. Hoewel we niet de expressieniveaus van deze genen verw...

Toegang beperkt. Log in of start een proefperiode om deze inhoud te bekijken.

Discussie

De hier beschreven methode maakt de efficiënte visualisatie van RNA transcripten met vermoedelijk variërende expressieniveaus in alle ontwikkelingsstadia van poelslak. Embryo's en larven van de capsules te verwijderen we uitgetest diverse chemicaliën, osmotische shock en fysische behandelingen gerapporteerd voor andere encapsulated- het ontwikkelen van model organismen. In onze handen de hier beschreven werkwijze is het enige high-throughput techniek die de taaie capsulaire membraan verwijderd zonder bescha...

Toegang beperkt. Log in of start een proefperiode om deze inhoud te bekijken.

Openbaarmakingen

De auteurs hebben niets te onthullen.

Dankbetuigingen

Dit werk werd ondersteund door de financiering aan DJJ door de DFG-project # JA2108 / 2-1.

Toegang beperkt. Log in of start een proefperiode om deze inhoud te bekijken.

Materialen

```html
Lijst van materialen gebruikt in dit artikel
NaamBedrijfCatalogusnummerOpmerkingen
Featherweight forcepsEhlert & Partner#4181119
Silicon tubingGlasgerätebau OCHS GmbH760070
Glass capillariesHilgenberg1403547
12 well tissue culture dishesCarl RothCE55.1
37% FormaldehydeCarl RothP733.1VOORZICHTIG - Kankerverwekkend zijn. Giftig bij inademing, bij contact met de huid en als het wordt ingeslikt. Giftig: gevaar voor zeer ernstige onomkeerbare effecten door inademing, bij contact met de huid en als het wordt ingeslikt.
EthyleendiaminetetraazijnzuurCarl RothCN06.3VOORZICHTIG - KAN OOGIRRITATIE VEROORZAKEN. KAN IRRITATIES VAN DE ADEMHALING EN DE HUID VEROORZAKEN. Vermijd het inademen van stof. Vermijd contact met ogen, huid en kleding. Alleen gebruiken met voldoende ventilatie
MagnesiumchlorideCarl Roth2189.1
Tween-20Carl Roth9127.1VOORZICHTIG - Kan schadelijk zijn bij inademing. Kan irritatie van de luchtwegen veroorzaken. Kan schadelijk zijn bij opname door de huid. Kan huidirritatiem veroorzaken. Kan oogirritatiem veroorzaken. Kan schadelijk zijn bij inslikken.
NatriumchlorideCarl Roth3957.1
Ficoll type 400Carl RothCN90.1
polyvinylpyrrolidon K30 (MW 40)Carl Roth4607.1VOORZICHTIG - Kan schadelijk zijn bij inademing. Kan irritatie van de luchtwegen veroorzaken. Kan schadelijk zijn bij opname door de huid. Kan huidirritatiem veroorzaken. Kan oogirritatiem veroorzaken. Kan schadelijk zijn bij inslikken.
Nuclease-vrij bovien serumalbumineCarl Roth8895.1
ZalmbremCarl Roth5434.2
HeparineCarl Roth7692.1VOORZICHTIG - BIJWERKINGEN OMVATT BLOEDINGS, LOKALE IRRITATIE. MOGELIJK ALLERGISCHE REACTIE ALS GEÏNHAAL, GEÏNST/CONTACT. IRRITAANT VOOR OEGEN/HUID/ADEMHAALWEG. MOGELIJKE OVERGEVOELIGHED. TIJDENS ZWANGERSCHAP IS GERAPPORTEERD DAT HET HET RISICO VAN STILBORT VERHOOGT
Proteinase-KCarl Roth7528.1
GlycineCarl Roth3790.2
De-ioniseerd formamideCarl RothP040.1VOORZICHTIG - Irriterend voor ogen en huid. Kan schadelijk zijn bij inademing, bij contact met de huid en als het wordt ingeslikt. Kan schadelijk zijn voor de ongeboren baby. Hygroscopisch.
Standaard formamideCarl Roth6749.3VOORZICHTIG - Irriterend voor ogen en huid. Kan schadelijk zijn bij inademing, bij contact met de huid en als het wordt ingeslikt. Kan schadelijk zijn voor de ongeboren baby. Hygroscopisch.
TriethanolamineCarl Roth6300.1VOORZICHTIG - Vermijd het inademen van dampen of mist. Vermijd contact met de ogen. Vermijd langdurig of herhaald contact met de huid. Was grondig na gebruik.
AcetaanzuuranhydrideCarl Roth4483.1VOORZICHTIG - KAN ERNSTIGE HUID- EN OOGVERBRANDINGEN VEROORZAKEN. REAGEERT GEWELDIG MET WATER. SCHADELIJKE ALS GEÏNST. DAMP IRRITATIE VOOR DE OGEN EN DE ADEMHAALWEG
MaleïnezuurCarl RothK304.2VOORZICHTIG - Zeer gevaarlijk bij contact met de ogen (irriterend), bij inname, . Gevaarlijk bij contact met de huid (irriterend), bij inademing (longirritant). Licht gevaarlijk bij contact met de huid (permeator). Corrosief voor ogen en huid.
BenzylbenzoaatSigmaB6630-250MLVOORZICHTIG - Kan schadelijk zijn bij inademing. Kan irritatie van de luchtwegen veroorzaken. Kan schadelijk zijn bij opname door de huid. Kan huidirritatiem veroorzaken. Kan oogirritatiem veroorzaken. Schadelijk als ingeslikt.
BenzylalcoholSigma10,800-6VOORZICHTIG - Schadelijk als ingeslikt. Schadelijk bij inademing. Veroorzaakt ernstige oogirritatiem.
GlycerolCarl Roth3783.1
Blocking powderRoche11096176001
Anti DIG Fab fragmenten AP-geconjugeerdRoche11093274910
Tris-HClCarl Roth9090.3
4-Nitro blauw tetrazoliumboorchloride in dimethylformamide Carl Roth4421.3VOORZICHTIG - Kan schadelijk zijn voor de ongeboren baby. Schadelijk bij inademing en bij contact met de huid. Irriterend voor de ogen.
5-bromo-4-chloro-3-indolyl-fosfaatCarl RothA155.3VOORZICHTIG - Potentieel schadelijk bij inname. Niet op huid, in ogen of op kleding komen. Mogelijke huid- en oogirritant. 
N-acetylcysteïneCarl Roth4126.1
DithiothreitolCarl Roth6908.1VOORZICHTIG - Kan oog- en huidirritatiem veroorzaken. Kan irritatie van de luchtwegen en het spijsverteringskanaal veroorzaken. De toxicologische eigenschappen van dit materiaal zijn niet volledig onderzocht.
TergitolSigmaNP40SVOORZICHTIG - Kan schadelijk zijn bij inademing. Kan irritatie van de luchtwegen veroorzaken. Kan schadelijk zijn bij opname door de huid. Kan huidirritatiem veroorzaken. Kan oogirritatiem veroorzaken. Kan schadelijk zijn bij inslikken.
NatriumdodecylsulfaatCarl RothCN30.3VOORZICHTIG - Schadelijk als ingeslikt. Giftig bij contact met de huid. Veroorzaakt huidirritatie. Veroorzaakt ernstige oogbeschadiging. Kan irritatie van de luchtwegen veroorzaken.
KaliumchlorideCarl Roth6781.1

Referenties

  1. Smith, S. A., Wilson, N. G., Goetz, F. E., Feehery, C., Andrade, S. C. S., et al. Resolving the evolutionary relationships of molluscs with phylogenomic tools. Nature. 480 (7377), 364-367 (2011).
  2. Brusca, R. C., Brusca, G. J. Invertebrates. , Sinauer. Sunderland. (2002).
  3. Food and Agriculture Organisation of the United Nations. Global Aquaculture Production 1950-2013. , Available from: http://www.fao.org/fishery/statistics/global-aquaculture-production/query/en (2013).
  4. World Health Organization. Schistosomiasis: number of people treated in 2011. Week. Epi. Rec. 88, 81-88 (2013).
  5. Henry, J. Q., Collin, R., Perry, K. J. The slipper snail, Crepidula.: an emerging lophotrochozoan model system. Biol. Bull. 218 (3), 211-229 (2010).
  6. Perry, K. J., Henry, J. Q. CRISPR/Cas9-mediated genome modification in the mollusc, Crepidula fornicata. Genesis. 53 (2), 237-244 (2015).
  7. Kandel, E. R. The molecular biology of memory storage: a dialog between genes and synapses. Bio. Rep. 24, 475-522 (2004).
  8. Jackson, D. J., Ellemor, N., Degnan, B. M. Correlating gene expression with larval competence, and the effect of age and parentage on metamorphosis in the tropical abalone Haliotis asinina. Mar. Biol. 147, 681-697 (2005).
  9. Carter, C. J., Farrar, N., Carlone, R. L., Spencer, G. E. Developmental expression of a molluscan RXR and evidence for its novel, nongenomic role in growth cone guidance. Dev. Biol. 343 (1-2), 124-137 (2010).
  10. Rittschof, D., McClellan-Green, P. Molluscs as multidisciplinary models in environment toxicology. Mar. Pollut. Bull. 50 (4), 369-373 (2005).
  11. Liu, M. M., Davey, J. W., Jackson, D. J., Blaxter, M. L., Davison, A. A conserved set of maternal genes? Insights from a molluscan transcriptome. Int. J. Dev. Biol. 58 (6-8), 501-511 (2014).
  12. Hohagen, J., Herlitze, I., Jackson, D. J. An optimised whole mount in situ. hybridisation protocol for the mollusc Lymnaea stagnalis. BMC Dev. Biol. 15 (1), 19(2015).
  13. Raven, C. P. The development of the egg of Limnaea stagnalis. L. from oviposition till first cleavage. Arch. Neth. J. Zool. 1 (4), 91-121 (1946).
  14. Raven, C. P. The development of the egg of Limnaea Stagnalis. L. from the first cleavage till the troghophore stage, with special reference to its' chemical embryology. Arch. Neth. J. Zool. 1 (4), 353-434 (1946).
  15. Raven, C. P. Morphogenesis in Limnaea stagnalis. and its disturbance by lithium. J. Exp. Zool. 121 (1), 1-77 (1952).
  16. Raven, C. P. The nature and origin of the cortical morphogenetic field in Limnaea. Dev. Biol. 7, 130-143 (1963).
  17. Morrill, J. B., Blair, C. A., Larsen, W. J. Regulative development in the pulmonate gastropod, Lymnaea palustris., as determined by blastomere deletion experiments. J Exp Zool. 183 (1), (1973).
  18. Van Den Biggelaar, J. A. M. Timing of the phases of the cell cycle during the period of asynchronous division up to the 49-cell stage in Lymnaea. J. Emb. Exp. Morph. 26 (3), 367-391 (1971).
  19. Verdonk, N. H. Gene expression in early development of Lymnaea stagnalis. Dev. Biol. 35 (1), 29(1973).
  20. Gall, J. G., Pardue, M. L. Formation and Detection of Rna-Dna Hybrid Molecules in Cytological Preparations. Proceedings Of The National Academy Of Sciences Of The United States Of America. 63 (2), 378-383 (1969).
  21. Iijima, M., Takeuchi, T., Sarashina, I., Endo, K. Expression patterns of engrailed and dpp in the gastropod Lymnaea stagnalis. Dev Genes Evol. 218 (5), 237-251 (2008).
  22. Shimizu, K., Sarashina, I., Kagi, H., Endo, K. Possible functions of Dpp in gastropod shell formation and shell coiling. Dev Genes Evol. 221 (2), 59-68 (2011).
  23. Koop, D., Richards, G. S., Wanninger, A., Gunter, H. M., Degnan, B. M. D. The role of MAPK signaling in patterning and establishing axial symmetry in the gastropod Haliotis asinina. Dev. Biol. 311 (1), 200-212 (2007).
  24. Lartillot, N., Lespinet, O., Vervoort, M., Adoutte, A. Expression pattern of Brachyury in the mollusc Patella vulgata suggests a conserved role in the establishment of the AP axis in Bilateria. Development. 129 (6), 1411-1421 (2002).
  25. Jackson, D. J., Wörheide, G., Degnan, B. M. Dynamic expression of ancient and novel molluscan shell genes during ecological transitions. BMC Evol. Biol. 7 (1), 160(2007).
  26. Jackson, D. J., Meyer, N. P., Seaver, E., Pang, K., McDougall, C., et al. Developmental expression of COE. across the Metazoa supports a conserved role in neuronal cell-type specification and mesodermal development. Dev Genes Evol. 220, 221-234 (2010).
  27. Perry, K. J., Lyons, D. C., Truchado-Garcia, M., Fischer, A. H. L., Helfrich, L. W., et al. Deployment of regulatory genes during gastrulation and germ layer specification in a model spiralian mollusc. Dev. Dyn. , (2015).
  28. Iijima, M., Takeuchi, T., Sarashina, I., Endo, K. Expression patterns of engrailed and dpp in the gastropod Lymnaea stagnalis. Dev Genes Evol. 218 (5), 237-251 (2008).
  29. Shimizu, K., Iijima, M., Setiamarga, D. H. E., Sarashina, I., Kudoh, T., et al. Left-right asymmetric expression of dpp in the mantle of gastropods correlates with asymmetric shell coiling. EvoDevo. 4 (1), 15(2013).
  30. Christodoulou, F., Raible, F., Tomer, R., Simakov, O., Trachana, K., et al. Ancient animal microRNAs and the evolution of tissue identity. Nature. 463, (2010).
  31. Koga, M., Kudoh, T., Hamada, Y., Watanabe, M., Kageura, H. A new triple staining method for double in situ hybridization in combination with cell lineage tracing in whole-mount Xenopus embryos. Dev Growth Differ. 49 (8), 635-645 (2007).
  32. Lauter, G., Söll, I., Hauptmann, G. Two-color fluorescent in situ hybridization in the embryonic zebrafish brain using differential detection systems. BMC Dev. Biol. 11 (1), 43(2011).
  33. Davison, A., Frend, H. T., Moray, C., Wheatley, H., Searle, L. J., Eichhorn, M. P. Mating behaviour in Lymnaea stagnalis. pond snails is a maternally inherited, lateralized trait. Biol. Lett. 5 (1), 20-22 (2009).
  34. Kuroda, R., Endo, B., Abe, M., Shimizu, M. Chiral blastomere arrangement dictates zygotic left-right asymmetry pathway in snails. Nature. 462 (7274), 790-794 (2009).
  35. Shibazaki, Y., Shimizu, M., Kuroda, R. Body handedness is directed by genetically determined cytoskeletal dynamics in the early embryo. Curr. Biol. 14 (16), 1462-1467 (2004).
  36. Lu, T. Z., Feng, Z. P. A sodium leak current regulates pacemaker activity of adult central pattern generator neurons in Lymnaea stagnalis. PLoS One. 6 (4), e18745(2011).
  37. Dawson, T. F., Boone, A. N., Senatore, A., Piticaru, J., Thiyagalingam, S., et al. Gene Splicing of an Invertebrate Beta Subunit (LCav-beta) in the N-Terminal and HOOK Domains and Its Regulation of LCav1 and LCav2 Calcium Channels. PLoS ONE. 9 (4), e92941(2014).
  38. Smith, S. A., Wilson, N. G., Goetz, F. E., Feehery, C., Andrade, S. C. S., et al. Resolving the evolutionary relationships of molluscs with phylogenomic tools. Nature. 480 (7377), 364-367 (2011).
  39. Gregory, T. R., Nicol, J. A., Tamm, H., Kullman, B., Kullman, K., et al. Eukaryotic genome size databases. Nuc. Acids. Res. 35 (Database issue), D332-D338 (2007).

Toegang beperkt. Log in of start een proefperiode om deze inhoud te bekijken.

Herprints en machtigingen

Tags

Embryonale larvenpreparatieverwijdering van de eikapselProteinase K-behandelingclassificatie van ontwikkelingsstadiariboprobe-hybridisatievisualisatie van genexpressieontwikkelingsbiologische techniekenweekdier-modelssysteem