Dit protocol beschrijft een werkwijze voor het meten van de oxidatie van specifieke radioactief gemerkte substraten in volwassen Drosophila melanogaster. Deze techniek is eenvoudig kwantitatieve, reproduceerbare en gevoelige en vult het bestaande methoden de totale CO 2 productie en O 2 verbruik te meten omdat het kan worden gebruikt om de nutriënt (en) wordt geoxideerd ATP productie te identificeren.
Meting van CO2 vrijgemaakt uit de oxidatie van specifieke radioactief gemerkte substraten als hier beschreven is complementair aan technieken totale CO 2 productie te meten. Totale CO 2 productie (V CO2) maakt schatting van metabolisme en bij totale O2 verbruik (V O2) bekend is, kan de stofwisseling berekend en wordt de brandstof voor oxidatie kan worden geschat op basis van de respiratoire ruilverhouding (V CO2 / V O2 = RER). Wanneerkoolhydraten zijn de exclusieve substraat RER = 1, maar wanneer vetzuren zijn de enige bron, RER = 0,7, vanwege de stoechiometrie van de reactie van glucose en lipiden oxidatie. Aangezien apparatuur zuurstofverbruik in Drosophila 14 te meten, kan de oxidatieve brandstof niet worden geïdentificeerd. Echter, door labeling vliegt met sporen van een radioactief substraat of andere en meten van snelheden van radiolabeled CO 2 productie, kan men conclusies trekken over de mogelijkheid van vliegen naar een bepaald substraat op verschillende tijdstippen oxideren tijdens een stimulus of de effecten van een gegeven mutatie op brandstof oxidatie.
Er zijn een aantal kritische stappen in dit protocol. In de eerste plaats moet erop worden gelet bij het gebruik van radioactieve stoffen te morsen en verontreiniging van onderzoeksgebieden te voorkomen. Ten tweede, als verlamming vliegen tijdens de stappen 2.1 en 3.4, de experimentator moet snel werken om effecten van langdurige CO 2 te voorkomenexposure op de stofwisseling en het gedrag. Een groep van 20 vliegen worden verdoofd en overgebracht naar een nieuw flesje of in een vlieg pad in 20 seconden of minder. Wanneer overgebracht van een narcose apparaat aan een levensmiddel flacon, moet de flacon worden rustte op zijn kant om te voorkomen dat verdoofde vliegen vast komen te zitten op het voedsel oppervlak. Bij vliegen worden gevoed radioactief gemerkt voedsel in de loop van enkele dagen als in stap 2.2, moet de onderzoeker te verzekeren dat het voedsel niet uitdroogt hemelsbreed zijn gevoelig voor uitdroging.
De gevoede of nuchtere toestand voorafgaand aan de etikettering, de keuze van het label, de lengte van de etikettering van de tijd, de tijd in de vlieg pod, en de wijze van verdoving zijn parameters die kunnen worden onderworpen aan het oplossen van problemen en aanpassen bij het gebruik van deze techniek. Eerst, vliegen onderworpen aan korte perioden labeling (2-3 uur) geen wezenlijke hoeveelheden radioactief gemerkte voedsel consumeren tenzij onderworpen aan een vastenperiode vooraf. Ten tweede, de keuze van het label ceen invloed hebben op de conclusies is men in staat te stellen over metabole fenotypes. Bijvoorbeeld radiolabeled CO 2 productie van D- [1- 14C] glucose oxidatie kan via de citroenzuurcyclus of de pentosefosfaat shunt reflecteren, terwijl radiolabeled CO 2 productie van D- [6- 14C] glucose oxidatie weerspiegelt via de citroenzuurcyclus alleen 12,15,16. Toevoeren vliegen met een radioactief gemerkte tracer voor een essentieel aminozuur 17,18 zou een goede strategie voor het beoordelen oxidatie van aminozuren afgeleid van eiwitten. Tenslotte langdurig labelen met radioactief gemerkt glucose ook de mogelijkheid van opneming van deze precursor verhogen in andere klassen van moleculen zoals triglyceriden 19 en aminozuren zoals alanine, die gemakkelijk interconverts met pyruvaat. Dit kan worden bepaald door het meten van radioactiviteit ingebouwd in de verschillende klassen van moleculen 6. Inderdaad kunnen aparte cohorten vliegen worden gevoed radiolabeled substraten op dezelfde wijze en vervolgens gebruikt voor vlieg pod experimenten of meting van radiolabel die is opgeslagen en blijft in glycogeen en triglyceriden bij voeden als bij vasten 6, bijvoorbeeld. Een andere strategie is om korte periodes labeling die waarschijnlijk oxidatie van het radioactief gemerkte voedingsstoffen zelf en niet opslagvormen van deze voedingsstoffen bekend zijn gebruikt. Ten derde is het ook mogelijk dat twee groepen vliegen identieke snelheden van 14 CO 2 productie gedurende een bepaalde tijd, maar zeer uiteenlopende snelheid initieel kan hebben. Derhalve variëren van de hoeveelheid tijd die vliegt door in de vlieg pod kan een belangrijke parameter te wijzigen bij de beoordeling van fenotypische variatie. Ten slotte is dit protocol vraagt om het gebruik van een korte periode van CO 2 anesthesie bij het aantrekken vliegen in de vlieg pod apparaat. Het is mogelijk dat de CO 2 anesthesie metabolische functie kan beïnvloeden in de loop van de vlieg pod experiment. Een alternatieve eenAANPAK is om stikstof narcose die geen invloed heeft op de stofwisseling 20 gebruiken.
Zoals met elke techniek die een dergelijk complex systeem als brandstof oxidatie en stofwisseling meet de hier beschreven werkwijze heeft beperkingen. Ten eerste is het mogelijk dat vliegt in verschillende groepen kunnen verschillende hoeveelheden radioactief gemerkt voedsel consumeren en zou dus de CO 2 verzamelfase van de assay te gaan met verschillende uitgangsposities hoeveelheden substraat. Dit kan voor het tot op zekere hoogte worden gecontroleerd door het uitvoeren van het experiment met grote steekproeven en door het voeren van vliegen en masse. Voor korte periodes labeling, vliegt met vergelijkbare blauw gekleurde lef het radiolabel zal verbruikt hebben en kunnen zich aan de jacht deel van het experiment worden uitgevoerd. De resterende hoeveelheid in een groep vliegen radiolabel kan worden gemeten aan het eind van het experiment en in afzonderlijke cohorten vliegen na afloop van de voeding en de eerste uitwasperiode. Ten tweede, de activiteit tussengroepen van vliegen in de vlieg peulen kunnen verschillen. Dit moet proefondervindelijk worden bepaald en in aanmerking worden genomen bij het interpreteren van data. Ten derde, is deze techniek niet gemeten totale CO 2 productie, maar de productie van een bepaalde voedingsstof of de opslag vorm (s) van deze voedingsstof. Dit protocol is geen vervanging van maar een aanvulling op de metingen van VCO 2 omdat het verschillende en aanvullende informatie.
De hier beschreven methode meet uitgeademd, radiolabeled CO 2 die een product van de oxidatie van sporenhoeveelheden specifieke metabolische substraten. Door het variëren van het etiket - glucose, vetzuren of aminozuren - men steeds geavanceerdere experimenten de bijdragen van verschillende substraten metabolisme onder verschillende fysiologische omstandigheden, zoals honger en verschillende genetische achtergronden beoordelen ontwerpen. Toekomstige toepassingen van deze techniek omvatten meting van metabolism in het larvale en popstadium ontwikkelingsfasen twee fasen van de levenscyclus Drosophila die worden gekenmerkt door extreme nutriënt opslag en analyse, respectievelijk.