$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Enkele nucleotide polymorfisme (SNP), dat een enkele basepaar verschil in een DNA-sequentie, is een van de meest voorkomende genetische variaties. Huidige studies rapporteren dat SNPs geassocieerd met de ziekte risico, drug werkzaamheid en bijwerkingen van individuen door beïnvloeding genfunctie. 1,2 recent onderzoek is ook gebleken dat twee of meerdere puntmutaties (multi-nucleotide polymorfisme) bepaalde ziekte veroorzaakt en individuele verschillen in de effecten van de ziekte. 3.4 de detectie van nucleotide polymorfisme is daarom noodzakelijk in prescreening ziekte. Eenvoudige en efficiënte werkwijzen voor de snelle detectie van sequentie-specifieke oligonucleotiden werden sterk ontwikkeld in de laatste twee decennia. 1,5 Huidige benaderingen voor DNA-mutaties typisch procedures waaronder probe immobilisatie fluorescentie labeling, gelelektroforese, etc. identificeren betrekken 6,7 maar deze methoden vereisen over het algemeen een lange analytisch proces, uitgasive apparatuur, goed opgeleide technici, en een aanzienlijk verbruik van de monsters en reagentia.
Een nanodeeltjes met een grote verhouding van oppervlak tot volume en unieke fysisch-chemische eigenschappen is een ideaal materiaal als een zeer gevoelige en goedkope detectie platform voor specifieke biomarkers. Gouden nanodeeltjes (AuNP) worden veel gebruikt voor DNA detectie vanwege hun grote vermogen om te worden gemodificeerd met oligonucleotideprobes. 8-10 SNP detectie technieken werden ontwikkeld met AuNP. 11-13 In dit werk wij een nieuwe benadering voor de colorimetrische detectie aangenomen multi-nucleotide polymorfisme (MNP) door middel van DNA-hybridisatie-gemedieerde groei van AuNP probes. 14 Deze eenvoudige en snelle indringende methode is gebaseerd op de theorie dat verschillende lengten van enkelstrengs DNA (ssDNA) of dubbelstrengs DNA (dsDNA) geconjugeerd aan AuNP invloed op de groei grootte en vorm van de AuNP (zie figuur 1). 15 Deze methode van detectie DNAheeft een klein verbruik van reagentia, een kleine test periode (enkele minuten), en een eenvoudige procedure zonder temperatuurregeling die prospectief toepasbaar voor klinische diagnose en huishoudelijke medische screening.
Verscheidene microfluïdische systemen voor de DNA-sequentie te detecteren zijn ontwikkeld; 16 deze microfluïdische systemen geëvolueerd van traditionele experimentele protocollen vereist minder stukken grootschalige apparatuur en vereenvoudigde de testprotocollen teneinde de gevoeligheid, detectielimiet en specificiteit van de DNA verbeteren biosensor. DNA detectiemethoden in de microfluïdische systemen nog vereisen echter instrumenten van een volgend proces, zoals een PCR (polymerasekettingreactie) machine voor signaalversterking en een fluorescentie lezer voor een uitlezing van de heterogene SNP identificeren. 17,18 ontwikkelen van een eenvoudige platform zonder verdere verwerking direct uitlezen van de resultaten van de multi-nucleotide polymorfismeis zeer gewenst. Vergeleken met goed gebruikt, conventioneel, gesloten microfluïdische systemen, de open oppervlak microfluïdische inrichtingen verscheidene voordelen, zoals een heldere optische pad een eenvoudige toegang tot het monster, een rechtstreekse milieu toegankelijkheid en niet gemakkelijk gevormd cavitatie of grensvlak obstructie in bieden veelbelovend het kanaal. 19 Ons voorgaand onderzoek werd een eenvoudige pneumatische platform open oppervlak druppel manipulatie (zie figuur 2). 20 op dit platform, druppeltjes kunnen gelijktijdig worden getransporteerd en gemanipuleerd zonder inmenging van een aandrijfenergie via een zuigkracht die een heeft een groot potentieel in de biologische en chemische toepassingen. Deze pneumatische platform wordt aldus gebruikt voor de manipulatie van DNA-monsters uitgevoerd voor MNP detectie in combinatie met de colorimetrische benadering hand van het begrip van DNA-hybridisatie-gemedieerde groei van AuNP probes.
Het protocol in dit document beschrijfteen eenvoudige visuele detectie van multi-nucleotide polymorfismen op de pneumatische druppel manipulatie platform een open oppervlak. Dit werk bevestigd dat meerdere nucleotide polymorfisme detecteerbaar met het blote oog; de voorgestelde pneumatische platform is geschikt voor biologische en chemische toepassingen.