| Kurk | VWR Scientific | 23420-708 | Snijd in kleine vierkantjes met een scherp mes. |
| Kunststof coverslip | Fisher Scientific | 12-547 | Wordt gebruikt om de spier tijdens het bevriezen te oriënteren. |
| Lage temperatuur thermometer | VWR Scientific | 89370-158 | |
| 2-methylbutaan | Sigma | M32631-4L | Let op: gevaarlijke chemische stof. Bewaren in een brandbare kast. |
| Inbeddingshars: "cryomatrix" | Thermo Fisher Scientific | 6769006 | Andere inbeddingsharsen kunnen worden vervangen door cryomatrix. |
| Cryostat | Thermo Fisher Scientific | microm HM550 met wegwerp mesdrager | Elke werkende cryostat zou voldoende moeten zijn voor het protocol. |
| Wegwerp cryostatmes | Thermo Fisher Scientific | 3052835 | Gebruik een geschikt mes of mes voor de te gebruiken cryostat. |
| RNAse decontaminatieoplossing: "RNase Zap" | Thermo Fisher Scientific | AM9780 | |
| Analytische weegschaal | Mettler Toledo | XS64 | |
| Verfkwast | Daler Rowney | 214900920 | Gebruik om cryosecties te hanteren. Kan worden gevonden in winkels met eenvoudige kunstbenodigdheden. |
| Scheermesje | VWR Scientific | 55411-050 | |
| Microscoopglaasje | VWR Scientific | 48311600 | |
| RNA organische extractie reagens: TRIzol | Thermo Fisher Scientific | 15596026 | Let op: TRIzol is een gevaarlijke chemische stof. Opmerking: Alleen organische extractiereagentia worden aanbevolen voor RNA-extractie uit skeletspier. |
| 18 gauge naald | VWR Scientific | BD305185 | |
| 22 gauge naald | VWR Scientific | BD305155 | |
| 26 gauge naald | VWR Scientific | BD305115 | Optioneel. Kan worden gebruikt voor een derde ronde van monster trituratie in het RNA-extractieprotocol. |
| 1 ml spuit | VWR Scientific | BD309659 | Voor monsters met een zeer hoge waarde wordt een Luer-Lok-spuit aanbevolen (bijv. VWR BD309628). |
| 1-bromo-3-chloropentaan (BCP) | Sigma | B9673 | |
| Voor 70% ethanol in DEPC water: 200 proof alcohol | Decon Laboratories, Inc. | +M18027161M | Meng 35 ml 200 proof alcohol + 15 ml DEPC water. |
| Voor 70% ethanol in DEPC water: DEPC-behandeld water | Thermo Fisher Scientific | AM9922 | Meng 35 ml 200 proof alcohol + 15 ml DEPC water. |
| RNA zuiveringskit: PureLink RNA minikit | Thermo Fisher Scientific | 12183018A | Laatste stappen van RNA-voorbereiding. |
| DNase/Rnase-vrij water | Gibco | 10977 | DEPC-behandeld water kan ook worden gebruikt. |
| Spectrofotometer: Nanodrop 2000 | Thermo Fisher Scientific | NanoDrop 2000 | |
| Dnase I | Thermo Fisher Scientific | AM2222 | Behandel gezuiverd RNA om eventuele DNA-besmetting te verwijderen voor downstream toepassingen. |
| Hydrofobe pen | Thermo Fisher Scientific | 8899 | |
| Dulbecco's PBS | Gibco | 14190 | PBS voor immunofluorescence protocol. |
| Donkey serum | Jackson ImmunoResearch Laboratories, Inc | 017-000-121 | Rehydreer normaal donkey serum volgens de instructies van de fabrikant en verdun vervolgens een aliquot tot 5% voor immunofluorescence. Normaal geitenserum kan ook worden gebruikt. |
| eMHC antilichaam | University of Iowa Developmental Studies Hybridoma Bank | F1.652 | |
| Collageen VI antilichaam | Fitzgerald Industries | #70R-CR009x | |
| Donkey anti-konijn AlexaFluor488 | Thermo Fisher Scientific | A21206 | |
| Geit anti-muis IgG1 AlexaFluor546 | Thermo Fisher Scientific | A21123 | |
| DAPI (4',6-diamidino-2-fenylindol) | Thermo Fisher Scientific | D1306 | |
| Waterige montage media: Permafluor | Thermo Fisher Scientific | TA-030-FM | Gebruik alleen montage media die zijn ontworpen voor fluorescerende toepassingen met anti-fade eigenschappen. |
| Glazen coverslip | VWR Scientific | 16004-314 | Gebruik voor het monteren van dia's aan het einde van het immunofluorescentieprotocol |
| Beeldanalysesoftware: ImageProExpress | Media Cybernetics, Inc. | Image-Pro Express, of meer geavanceerde producten | Freeware ImageJ zou ook moeten werken voor handmatige telling. Meer geavanceerde software met segmentatiemogelijkheden kan gedeeltelijke automatisering van het proces mogelijk maken; bijv., ImageProPremier. |
| Sectieafbeeldingen samenvoegen en in kaart brengen: Photoshop | Adobe | Photoshop | |
| Cardiotoxine | Sigma | C9659 | Sigma C9659 is stopgezet. Andere opties voor cardiotoxine zijn EMD Millipore #217503; American Custom Chemicals Corp. # BIO0000618; of Ge Script # RP17303; maar deze zijn niet gevalideerd. |
| reverse transcriptiekit: Superscript III First-strand synthese systeem | Thermo Fisher Scientific | 18080051 | Elke gevalideerde, hoogwaardige reverse transcriptie reagens kan worden gebruikt. |
| Standaard PCR: GoTaq Flexi polymerase systeem | Promega | M8298 | Elk gevalideerd, hoogwaardig Taq polymerase systeem kan worden gebruikt. Als DNA-sequencing moet worden gebruikt voor enige toepassing stroomafwaarts van de PCR, dan moet een hoog nauwkeurigheid PCR-systeem worden gebruikt in plaats daarvan. |
| SYBR groen | Thermo Fisher Scientific | S7585 | Voor gebruik in qPCR wanneer geen specifiek qPCR mastermix wordt gebruikt. Gebruik met SuperROX (voor Applied Biosystems instrumenten) en GoTaq Flexi polymerase en buffers. |
| ROX: SuperROX, 15 mM | BioResearch Technologies, Inc. Novato CA | SR-1000-10 | SuperROX is stabieler in de PCR-reactie, dus het wordt bij voorkeur gebruikt als een qPCR passieve referentiekleurstof over ROX (carboxy-X-rhodamine). Voor qPCR met Applied |