Alle experimentele procedures werden uitgevoerd met de goedkeuring van de ethiek en verzorging van dieren commissies van Homburg University Medical Center.
1. Voorbereiding van Materialen en Buffers
- Vers voor te bereiden alle buffers die nodig zijn voor de lever spijsvertering met steriele componenten en een laminaire kap om bacteriële besmetting te voorkomen.
- Bereid de collectie buffer (CB) door mengen 49,5 ml RPMI medium en 0,5 ml foetaal runderserum (FBS, laag endotoxine, geïnactiveerd) aan een oplossing 1% (v / v) te bereiken. Bewaar de oplossing op ijs tot verder gebruik.
OPMERKING: Ongeveer 25 ml CB moet een gehele lever verteren. - Bereid de digestie buffer (DB) met de volgende ingrediënten: RPMI-medium, 1% (v / v) FBS (laag endotoxine, hitte geïnactiveerd), collagenase P (0,2 mg / ml), DNase-I (0,1 mg / ml) en dispase (0,8 mg / ml).
OPMERKING: Ongeveer 25 ml DB moet een gehele lever verteren. Pre-warm de DB in thij 37 ° C waterbad voor gebruik. - Reconstrueren de enzymen bij aankomst in Hanks 'gebalanceerde zoutoplossing (HBSS; collagense P en dispase) of DNase-I buffer (50% (v / v) glycerol, 1 mM MgCl2 en 20 mM Tris-HCl, pH 7,5) , aliquot het, en op te slaan bij -20 ° C. Bewaar de DNase I-buffer bij 4 ° C en gebruik het binnen twee maanden.
2. Voorbereiding van de lever Single-cell Suspension
- Euthanaseren onbehandeld wild-type muizen door cervicale dislocatie in overeenstemming met de lokale ethiek en verzorging van dieren commissies.
- Leg de muizen op een dissectie board en nat van de vacht met 70% ethanol. Met een schaar, opent de buik met een middellijn incisie van de huid, gevolgd door een Y-incisie aan de ledematen. Open het buikvlies tot aan het borstbeen met de schaar. Om de lever bloot te leggen, verplaatsen de darm voorzichtig naar rechts met een wattenstaafje.
- Met de hulp van een schaar en pincet, verwijder de lever lobben,het verlaten van de galblaas achter, en besmetting met bindweefsel te voorkomen. Weeg de lever en plaats het op het ijs in een petrischaal met HBSS.
- Plaats de lever lobben op een droge petrischaal en snijd de leverweefsel in homogene blokjes van ongeveer 2 mm een zij met behulp van een scalpel. Breng de stukken in een 15-ml conische centrifugebuis.
- Voeg 2,5 ml van DB naar de 15-mL conische centrifugebuis die de lever stukken en leg het in een 37 ° C waterbad om de spijsvertering te starten (een gezonde lever duurt 60-70 min en een levercirrose neemt 80-90 min ).
Opmerking: Als een gehele lever wordt verteerd, moet de lever worden gescheiden in twee 15-ml conische centrifugebuizen goede cellevensvatbaarheid waarborgen. - Bereid een nieuwe 15 ml conische centrifugebuis om vrijgelaten levercellen te verzamelen. Plaats een polyamide 100-um zeef bovenop de buis en bevochtig het gaas met 800 gl CB. Plaats de conische centrifugebuis op ijs.
- Meng de samples in het 37 ° C waterbad na 5 en 10 minuten om de spijsvertering te ondersteunen door schudden van de 15-ml conische centrifugebuis die de lever stukken.
- 15 minuten na het starten van de spijsvertering, meng de lever stukken met behulp van een 1000-ul pipet met een cut tip dat de lever stukken in staat stelt door middel van eenvoudig te passen. Plaats de buizen terug in het waterbad en laat de stukken te regelen voor 2 min.
- Verwijder de bovenstaande vloeistof met de verspreide cellen (meestal 2x 700 ui) en voeg deze toe aan de buis bereid in stap 2.6. Vervang de verwijderde bovenstaande vloeistof met DB (2x 700 pi) en plaats het terug in de 37 ° C waterbad.
- Herhaal de procedure in stap 2,8 (kenmerkend bij 30, 40, 50, 55 en 60 min) beschreven tot ongeveer 60-70 minuten sinds het begin van de spijsvertering doorgegeven. Vanaf 40 minuten verder, moet het resterende lever stukken klein genoeg om door middel van een ongesneden 1000-pi pipet tip door te geven.
LET OP: De gezonde lever is DIGEsted volledig binnen 60-70 min, terwijl fibrotische lever meestal nodig 80-90 min. Door dit tijdstip moet het leverweefsel niet zichtbaar op de conische 15 ml centrifugebuis die de lever stukken en alle uitgebrachte cellen worden overgebracht in de buis bereid in stap 2.6. - Aan het eind van de spijsvertering, het verzamelen van de cellen en centrifugeer ze gedurende 8 min bij 180 xg en 4 ° C (onder verminderde versnelling / vertraging en 4/2).
- Resuspendeer de celpellet in 1 ml ammonium- chloride-kalium (ACK) lysis buffer en incubeer gedurende 1 min bij kamertemperatuur om de rode bloedcellen te lyseren. Stop de reactie door toevoeging van 5 ml CB en centrifugeer de cellen gedurende 8 min bij 180 xg en 4 ° C (onder verminderde versnelling / vertraging en 4/2). Resuspendeer de cellen in 4 ml CB en bewaar ze op ijs. Tel de cellen, zoals beschreven in stap 3.
OPMERKING: De celpellet los, en daarom wordt de supernatant verwijderd gepipetteerd plaats van gedecanteerd.
3. Bepaling van het aantal cellen met behulp van flowcytometrie
Opmerking: Voor het bepalen van het aantal cellen of een geautomatiseerde celgetalmeter of, idealiter, wordt de doorstroomcytometrie-gebaseerde cel kwantificering hieronder voorgesteld in plaats van de klassieke Neubauer kamerstelsel methode. De lever eencellige suspensie in stap 2 beschreven bevat parenchym en niet-parenchymale cellen (NPC) met zeer verschillende afmetingen en granularities. De juiste uitsluiting van cellulaire resten met de gating-on voorwaartse verstrooiing, zijwaartse verstrooiing (FSC-SSC) kenmerkend NPC bij gebruik van stromingscytometrie zorgt het succes van de 12 beschreven protocol.
- Bereid een monster van de lever celsuspensie (20 ui) en voeg 174 ul van fosfaat gebufferde zoutoplossing (PBS) en 6 pl propidiumjodide (PI; eindconcentratie 0,375 ug / ml). Optellende parels die het mogelijk maken de kwantificering van de cellen.
- Gate aan SSC-A-FSC-A om vuil te voorkomen en verder sluiten doubletten behulp FSC-H en FCS-A.
NB: Het is belangrijk om de gating strategie weergegeven in figuur 2 te volgen. - Gate out PI-positieve dode cellen, het meten van 30 pi van uw monsters, en de gebeurtenissen vast te leggen. Volg de richtlijnen van de fabrikant om het aantal cellen te berekenen.
LET OP: Volg de stappen 4 voor flowcytometrie meting, stappen 5 en 6 voor magnetische gebaseerd voorlopercellen cel isolatie, en stap 7 voor flowcytometrie soort voorlopercellen subpopulaties.
4. kleuring van de lever Single-cell suspensie voor de Fow Cytometry Analyse van Progenitor subsets
| Antilichaam | Clone | Host / Isotype | Stock Concentratie [mg / ml] | Verdunning |
| CD64 | X54-5 / 7.1 | Mouse IgG1, κ | 0.5 | 1: 100 |
| CD16 / 32 | 93 | Rat IgG2a, λ | 0.5 | 1: 100 |
| CD45 | 30-F11 | Ratte IgG2b, κ | 0.2 | 1: 200 |
| CD31 | MEC13.3 | Rat IgG2a, κ | 0.5 | 1: 200 |
| ASGPR1 | | Polyklonaal Geit IgG | 0.2 | 1: 100 |
| podoplanin | 2001/01/08 | Syrische Hamster IgG | 0.2 | 1: 1400 |
| podoplanin | 2001/01/08 | Syrische Hamster IgG | 0.5 | 1: 1400 |
| CD133 | Mb9-3G8 | rat IgG1 | 0.03 | 3 pi |
| CD133 | 315-2C11 | rat IgG2a, λ | 0.5 | 1: 100 |
| CD34 | RAM34 | Rat IgG2a, κ | 0.5 | 1: 100 |
| CD90.2 | 53-2,1 | Rat IgG2, κ | 0.5 | 1: 800 |
| CD157 | BP-3 | Muis IgG2b, κ | 0.2 | 1: 600 |
| EpCAM | G8.8 | Rat IgG2a, κ | 0.2 | 1: 100 |
| Sca-1 | D7 | Rat IgG2a, κ | 0.03 | 10 pi |
| Muis IgG2b, κ | MPC-11 | | 0.2 | |
| rat IgG1 | RTK2071 | | 0.2 | |
| Ratte IgG2b, κ | RTK4530 | | 0.2 | |
| Rat IgG2a, κ | RTK2758 | | 0.5 | |
| Rat IgG2a, κ | RTK2758 | | 0.2 | |
| Syrische Hamster IgG | SHG-1 | | 0.2 | |
| Syrische Hamster IgG | SHG-1 | | 0.5 | |
| Normaal Geit IgG controle | | Polyklonaal Geit IgG | 1 | |
| Ezel anti-Geit IgG | | Donkey IgG | 2 | 1: 800 |
| streptavidine | | | 1 | 1: 400 |
Tafel 1.
| Antilichaam | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 |
| CD45 APC / Cy7 | Ratte IgG2b, κ 0,5 pl | + | + | + | + |
| CD31 biotine | + | Rat IgG2a, κ 0,5 pl | + | + | + |
| ASGPR1 gezuiverd | + | + | Normaal Geit IgG controle 0,2 pl | + | + |
| podoplanin APC | + | + | + | Syrische Hamster IgG 1 ui van een 1:14 verdunning | + |
| CD133 PE | + | + | + | + | rat IgG1 0,45 pi |
Ezel anti-Goat Alexa Fluor 488 | + | + | + | + | + |
streptavidine Alexa Fluor 405 | + | + | + | + | + |
Tafel 2.
- Plaats een hoeveelheid van de celsuspensie uit stap 2,11 in een reactiebuis (1,5 ml) dat 2,5 x 10 5 cellen, bepaald zoals beschreven in stap 3.
- Centrifugeer de cellen gedurende 3 min bij 300 xg en 4 ° C met behulp van een microcentrifuge.
OPMERKING: Op dit punt, kan een vacuümpomp worden gebruikt om voorzichtig de supernatant. - Resuspendeer de cel pellet in Fc-blok mix en incubeer het voor 5 minuten op ijs. Bereid Fc-blok mix met een totaal volume van 50 ul per vlek. Voeg 10 gl FcR-blokkerende reagens, 1 ul van gezuiverd anti-CD64 (1: 100; 0,5 ug / kleuring) en 40 pl vlekken buffer (ST buffer: HBSS, 1% (v / v) FBS en 0,01% natriumazide) per vlek.
OPMERKING: Natriumazide is zeer giftig. Gebruik geschikte persoonlijke beschermingsmiddelen, zoals nitril handschoenen, een laboratoriumjas en een gezichtsmasker. - Voeg 50 ul van kleuring mengsel aan de cellen (de totale hoeveelheid cellen nu 100 ui) en incubeer de cellen met het antilichaam mix, beschermd tegen licht en 20 min op ijs.
- Bereid het antilichaam mix met een totaal volume van 50 ul per vlek. Voor 50 ul van ST buffer, voeg de volgende geconjugeerde antilichamen voor eenvoudige kleuring: CD45 (0,5 ui, 1: 200; 0,1 ug / vlek), CD31 (0,5 ui, 1: 200; 0,25 ug / vlek), ASGPR1 (1 pl ; 1: 100; 0,2 ug / vlek), podoplanin (1 ui van een 1:14 verdunning; 1: 1400 verdunning eind; 0,014 gg / vlek) en CD133 (3 pl; 0,09 gg / kleuring).
LET OP: Table1 vat het antilichaam klonen en verdunningen gebruikt voor basis vlekken en voor meer oppervlaktemerkers van de verschillende subsets. Houd extra celsuspensies voor het antilichaam mengsel dat de overeenkomstige isotype controles en / of fluorescentie minus één controles (FMO), zoals aangegeven in tabel 2. - Voeg 400 ul van ST buffer aan elk monster en centrifugeer de cellen gedurende 4 min bij 300 xg en 4 ° C.Discard het supernatant en resuspendeer de cellen in 100 pi secondair antilichaam mengsel dat 0,125 gl ezel anti-geit IgG (1: 800, 0,25 ug / kleuring) en 0,25 pl fluorescent-geconjugeerde streptavidine (1: 400, 0,25 ug / kleuring) in 100 pl buffer ST.
- Incubeer de cellen terwijl beschermd tegen licht en met het antilichaam mengsel gedurende 20 min op ijs. Voeg 400 ul van ST buffer aan elk monster en centrifugeer de cellen gedurende 4 min bij 300 xg en 4 ° C. Verwijder het supernatant en resuspendeer de cellen in 300 pl ST buffer met 0,25 ug / ml PI.
NB: De cel levensvatbaarheid van stamcellen neemt af met de tijd; Daarom wordt voorgesteld om verse monsters zo snel mogelijk te meten.
5. Magnetische Microbead gebaseerd Verrijking van Progenitor Cellen
- Breng een hoeveelheid van de lever enkelvoudige celsuspensie bevattende 1,5-2 x 10 6 cellen, op basis van het celgetal bepaald zoals beschreven in stap 3, in een nieuwe 15-ml conische centrifugebuis.
- Centrifugeer de cellen gedurende 8 min bij 180 xg en 4 ° C (met behulp van vereenvoudigde versnelling / vertraging en 4/2).
OPMERKING: Meestal een gezonde C57BL / 6 muizenlever (of 1 g leverweefsel) moet in drie 15-ml conische centrifugebuis te scheiden. - Resuspendeer de cellen in 400 ui HBSS 0,5% (v / v) runderserumalbumine (BSA) en voeg 40 ul van anti-CD31 microbolletjes en 30 pl anti-CD45 microbolletjes. Incubeer de cellen gedurende 15 minuten bij 4 ° C.
OPMERKING: niet meer dan tHij incubatietijd, de zuiverheid van de scheiding aanzienlijk wordt verminderd. - Voeg 5 ml HBSS 0,5% (v / v) BSA aan de cellen en centrifugeer ze gedurende 8 min bij 180 xg en 4 ° C (onder verminderde versnelling / vertraging en 4/2).
- Resuspendeer de celpellet in 100 ui van dode cellen verwijderd kralen en incubeer bij kamertemperatuur gedurende 15 min. In de tussentijd bereidt een LS kolom voor de scheiding en het ijken van het met 3 ml HBSS 0,5% (v / v) BSA.
NB: Neem niet meer dan de incubatietijd, de zuiverheid van de scheiding zal aanzienlijk worden verminderd. - Voeg 900 ul HBSS 0,5% (v / v) BSA aan de cellen filteren via 100-um zeef polyamide en plaats ze op de kolom LS scheiding.
LET OP: Laad één hele lever op één LS scheidingskolom. - Was de kolom driemaal met 3 ml HBSS 0,5% (v / v) BSA en laat het doorstroomkanaal.
- Centrifugeer de doorstroming gedurende 8 min bij 180 xg en 4 ° C (onder verminderde acceleration / 4 en vertraging / 2).
- Resuspendeer de celpellet hetzij in spoelbuffer (RB) (PBS en 2 mM ethyleendiaminetetra-azijnzuur (EDTA)) dat 0,5% (v / v) BSA of ST buffer, afhankelijk van de verdere experimentele procedure.
6. Magnetische Microbead-based Automated Cell Zuivering van voorlopercellen cel subsets gecombineerd uit Multiple levers
OPMERKING: Aangezien progenitor cel subsets vertegenwoordigen zeldzame celpopulaties combineert cellen uit meerdere levers vaak nodig om voldoende aantallen cellen te bereiken voor verdere experimenten. Als voorbeeld, CD133 + en gp38 + celscheiding wordt hieronder beschreven.
- Isolatie van CD133 + progenitors
- Na stap 5.9, tel de cellen, zoals beschreven in stap 3, en resuspendeer tot 10 6 cellen (typisch 4-6 poolen gezonde levermonsters) in 100 pl RB.
- Add anti-CD64 1: 100 en anti-CD16 / 32 1: 100 tot de cellen en incubat ze op ijs gedurende 5 minuten. Voeg 1: 100 anti-CD133 gebiotinyleerd antilichaam aan de cellen en incubeer ze op ijs gedurende nog eens 10 min.
- Voeg 5 ml RB en centrifugeer gedurende 8 min bij 180 xg en 4 ° C (onder verminderde versnelling / vertraging en 4/2).
- Resuspendeer de cellen in 400 pi van RB en voeg 10 ul van anti-biotine microbolletjes. Incubeer het monster gedurende 15 minuten bij 4 ° C. Niet overschrijden incubatietijd, omdat dit de zuiverheid van de monsters vermindert.
- Voeg 5 ml RB en centrifugeer gedurende 8 min bij 180 xg en 4 ° C (onder verminderde versnelling / vertraging en 4/2). Resuspendeer de pellet in 1 ml RB.
- Isolatie van GP38 + progenitors
- Na stap 5.9, tel de cellen, zoals beschreven in stap 3, en resuspendeer tot 10 6 cellen (typisch 4-6 poolen gezonde levermonsters) in 100 pl RB.
- Add anti-CD64 1: 100 en anti-CD16 / 32 1: 100 aan de cellen en incubeer ze op ijs gedurende 5 minuten. Voeg vervolgens 1:100 anti-gp38 gebiotinyleerd antilichaam aan de cellen en incubeer ze op ijs gedurende nog eens 10 min.
- Voeg 5 ml RB en centrifugeer gedurende 8 min bij 180 xg en 4 ° C (onder verminderde versnelling / vertraging en 4/2).
- Resuspendeer de cellen in 400 pi van RB en voeg 5 ul van anti-biotine microbolletjes. Incubeer het monster gedurende 15 minuten bij 4 ° C. Niet overschrijden incubatietijd, omdat dit de zuiverheid van de monsters vermindert.
- Voeg 5 ml RB en centrifugeer gedurende 8 min bij 180 xg en 4 ° C (onder verminderde versnelling / vertraging en 4/2).
- Resuspendeer de celpellet in 1 ml RB.
- Vaak stappen na stap 6.1 of 6.2
- Plaats de 15 ml conische centrifugebuis die de magnetisch gelabelde celsuspensies Op een chill 5 rack met twee extra lege buizen voor het verzamelen van de positieve en negatieve fracties. Plaats de kou rek op de scheiding platform van de afscheider.
- Gebruik de positieve selectie programma(Possel_d2) met een uitgebreid wassen stap tussen elk monster (spoeling optie).
OPMERKING: Gebruik kolommen gebaseerde handmatige scheiding van cellen in plaats van het automatische afscheider zal de zuiverheid van het monster te verlagen. - Verzamel de positieve fractie en centrifugeer gedurende 8 min bij 180 xg en 4 ° C (onder verminderde versnelling / vertraging en 4/2).
- Resuspendeer de celpellet hetzij RB of ST buffer, afhankelijk van de verdere experimentele procedure.
- Voor een zuiverheid controle een aliquot van de cellen en vlekken ze als beschreven in stap 4.
7. flowcytometrie Cell Sorting
OPMERKING: Een hoge zuiverheid van elke soort voorlopercel deelverzameling kan worden bereikt met de hierna beschreven protocol. De totale opbrengst aan cellen is veel lager dan die beschreven in stap 6 en het beste is voor genexpressie analyse.
| Parameter | omgeving |
| nozzle Size | 85 urn |
| Frequentie | 46,00-46,20 |
| Amplitude | 38,30-55,20 |
| Fase | 0 |
| Drop Delay | 28,68-28,84 |
| verzwakking | Uit |
| eerste Drop | 284-297 |
| Target Gap | 9.-14 |
| Druk | 45 psi |
Tabel 3.
- Verwerven cellen van de magnetische-gebaseerde verrijking (beschreven in stap 5); tellen, zoals beschreven in stap 3; en vlek hen voorlopercellen markers (CD133, gp38), CD31, en CD45 ASGPR1, zoals beschreven in stap 4.
- Bereid sorteren medium (SM): fenol-rood vrij Dulbecco's gemodificeerd Eagle's medium (DMEM) dat 0,5% (v / v) BSA en 0,01% (v / v) natriumazide. Resuspendeer de gekleurde cellen in SM, zet ze in een polypropyleen ronde bodem buis, en leg ze op ijs.
OPMERKING: Natriumazide is zeer giftig. Gebruik geschikte persoonlijke beschermingsmiddelen, zoals nitril handschoenen, een laboratoriumjas en een gezichtsmasker. Niet gebruiken natriumazide als de gesorteerde cellen worden gebruikt voor functionele bepalingen. - Met de juiste software voor het type sorteerder gebruikt voor celisolatie. Open de software en volg de instructies van de fabrikant voor het opzetten van de sorteermachine parameters en machine specificaties.
OPMERKING: De machine specificaties zijn samengevat in tabel 3. Hoewel verschillende machinespecificaties bij verschillende instellingen te maken, is het belangrijk op te merken dat de vermindering van het sorteren druk en een grotere dopmaat nodig (45 psi en 85-um nozzle) de levensvatbaarheid van de voorlopercellen populat vergrotenion en de kwaliteit van het RNA bereid uit de cellen gesorteerd. Belangrijk is verrijkt leverprogenitorcellen gebruikt voor het instellen van de compensatie. Andere lever of leukocyten populaties verschillende auto-fluorescentie en resulteren in een suboptimale oplossing van de stromale bevolking en een valse gating strategie. - Kalibreren van de machine en plaats een 5-mL polypropyleen ronde bodem buis met 350 pi van SM in het soort collectie apparaat. Start monster acquisitie en sorteren. Verzamel 1.000 gebeurtenissen van de subpopulatie en stop de sample flow.
- Neem de buis uit de sorteerinrichting en meet de gesorteerde cellen op de flowcytometer. Identificeer het percentage van de gesorteerde celpopulatie aanwezig tussen de levende cellen. Dit percentage geeft de zuiverheid van de gesorteerde cellen.
- Als een soort zuiverheid 95% overschrijdt, plaats een 5-mL polypropyleen ronde bodem buis met 350 ul RLT lysisbuffer in het soort collectie apparaat.
- Start het soort en het verzamelen van 7,000-10.000 evenementen per stromale subpopulatie.
- Breng de RLT lysisbuffer die de gesorteerde cellen op een DNase- en RNase-vrij reactiebuis en de monsters opgeslagen bij -80 ° C tot verdere analyse.