Deze Malachiet groen-assay met pT werd gebruikt voor het meten van PP2Ac activiteit, omdat het eenvoudiger uit te voeren dan de klassieke methode die gebruikmaakt van 32P-gelabelde substraten. Een ander voordeel van deze bepaling over radioactieve testen is dat radio-isotopen sommige risico en kunnen duur, met name 32P-gelabelde moleculen dat korte halfwaardetijd, die beperkt het aantal tests een uitvoeren kunt voordat reagentia verlopen. Met behulp van Malachiet groen in plaats van radioactiviteit elimineert de noodzaak om te beschikken over 32afval P. Malachiet groen tests zijn ook erg gevoelig bij het meten van de activiteit van serine/threonine phosphatases in vergelijking met een andere colorimetrische bepaling die gebruikmaakt van het substraat p-nitrophenylphosphate (pNPP), die is niet-selectieve als het kan worden gedefosforyleerd door een breed aantal enzymen32.
Commerciële Malachiet groen kits voor het meten van de PP2A activiteit hebben al enige tijd beschikbaar en voorheen werden gebruikt in het laboratorium. Bij het doen van veel Malachiet groen testen, werd deze kits echter onbetaalbaar. Bovendien, commerciële kits voor PP2A activiteit zijn stabiel slechts voor één jaar, terwijl de vorm hebben van reagentia beschikbaar in poedervorm en met correcte opslag, over beschikbaar assay-onderdelen die voor langere tijd structureel stabiel zijn.
Voor het testen van bSyn en gSyn, werd aSyn gebruikt als positieve controle ter stimulering van PP2Ac activiteiten en om te bepalen van de hoeveelheid PP2Ac die nodig zijn voor het testen, en ook om te bevestigen dat de resulterende gegevens op de schaal met de standaard curve (150-2400 pmol van PO4 blijven ). Het is opmerkelijk dat als aSyn PP2Ac stimuleert te sterk, al is de reactie meestal lineaire, gegevens zal afgaan op schaal en chemicaliën in de oplossing MGT neerslaan, waardoor het onmogelijk om te meten van de juiste bedragen van vrijgegeven gratis-PO4 met een plaat lezer.
Gezien het feit dat aSyn draagt bij aan PP2Ac activiteit in vivo en in vitro12,19,21,23,25, en dat alle synucleins hebben aanzienlijke homologie, het was geweest veronderstelde dat alle familieleden van de synuclein mei zitten kundig voor stimuleren van PP2Ac in cel gratis testen. Met behulp van de colorimetrische bepaling beschreven hier, bleek het dat inderdaad, alle drie recombinant synucleins (aSyn, bSyn, gSyn) gestimuleerd PP2Ac activiteit, verhogen van de mogelijkheid dat alle drie synucleins soortgelijke functies in het zenuwstelsel vervullen kan. Echter, brain van Parkinson of dementie met Lewy Body gevallen hebben minder PP2Ac activiteit in weefsels met sterk geaggregeerde aSyn23. Muis weefsels herbergen Lewy body-achtige pathologie vertonen ook verminderd PP2Ac activiteit25. Dit, en nieuwe gegevens in Figuur 3 alsmede voorafgaande gegevens van aSyn knock-out muizen12, raden dat noch bSyn, noch gSyn meestal kan compenseren voor het verlies van oplosbare aSyn in de hersenen, of anders dat deze synuclein homologen kunnen niet koppelen met PP2Ac zo sterk als aSyn zoals aangegeven (Figuur 3). De Atlas van de hersenen Allen toont colocalization van alle drie synuclein mRNAs in vele hersengebieden, en hoewel triple synuclein knock-out muizen gegenereerde9,33, PP2Ac activiteit niet is beoordeeld in dat model zijn geweest. Interessant, aSyn die op Ser129 is phosphorylated door Polo-achtig kinase 2, is minder goed in staat om te activeren PP2Ac12, maar bewijs hieronder voor bSyn suggereren dat bSyn fosforylering is onwaarschijnlijk om de impact van de PP2Ac activiteit, zoals zeer weinig bSyn kwam met PP2Ac in de hersenen van de muis (Figuur 3). Samen genomen, blijkt uit de gegevens dat de endogene PP2Ac activiteit modulatoren, zoals aSyn, waarschijnlijk aan wellness- en ziekte bijdragen.
Het protocol hier geschetst is een eenvoudige maar toch krachtige techniek om te bepalen van het vermogen van PP2Ac om de dephosphorylate van een phosphopeptide substraat in reactie op de verschillende behandelingen. Deze zelfde methodologie kan bijvoorbeeld worden gebruikt om te testen van de andere PP2Ac-activators, zoals Ceramiden, alsmede mogelijke nieuwe therapeutics34, of om de impact van PP2Ac remmers in vitro. Het is ook belangrijk erop te wijzen dat soortgelijke testen kunnen het meten van de activiteit van PP2Ac dat heeft op zodanige wijze geïsoleerd door 1 d 6 immunoprecipitation van cel extracten of lichaamsweefsel, zoals hiervoor is beschreven door de auteurs12,19, 25. toekomst toepassingen voor de Malachiet groen assay bestaan buiten het meten van de PP2Ac activiteit, zoals ATP activiteit kan ook worden bepaald met behulp van een dergelijke bepaling.
Opmerking, een standaard curve moet worden gegenereerd elke keer voor elke onafhankelijke PP2Ac assay. Het is verplicht om ervoor te zorgen dat alle gebruikte reagentia fosfaat gratis, zoals gratis fosfaten kunstmatig verhogen van achtergrond signaal en foutieve resultaten opleveren. Op de dag van de test is het essentieel te bereiden genoeg verse MGT oplossing voor alle monsters worden bepaald. Ook is MGT alleen goed de dag dat het is gemaakt en heeft de neiging te precipiteren na een paar uur. PP2Ac gekocht bij een leverancier moet worden aliquotted en opgeslagen bevroren spoedig nadat het is ontvangen ter voorkoming van bevriezing dooi cycli die haar activiteiten te verminderen. Zoals andere phosphatases kunnen de pT substraat (bv PP1 en PP535), dephosphorylate bij het analyseren van extracten van de cel of het weefsel in die PP2Ac heeft niet op zodanige wijze geïsoleerd door immunoprecipitation, monsters via kolommen te verwijderen gratis fosfaten worden doorgegeven en specifieke remmers van phosphatases moeten worden gebruikt ter bevestiging fosfatase specificiteit, als eerder beschreven18.