$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Karakterisering van ongedifferentieerde hiPSCs
Om het fenotype van de hiPSCs te beoordelen, moet de analyse van de kolonie / celmorfologie, de bepaling van PSC-specifieke markers en het onderzoek van de genexpressie en alkalische fosfaatactiviteit worden uitgevoerd. Ongedifferentieerde hiPSC's zouden rond moeten zijn, met grote nucleolen en zonder overvloedig cytoplasma. De meerderheid van de kolonies zou moeten worden gekenmerkt door een platte en stevig verpakte morfologie, indicatief voor een ongedifferentieerd fenotype ( Figuur 2A en Figuur 2B ). Bovendien zouden meer dan 80% van de kolonies positief moeten zijn voor alkalische fosfatase-activiteit kleuring ( Figuur 2C ).
Ongeveer 80% van de cellen zou positief moeten zijn voor klassieke pluripotentie-gerelateerde markers, zoals Oct4, SSEA3, SSEA4 en Tra1-60 ( Figuur 2D-H ), zoals getoond door immunocytochemie en stromingscytometrie, terwijl percentages nestin + en β-III-Tubulin + cellen significant lager moeten zijn (respectievelijk 8% en 3% Zoals getoond in figuur 2H ). Deze resultaten zouden over de passages reproduceerbaar moeten zijn.

Figuur 2. Karakterisering van ongedifferentieerde IMR90-hiPSCs. (A en B) Representatieve fase-contrast beelden (10X en 20X vergrotingen) van ongedifferentieerde IMR90-hiPSC kolonies. (C) representatieve afbeeldingen van alkalische fosfatase-gekleurde kolonies (4X vergroting). (DF) Representatieve immunocytochemische beelden van (D) Oct4 (rood), (E) SSEA3 (groen) en (F) TrA1-60 (groen). (G) Representatieve stip plot van SSEA1 (CD15) en SSEA4 kleuring, geanalyseerd door flow cytometry. (H) De staafdiagram geeft de percentages van Oct4 + (~ 75-80%), Tra1-60 + (~ 75-80%), SSEA3 + (~ 75-80%), nestin + (~ 10-15% ) En β-III-tubuline + (~ 3 - 7%) cellen, tegenverfsteld met DAPI en gekwantificeerd door HCI, met een gemiddelde van 3 tot 5 biologische replicaten ± de SEM (grafiek gemodificeerd uit referentie 6). Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.
Beoordeling van pluripoten via EB-vorming
HiPSC's zijn pluripotent, wat betekent dat ze onder kieme omstandigheden drie kiemlaaggerelateerde genen uitdrukken. Om de hiPSC pluripotency te beoordelen, is het mogelijk om een gemeenschappelijke toepassing toe te passenAanpak gebaseerd op spontane EB-vorming, die de vorming van de drie kiemlagen 14 induceert. Analyses van kiemlaagspecifieke genen moeten een tijdsafhankelijke toename van endoderm (α-fetoproteïne (AFP) en cytytatine 18 (KRT18)) aanduiden, ectoderm (Nestin, SRY-doos 1 (Sox1) en gepaarde doos 6 (Pax6) ) En mesoderm (natriuretische peptide A (NPPA) en Brachyury-T) -relateerde genexpressie ( Figuur 3A en Figuur 3B ); Zie de tabel van materialen.

Figuur 3. Beoordeling van Pluripotentie door EB-vorming. (A) Representatief fasecontrastbeeld van EB's op dag 1. (B) De staafdiagram toont qPCR-analyses van mesodermale (NPPA en brachyury), ectodermale (Pax6, Sox1 en nestin) en endodermale (AFP en KRT18 ) Genen genormaliseerd naar de referentie genen, β-actine en GAPDH, en gekalibreerd naar niet-gedifferentieerde cellen (Dag 0). Dit is de ΔΔCt methode, met een gemiddelde van 5 onafhankelijke analyses ± de SEM * p <0,05, ** p <0,01, *** p <0,001; Grafiek gewijzigd van Referentie 6. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te zien.
Inductie van neuronale en gliale differentiatie
IMR90-iPSC's kunnen worden onderscheiden in gemengde culturen van post-mitotische neuronen en glialcellen volgens de stappen samengevat in figuur 1 en in de protokol secties. 5-8 dagen na de plating van de EB's op standaardmatrix- of laminine-gecoate gerechten in aanwezigheid van compleet NRI-medium, moeten rozetachtige structuren zichtbaar worden (= "Xfig"> Figuur 4A). Rozetten worden gekenmerkt door de aanwezigheid van nestin + cellen (neuronale precursoren, ~ 90%), met weinig β-III-tubulin + cellen (toegewijde neuronale cellen, ~ 5 - 10%), die meestal hoofdzakelijk gelokaliseerd zijn aan de periferie van de Rozetten ( figuur 4B , rozetten op dag 12).
Bij rosette dissociatie en repliceren op laminine- of standaardmatrix-gecoate schotels of platen in aanwezigheid van compleet ND-medium beginnen cellen onderscheid te maken in gemengde culturen van neuronen en glia, die clusters van neuronale cellichamen die verbonden zijn met bundels van neurieten progressief vormen ( Figuur 4C en figuur 4D ). Vergelijkbare resultaten zouden moeten worden verkregen bij het analyseren van neuronale populaties verkregen door roset-afgeleide NSC's uit te breiden en ze te differentiëren in neuronen en glia. NSC's die uit rozetten worden uitgebreid, moeten n zijnEstin + ( Figuur 4E , inset met nestin + cellen).
Na 21 dagen van differentiatie zouden de cellen positief moeten zijn voor P-III-tubuline; NF200; tau; En MAP2, de late marker van dendriten ( Figuur 4D , 4F en Figuur 4H), met tenminste 10-15% van de cellen die positief zijn voor het glialfibrillair zuur eiwit (GFAP), een astrogliale marker ( Figuur 4G en Figuur 4H) . Bovendien zou ~ 20 - 30% van de cellen de expressie van nestin na differentiatie behouden ( Figuur 4H ). Het is belangrijk om te overwegen dat het percentage van elk celtype ( dat wil zeggen neuron, astrocyt, nestin + cellen) per passage kan variëren en de gebruiker-afhankelijke variabiliteit kan worden waargenomen.
Door het analyseren van specifieke neuronale subpopulaties, vertegenwoordigen GABAergische neuronen15 tot 20% van de totale cellen, dopaminergische neuronen ~ 13-20% en glutamatergische neuronen ~ 35-42%, zoals getoond door immunostaining voor gamma-aminoboterzuur (GABA), tyrosinehydroxylase (TH) en vesiculair glutamaat Transporteur 1 (VGlut1), respectievelijk (zie de representatieve kwantificering in Figuur 4H ). De inductie van differentiatie kan ook worden beoordeeld aan de hand van de analyse van pluripotentie-gerelateerde markers (bijvoorbeeld Oct4, Tra1-60 en SSEA3), die in gedifferentieerde cellen versus niet-gedifferentieerde hiPSC's moet worden geregeld (niet getoond, zie Referentie 6). Dit kan ook bevestigd worden door middel van de analyse van genuitdrukking door qPCR, die een afname van Oct4 en Nanog zou aanduiden en de upregulatie van neuronale genen, zoals neurale celadhesiemolecule 1 (NCAM1) en microtubule-geassocieerd eiwit 2 (MAP2); Het presynaptische gen, synaptofysine (SYP); En het post-synaptische gen, microtubule-geassocieerde eiwit tau (MAPT), zoals getoond in < Sterke klasse = "xfig"> Figuur 4I. Verder zijn dopaminergische (TH en NR4A1), noradrenerge (PHOX2A en PHOX2B), glutamatergische (NARG2, GRIA1 en GAP43), GABAergic (GABRA1 en GABRA3), motorneuronen (ISL1 en LHX3) en cholinergische (SLC5A7 en SLC18A13) verwante genen Resulteren in upregulated neuronale cellen vergeleken met ongedifferentieerde cellen ( Figuur 4J ).
De analyse van spontane elektrische activiteit, met behulp van MEA, is een waardevolle uitlezing om de functionaliteit van het neuronale netwerk in gedifferentieerde hiPSCs te beoordelen. Aan het einde van de differentiatieperiode worden neuronale derivaten gekenmerkt door een gemiddelde vuurfrequentie (MFR) van ten minste 60 spikes / min (zie het representatieve rasterplot in figuur 4K ). Er worden echter geen barsten gezien.
55702fig4.jpg "/>
Figuur 4. Differentiatie van IMR90-hiPSCs in Gemengde Culturen van Neuronen en Glia. (A en B) Representatieve beelden van rozetten na 7 DIV (A) en na 12 DIV (B) , gekleurd voor nestin (groen) en β-III-tubuline (rood). (C en D) Representatieve beelden van gedifferentieerde cellen na 22 DIV (C) en 28 DIV (D) , gekleurd voor P-III-tubuline (rood) en NF200 (groen)). (E) Representatief beeld van NSC's afgeleid van rosette dissociatie en expansie (inzet toont nestin + cellen, rood). (F en G) Representatieve beelden van neuronale cellen ( F , gekleurd voor NF200 (rood) en Tau (groen)) en gliale cellen ( G , gekleurd voor GFAP (rood)) onderscheiden van NSC's (na 21 DIV). (H) Kwantificering van nestine, MAP2, GFAP, gamma-aminoboterzuur (GABA), vesiculaire glutamaattransporteur 1 (VGlut1) en tyrosinehydroxylase (TH) -positieve cellen door HCI, waarbij IMR90-hiPSC-derivaten en cellen werden gedifferentieerd van IMR90-hiPSC afgeleide NSC's (grafiek gemodificeerd uit referentie 7). (I en J) Staafdiagrammen die qPCR-analyses van pluripotencygenen (Oct4 en Nanog) en neuronale genen (NCAM1, MAP2, SYP en MAPT) (I) en van dopaminergische (TH en NR4A1), noradrenerge (PHOX2A en PHOX2B) tonen, Glutamatergic (NARG2, GRIA1 en GAP43), GABAergic (GABRA1 en GABRA3), motorneuron (ISL1 en LHX3) en cholinergische (SLC5A7 en SLC18A13) verwante genen (J) . Alle analyses werden genormaliseerd naar de referentie genen, β-actine en GAPDH, en gekalibreerd naar niet-gedifferentieerde cellen (groene staven). Dit is de ΔΔCt methode, met een gemiddelde van 5 onafhankelijke analyses ± de SEM * p <0,05, ** p <0,01, *** p <0,001. De grafieken in I en J werden gewijzigd uit Referentie 6. (K) Representatieve raster-grafiek van IMR90-NSC-afgeleide neurOns (de opname werd uitgevoerd voor minimaal 600 s, de verticale staven vertegenwoordigen enkele spikes). Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.
Een specifieke handtekening van neuronale markers wordt geherreguleerd in gedifferentieerde IMR90-hiPSC's
In het nieuwe toxiciteits testparadigma is het essentieel om de moleculaire en cellulaire gebeurtenissen die zich voordoen in een cel na blootstelling aan een bepaald toxicant te definiëren. Daarom is het relevant om te specificeren welke signaalwegen worden geactiveerd en / of gereguleerd binnen het onderzochte cellulaire model.
Commercieel beschikbare arrays voor de analyses van proteïne kinase genuitdrukking kunnen gebruikt worden om ongedifferentieerde hiPSCs tegen gedifferentieerde cellen te vergelijken. GesplitsteGedifferentieerde IMR90-hiPSC's ondergaan de upregulatie van genen die betrokken zijn bij de controle van neurotrofinreceptoren, axonbegeleiderregulatie, neurietgroei modulatie, glial-afgeleide neurotrofe factor (GDNF) receptoren, botmorfogenetische eiwit (BMP) / TGF-beta pathway en bloedplaatjes- Afgeleide groeifactor (PDGF) receptoren ( Figuur 5A en Figuur 5B ).
De analyse van RPPA toont de upregulatie van een specifieke neuronale handtekening in gedifferentieerde IMR90-hiPSCs. In het bijzonder worden Erk / CREB, Akt / PDK1 / mTOR en Notch1 signaalwegen geactiveerd bij differentiatie ( Figuur 5C ).

Figuur 5. Gedifferentieerde Neuronale en Gliale cellen tonen de Activatie van Neuron-gerelateerde Wegen. (EENEn B) Staafgrafieken rapporteren de qPCR analyses van neuron-gerelateerde kinasen (A) en andere kinase gerelateerde genen (B) . Gene-expressiegegevens werden genormaliseerd aan de referentiegenen 18S en GAPDH (in de matrix verschaft) en gekalibreerd naar niet-gedifferentieerde cellen. Voor deze analyses werd een gen significant gereguleerd als zijn expressie tenminste 2x hoger was dan in niet-gedifferentieerde cellen (2 -ΔΔCt ≥ 2); Gemiddelde van 3 onafhankelijke analyses ± de SEM). (C) De staafdiagram toont de absolute eiwit kwantificeringen door middel van RPPA analyse, waarbij gedifferentieerde (rode staven) en ongedifferentieerde cellen (groene staven) worden vergeleken. De eiwitten die behoren tot dezelfde signaleringspadcascades worden als volgt samengevoegd: CREB / ERK / AKT, PDK1 / mTOR / Erk / Akt, Notch1, Shh en Wnt, SAPK / JNK en BMP / SMAD. Gemiddelde ± de SEM van 4 onafhankelijke analyses. * P <0,05, ** p <0,01, *** p <0,001; Grafiek gemodificeerd fRom Referentie 6. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.
IMR90-hiPSC-afgeleide neuronale / gliale culturen kunnen worden gebruikt om de effecten van rotenon te beoordelen
Rotenon, een remmer van complex I van de mitochondriale ademhalingsketen, is bekend om oxidatieve stress te veroorzaken door de activatie van de Nrf2-weg te activeren. Onder rustige omstandigheden wordt Nrf2 verankerd in het cytoplasma door Keap1 (Kelch-achtig ECH-geassocieerd eiwit 1), een Nrf2-repressor, die Nof2-ubiquitinatie en proteolyse 15 vergemakkelijkt. Na de inductie van oxidatieve stress translateert Nrf2 in de kern en activeert de expressie van Nrf2-ARE doelgenen 16 .
IMR90-hiPSC-afgeleide neuronen enD glialcellen kunnen gebruikt worden om de effecten van rotenon op Nrf2-activering te beoordelen door de cellen gedurende 24 uur aan verschillende concentraties rotenon (bijvoorbeeld 1, 10 en 100 nM) bloot te stellen. Deze concentraties werden vastgesteld volgens eerdere studies 17 , 18 .
Bij deze concentraties en tijden van blootstelling resulteerde rotenon niet in cytotoxiciteit, zoals blijkt uit de kwantificering van levende DAPI + celkernen ( Figuur 6A ). Rotenon geïnduceerde Nrf2 nucleaire translocatie, vooral nadat de cellen werden blootgesteld aan 100 nM rotenon ( Figuur 6B en Figuur 6E ). Bij dezelfde concentratie werd een significante daling van de cytoplasmatische Keap1 waargenomen ( Figuur 6C ), samen met een toename van zowel NAD (P) H-kinonoxidoreductase 1 (NQO1) en Sulfiredoxine 1 (SRXN1), twee Nrf2-target enZymes 19 , 20 ( Figuur 6D ).

Figuur 6. Effecten van Rotenone op Nrf2 nucleaire translocatie, Keap1, SRXN1 en NQO1 eiwitgehalten. (A) Kwantificering van levende DAPI + cellen ( dwz non-pyknotische kernen) na 24 uur behandeling met 1, 10, 100 nM rotenon en genormaliseerd naar onbehandelde cellen (Control, Ctr). (B) nucleaire translocatie van nrf2-eiwitten ( dwz nucleaire / cytoplasmatische verhoudingen) na 24 uur blootstelling aan rotenon, beoordeeld door metingen van fluorescentie-intensiteit met behulp van HCI-analyse. (C) Kwantificering van cytoplasmatische Keap1 eiwitgehalten bij rotenonebehandeling, beoordeeld door HCI analyse. (D) Kwantificering van NAD (P) H-kinon oxidoreductase 1 (NQO1) en SulfiRedoxine 1 (SRXN1) door middel van immunofluorescentie en HCI na 24 uur behandeling met rotenon. (E) Representatieve beelden van Nrf2 eiwit lokalisatie (groen). Alle waarden worden weergegeven als de gemiddelde ± SEM van 3 biologische replicaten. * P <0,05, ** p <0,01; Figuur gewijzigd van referentie 7. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te zien.
Bij deze concentraties en tijden van behandeling heeft rotenon ook een concentratieafhankelijke toename van het astrogliale (GFAP + ) celpercentage opgewekt ( Figuur 7A en Figuur 7B ), zonder de proporties van NSC's (nestin + ) en neuronen (MAP2 + ) te beïnvloeden ( Figuur 7B ). Door naar de verhoudingen van specifieke neuronale subtypen te kijken, werd rotenonebehandeling (10 nM en 100 nM)Het aantal dopaminergische neuronen (TH + ) ( Figuur 7C en D ) daalde aanzienlijk, terwijl de percentages GABAergic (GABA + ) en glutamatergische (VGlut1 + ) neuronen niet veranderden ( Figuur 7D ). Analoog hebben vorige in vivo en in vitro studies een rotenonafhankelijke en selectieve dopaminergische neuronale cel-dood 21 , 22 , 23 beschreven.

Figuur 7. Effecten van Rotenone op Glialcellen en Dopaminerge Neuronen. (A) Representatieve afbeeldingen van GFAP + cellen (rood), met 40X vergroting in de insets, onbehandeld of behandeld met 100 nM rotenon gedurende 24 uur. (B) Kwantificering Van nestin + , MAP2 + en GFAP + cellen, genormaliseerd naar onbehandelde cellen (controle, Ctr). (C) Representatieve beelden van dopaminergische TH + neuronen (groen), met 40X vergroting in de insets, onbehandeld of behandeld met 100 nM rotenon gedurende 24 uur. (D) Kwantificering van GABA + , VGlut1 + en TH + neuronale cellen, genormaliseerd naar onbehandelde cellen (Ctr). Alle waarden worden weergegeven als de gemiddelde ± SEM van 3 biologische replicaten. * P <0,05, ** p <0,01, *** p <0,001; Figuur gewijzigd van referentie 7. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te zien.
Statistische significantie werd beoordeeld door een eenmalige ANOVA met Dunnett's Multiple Comparison Test als post-test (vergelijking van alle kolommen versus de controle kolom)Xref "> 24 of door twee-tailed unpaired of paired t-test volgens het type analyse. Alle gegevens vertegenwoordigen het gemiddelde van ten minste drie biologische replicaten ± de standaard fout van het gemiddelde (SEM). Een sterretje over een balk geeft aan Een significant verschil met de controlegroep. * P <0,05, ** p <0,01, *** p <0,001.
Tafel 1.
Opmerking over gedissocieerde rozetplatingdichtheid: als rozetfragmenten niet helemaal gedissocieerd worden, om een celplatingdichtheid van ongeveer 15.000 cellen / cm2 te bereiken, kunnen dissocieerde rozettenfragmenten die afkomstig zijn van ongeveer 50 EBs / 1 x 60mm-schotel opnieuw worden gesuspendeerd in 50 ml compleet NRI-medium en als volgt geplateerd (afhankelijk van de plaatformaat):
| Multiwellplaten / MEA | Groei gebied (cm 2 / putje) | Volume van cel suspensie naar plaat per putje (of MEA chip) | Maximaal aantal platen die kunnen worden geplateerd (met 50 ml cel suspensie) |
| 96 putten | 0.3 | 100 ul | 5 |
| 48 putten | 0.7 | 220 ul | 4 |
| 24 putten | 2 | 625 ul | 3 |
| 12 putten | 4 | 1,25 ml | 3 |
| 6 putten | 10 | 3.125 ml | 2 |
| Enkele goed MEA chip | 3.5 | 1,1 ml | 45 |
Tabel 2: Acceptatiecriteria
| Markeerstift /Antilichaam | Percentage (op DAPI + (levende) cellen) na 28 DIV |
| B-III-tubuline (Tuj1) | 35-45% |
| MAP2 | 50-60% |
| NF200 | 45-55% |
| GFAP | 10-25% |
| Nestin | 15-25% |