Ja is een low-cost methode gebruikt voor het opsporen van oestrogene liganden in milieu monsters, zoals water, eten, plantaardige weefsels of producten voor persoonlijke verzorging. Gegevens gepresenteerd hier Vergelijk 2 oestrogeen receptoren (ERα en ERβ), 2 substraten (ONPG en CPRG) en 2 tijdlijnen (2 d zonder koeling) en zeven dagen protocol met koeling voor het meten van estrogenicity in producten voor persoonlijke verzorging via de ja-bepaling. De 7 d, gekoelde protocol gebruikt CPRG en gist uiting van ERα en/of ERβ beste kwantificeert EEQs terwijl undergraduate laboratorium cursussen die voldoen aan slechts eenmaal wordt ook compatibel met de tijdsdruk oplegt / week voor enkele h. In feite, werd in vergelijking met de bepaling van de 2 d zonder koeling, de zevendaagse gekoelde assay geassocieerd met verminderde variantie over plaat wordt gerepliceerd. Bovendien werd het lineaire deel van de standaard curve enigszins uitgebreid voor gegevens die zijn verzameld met behulp van de gekoelde assay. Het lineaire gebied van de standaard curve definieert het registratiebereik assay en is het enige gedeelte van de standaard curve die kan worden gebruikt voor het interpoleren van monster EEQs.
In alle, maar een van de geteste monsters waren gemeten met behulp van de CPRG EEQs lager dan die gekwantificeerd met ONPG. Met een hogere coëfficiënt van uitsterven en lagere Km en Vmax, CPRG tien keer gevoeliger is dan ONPG17. Dus, CPRG kan worden gebruikt bij lagere concentraties en kan worden gebruikt voor het detecteren van lagere bedragen van β-galactosidase. Om deze redenen heeft de CPRG in het algemeen voorkeur over ONPG18,19. Grotere substraat gevoeligheid verklaart echter niet de lagere waarden van de EEQ met CPRG ontdekt. De hogere waarden van de EEQ met ONPG ontdekt kon te wijten zijn aan interferentie van de matrix met de assay, zoals opgemerkt door andere auteurs2,18. Gele pigmenten uit persoonlijke verzorging product extracten kunnen opblazen EEQ waarden met ONPG ontdekt. Anderen hebben dit probleem omzeild door met inbegrip pigment controles in hun proefopzet2, een aanpak die het aantal platen in een experiment verdubbelt. Als matrix interferentie problematisch zijn kan, mogelijk CPRG een beter substraat voor de ja-assay, hoewel het is duurder en langere incubatietijd tijden dan ONPG vereist. Bovendien is de kleurverandering geïnduceerd door het splijten van substraat door β-galactosidase dramatischer met CPRG, waardoor het makkelijker voor studenten om te visualiseren van de resultaten.
Miller et al. (2010), die de gist gebruikt in dit protocol ontworpen, dat gist uitdrukken ERβ 30 x gevoeliger voor 17β-estradiol dan gist uiting van ERα, een bevinding gemotiveerd door onze gegevens14werden genoteerd. Afgezien van potentiële nuances in de plasmide bouw, Miller et al. (2010) dit verschil in gevoeligheid14niet kon verklaren. Een verschil tussen de twee plasmide constructies is dat ERα expressie wordt gereguleerd door galactose, terwijl ERβ expressie wordt gereguleerd door glucose of galactose. De gist gebruikt in de ja-assay zijn gekweekt in de media van de glucose en galactose alleen gegeven wanneer ze aan het begin van de test worden verdund. Gist uiting van ERβ kan daarom hogere moleculen van receptor eiwitten vóór de aanvang van de test, waardoor de overdracht van hogere gevoeligheid voor oestrogene liganden accumuleren.
De lagere gevoeligheid van ERα-uiten gist kan verklaren de hogere tarieven van niet-detectie van estrogenicity in monsters gemeten met ERα in vergelijking met ERβ. Om te vergroten de kans wordt dat monster EEQs gedetecteerd, gebruikers kunnen verschillende extractiemiddelen en methoden in dienst of hogere volumes van monster toe te voegen aan de gist. Als hogere volumes van het monster worden gebruikt, moeten de concentraties van E2 normen worden aangepast zodat hetzelfde volume van normen en monsters kan worden gebruikt in de test. Een beperking van het toevoegen van meer monster is dat gist slechts 6-10% ethanol, met betere tolerantie bij incubatie temperaturen van 30 Vs. 35 ° C20kan tolereren. Om te bepalen voor de effecten van ethanol op gist, moeten onderzoekers drievoudige "gist alleen" putten aan de plaat-indeling toevoegt en bevestigen dat de OD610 van deze "gist alleen" putten vergelijkbaar met de OD610 van voertuig-controleputjes onmiddellijk is na de toevoeging van LacZ buffer. Als alternatief, monsters, opgelost in ethanol kunnen worden toegevoegd aan droge microwell platen en de ethanol verdampt uit voordat gist worden toegevoegd. Dimethylsulfoxide (DMSO) wordt ook gebruikt als een monster oplosmiddel in Ja testen, maar de uiteindelijke concentratie van de werken van DMSO met gist beperkt tot 1%12 worden moet.
De ja-bepaling is een krachtige screening tool voor het opsporen van estrogenicity in milieu monsters. Specifiek, detecteert de ja liganden die nucleaire oestrogeen receptoren die samenwerken met oestrogeen response-elementen om te leiden van gen expressie14binden. De waarde Ja heeft echter ook belangrijke beperkingen. Ja detecteert geen EWS die werken door middel van niet-nucleaire mechanismen zoals membraan oestrogeen receptoren of mechanismen die betrekking hebben op aanvullende elementen zoals transcriptiefactoren Activator eiwit 1 (AP-1). Bovendien, omdat gist hebben niet dezelfde metabole capaciteit als cellen van zoogdieren, ja niet wordt gedetecteerd door liganden waarvoor metabole activering als oestrogene.
Bovendien, de ja-bepaling kan niet gemakkelijk onderscheid maken tussen oestrogene en Anti-oestrogene liganden in complexe monsters. In plaats daarvan meet net estrogenicity, die het effect van de som van de oestrogene en Anti-oestrogene liganden. Voor het kwantificeren van de concentratie van ER-antagonisten of evalueren van de inhiberende activiteit van mengsels, kan de bepaling worden gewijzigd door het gist met zowel de standaard agonist (17β-estradiol) en een aantal test sample concentraties12aan het broeden. Dit proces wordt bepaald of antagonisten in de monsters agonist-geïnduceerde verslaggever activiteit kunnen verminderen en biedt een handig scherm voor de identificatie van de aanwezigheid van ER antagonisten in monsters.
Het hier gepresenteerde protocol is geschikt voor diverse soorten monster, hoewel sommige monsters moet u mogelijk wijzigingen aan de extractie en sample voorbereiding stappen. Bijvoorbeeld, EEQs sterk uiteen tussen repliceert van sommige producten voor persoonlijke verzorging. De meer variabele monsters neiging om bevatten olie druppels of waren anders niet volledig homogeen, die aangeeft dat een meer lipofiele oplosmiddel zoals diethylether nuttig zou zijn. Als alternatief, olie en wax in producten voor persoonlijke verzorging kunnen worden uitgesloten door de winning van monsters met 50% ethanol in plaats van 100% ethanol.Een 50% ethanol extractie zal ook meer water oplosbare oestrogene liganden (bijvoorbeeld, sommige pigmenten) vangen. Echter 50% ethanol verdampt langzamer dan 100% ethanol en dus kan verlengen extractie tijd. Daarnaast werden enkele monsters (zoals zeep) cytotoxisch zijn voor gist, wat resulteert in verminderde cel dichtheid metingen (OD610). Fox et al. (2008) suggereren dat dergelijke monsters moeten worden verdund en Nacontrole verricht als cel dichtheid verschillen groter is dan 30% ten opzichte van voertuig controle putten12.
Als de ja-assay voor analytische onderzoeksdoeleinden wordt gebruikt, kunnen preventief bepalen juiste hoeveelheid extract worden toegevoegd aan gist in stap 4.5 verdunning curven van monster zwembaden worden beproefd. Als alternatief, extracten tegelijk kunnen worden getest op meerdere volumes (b.v., 5 µL en 20 µL extract toegevoegd aan gist in stap 4.5) of verdunningen, die zich uitstrekken van de ordes van grootte (b.v., 0.2 µL, 2 µL en 20 µL). "Juiste" hoeveelheid extract zijn die het identificeren van estrogenicity door LacZ waarden langs de lineaire deel van de standaard curve te vergelijken. Optimalisatie voorkomt problemen veroorzaakt door te veel of te weinig monster toe te voegen aan de gist, zoals cytotoxiciteit, valse negatieven of estrogenicity die hoger is dan de standaard curve. Zoals hierboven vermeld, moeten de omvang van de monsters en E2 normen worden aangepast wanneer verschillende hoeveelheden ligand worden gebruikt zodat de gist worden blootgesteld aan een consistent volume en de concentratie van ethanol of ander voertuig over de plaat.
Ondanks het potentieel voor valse negatieven, is de ja-bepaling geïdentificeerd als een Tier 3 testing tool voor endocriene verstoorders door Schug et al. (2013), die ontwikkelde een uitgebreide gelaagde Protocol voor endocriene verstoring (TiPED)21. Voor undergraduate onderwijs is de test waardevol voor het onderwijzen van begrippen met betrekking tot de hormoonontregeling, cultuur van de cel receptor bindende, enzymactiviteit, genetische manipulatie, statistieken en experimenteel design. Studenten die gebruik maken van de test ook praktijk fundamentele en breed toepasbare laboratorium vaardigheden zoals serieel verdunnen normen; winning van monsters; het maken van oplossingen; bouw en interpoleren standaard curven; berekening van de concentraties; het maken van oplossingen; tonen steriele techniek; kweken van cellen; identificeren van variabelen en besturingselementen; verzamelen, ordenen en analyseren van gegevens; bouw en interpreteren van de grafieken; en het gebruik van gemeenschappelijke laboratoriumapparatuur zoals micropipettors en spectrofotometers.