$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
De kritische stappen in het protocol zijn als volgt. Eerst, cellen moeten worden gekweekt op de schotel van cultuur als een enkelgelaagde omdat het uitvoeren van een morfologische analyse van DAPI gebeitste kernen moeilijk voor meerdere lagen cellen is. Te dien einde in stap 2.9, is zorgvuldige overdracht van de cultuur-schotel naar een incubator aanbevolen; schudden van de cultuur-schotel genereert een werveling van zwevende cellen die tot de concentratie van cellen in het midden van de cultuur-schotel leidt. Bovendien, moet overconfluence leiden tot meerdere lagen cellen worden vermeden. Te dien einde in stap 2.7, kan het aantal cellen ontpit op de cultuur schotel worden gewijzigd op basis van de populatie verdubbeling van tijd en het interval tussen de bestraling en fixatie. Een samenloop van ongeveer 80 ten tijde van de fixatie wordt aanbevolen. Ten tweede, is snelheid belangrijk voor fixatie en DAPI kleuring (d.w.z., stap 4 en 5). Inter monster inconsistentie met betrekking tot de termijnen voor deze stappen kan leiden tot heterogeniteit in de DAPI signaalsterkte in de kernen, die de morfologische beoordeling verhullen zou.
In stap 2.2, kan het aantal cover slips in een enkele cultuur schotel worden verhoogd; een maximum van vier cover slips kan worden geplaatst in een schotel van 35 mm, en het aantal kan verder worden verhoogd met behulp van grotere gerechten. Meerdere cover slips in elke cultuur schotel plaatsen kunt de efficiënte werking van tijd cursus beoordeling voor een bepaalde behandeling (dat wil zeggen, de hoes glijdt kunnen worden verzameld van een cultuur schotel één voor één op meerdere tijdstippen van belang).
Bij stap 3.2, kan de dosis van de bestraling worden gewijzigd volgens de onderzoekers belang. De toepassing van een consistente dosis op meerdere cellijnen kan de vergelijking van de gevoeligheid voor elke modus van de dood van de cel van clonogenic onder de cellijnen. Aan de andere kant, maakt het gebruik van iso-clonogenic overleven doses voor elke cel regel vergelijking van clonogenic cel dood profielen onder de cellijnen. De iso-clonogenic overleven dosis kan worden bepaald door de clonogenic overleven assay12. De D-waarde10 , de dosis die 10% clonogenic overleven biedt, is een gemeenschappelijk eindpunt voor de iso-clonogenic overleven dosis.
In stap 3.3, kan de tijd tussen bestraling fixatie worden gewijzigd volgens de onderzoekers belang; Dit is belangrijk omdat de piek tijd voor IR-veroorzaakte apoptosis, mitotische catastrofe en cellulaire senescentie is afhankelijk van de cellijn en behandeling. In dit artikel, we gebruikten 72 h na bestraling als het tijdstip dat zou nuttigst voor de eerste screening van clonogenic cel dood profielen, op basis van meerdere studies door onze fractie en anderen beschreven als volgt1,2, 3 , 4 , 8 , 9: (i) X-Vleug-veroorzaakte apoptosis in cellen vastgesteld van solide tumoren meestal een paar dagen na bestraling plaatsvindt. (ii) X-Vleug-geïnduceerde mitotische catastrofe in kankercellen gebeurt meest prominent op de tweede of derde mitose na vrijlating uit de tijdelijke celcyclus arrestatie geïnduceerd door bestraling van. De release gebeurt meestal ongeveer 24 uur na bestraling, gevolgd door herhaalde tussen intervallen van ongeveer 24 h. (iii) X-Vleug-geïnduceerde cellulaire senescentie wordt duidelijk na een interval afhankelijk van de betrokken cellijn: 2 dagen na bestraling voor sommige vroege gevallen, en de 7 dagen na bestraling voor meeste cellijnen. Na het verkrijgen van een totaalbeeld van de clonogenic-cel dood profielen uit de eerste screening, tijd cursus experimenten zorgt voor een meer gedetailleerde opheldering van de piek tijd voor elke toestand van dood van de cel van de clonogenic in de specifieke cellijn en/of toestand van belang4.
Opgemerkt moet worden dat de DAPI kleuring assay en de bepaling van de overleving clonogenic, een methode van de gouden standaard voor straling gevoeligheid beoordeling, zijn niet uitwisselbaar. Apoptosis en de mitotische ramp slechts duren uren. Dus, detecteert de DAPI kleuring assay voor een bepaald tijdstip apoptosis en mitotische catastrofe die op het tijdstip van de beoordeling plaatsvindt. Aan de andere kant, assay de resultaten van het voortbestaan van clonogenic op een bepaald moment punt omvatten het totale bedrag van apoptosis en de mitotische catastrofe die hebben plaatsgevonden tijdens de incubatieperiode voor meestal 10-14 dagen na bestraling. Verschillende van apoptosis en mitotische catastrofe, verouderend cellen blijven op de schotel van cultuur; zij accumuleren geleidelijk in de tijd na bestraling. De resultaten van zowel de DAPI kleuring assay en de bepaling van de overleving clonogenic weerspiegelen derhalve de totale hoeveelheid senescentie die hebben plaatsgevonden tijdens de incubatieperiode. Nog belangrijker is, het aandeel van apoptosis, mitotische catastrofe en senescentie geïnduceerd door bestraling van verschilt volgens cel lijn en bestraling dosis. Tezamen, theoretisch, kunnen niet de resultaten van een test worden omgezet direct die van de andere bepaling.
De DAPI kleuring assay heeft een paar beperkingen. Ten eerste, het blijft controversieel of mitotische catastrofe een aparte manier van celdood is. Op het gebied van straling biologie, mitotische catastrofe wordt beschouwd als een belangrijke vorm van IR-veroorzaakte celdood die verschilt van andere mechanismen van clonogenic cel dood1. Aan de andere kant, argumenteren anderen dat mitotische catastrofe is niet een aparte modus van celdood, maar eerder een proces dat voorafgaat aan de dood van de cel met inbegrip van apoptosis en de necrose13,14. Dus, apoptosis en de mitotische catastrofe kunnen overlappen elkaar tot op zekere hoogte. Tweede, vorige studies suggereren dat cellulaire senescentie bij gebrek aan SAHF in sommige cellijnen en behandeling instellingen2 optreden kan. Aanwezig, andere testen, speciaal ontworpen voor elke cel clonogenic moet dood modus worden gebruikt te verhogen van de robuustheid van de conclusies van een gegeven experiment. Ten derde, de DAPI kleuring assay kan niet beoordelen vervoerswijzen clonogenic celdood dan apoptosis, mitotische catastrofe en cellulaire senescentie (bijvoorbeeldnecrose en autophagy). Ten vierde heeft het nut van de DAPI kleuring assay als voorspeller van tumor reactie op radiotherapie niet is toegelicht in de kliniek. Vanuit dit oogpunt is de clonogenic overleven assay, die het totale bedrag van de dood van de cel van de clonogenic beoordeelt, superieur aan de DAPI kleuring assay omdat een correlatie tussen SF2, de overlevende Fractie van cellen bestraald met 2 Gy is vastgesteld X-stralen, en de reactie van de tumor op radiotherapie15. Het is echter opmerkelijk dat de bepaling van de overleving clonogenic niet wijd in de kliniek, voornamelijk als gevolg van de eis voor een hoge mate van deskundigheid en een lange periode van tijd (d.w.z., 14 dagen) wordt gebruikt voor data-acquisitie. Ter vergelijking: de procedure voor de DAPI kleuring assay is eenvoudiger en kost aanzienlijk minder tijd, ongeveer 3-4 dagen, om resultaten te genereren. Het nut van de DAPI kleuringassay als voorspeller van tumor reactie op radiotherapie zal worden getest in de kliniek in de nabije toekomst.
Kortom is de DAPI kleuring assay een kosteneffectieve one-step test gelijktijdig beoordelen de drie belangrijke takken van clonogenic IR-veroorzaakte celdood. Deze aanpak maakt het mogelijk om gemakkelijk het scherm voor de modi van de dood van de cel van clonogenic voor verschillende cellijnen, behandelsettings en tijdstippen, met het doel van het ophelderen van de mechanismen van celdood in de doelcellen en de voorwaarden van belang.