Alle dierproeven zijn uitgevoerd volgens de richtsnoeren voor de verzorging en het gebruik van proefdieren en goedgekeurd door de verantwoordelijke autoriteiten (Regierung von Oberbayern, München, Duitsland en Stanford institutionele dier zorg en gebruiken Comité, Stanford, CA, USA). Een lijst van alle plasmiden voor klonen (stap 1 t/m 4) vindt u in de aanvullende tabel S1.
1. het klonen van een transgenic voor constitutieve genexpressie
- Inleidingen voor transgenic amplificatie13,14te ontwerpen.
- Beperkingsplaatsen voor PacI (TTAATTAA) aan het einde 5' van de voorwaartse primer toevoegen. Beperkingsplaatsen voor AscI (GGCGCGCC) of FseI (GGCCGGCC) toevoegen aan het einde 5' van de omgekeerde primer.
- Amplify transgenic door PCR voorwaarden geoptimaliseerd voor de gewenste transgenic14gebruiken. Zuiveren met behulp van een commercieel beschikbare DNA zuivering kit.
Opmerking: Onthardende tijd hangt af van de inleidingen ontworpen in stap 1.1., rek tijd hangt af van de lengte van de constructie. Bijvoorbeeld voor een constructie van 1000 bp lengte gebruik 60 s rek tijd.
- Verteren transgenic en vector voor constitutieve gen expressie15 met respectieve beperking nucleasen (zie stap 1.2) en buffer in een totaal volume van 50 µL bij 37 ° C's nachts. Bijvoorbeeld, te verteren construct met 5 eenheden PacI en 5 stuks FseI, indien van toepassing (zie stap 1.2).
- Gel zuiveren verteerd vector en invoegen met behulp van een commerciële gel extractie kit volgens de instructies van de fabrikant. Het uitvoeren van een standaard Afbinding van 100 ng van vector en 100-1000 ng van invoegen met behulp van 400 U T4 inactivering van ligase bij 14 ° C gedurende 16 h. warmte bij 65 ° C gedurende 10 minuten.
- Transformeren bevoegde bacteriën met behulp van een standaard warmte-schok-protocol16.
- Plaat op agar platen met 100 µg/mL ampicilline. Incubeer bij 30 ° C gedurende 24 uur.
- Kies één kolonies, zuiveren plasmide DNA met behulp van een commerciële miniprep kit volgens de instructies van de fabrikant en de volgorde controleren door Sanger sequencing17 (sequencing primer: 5' TGCTGGAGTTCTTCGCC 3').
- Gebruik positieve kolonies voor maxi schaal versterking van plasmide DNA en zuiveren met behulp van een endotoxine-vrije plasmide voorbereiding kit18 volgens de instructies van de fabrikant.
- Construct is klaar voor de injectie, dus ga verder met stap 5.
2. het klonen van een transgenic voor afleidbare genexpressie
- Inleidingen voor transgenic amplificatie13,14te ontwerpen.
- Beperkingsplaatsen voor SacI (GAGCTC), SpeI (ACTAGT) of KpnI (GGTACC) toevoegen aan het einde 5' van de voorwaartse primer. Beperkingsplaatsen voor kennisgevingen (GCGGCCGC) of XhoI (CTCGAG) toevoegen aan het einde 5' van de omgekeerde primer.
- Amplify transgenic door PCR voorwaarden geoptimaliseerd voor de gewenste transgenic14gebruiken. Zuiveren met behulp van een commerciële DNA zuivering kit.
- Verteren de gezuiverde transgenic en 4 µg Entry vector (pEN_TTmcs-Vector, Zie Tabel van materialen)19 afzonderlijk met geschikte beperking nucleasen (zie stap 2.2) en buffer in een totaal volume van 50 µL bij 37 ° C's nachts.
- Gel zuiveren verteerd vector en invoegen met behulp van een commerciële gel extractie kit volgens de instructies van de fabrikant. Het uitvoeren van standaard afbinding met 100 ng van vector en 100-1000 ng van invoegen met behulp van 400 U T4 inactivering van ligase bij 14 ° C gedurende 16 h. warmte bij 65 ° C gedurende 10 minuten.
- Transformeren bevoegde bacteriën met behulp van een standaard warmte-schok-protocol16.
- Plaat op agar platen bevatten 15 µg/mL gentamicine. Incubeer bij 37 ° C gedurende 16 uur.
- Kies één kolonies, zuiveren plasmide DNA, en Bevestig wachtwoord invoegen door sequentiebepaling17 met behulp van de pCEP naar voren primer: 5' AGAGCTCGTTTAGTGAACCG 3'.
Opmerking: PCR op één kolonies kan worden uitgevoerd zonder voorafgaande zuivering met inleidingen pCEP vooruit en pCEP reverse (5' AGA AAG CTG GGT CTA GAT ATC TCG 3'). Deze stap kan nuttig zijn voor de voorselectie van positieve kolonies.
- Ga verder met stap 4.
3. het klonen van een miR-shRNA voor afleidbare Gene Knock-down
- Het ontwerp van miR-shRNA oligonucleotides volgens het pSLIK protocol19klonen. Anneal oligonucleotides zuiveren en verdunnen 1:20 in ddH2O.
- Digest 3 µg Entry vector met 5 U BfuAI bij 50 ° C gedurende 3 uur, vervolgens inactivering van de reactie bij 65 ° C gedurende 20 min.
Opmerking: Indien co uitdrukking van groen fluorescent proteïne (GFP) is gewenst, gebruik pEN_TTGmiRc19 als een vermelding vector, anders gebruiken pEN_TTmiRc219.
- Gel zuiveren verteerd vector zoals in stap 2.5. Uitvoeren van standaard Afbinding van 100 ng van vector en 1 µL van gezuiverd en shRNA oligonucleotides (stap 3.1) verdund met behulp van 400 U T4 ligase bij kamertemperatuur voor 1 h. warmte inactivering van 65 ° c gedurende 10 minuten.
- Transformeren bevoegde bacteriën met behulp van een standaard warmte-schok-protocol16.
- Plaat op agar platen bevatten 15 µg/mL gentamicine. Incubeer bij 37 ° C gedurende 16 uur.
- Kies één kolonies, zuiveren plasmide DNA, en Bevestig wachtwoord invoegen door Sanger sequencing17 (sequencing primer: 5' TAGTCGACTAGGGATAACAG 3').
- Ga verder met stap 4.
4. recombinational klonen voor het genereren van klaar-voor-injectie klonen
- Mix 150 ng van post vector (vanaf stap 2 of stap 3) en 150 ng van pTC TET-vector20.
- TE buffer toevoegen aan een totaal volume van 8 µL (pH = 8).
- Overdracht van de LR-clonase enzym mix II (Zie Tabel van materialen) om het ijs, Incubeer gedurende 2 min. Vortex tweemaal.
- Voeg 2 µL van LR-clonase enzym mix II met de reactie en Incubeer bij 25 ° C gedurende 1 uur.
- Zet de reactie stop door toevoeging van 1 µL van proteïnase K-oplossing. Incubeer bij 37 ° C gedurende 10 minuten.
- Stbl3 bevoegde bacteriën met 2 µL van recombinational klonen mengen met behulp van een standaard warmte-schok-protocol16transformeren.
- Plaat op agar platen met 100 µg/mL ampicilline. Incubeer bij 30 ° C gedurende 24 uur.
- Kies één kolonies, zuiveren plasmide DNA met behulp van een endotoxine-vrije plasmide voorbereiding kit18 volgens de instructies van de fabrikant, en bevestigen van vector integriteit door Sanger sequencing17 (sequencing primer 5' AGGGACAGCAGAGATCCAGTTTGG 3').
- Construct is klaar voor de injectie, gaat u verder met stap 5.
5. voorbereiden oplossing door hydrodynamische staart veneuze injectie
Opmerking: Voorbereiding van constructies voor constitutieve en afleidbare genexpressie zijn beschreven in stap 1, 2, 3 en 4.
- Bereiden van steriele zoutoplossing 0,9% voor injectie (doen niet gebruik PBS). Gebruik volume dat overeenkomt met ongeveer 10% van het lichaamsgewicht van de muis. Voorbeeld: voor een muis met een gewicht van 20 g, bereiden 2 mL oplossing.
- Bereiden injectie vectoren die werden gezuiverd met behulp van een plasmide endotoxine-gratis reiniging kit18 (zie stap 1.8 of 4.8, respectievelijk).
- Voeg 10 µg of 15 µg voor Doornroosje endotoxine-vrije vector construct (uit stap 1 gebruik 10 µg, uit stap 4 gebruik 15 µg, respectievelijk) en 1 µg endotoxine-gratis pc-HSB5,21 per mL steriele zoutoplossing.
- Winkel oplossing voor maximaal 4 uur bij 4 ° C. Niet invriezen.
6. het uitvoeren van hydrodynamische staart veneuze injectie
- Gebruik een afdekking voor staart-veneuze injectie (commercieel of bereid uit een conische buis van 50 mL met gaten voor de ademhaling en de staart). Vul de onderkant van de buis met papieren zakdoekje.
- Gebruik voor injectie, muizen van ongeveer 8 – 10 weken oud met een gewicht van 20 tot 25 g.
- Weeg muizen vóór injectie en bereiden van geïnjecteerde volume volgens lichaamsgewicht (overeenkomt met 10% van het lichaamsgewicht, zie stap 5.1). Een steriele 3 mL-spuit met een 27 G-naald voorbereiden door injectie en vulling met de vereiste volume.
- Plaats de muis in de afdekking. De hoeveelheid papieren zakdoekje aanpassen (zie stap 6.1) te verlaten slechts minimale ruimte voor beweging maar genoeg ruimte om te ademen.
- Zorg ervoor dat de muis regelmatig ademt.
- Warm de staart met behulp van een infrarood lamp voor 30-60 s. zorgvuldig letten op tekenen van oververhitting.
- Reinig de staart met een alcohol doekje.
- Steek de naald bijna horizontaal in een van de twee zijdelingse staart aderen dicht bij de basis van de staart.
Opmerking: Indien succesvol geplaatst, kan een kleine hoeveelheid bloed stromen terug in de conus van de naald. Het is niet aanbevolen om actief gecombineerd zoals elke extra beweging van de naald leiden de verplaatsing en/of letsel van de ader tot kan.
- Injecteer het totale volume in de ader van de staart binnen 8-10 s.
- Onmiddellijke verwijdering van de muis van de afdekking. Comprimeren van injectie wond voor ten minste 30 s of totdat een bloeding afneemt.
- Hiermee plaatst u de muisaanwijzer in een aparte kooi. Zodra de muis is hersteld van de procedure (ongeveer 30-60 min), de muis ook terug overzetten naar zijn oorspronkelijke kooi. Sortie voort naar de muis regelmatig gedurende de volgende 24 uur.
Opmerking: Milde sedatie van de muis wordt regelmatig waargenomen voor maximaal 2 uur na de injectie.
- Voordat u verdergaat met verdere experimenten (d.w.z., stap 7), wacht 10 tot 15 dagen voor de goedkeuring van de niet-geïntegreerde vectoren.
7. de inductie van Transfected CreER met Tamoxifen
Let op: Tamoxifen schadelijk is kan, worden kanker of schade van vruchtbaarheid. Raadpleeg het veiligheidsinformatieblad.
- Plan intraperitoneaal tamoxifen injecties op drie opeenvolgende dagen.
- Los op dag 1, 10 mg van tamoxifen in 40 µL ethanol. Incubeer bij 55 ° C gedurende 10 min. Vortex meerdere malen totdat de tamoxifen heeft opgelost.
- Toevoegen van 960 µL maïsolie. Incubeer gedurende 5 minuten bij 55 ° C. Vortex meerdere malen om een heldere oplossing.
- Bereid de oplossing in een 1-mL insuline-injectiespuit met een naald 27 G.
- Nekvel de muis door grijpen de hals van de muis zorgvuldig met de duim en de tweede vinger, tot vaststelling van de staart tussen de basis van de hand en de vierde en vijfde vinger.
- Injecteren 0,1 mL (= 1 mg van tamoxifen) van de oplossing intraperitoneally in het linker onderste kwadrant van het abdomen.
- Herhaal de injecties op dag twee en drie.
8. de inductie van Tetracycline-afhankelijke gen of shRNA expressie
Let op: Doxycycline schadelijk kan zijn. Raadpleeg het veiligheidsinformatieblad.
Opmerking: Afhankelijk van het type en de duur van het experiment, doxycycline kan geleverd worden in drinkwater (stap 8.1) of de chow (stap 8.2)
-
Voor korte termijn experimenten (< 10 dagen) beheer van de doxycycline via drinkwater met behulp van de onderstaande voorschriften.
- Los 5 g sacharose in 100 mL leidingwater. Autoclaaf.
- Los 100 mg doxycycline-hyclate in 5 mL sacharoseoplossing (stap 8.1.1) in een conische buis 15 mL.
- Behulp van een 10 mL spuit, steriele filter de oplossing door een 0,2 µm filter. Voeg toe aan de sacharoseoplossing bereid in stap 8.1.1.
- Doxycycline-sacharoseoplossing verstrekken als drinkwater voor de muis. Controleer dagelijks en vervangen wanneer de oplossing wordt bewolkt met vermelding van bacteriële overgroei (heldere oplossing vervangen na drie dagen uiterlijk).
- Voor lange termijn experimenten (> 10 dagen) of experimenten gevoelig voor metabole veranderingen, gebruik commerciële doxycycline-chow (bijvoorbeeldDoxycycline Hyclate Chow 0.625 g/kg) om te voorkomen dat uitdroging en/of sacharose-geïnduceerde veranderingen in de lever van behandelde dieren.
9. voorbereiding van muis lever voor analyse door immunokleuring
Let op: Paraformaldehyde schadelijk kan zijn. Raadpleeg het veiligheidsinformatieblad.
Opmerking: Het timepoint wanneer muizen zal worden geanalyseerd is afhankelijk van het experiment. Het is aanbevolen om het analyseren van leverweefsel na maar liefst drie dagen van doxycycline behandeling om voldoende inductie van transgenic of shRNA expressie.
- Bereiden een spuit van 1 mL met een 27 G naald met 1 mL van 4% paraformaldehyde-oplossing (PFA).
- De muis door een geschikte methode volgens een goedgekeurde dierlijke protocol euthanaseren.
Opmerking: Richtsnoeren voor passende methoden voor euthanasie kunnen variëren afhankelijk van de instelling.
- Open de buikholte met ontleden schaar en anatomische pincet, zorgvuldig met een mediane laparotomie bloot van de lever. De dunne darm naar rechts om de portal-ader en de vena cava (IVC), inferior bloot te verplaatsen.
- De naald van de spuit bereid invoegen (zie stap 9.1) in het IVC en snijd de ader van de portal. Injecteren 1 mL PFA langzaam het IVC perfuse het leverweefsel en verwijderen van auto-belichting fluorescerende rode bloedcellen (wenselijk als immunefluorescentie kleuring worden uitgevoerd).
- Het verwijderen van de lever. Spoelen in water en breng aan 5-10 mL van 4% PFA-oplossing.
- Voor paraffine secties is fix weefsel voor 36 – 48 h. weefsel klaar voor uitdroging en paraffine insluiten.
-
Voor bevroren secties, vast weefsel in 4% PFA gedurende 1 uur.
- Draag voor een cryoprotection, naar 10% sacharoseoplossing. Incubeer 60 min.
- Transfer naar 20% sacharoseoplossing. Incubeer 60 min.
- Transfer naar 30% sacharoseoplossing. Incubeer 12 – 16 h. Embed in te embedding samengestelde voor bevroren secties en bevriezen bij-20 ° C.