Het volgende protocol is in overeenstemming met de richtsnoeren van de ethiek door het Duke University onderzoek ethisch comité vastgesteld.
1. de weefsels voorbereiding en Developmental enscenering van Drosophila melanogaster Verpopping
- Kies eerst hoeveel vliegen nodig zal zijn voor de dissectie. Voor RT-PCR en RNAseq, 100-200 antennal schijven en antennes van individuen die nodig in prepupal, 8 h APF, 40 h APF, en volwassen stadia zijn te verzamelen. Ontleden voor immunohistochemistry, 10-20 individu.
- Alle materialen, met inbegrip van hersendissectie pads en pincet, doekjes met 70% reinigen EtOH. Als de ontleed materiaal is om te worden gebruikt voor RNA extracties, schoon alles met RNase neutraliserende en alle oplossingen via nuclease-vrije of diethyl-pyrocarbonate (DEPC) behandeld water.
Opmerking: Dit protocol maakt gebruik van silicone dissectie pads in plaats van glas voor de ontledingen. Silicone pads zijn vriendelijk voor ultra-fijne pincet en bevorderen van snelle en kwalitatief hoogwaardige dissecties.
- Verzamelen Verpopping bij de 0 h APF/prepupal stadium.
- Om de meest nauwkeurige tijdelijke, monitor de larven op 30 min tot 1U intervallen.
Opmerking: Dolende derde instar-larven in een matig overvolle fles zal waarschijnlijk binnen een paar uur verpoppen.
- Zodra de larven immobiel en zijn omringd door een erg licht (bijna witte) gekleurde pop geval, ze vervolgens overbrengen naar een kleine 2 - in petrischaal met een vochtig filterpapier.
- Blijven voor 1-2 h, af en toe controle, identificatie, en de overdracht van prepupae.
Opmerking: Als alternatief, duidelijk een fles van alle poppen en laat de larven te ontwikkelen gedurende 2 uur. Alle poppen verzameld na 2U zal binnen een 0 - 2 h APF bereik.
- Onmiddellijk naar stap 3.1 verplaatsen om te ontleden de prepupal antennal schijf voor de fase van de APF 0 h. Als de prepupa worden ouder moet, verzamelen ze in een schotel, dekking van de schotel en plaats een paraffine-film rond de randen voor de remming van de droogte en plaats de petrischaal bij 25 ° C.
Opmerking: De poppen kunnen nu worden leeftijd tot eclosion.
- Leeftijd voor poppen verzameld in een 2U-bereik, de prepupae voor minder dan de gewenste leeftijd 2 h om ervoor te zorgen dat de poppen geen overdosering.
- Gebruik ultra-fijne pincet (Dumont 55) als het weefsel is zeer klein en kwetsbaar.
2. de weefsels voorbereiding en ontwikkelingsstoornissen enscenering van Verpopping van andere diersoorten Drosophila
- Om te bepalen van de lengte van de pop ontwikkeling in andere soorten Drosophila , leg de monsters op de optimale temperatuur, vastleggen van de data wanneer prepupae worden waargenomen, sorteren hen in een verse flesje en registreren het aantal dagen vanaf de prepupa tot volwassenheid.
- De verhouding van tijd voor pop ontwikkeling voor niet -melanogaster soorten en melanogasteropnemen. De verhouding van de ontwikkelings tijd door het aantal uren voor de enscenering melanogaster gebruikt zodat het aantal uren tot de leeftijd van de soorten niet -melanogaster vermenigvuldigen.
3. dissectie van D. melanogaster pop Antennal Disc
Opmerking: Alle tijden van de veroudering en dissectie protocollen worden beschreven voor Drosophila melanogaster. Voor alle andere soorten, zal een wijziging van het protocol van de veroudering op basis van de punten van de soortspecifieke ontwikkelings tijd nodig zijn, zoals hierboven beschreven.
- Voor pop antennal schijf dissecties, verzamelen van 50-100 0 - 2 h of 6-8 h oude poppen met behulp van een spatel en leg ze op een dissectie pad.
- Pipetteer 150 µL van RNA isolatie-oplossing in een RNase gratis 1.5-mL microfuge buis met behulp van een precisiepipet 200-µL en plaats de buis op ijs.
- Het ontleden van de poppen in 150-200 µL van 1 x PBS (phosphate buffered saline, nuclease-gratis). Plaats meerdere druppels met PBS (150-200 µL per druppel) op de dissectie-pad.
- Op het pad van de dissectie, plaats u de 0 - 2 h of 6-8 h ouder poppen (één Verpopping per druppel) om te worden ontleed in één van de 1 x PBS druppels. Gebruik pincet in de ene hand om het lichaam te stabiliseren.
- Voor de 0 - 2 h veroudering van poppen, pincet in de andere hand, houd op met het meest voorste deel (de mond hooks) van de prepupa en het blootstellen van de hersenen en het imaginaire schijven aangesloten op het voorste pop geval uitlichten.
- Voor de 8 h APF poppen, eerst zachtjes afschilferen het pop geval vanaf het meest anterior kwartaal voor de verpopping, bloot het hoofd binnen de membraan-zak, die het lichaam omringt.
Opmerking: Het lichaam, in dit stadium ziet eruit als een degenererende larve.
- Verwijder het hoofd op het gewricht van de nek.
Opmerking: Dit zorgt ervoor dat de antennal schijven zal niet verloren gaan, die in dit stadium zijn aangesloten voornamelijk op de optische kwabben van de hersenen.
- Het weefsel met de hersenen en het imaginaire schijven naar een andere 1 x PBS druppel met pincet of een 20-µL pipet overbrengen.
- Het identificeren van de oog-antennal schijf aangesloten op de hersenen bij de optische kwabben. Met behulp van Tang, Verbreek de oog-antennal schijf de hersenen en de pop zaak. Overbrengen naar een nieuwe 1 x PBS druppel met pincet of een 20-µL pipet.
Opmerking: De prepupal oog-antennal disc is een platte weefsel. Echter door de 8 h poppen, worden de oog-schijven geroteerd cupping de antennal schijven, die zit anterior to de centrale hersenen.
- Met behulp van Tang, knip het weefsel op de site van de verbinding tussen het oog en de antennal schijf. Een 20-µL pipet zachtjes overdracht van het ontleed weefsel in het RNA reagens voor de oplossing van de isolatie gebruiken Het minimaliseren van de hoeveelheid vloeistof die door een zo klein mogelijk bedrag pipetteren overgedragen.
- Herhaal totdat alle poppen hebben is ontleed.
4. dissectie van D. melanogaster medio-pop en volwassen antennes
Opmerking: Door 40 h APF, de meerderheid van de metamorfose is voltooid, en de volwassen structuren zijn steeds herkenbaar, maar zijn nog steeds wit en onopvallend. Op dit punt van de ontwikkelings tijd, de volwassen antenne heeft haar definitieve vorm gekregen maar nog steeds is transparant en de meerderheid van de olfactorische receptoren, met uitzondering van enkelen, expressie niet zijn begonnen.
- Voor pop antennal dissecties, verzamelen van 50-100 prepupae zoals beschreven in stap 1 en leeftijd ze voor 40 h bij 25 ° C.
- Pipetteer 150 µL van RNA isolatie-oplossing in een RNase gratis 1.5-mL microcentrifuge tube met behulp van een 200-µL pipet en plaats de buis op ijs.
- Het pad van de dissectie, plaatst de verpopping te worden ontleed in één van de 1 x PBS druppels. Gebruik pincet in de ene hand om het lichaam te stabiliseren. Zachtjes de pop geval vanaf het meest anterior kwartaal van de verpopping, bloot het hoofd binnen de membraan-zak, die het lichaam omringt met pincet in de andere hand, afschilferen.
- Met behulp van Tang, zorgvuldig afgesneden het hoofd van de rest van de pop lichaam door het lichaam met één set pincet en rippen van het hoofd af bij de hals gezamenlijk met een andere set van verlostang. Pipetteer zachtjes het hoofd in een ander 1 x PBS druppel met pincet. Pipetteer omhoog en omlaag om de inhoud van het hoofd (hersenen, etc.) te verkrijgen van een duidelijke membraan dat gebruikt om te omringen het ontwikkelende Drosophila hoofd leeghalen.
Opmerking: Bij 40-50 h APF, de antennes zijn aangesloten op het anterior-meeste gedeelte van het membraan. Zij zal blijken voor dissectie wanneer de inhoud van het hoofd met pipetteren zijn gewist.
- Met behulp van Tang, wordt de pop antennes verbreken door het membraan. De 2nd -segment van de antenne te verbreken van de 3rd met behulp van Tang aan het segment op het segmentale gewricht, zoals alleen de 3rd segment zal het huis van de olfactorische receptor neuronen.
- Een 20-µL pipet zachtjes overdracht van het ontleed weefsel in het RNA reagens voor de oplossing van de isolatie gebruiken Het minimaliseren van de hoeveelheid vloeistof die door een zo klein mogelijk bedrag pipetteren overgedragen. Herhaal totdat alle poppen hebben is ontleed.
- Voor volwassen antennal dissecties, verzamelen van ongeveer 50 volwassenen en hen voor een week na eclosion leeftijd.
Opmerking: De expressie van genen die olfactorische receptor en andere genen piek een week na eclosion. De volwassenen zijn leeftijd voor een week om biologisch relevante genen met lage overvloed afschriften te stijgen boven de drempel van detectie.
- Ontleden voor RNA extracties, vliegen terwijl ze nog in leven op een CO2 pad. Behandel de CO2 -pad met RNase remmers. Voor confocal imaging, ontleden de vliegen op een pad van de dissectie in 1 x PBS of PBS + 0,2% Triton.
- Ten eerste, de volwassenen om te slapen op de CO2 station pad onder het toepassingsgebied van de dissectie plaatsen Op de CO2 station pad, gebruik pincet in de ene hand te stabiliseren van het lichaam, kunt pincet in de andere hand zachtjes trekken/snuifje uit het derde antennal segment van de tweede.
- Overdracht van de antennes in een isolatie-oplossing van RNA, gebruik pincet te plaatsen van de antenne rechtstreeks in de vloeistof. Herhaal totdat alle volwassenen hebben is ontleed.
Opmerking: Zorg ervoor dat de antennes zijn ondergedompeld in RNA isolatie-oplossing. De antennes kunnen worden vast te zitten aan de zijkant van de buis. Hierdoor wordt een verhoogde afbraak van het RNA, vermindering van RNA kwaliteit en kwantiteit.
- Direct overgaan tot de RNA extractie of plaats de buis bij-80 ° C voor langdurige opslag.
5. RNA isolatie uit ontleed weefsels
- Verwijder alle monsters van de opslag-80 ° C en hen in de ijskast ontdooien.
- Kort draaien (5-6 s, ~ 6.000 x g) elk monster voor het verzamelen van het materiaal aan de onderkant van de buis.
- Slijpen van elk monster met behulp van een gesteriliseerde met autoclaaf kunststof stamper en een elektromotor voor 10 s op ijs.
- Herhaal stap 5.2 en 5.3 4.
- Uitvoeren van het RNA extractie met behulp van commercieel beschikbare kits en de protocollen van de fabrikant voor een optimale opbrengst.
- QRT-PCR met verkrijgbare reagentia en specifieke primers tegen genen van belang en na de fabrikant protocollen uitvoeren.
- Alle PCR reacties met behulp van de volgende voorwaarden vervullen: denaturatie van 95 ° C gedurende 10 minuten gevolgd door 40 cycli van 95 ° C voor 15 s, 55 ° C gedurende 30 s en 60 ° C gedurende 30 s.
Opmerking: Primerparen voor DIP en dpr genen zijn vermeld in tabel 1, en inleidingen voor olfactorische receptor genen staan in Hueston CE et al. 8.
6. fixatie van de pop Antennal schijven en antennes voor Immunohistochemistry
Opmerking: Correctie van de weefsels in batches van 10-20 personen te zorgen dat de weefsels zijn vaste voor dezelfde hoeveelheid tijd. Minimaliseer de hoeveelheid tijd die de monsters in PBT (PBS met afwasmiddel blijven) vóór het overbrengen van hen naar een fixatief om te maximaliseren van de integriteit van de weefsels.
- Verzamel de ontleed antennal schijven of pop antennes in een 200-µL PCR buis met 200 µL van 0,2% PBT op ijs om weefsel integriteit te handhaven, en om te voorkomen dat het monster van het plakken aan de muur van 200-µL PCR buizen die tot een onvolledige fixatie leiden zal.
Opmerking: Pop antennes en antennal schijven kunnen worden moeilijk te zien zoals ze vrij doorzichtig zijn. Het is raadzaam om een dissectie bereik voor alle wassen stappen gebruiken om te voorkomen dat enig verlies van weefsel. Anderzijds kunnen 96-wells-platen voor Terasaki worden gebruikt voor de fixatie en kleuring voor het beste bijhouden van het weefsel.
- Fix de ontleed antennal schijf en antennal monsters van poppen in ongeveer 200 µL van 4% PFA (Paraformaldehyde) gedurende 30 minuten bij kamertemperatuur. Voor dit en daaropvolgende houd stappen, de buizen met de monsters op een nutator goed mengen de monsters in de oplossing. Vooruitgang naar stap 6.7.
- Voor de volwassen antenne, eerst de gehele kop ontleden en repareren in ongeveer 200 µL van 4% PFA (paraformaldehyde) gedurende 1 uur bij kamertemperatuur.
- Wassen van 3 x met 200 µL van 0,2% PBT voor elke 10 min. Houd de monsters op de nutator tijdens de incubatie.
- Ga terug naar de dissectie Microscoop voor een fijnere dissectie van de tweede antennal segment van de vaste hoofden. Met behulp van Tang te stabiliseren van het hoofd zachtjes trekken/snuifje uit het derde antennal segment van de tweede.
- Breng de ontleed derde antennal segmenten in ongeveer 200 µL van 4% PFA (paraformaldehyde) en corrigeren gedurende 30 minuten bij kamertemperatuur.
- Wassen van 3 x met 200 µL van 0,2% PBT voor elke 10 min. Houd de monsters op de nutator tijdens de incubatie.
- Opslaan van de monsters bij 4 ° C of gaan direct met hele mount immunohistochemistry.
Opmerking: De efficiëntie van de kleuring kan veranderen wanneer het antilichaam wordt gebruikt. Deze methode moet geschikt zijn voor minder overvloedige eiwit tags of zwakkere antilichamen. Nochtans, soms, wellicht het een optimalisering van het protocol (de identiteit of de fixeerspray hoeveelheid of de tijd van fixatie).