Hier presenteren we een protocol om te bouwen van lab-schaal zeepbel kolom photobioreactors en ze gebruiken om cultuur microalgen. Het biedt ook een methode voor de bepaling van de groeisnelheid van de cultuur en de neutrale vetgehalte.
Een abonnement op JoVE is vereist om deze inhoud te bekijken. Log in of start vandaag met uw gratis proefperiode.
Methodenartikel
Hier presenteren we een protocol om te bouwen van lab-schaal zeepbel kolom photobioreactors en ze gebruiken om cultuur microalgen. Het biedt ook een methode voor de bepaling van de groeisnelheid van de cultuur en de neutrale vetgehalte.
Er is aanzienlijke interesse in de studie van microalgen voor waterbouwkundige toepassingen zoals de productie van biobrandstoffen, hoogwaardige producten, en voor de behandeling van afval. Zoals de meeste nieuwe onderzoeksinspanningen op laboratoriumschaal beginnen, is er behoefte aan een kosteneffectieve methoden voor het kweken van microalgen op een reproduceerbare wijze. Hier, communiceren we een effectieve benadering van cultuur microalgen in laboratoriumschaal photobioreactors en de groei en de neutrale vetgehalte van die algen te meten. Instructies vindt u ook op het instellen van het photobioreactor-systeem. Hoewel de organismen voorbeeld soorten Chlorella en Auxenochlorella zijn, kan dit systeem worden aangepast om het kweken van een breed scala van microalgen, met inbegrip van co culturen van algen met niet-algen soorten. Stamculturen worden eerst gekweekt in flessen te produceren van entmateriaal voor het photobioreactor-systeem. Algen entmateriaal is geconcentreerd en overgedragen aan photobioreactors voor de teelt in de batchmodus. Monsters worden dagelijks verzameld voor de gemeten optische dichtheid. Aan het einde van de batch-cultuur, cellen worden geoogst door centrifuge, gewassen, en gedroogd tot een droge eindgewicht verwachte concentratie aan bevriezen. De droge eindgewicht concentratie wordt gebruikt voor het maken van een correlatie tussen de optische dichtheid en de concentratie van het drooggewicht. Een gemodificeerde Folch methode wordt vervolgens gebruikt om totale lipiden uittreksel uit de gevriesdroogde biomassa en het extract is vehiculumcontrolegroep haar neutrale vetgehalte met behulp van een microplate-assay. Deze bepaling heeft eerder gepubliceerd maar protocol stappen waren hier om te markeren van kritische stappen in de procedure waar fouten vaak voorkomen. Het systeem van de bioreactor hier beschreven vult een niche tussen eenvoudige kolf teelt en volledig gecontroleerde commerciële bioreactoren. Zelfs met slechts 3-4 biologische repliceert per behandeling, onze benadering van het kweken van algen leidt tot strakke standaarddeviaties in de groei en lipide testen.
De toepassing van microalgen in engineering en biotechnologie heeft aangetrokken veel belangstelling in de afgelopen jaren. Microalgen worden bestudeerd voor gebruik in afvalwater behandeling,1,2,3,4, biobrandstof productie5,6,7,8, en de productie van nutraceuticals en andere hoogwaardige producten9,10. Algen zijn ook wordt genetisch gemodificeerde tegen grotere prijzen in een poging om hun geschiktheid voor specifieke technische toepassingen11,12te verbeteren. Er is dus grote belangstelling voor experimenten met industrieel relevante organismen in gecontroleerde instellingen. Het doel van deze methode is een doeltreffende benadering van cultuur microalgen in een gecontroleerde laboratoriumomgeving communiceren en voor het meten van de groei en de neutrale vetgehalte van die algen. Verbetering van groei tarieven en neutrale vetgehalte van microalgen zijn geïdentificeerd als twee grote knelpunten richting van commercialisering van algen biobrandstoffen13.
Een breed scala van benaderingen zijn gebruikt om cultuur algen voor experimentele doeleinden. In het algemeen, kunnen deze benaderingen worden verdeeld tussen grootschalige outdoor teelt en kleinschalige binnen kweek. Outdoor teelt in photobioreactors en open vijvers is geschikt voor experimenten gericht op schaalvergroting van processen die reeds hebben bewezen op laboratoriumschaal (bijvoorbeeld voor het testen van schaal-up van een nieuwe hoge-lipide-stam van algen)14. Echter binnen kleinschalige teelt geschikt bij het ontwikkelen van nieuwe of verbeterde algen stammen is of het uitvoeren van experimenten gericht op het begrip biologische mechanismen. In deze laatste gevallen moet een hoge mate van experimentele controle plagen uit subtiele veranderingen in de biologische werking. Te dien einde zijn een culturen vaak nodig om te minimaliseren van de complexe biotische factoren die samenhangen met andere organismen (bijvoorbeeld bacteriën, en andere algen) die onvermijdelijk in grootschalige outdoor systemen groeien. Zelfs bij de studie van interacties tussen algen en andere organismen, die we hebben gevonden dat gebruik van hoogst-gecontroleerde experimentele omstandigheden nuttig is bij de behandeling van moleculaire uitwisseling tussen organismen15,16,17.
Binnen de categorie van kleinschalige indoor algen teelt en een aantal benaderingen zijn gebruikt. Misschien is de meest voorkomende benadering groeien algen in conische kolven op een shaker tafel onder een lichte bank18,19. Uitwisseling van zuurstof en CO2 vindt plaats door passieve diffusie door middel van een stekker schuim in de top van de kolf. Sommige onderzoekers hebben deze set-up via actieve beluchting van de kolven20verbeterd. Een andere aanpak is het kweken van algen in flessen, gemixt door roer bar en actieve beluchting. Ondanks hun eenvoud, hebben we vonden dat het gebruik van flacons en flessen vaak tot een inconsistente resultaten van biologische replicaat-organismen leidt. Vermoedelijk is dit te wijten aan de positie effecten - verschillende posities krijgen verschillende hoeveelheden van het licht, die ook van invloed op interne reactor temperaturen. Dagelijkse rotatie van reactoren naar nieuwe posities kan helpen, maar is niet het probleem verlichten omdat bepaalde fases van de groei van algen (bijvoorbeeld vroeg exponentiële) zijn gevoeliger voor positionele effecten dan anderen (bijvoorbeeld log fase).
Aan de andere kant van het spectrum van technologische geavanceerdheid zijn volledig gecontroleerde commerciële photobioreactors. Deze systemen voortdurend controleren en aanpassen van de omstandigheden in de reactor voor het optimaliseren van de groei van algen. Ze hebben programmeerbare verlichting, real-time temperatuurregeling en pH-control. Helaas, ze zijn duur en typisch kosten duizenden dollars per reactor. Meest wetenschappelijke en technische tijdschriften vereisen biologische replicatie van resultaten, waardoor de aankoop van meerdere bioreactoren. Wij presenteren hier een zeepbel kolom reactor systeem dat de kloof tussen de eenvoudige (kolf) en geavanceerde (volledig gecontroleerde bioreactor) benaderingen voor lab-schaal algen teelt bruggen. Bubble kolommen kunnen stijgende gasbellen gas uitwisseling en meng de reactor. Deze aanpak biedt een zekere mate van controle over de verlichting en de temperatuur, maar doet dit op een manier die rendabel. Bovendien hebben we gevonden dit systeem zeer consistente resultaten van biologische replicaat-organismen, vermindering van het vereiste aantal biologische replicatieonderzoeken noodzakelijk zijn voor het verkrijgen van statistisch significante resultaten in vergelijking met de kolf of fles aanpak. Ook hebben we dit systeem gebruikt te kweken mengsels van algen en bacteriën21. Naast de teelt van algen schetsen we een procedure voor het meten van de neutrale vetgehalte in de gekweekte algen. De laatste methode is gepubliceerd elders22, maar ook hier de procedure om te bieden stapsgewijze instructies voor het met succes gebruiken.
Toegang beperkt. Log in of start een proefperiode om deze inhoud te bekijken.
1. installatie van Bubble kolom Photobioreactors

Figuur 1. Schema en foto's voor de bouw van de bioreactoren. (A) Schematische voor de bouw van de bioreactor deksels (B) foto van het geassembleerde bioreactor deksel, en (C) foto van het geassembleerde deksel, gebruikt voor de luchtbevochtiger. Merk op dat de luchtbevochtiger-hulpstukken moeten worden gecoat in waterdichte siliconen om een luchtdichte zegel met het deksel. Klik hier voor een grotere versie van dit cijfer.

Figuur 2. Schema en foto's voor het samenstellen van de zeepbel kolom systeem. (A) Schematische voorstelling van de beluchting systeem (B) foto van de luchtbevochtiger, mengen van de val, en rotameter bank, en (C) foto van de variëteiten gebruikt de rotameter banken om elkaar te verbinden. Klik hier voor een grotere versie van dit cijfer.

Figuur 3. Systeem schema voor de fles bioreactoren (links) en de photobioreactors van de kolom van de zeepbel (rechts). Dit cijfer is gewijzigd van Higgins et al. 17. Klik hier voor een grotere versie van dit cijfer.
2. voorbereiding van microalgen entmateriaal
3. teelt van microalgen in Bubble kolom Photobioreactors
4. oogsten en vriesdrogen van Microalgal biomassa
5. lipide extractie met behulp van een gemodificeerde Folch methode24
6. neutrale lipide Assay met een Microplate-methode (aangepast van Higgins et al. 201422)
Toegang beperkt. Log in of start een proefperiode om deze inhoud te bekijken.
Deze procedure levert een tijdsverloop van algen optische dichtheid gegevens bij OD 550 nm (figuur 4A). De optische dichtheid en het droge gewicht concentratie gegevens kunnen worden gecorreleerd (figuur 4B). Dit wordt bereikt door de eerste berekening van de concentratie van de algen droge eindgewicht na de freeze-drying stap. Vervolgens kan de optische dichtheid van de cultuur seriële verdunning (uitgevoerd op de laatste dag va...
Toegang beperkt. Log in of start een proefperiode om deze inhoud te bekijken.
De belangrijkste overweging bij het kweken van algen is een goed begrip van de specifieke behoeften van het organisme of groep van organismen. De algen Cultuurstelsel hier beschreven kan worden gebruikt om de cultuur van een breed scala van algen, maar de specifieke abiotische factoren (temperatuur, media, pH, licht intensiteit, CO2 -niveau, beluchting tarief) moeten worden aangepast aan de behoeften van het organisme. Opmerking de hier beschreven parameters werden gebruikt voor de teelt van Chlorella...
Toegang beperkt. Log in of start een proefperiode om deze inhoud te bekijken.
De auteurs hebben niets te onthullen.
Steun voor dit onderzoek werd verzorgd door USDA nationale Instituut voor voedsel en landbouw Hatch Project ALA0HIGGINS en de Auburn University kantoren van de rector, de Vice President voor onderzoek en de Samuel Ginn College of Engineering. Ook werd de steun verleend door NSF verlenen CBET-1438211.
Toegang beperkt. Log in of start een proefperiode om deze inhoud te bekijken.
| Naam | Bedrijf | Catalogusnummer | Opmerkingen |
|---|---|---|---|
| Benodigdheden voor airlift fotobioreactor opstelling | |||
| 1 L Pyrex flessen | Corning | 16157-191 | Voor flesreactoren, bevochtigers |
| 1/2" slangklem | Home Depot | UC953A | of gelijkwaardig |
| 1/4" vrouwelijke luer naar barb | Nordson biomedical | Nordson FTLL360-6005 | 1/4" ID, PP |
| 1/4" ID, 3/8" OD autoclaveerbare PVC buis | Thermo-Nalgene | 63013-244 | 50' |
| 1/4" in O-ringen | Grainger | 1REC5 | #010 Medium Hard Silicone O-Ring, 0.239" I.D., 0.379"O.D. |
| 1/8" Vrouwelijke luer naar barb | Nordson biomedical | FTLL230-6005 | |
| 1/8" ID, 1/4" OD autoclaveerbare PVC buis | Thermo-Nalgene | 63013-608 | 250' |
| 1/8" mannelijke draaiende luer naar barb | Nordson biomedical | MLRL013-6005 | |
| 1/8" multiport barb | Nordson biomedical | 4PLL230-6005 | 1/8" multiport barb |
| 1/8" NPT naar barb | Nordson biomedical | 18230-6005 | 1/8" 200 series barb |
| 1/8" paneelmontage luer | Nordson biomedical | Nordson MLRLB230-6005 | 1/8", PP |
| 10 gallon vistank | Walmart | 802262 | Kan tot 8 bioreactoren bevatten, afhankelijk van de lay-out |
| 100-1000 ccm debietmeter | Dwyer | RMA-13-SSV | Voor flesreactoren |
| 2 ft fluorescentie lichtbank | Agrobrite | FLT24 T5 | |
| 200-2500 ccm debietmeter | Dwyer | RMA-14-SSV | Voor luchtregeling stroomopwaarts van bevochtiger |
| 250 mL Pyrex flessen | Corning | 16157-136 | Voor gasmenging na bevochtiger |
| 50-500 ccm debietmeter | Dwyer | RMA-12-SSV | Voor hybridisatiebuisreactoren |
| 5-50 ccm debietmeter | Dwyer | RMA-151-SSV | Voor CO2 stromingssnelheidscontrole |
| Luchtfilters 0.2 µm | Whatman/ Fisher | 09-745-1A | Polyvent, 28 mm, 0.2 µm, PTFE, 50 pack |
| Terugslagkleppen | VWR | 89094-714 | |
| Corning deksels voor pyrex flessen | VWR | 89000-233 | 10 GL45 deksels |
| Vrouwelijke luer dop | Nordson biomedical | Nordson FTLLP-6005 | Vrouwelijke stabiele PP |
| Hybridisatiebuizen | Corning | 32645-030 | 35x300 mm, pak van 2 |
| Lichttimer | Walmart | 556393626 | |
| Veiligheidsmoeren | Nordson biomedical | Nordson LNS-3 | 1/4", rood nylon |
| Laag profiel magnetische roerder | VWR | 10153-690 | Laag profiel magnetische roerder |
| Mannelijke luer dop | Nordson biomedical | Nordson LP4-6005 | Mannelijke plug PP |
| Spinning luer vergrendelingsring | Nordson biomedical | Nordson FSLLR-6005 | |
| Roerstaven - lang | VWR | 58949-040 | 38.1 mm, voor flesreactoren |
| Roerstaven - middel | VWR | 58949-034 | 25 mm, voor hybridisatiebuizen |
| Benodigdheden en reagentia voor het kweken van algen | |||
| 0.2 µm filters | VWR | 28145-491 | 13 mm, PTFE, voor het filteren van gebruikt medium uit dagelijkse kweekbemonstering |
| 1 mL spuiten | Air-tite | 89215-216 | Voor het filteren van gebruikt medium uit dagelijkse kweekbemonstering |
| 1.5 mL buizen | VWR | 87003-294 | Steriel (of gelijkwaardig) |
| 10 mL Serologische pipetten | Greiner Bio-One | 82050-482 | Steriel (of gelijkwaardig) |
| 100 mm platen | VWR | 25384-342 | 100x15 mm stapelbare petrischalen, steriele |
| 15 mL buizen | Greiner Bio-One | 82050-276 | Steriel (of gelijkwaardig), polypropyleen |
| 2 mL Serologische pipetpunten | Greiner Bio-One | 82051-584 | Steriel (of gelijkwaardig) |
| 2 mL buizen | VWR | 87003-298 | Steriel (of gelijkwaardig) |
| 50 mL buizen | Greiner Bio-One | 82050-348 | Steriel (of gelijkwaardig), polypropyleen |
| 96 well microplaat | Greiner Bio-One | 89089-578 | Polystyreen met deksel, platte bodem |
| Inoculatie lussen | VWR | 80094-478 | Steriel (of gelijkwaardig) |
| Vloeibare kooldioxide tank en regelaar | Airgas | CD-50 | |
| Benodigdheden en reagentia voor lipide extractie en neutrale lipide assay | |||
| 2 mL bead buizen | VWR | 10158-556 | Polypropyleen buis met deksel |
| 96 well microplates | Greiner Bio-One | 82050-774 | Polypropyleen, platte bodem |
| Bleekwater | Walmart | 550646751 | Gebruik alleen gewoon bleekwater, geen schoonmaakbleekwater |
| Chloroform | BDH | BDH1109-4LG | |
| Dimethyl sulfoxide | BDH | BDH1115-1LP | |
| Isopropyl alcohol | BDH | BDH11 |
Toegang beperkt. Log in of start een proefperiode om deze inhoud te bekijken.