Hier is een protocol voor het verzamelen en analyseren van driedimensionale kinematica van quadrupedal motoriek bij knaagdieren voor preklinische studies.
Methodenartikel
Hier is een protocol voor het verzamelen en analyseren van driedimensionale kinematica van quadrupedal motoriek bij knaagdieren voor preklinische studies.
Het nut van driedimensionale (3D) kinematische bewegingsanalyse systemen is beperkt in knaagdieren. Een deel van de reden voor deze ontoereikendheid is het gebruik van complexe algoritmen en wiskundige modellering die gepaard gaan met 3D-gegevensverzamelings-en analyseprocedures. Dit werk biedt een eenvoudige, gebruiksvriendelijke stap-voor-stap gedetailleerde methodologie voor 3D kinematische gang-analyse tijdens loopband voortbeweging in gezonde en neurotraumatische ratten met behulp van een motion capture-systeem met zes camera's. Ook voorzien zijn details over 1) kalibratie van het systeem in een experimentele set-up aangepast voor quadrupedal motoriek, 2) gegevensverzameling voor loopband motoriek bij volwassen ratten met behulp van markers gepositioneerd op alle vier de ledematen, 3) opties beschikbaar voor video tracking en verwerking, en 4) elementaire 3D-kinematische gegevens generatie en visualisatie en kwantificering van gegevens met behulp van de ingebouwde gegevensverzamelings software. Ten slotte wordt gesuggereerd dat het nut van deze motion capture-systeem worden uitgebreid naar het bestuderen van een verscheidenheid van motorische gedragingen voor en na neuro trauma.
Bij knaagdieren worden de tekorten van forelimb en achterpoot locomotief na neurologische aandoeningen vaak beoordeeld met behulp van subjectieve scorings systemen1. Geautomatiseerde systemen2,3,4,5 zijn aangenomen voor de analyse van de loop, maar hebben nadelen, omdat de primaire uitkomsten zijn gebaseerd op footprint analyse en niet in het vastleggen van cruciale segmentale en gezamenlijke kinematische variabelen die anders echte kinematica van bewegingen van ledematen kunnen onthullen2. Aangezien de meeste gang parameters gecorreleerd zijn, is een verzameling van parameters nodig om de compensaties te begrijpen die door ratten zijn aangenomen om motorische tekorten volledig te beoordelen.
In het afgelopen decennium zijn verschillende 3D-Bewegingsanalyse systemen6 ontwikkeld voor biomedisch onderzoek bij de mens. Deze systemen zijn succesvol en bewezen effectief in het opvangen van tekorten in motoriek bij gezonde menselijke volwassenen en veranderde kinematica van het lopen van6,7. Bij knaagdieren, momenteel beschikbare 3D kinematische bewegingssystemen nemen complexe algoritmen en modellering voor het bewegingsgedrag en gebruik maken van geavanceerde data-analysetechnieken8,9,10,11 , die uiteindelijk hun veelzijdigheid te beperken. Bovendien worden de methoden die worden gebruikt voor het verzamelen van gegevens met de meeste 3D-motion capture-systemen niet voldoende toegelicht in de literatuur. De details over gegevensverzameling en analyseprocedures, beperkingen en technieken die betrokken zijn bij het effectief gebruik van het systeem ontbreken.
Daarom is een van de gemeenschappelijke begrippen onder onderzoekers dat 3D motion tracking kinematische evaluaties nogal omslachtige en tijdrovende procedures zijn die technische expertise en uitgebreide gegevensanalyse nodig hebben. De bedoeling van dit werk is om de protocollen voor het verzamelen en analyseren van gegevens af te breken en de methodologie te beschrijven via een stapsgewijs proces, zodat het objectief, gemakkelijk te leren is en systematisch kan worden benaderd. Vandaag de dag is er een opkomende nadruk op het beoordelen van functioneel motorische gedrag op een uitgebreidere en systematische manier na neurologische verwondingen en interventies in preklinische studies.
Op het gebied van quadrupedal locomotief, hier gepresenteerd is het gebruik van een 3D-bewegings volgsysteem dat aanvullende informatie kan bieden, zoals lichaamshouding, paw-rotatie met betrekking tot lichaams assen, onderlinge relaties van gewrichten en nauwkeurigere informatie met betrekking tot de coördinatie, terwijl tegelijkertijd het hele dier uit alle vliegtuigen wordt gevisualiseert. Dit, op zijn beurt, kritische verschillen in motorische gedrag binnen en tussen gezonde en gewonde ratten kan onthullen door middel van meerdere uitkomsten. Met een meer verfijnde Kinematische analyse die nauwkeurig en objectief is, wordt het risico van ten onrechte onvruchtingseffecten van een interventie geminimaliseerd. De gegenereerde gegevens van deze motion capture-software worden frame-voor-frame gevisualiseerd voor de kwaliteit van de beweging en kunnen automatisch worden bijgehouden, en het verzamelen of kwantificeren van gegevens vereist geen extra algoritmen of modellering. Het doel van dit werk is het verschaffen van methodologische details en overwegingen die betrokken zijn bij het verzamelen van en analyseren van 3D-gang-kinematica tijdens loopband bewegingen in gezonde en ruggenmerg gewonde ratten. Dit protocol is bedoeld voor gebruik door preklinische onderzoekers die gebruik maken van neurologische rat modellen in experimenten.
Deze studie werd uitgevoerd in overeenstemming met de aanbevelingen van de National Institutes of Health Guide voor de verzorging en het gebruik van proefdieren. Het protocol werd goedgekeurd door de Stony Brook University Chancellor ' Animal Research Committee.
1. set-up van motion capture systeem
2. kalibratie van het motion capture-systeem
3. trainen en voorbereiden van het dier voor loopband motoriek
4. motion capture
5. bewegingsregistratie
6. Kinematische analyse
Dit protocol demonstreert een methodologie voor kwantitatieve 3D-kinematische gegevensverzameling en-analyse voor loopband motoriek bij knaagdieren met behulp van een eenvoudige, ingebouwde software. De resultaten tonen aan dat het protocol haalbaar is bij het verzamelen en analyseren van quadrupedal motoriek kinematica in gezonde en ruggenmerg gewonde ratten. Onderzoekers met Rat handling-ervaring moeten markers op ratten plaatsen, vervolgens kalibreren en het motion capture-systeem gebruiken zonder kritieke problemen. Gegevens worden gemakkelijk gegenereerd zonder het gebruik van complexe algoritmen.
Hier, het protocol werd geïmplementeerd in gezonde en ruggenmerg gewond (C5 right hemisection) ratten. Voor het doel van dit manuscript worden alleen representatieve resultaten getoond. Over het algemeen waren verschillende kinematica van de beweging van het gewricht en de ledematen gemakkelijk te verkrijgen vanuit de 3D-coördinaten van elke marker. Kritische verschillen tussen abnormale gang en gezonde loop cycli werden gemakkelijk gedetecteerd met meerdere uitkomsten, waaronder (maar niet beperkt tot) stap hoogtemetingen, gewrichts snelheid, gewrichts hoek (Figuur 9), stap cyclus fase duur voor alle vier de ledematen, coördinatie van de ledematen (Figuur 10). Analyse van kwalitatieve gegevens in de vorm van percelen en stok diagrammen kan leiden tot de bepaling van de kwantitatieve instrumenten die worden gebruikt om de eindresultaten van deze analyse benadering te verwezenlijken (Figuur 11).
In een representatieve gezonde rat toonde het profiel van de elleboog hoek gladde, enkelvoudige pieken met consistente aangrenzende gang cycli die een volledig bewegingsbereik vertoonden (Figuur 9). De alternerende houding fase en de swing fase duur van de traceringen suggereerden een consistente intralimb coördinatie. In tegenstelling, de elleboog hoekprofiel van een representatieve ruggenmerg gewonde rat toonde meerdere vervormde pieken, die minder consistent en van kleinere bewegingsbereik waren. Naast de veranderingen in de verlengde Stance fase en de verkorte Swing fase duur, was er een tekort aan intralimb coördinatie voor de RFL.
In de gepresenteerde representatieve gegevens die werden uitgezet voor de coördinatie, bleek dat de coördinatie plots (Figuur 10) die werden gegenereerd door representatieve gezonde ratten, een welomschreven, afwisselende ritmische coördinatie vertoonden in ipsilaterale ledematen tijdens het cycli (L-vormig patroon) en in-Phase D-vormig patroon met contralaterale ledematen. Ter vergelijking, een representatieve ruggenmerg-gewond (C5 rechter hemisectie) toonde een slechte niet-alternerende en niet-ritmische coördinatie in ipsilaterale ledematen en een ongewone alternerende ritmische coördinatie (L-vormig patroon) in een van de contralaterale combinaties van ledematen (Figuur 10). Gezien het waarneembare tekort in de rechter voorkant van de opgenomen bewegings video, suggereert dit dat de RFL en LHL niet in staat waren om op een bepaald moment volledig gewicht te dragen zonder de ondersteuning van LFL of RHL. Deze trend suggereert een compenserende mechanisme om te gaan met de geforceerde loopsnelheid op een loopband.
Kwantificeerbare gegevens werden gemakkelijk gegenereerd uit het gebruik van het 3D-systeem, maar dit betrof toegang tot afzonderlijke tabbladen en selecteren uit een veelheid aan opties die beschikbaar zijn in de software. Er is momenteel werk aan het ontwikkelen van een geautomatiseerd sjabloon die kwantitatieve en kwalitatieve gegevens genereert in één rapport voor de meest voor de hand liggende uitkomsten van belang (zonder de noodzaak om afzonderlijk verschillende uitkomsten te genereren), zoals routinematig wordt gedaan met kinematische systeem gebruikt voor klinische studies. Zo kunnen verschillende eindpunten worden gecompileerd en geëxporteerd in een rapportindeling die direct na een proefperiode gemakkelijk kan worden gevisualiseerd.

Figuur 1 : Experimentele opstelling. (A) Schematische voorstelling van een kinematische gegevensverzamelings opstelling met zes camera's voor een loopband wandeltaak. Aan beide zijden van de loopband wordt een set van drie camera's geplaatst om (frame-voor-frame) linker-en rechter markerings bewegingen te vangen tijdens het rijden. B) diagram met de plaatsing van de marker over de Bony-monumenten op de voorpoten en achterpoten van de knaagdieren om de bewegings bewegingen van het viervoetige te vangen. Er worden in totaal 11 markeringen aan elke kant van de rat geplaatst. De gearceerde gebieden tonen het gebied waar de rat geschoren is. Klik hier om een grotere versie van dit cijfer te bekijken.

Figuur 2 : Markers voor kalibratie. A) toewijzingen van markerings punten voor het kalibratiesysteem voor de wand, met behulp van twee kalibratie frames: l-frame en toverstaf (B) het coördinatensysteem wordt gedefinieerd door het l-frame, waarbij de oorsprong van het l-frame (snijpunt van twee poten van het frame) wordt gedefinieerd als (0, 0). De twee ledematen van het L-frame, L-frame kort en L-frame Long definiëren respectievelijk de x-en y-as en de z-as wordt als loodrecht op het XY-vlak gedefinieerd. Klik hier om een grotere versie van dit cijfer te bekijken.

Figuur 3 : Markerings typen. A) foto van de onderste romp van de rat met daarin de twee soorten markers die worden gebruikt. B Foto toont een retroreflecterend marker geplaatst op de iliacale Crest met dubbelzijdige tape die is ontworpen om te voldoen aan de huid (rood omcirkeld). C De foto toont de plaatsing van een penmarkering over het rechter metatarsophalangeale gewricht (rood omcirkeld). Klik hier om een grotere versie van dit cijfer te bekijken.

Figuur 4 : Bewegingsregistratie. (A) afbeelding toont de bewegings tracerings interface waar meerdere markeringen tegelijkertijd kunnen worden bijgehouden met behulp van de functies "track automatisch" en "bijhouden met behulp van patroon matching". B) vergrote weergave van een retroreflecterend marker wordt gedetecteerd als een helder witte ronde vlek in de functie "track automatisch" tijdens de marker toewijzing. De software herkent deze plek als een helder blauwe ronde vlek. De rode stip wordt uiteindelijk herkend als het middelpunt van de voorgeschreven marker. Een gecentreerde rode vlek binnen de ronde markering verkleint de kans op experimentele fouten tijdens het bijhouden van gegevens. Afwijking van het centrum suggereert dat latere metingen en analyses waarschijnlijk onnauwkeurig zijn. C Vergrote weergave van een retroreflecterend marker geselecteerd voor patroon matching. Op basis van de grootte, vorm en kleur van de geselecteerde markering identificeert de software automatisch markeringen die overeenkomen met de beschrijving in de volgende videoframes. Klik hier om een grotere versie van dit cijfer te bekijken.

Figuur 5 : Basis en geavanceerde tracking opties. (A) Video's kunnen binnen de software worden verwerkt door met de rechtermuisknop op de video te klikken tijdens de analyse, zodat onduidelijke of wazige markeringen duidelijk worden gevisualiseerd om automatische tracking mogelijk te maken. Voor demonstratiedoeleinden worden twee soorten beeldverwerkingsinstellingen weergegeven die zijn aangepast aan verschillende omgevingslichtomstandigheden tijdens het verzamelen van gegevens voor eenvoudige tracering. (B) een representatief videoframe voorafgaand aan de beeldverwerking. (C) voor eenvoudige beeldverwerking (Verwerkingstype I), helderheid en contrastinstellingen worden aangepast voor een duidelijkere weergave. (D) met behulp van de geavanceerde beeldverwerkingsinstellingen (Verwerkingstype II) wordt de rechter metatarsophalangeale gewrichts marker (zwarte marker) omgekeerd en kan deze vervolgens automatisch worden bijgehouden. Klik hier om een grotere versie van dit cijfer te bekijken.

Figuur 6 : Fasetoewijzingen. De loopcyclus voor elke ledemaat kan worden onderverdeeld in afzonderlijke fasen volgens het experimentele ontwerp. Voor demonstratiedoeleinden worden drie fasen van de gang cyclus weergegeven. A) de Stance-fase wordt gedefinieerd als het eerste frame waarin de ledemaat contact maakt met het loopband oppervlak. B) de swing fase wordt gedefinieerd als het eerste frame waarin de ledemaat verlaat de loopband oppervlak (C) mid Swing fase is het eerste frame na de ledematen klaring waar de poot begint af te dalen. In (D) wordt een complete loopcyclus gedefinieerd vanaf het begin van de initiële koers tot de Stance-fase toewijzing van de volgende gang cyclus. Klik hier om een grotere versie van dit cijfer te bekijken.

Figuur 7 : Geavanceerde opties voor stap fase analyse. Deze optie biedt een diepgaande weergave van tracking-en fasetoewijzingen, evenals de mogelijkheid om fasetoewijzingen te wijzigen. (A) markerings keuzevakje om de gewenste marker te bekijken en te selecteren. (B) coördinaat selectievenster: het markeren van de coördinaat van belang (in dit geval z-coördinaten) wordt weergegeven als rood in het hoofddiagram venster. (C) faseselectie venster: toegewezen fasen voor een ledemaat kunnen worden bekeken met betrekking tot markers en coördinaten geselecteerd onder a) en (B). Fasen kunnen ook via dit venster worden bewerkt. (D) diagram venster: coördinaten voor een specifieke marker kunnen gelijktijdig worden vergeleken tijdens individuele cyclusfasen. Het groen en geel representeren respectievelijk de standen-en swing fases voor de rechter achterledemaat tijdens quadrupedal motoriek. Klik hier om een grotere versie van dit cijfer te bekijken.

Figuur 8 : Voorbeeld van 3D-kinematische gegevens. A) verschillende uitkomsten van elke gezamenlijke marker kunnen worden gevisualiseerd vanuit de 3D-coördinaten dataset na video tracking (B) representatieve gegevens gegenereerd voor de koers-en swing fase cycli voor elk forelimb en hindledemaat tijdens quadrupedaal wandelen in een rat. Kleuren vertegenwoordigen standen en swing fasen van opeenvolgende stap cycli. Rood en groen corresponderen met respectievelijk de juiste fasen van de voor-en achterledematen. Blauw en Teal corresponderen met respectievelijk de linkerfasen van de forelimb en de achterledematen. Geel komt overeen met de swing fase van elke ledemaat. (C) meerdere gegevensgroepen (discrete markers of uitkomsten) gelijktijdig met gemak kunnen worden vergeleken. De z-coördinaat Velocity gegevens van de linker en rechterknie gewricht markeringen worden willekeurig geselecteerd om de verticale snelheid van de kniegewricht marker van de loopband oppervlak te demonstreren. Klik hier om een grotere versie van dit cijfer te bekijken.

Figuur 9 : Representatieve gezamenlijke hoek kinematische gegevens van gezonde en cervicale ruggenmerg-gewonde ratten tijdens loopband motoriek. (A) elleboog gewrichts hoekprofiel in een gezonde representatieve rat toont gladde, enkelvoudige pieken van de gewrichts hoek traceringen met consistente aangrenzende gang cycli die een volledig bewegingsbereik weergeven. Rode en gele staven duiden respectievelijk de koers-en zwenk fasen van de forelimb-stap cyclus aan. B) daarentegen zijn de sporen in een representatieve, in het ruggenmerg gewonde rat relatief meer vervormd en vertonen inconsistente meervoudige pieken met een globaal kleiner bereik van gezamenlijke beweging. Klik hier om een grotere versie van dit cijfer te bekijken.

Figuur 10 : Representatieve ledematen coördinatie gegevens van een gezonde en cervicale ruggenmerg gewonde rat tijdens loopband motoriek. A) de waarden van de z-coördinaat van de metacarpophalangeale (MCP) en metatarsophalangeale (MTP) markeringen van stap hoogtemaat regelen worden uitgezet in zes verschillende combinaties tussen ledematen vanaf ongeveer 10 stappen tijdens het viervoetenlopen. Getoond zijn representatieve demonstratie van alle zes mogelijke ledematen coördinatie paren. B) een gezonde rat toont een duidelijke alternerende ritmische coördinatie (L-vormig patroon) voor alle paren (i, II, III, IV). Wanneer ledematen in fase zijn (v, VI), volgen de coördinatie paren een D-vormig patroon. C) in een gewonde wervelkolom van het cervicaal koord (i) de slechte coördinatie tussen de twee forelimbs, (III) rechter ipsilaterale koppeling en (IV) ongewone coördinatie voor een van de contralaterale ledematen paren. Houd er rekening mee dat de coördinatie plots (B, C) niet dezelfde schaaldelen. Klik hier om een grotere versie van dit cijfer te bekijken.

Figuur 11 : Geanimeerde 3D stok figuur. Voorbeeld van een 3D-stok figuur die wordt gegenereerd op basis van bijgehouden gegevens. Klik hier om dit cijfer te downloaden.
| Kalibratie parameter | Kalibratie-ingangen |
| Lengte van de wand [mm] | 100 |
| L-frame vloer offset [mm] | 7 |
| Iteraties voor outlier-detectie | 4 |
| Toegestane wand-lengte-afwijking | 0,3 |
| De wand moet zichtbaar zijn in ten minste __ camera's | 4 |
| Hoogte-breedte verhouding corrigeren | Gecontroleerd |
| Fix scheeftrekken-parameter | Gecontroleerd |
| Hoofdpunt corrigeren | Gecontroleerd |
Tabel 1: geavanceerde instellingen voor kalibratie. De tabel geeft een overzicht van de parameters die we gebruikten om de set-up met zes camera's nauwkeurig te kalibreren. Deze instellingen zijn experimenteel getest en optimaal gevonden voor onze set-up.
Dit protocol artikel demonstreert het gebruik van een bewegings volgsysteem voor het verzamelen en analyseren van 3D kinematische gegevens tijdens viervoetige loopband motoriek bij knaagdieren. Belangrijke kenmerken van het 3D-KINEMATISCH bewegingsanalyse systeem zijn een gedetailleerde kwantificering van kinematica van gezamenlijke beweging (stap fase kinematica, gewrichts hoeken, bewegingsbereik, stap snelheden) van meerdere gewrichten en ledematen tegelijk, detectie van motorische tekorten onmeetbaar door het blote oog, eliminatie van subjectieve bias in het verzamelen en analyseren van gegevens, en eenvoudige visualisatie van de hele ledematen en houdings kinematica die kunnen worden vergeleken met gelijktijdige nevenschikking van de hele rat in beweging. Zonder de noodzaak voor toegevoegde algoritmen en modellering, tonen de methoden de mogelijkheid van de software om kinematica van gang kwantitatief te analyseren met veel detail, efficiëntie, gemak, precisie en reproduceerbaarheid.
Bij knaagdieren worden de tekorten van forelimb en achterpoot locomotief na een ruggenmergletsel (SCI) vaak beoordeeld met behulp van subjectieve en gestandaardiseerde systemen voor het scoren van locomotief, zoals het BBB scoring system1. Subjectieve scorings systemen introduceren in het algemeen tester bias omdat verschillende onderzoekers verschillende scores kunnen toekennen voor hetzelfde motor tekort of dezelfde score voor verschillende motorische tekorten, wat resulteert in verminderde reproduceerbaarheid en gevoeligheid van de test13 . Bovendien draagt het onvermogen om subtiele tekorten op te sporen het risico dat de effecten van een interventie ten onrechte worden afgeleid.
Om deze problemen te bestrijden, zijn geautomatiseerde systemen2,3,4,5 en systemen met of zonder gebruik van complexe algoritmen14,15 door sommige onderzoekers overgenomen. Deze tests uitvoeren stap cyclus analyse die gewicht lager profielen en stap sequentie patronen afgeleid van paw plaatsing bewegingen van ratten lopen over een landingsbaan onthullen. Een groot nadeel van ventrale vliegtuig video analyse is echter dat het lichaam van het onderwerp zelf niet direct zichtbaar is2,3. Deze gegevens worden beperkt tot informatie die is verkregen uit indrukken van voeten en poot bewegingen, waarbij de selectie en interpretatie van de parameters bij het beoordelen van tekorten wordt verhogend (Zie Chen et al.16). Details van beweging die dynamische segmentale kinematica van beweging van de ledematen en positionering onthullen zijn niet nauwkeurig verkrijgbaar voor motoriek analyse3,5. Kritische afwijkingen van de gegevens van de gezamenlijke hoek (d.w.z. het bereik van bewegingen, de snelheid van bewegingen, enz.), de relatie van gewrichten ten opzichte van elkaar binnen een ledemaat en tussen ledematen, en onderliggende lichaams mechanica die de gang patronen veranderen, zijn onmogelijk te verkrijgen. Als zodanig, of eventuele waarneembare gang-beperkingen het gevolg zijn van veranderingen in enkelvoudige en/of meervoudige segmentale gewrichts bewegingen (d.w.z. proximale-distale intralimb-coördinatie, houdings verhoudingen van de romp met betrekking tot de positie en de gang cyclus van ledematen, enz.) blijven gemaskeerd.
Weinig momenteel beschikbare systemen vangen gang kinematica en beoordelen motorische disfunctie kwalitatief en kwantitatief, maar worden minder veel gebruikt. Een full-body video-tracking-analysesysteem met hoge snelheid maakt spontane gang cycli van drie zijden (één ventrale en twee laterale vlakken) en spoor Bony-monumenten op om een aantal gang-uitkomsten17,18uit te voeren. De kinematische gang-analyse van het sagittale vlak wordt door sommige onderzoekers gebruikt om 2D-bewegingsgegevens te verkrijgen van de geïnteresseerde achterledemaat19,20. Een derde dimensie van beweging die orthogonaal op het kijkvlak (laterale of Sagittaal) voorkomt, is echter niet detecteerbaar in de analyses11,18,19.
Andere geavanceerdere, 3D, drie Body-segment knaagdieren lichaam houdings gegevensverzamelingssystemen maken gebruik van 3D-wiskundige modellering van gegevensverzameling en analysesysteem om de 3D-beweging van de lichaams segmenten van de knaagdieren te volgen en te kwantificeren, terwijl het hoofd bewegingspatronen8. Madete et al.9 hebben een marker gebaseerd opto-elektronische motion capture-systeem ontwikkeld om 3D Body houdings kinematica te kwantificeren tijdens bovengrondse motoriek op wandel balken met behulp van een zeven camerasysteem. De belangrijkste uitkomsten bestudeerd in de laatste twee werken richten zich vooral op de algehele houding van het knaagdier in plaats van een gang analyse. 3D motion capture-systemen bieden hoge doorvoer 3D kinematische gang gegevens met behulp van meerdere camera's en uitgebreide software systemen, zoals beoordeeld door Bhimani et al.21. Oudere versies van het gepresenteerde 3D-Bewegingsanalyse systeem zijn ook gebruikt in eerdere werkzaamheden bij ratten met en zonder neuro trauma12,22,23.
Ondanks de beschikbaarheid van 3D-systemen voor bewegings inzameling en-analyse voor onderzoek, blijft het preklinisch gebruik van deze techniek bij knaagdieren relatief beperkt. Een deel van de reden voor dit probleem is dat de protocollen voor het verzamelen en analyseren van gegevens sterk afhankelijk zijn van het gebruik van kinematische modellen en ingewikkelde algoritmen die passen bij een KINEMATISCH model van de achterledemaat van de rat tijdens het lopen om een fijne, hoge resolutie te genereren gang kinematica8,9,11,22. De gedetailleerde methodologie die hier wordt gepresenteerd, bevat nadere bijzonderheden over de procedure die tijdens het experimentele proces betrokken is, waaronder de behandeling van dieren, training, experimentele opstelling, gegevensverzameling en analysestappen.
Ook zijn details over de kalibratie van het systeem, dat is het fundamentele deel van het Protocol, dat de reproduceerbaarheid tussen de aangrenzende proeven binnen en tussen onderwerpen verzekert zal. De beschreven stap-voor-stap technieken introduceren objectiviteit in de procedure voor het verzamelen van gegevens en maken deze zeer reproduceerbaar. De gegenereerde gegevens van deze motion capture-software kunnen frame-voor-frame worden gevisualiseerd voor de kwaliteit van de beweging en automatisch worden bijgehouden. Verder beschreven is hoe deze verzameling of kwantificering van gegevens geen extra algoritmen of modellering vereist. Studenten, medewerkers en onderzoekers kunnen gebruik maken van eenvoudige statistische software om elementaire kinematische uitvoer te genereren zonder te vertrouwen op specifieke technische expertise.
Dit systeem kan ook worden gebruikt voor bovengrondse motoriek, bereiken en grijpen, en andere experimentele opstellingen om het experimentele doel aan te passen. Het aantal en het type markeringen kunnen desgewenst ook worden aangepast voor de staart, achterkant, romp of oren. Een groter voordeel van de gepresenteerde software in vergelijking met systemen is de mogelijkheid om hoge-resolutie videogegevens van het onderwerp te verzamelen. Als zodanig kunnen complexe sets van berekeningen (d.w.z. hoek bewegingen, stok lijnen die meerdere gewrichten verbinden, enz.) worden bovenop de opgenomen video. De plaatsing van de marker en de gegenereerde 3D-gegevens kunnen worden geverifieerd met daadwerkelijke bewegingen van een rat in beweging. In tegenstelling, met de andere 3D motion capture systeem, alleen de markers worden vastgelegd, en elke re-analyse moet worden gedaan op de stok diagrammen (skelet kader) in plaats van de video van de eigenlijke onderwerp. Bijgevolg ontbreekt de controle van de plaatsing van de marker op de eigenlijke beweging van het onderwerp.
Op basis van ervaring met dit systeem speelt kalibratie een cruciale rol in het succes van het verzamelen van gegevens. De kalibratie van het systeem is zeer gevoelig voor verandering. en een lichte beweging van een camera kan het volledige verzamelen en analyseren van gegevens van 3D-coördinaten in gevaar brengen. Er zijn slechts twee camera's aan elke kant van een kijkvlak vereist voor het verzamelen van gegevens, maar de derde camera wordt ten zeerste aanbevolen om meer nauwkeurigheid te bieden door de locaties van elke marker met andere camera's te kruisen. Naarmate het aantal tracking camera's toeneemt, zal de nauwkeurigheid van de 3D-coördinaat voor een specifieke marker ook toenemen. In gevallen waarin markers worden verduisterd als gevolg van gang tekorten (zoals Teen curling of slepen in het geval van gang na neuro trauma), kunnen deze voorwaarden vereisen uitgebreide handmatige tracking. Niettemin, de hoeveelheid gegevens die uiteindelijk gegenereerd uit de tracking is waardig van de tijd geïnvesteerd in het handmatig volgen van de markers, waardoor het een onschatbare hulpmiddel bij het opsporen van subtiele motorische tekorten.
In onze ervaring ligt elke teijdigheid die gepaard gaat met het gebruik van het systeem buiten het gebruik van de apparatuur en technologie zelf. Vergelijkbaar met andere protocollen voor de beoordeling van motorische gedragingen, de methode waarmee ratten worden gehanteerd en getraind voor de taak sterk beïnvloedt resultaten. Bijvoorbeeld, het isoleren van ratten uit hun cohort is van cruciaal belang tijdens het testen; anders, ratten die niet zijn getest, maar nog steeds aanwezig zijn tijdens het testen tonen uiteindelijke verslechtering van de prestaties van de taak. Optimale kamertemperaturen, verlichting en geluidsniveaus zijn andere determinanten. Fouad et al. publiceerde andere uitdagingen die functionele motortesten bij ratten24begeleiden. Zelfs geblindeerde gebruikers uit dit laboratorium die de methodologie correct volgden, ondervinden geen grote hindernissen met gegevensverzameling, bewegingsregistratie en gegevensanalyse.
In dit document wordt een 3D motion capture-systeem voor het effectief verzamelen en analyseren van locomotief gegevens beschreven, zodat onderzoekers enorme hoeveelheden in-depth bewegingsgegevens snel van meerdere ratten kunnen verzamelen. We werken momenteel aan het maken van een geautomatiseerde data analyse-sjabloon die in de software kan worden ingebouwd en in staat zal zijn om binnen enkele seconden een rapport van vooraf bepaalde uitkomsten te genereren voor loopband motoriek bij knaagdieren, vergelijkbaar met wat wordt gedaan in menselijke studies met behulp van motion capture en analysesystemen6,25. De ontwikkeling van deze sjabloon zal preklinische onderzoekers toelaten om gedetailleerde knaagdier locomotief gegevens te verkrijgen met het gemak van een paar klikken van een muisknop. Het is te hopen dat de methoden die in dit werk worden geboden, nuttig zullen blijken voor preklinische onderzoekers om het gedrag van knaagdieren op een meer objectieve wijze te beoordelen. We zijn nu op de hoogte van het gebruik van dit systeem voor het verzamelen van 3D-kinematische gegevens met hoge doorvoer tijdens gemeenschappelijk, bekwaam gedrag van forelimb, zoals bereiken en grijpen. Belangrijk is dat het nut van deze methode kan worden uitgebreid tot ratten met een verscheidenheid van neurotraumatische en niet-neurotraumatische verwondingen.
De auteurs hebben niets te onthullen.
Onze speciale dank aan Pawan Sharma voor zijn hulp bij de experimentele opstelling voor de video en de intellectuele bijdrage aan dit project. We danken Christopher Palacio ook voor zijn bijdrage aan de demonstratie van het video protocol.
| Naam | Bedrijf | Catalogusnummer | Opmerkingen |
|---|---|---|---|
| 6 camera Basler (Scout scA640-120gu) motion capture system. | Simi Reality Motion Systems GmbH Max-Planck-Str. 11 85716 Unterschleibheim, Germany | N/A | Opnameapparaat voor bewegingsanalyse. |
| Calibration Frame and Wand | Simi Reality Motion Systems GmbH Max-Planck-Str. 11 85716 Unterschleibheim, Germany | N/A | L-vormig kalibratieframe dat het wereldwijde coördinatensysteem definieert, en de drietandvormige scepter (100 mm) |
| Markers | Shah Lab | N/A | Opnameapparaat voor bewegingsanalyse. Markers worden in ons lab op maat gemaakt van 0,5 cm googly-ogen bedekt met reflecterend plakband. |
| Matlab | Mathworks, Inc, Natic, Ca | N/A | Data-analysesoftware |
| Rodent Cage | Custom Made binnen Stony Brook. | N/A | Duidelijke plexiglaskooi die wordt gebruikt om de knaagdieren op de loopband te houden. |
| Simi Reality Motion Systems | Simi Reality Motion Systems GmbH Max-Planck-Str. 11 85716 Unterschleibheim, Germany | N/A | 3D-trackingsoftware. |
| Treadmill | Mk Automation Inc., Bloomfield, CT 06002 | N/A | Loopband gebruikt voor knaagdierlocomotion. |