$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Op aarde moleculaire zuurstof in opmerkelijke concentraties is beschikbaar in gebieden met direct contact met de atmosfeer of in de aanwezigheid van Oxygene fototrophs. Omgevingen waarin zuurstof ontbreekt worden anaerobe genoemd. Echter, Energieconversie is nog steeds mogelijk onder anaerobe condities via twee verschillende metabole processen, fermentatie en anaerobe ademhaling1.
Terwijl organismen die aërobe ademhaling ondergaan zuurstof gebruiken als een terminale elektron acceptor, vereist anaerobe ademhaling alternatieve elektron acceptoren zoals nitraat of sulfaat2. In de zogenoemde "elektronen toren" worden redox koppels georganiseerd volgens hun redoxpotentiaal, met de meest negatieve aan de top (elektron donoren) en de sterkste oxidatiemiddelen met positieve redoxpotentiaal onderaan (elektron acceptors). De elektron overdracht tussen donoren en accepteurs leidt tot energiebesparing via de zogenaamde Ademhalings keten en elektronen kunnen worden opgevangen door elektronen acceptoren-om in de foto te blijven-in verschillende verdiepingen van de toren. Daardoor, hoe hoger de val van elektronen door de elektronen toren, hoe meer energie kan worden behouden door de respectieve reactie. Daarom is ademhaling ook mogelijk in anaerobe habitats, bijvoorbeeld met redox paren, waaronder geen3-/No2-, fumarinezuur/BARNSTEENZUUR, dus32-/u2s, s °/u2s, MN (IV)/mn (II ), Fe (III)/Fe (II)2,3. Eerste, de resulterende energie wordt bewaard als membraanpotentiaal, die vervolgens wordt gebruikt door elektron transport fosforylering voor adenosine-trifosfaat (ATP) synthese door membraan gebonden ATP-synthases. In tegenstelling tot aërobe ademhaling, de hoeveelheid energie die kan worden bewaard door anaerobe ademhaling kan drastisch worden verminderd; echter, de energie-output van de meeste anaerobe ademhaling is nog steeds hoger in vergelijking met fermentatie, een anaerobe energiebeschermingsweg in habitats die geen zuurstof en andere terminale elektron acceptoren2.
Tijdens de fermentatie worden energierijke, organische substraten afgebroken tot verschillende fermentatie producten die vaak de naam van het totale proces definiëren, bijvoorbeeld alcoholische fermentatie. In tegenstelling tot Ademhalings processen is de ATP-generatie tijdens de fermentatie beperkt tot substraat niveau fosforylering waarbij een fosfaatgroep wordt overgebracht naar adenosine-di-fosfaat (ADP) van een energierijke fosforyleerd substraat2. Het fermenteren van micro-organismen speelt een centrale rol bij de anaerobe afbraak van organisch materiaal, omdat het belangrijke spelers in de substraat afbraak zijn. De primaire fermentatie producten, zoals organische zuren, alcoholen, CO2en h2, kunnen vervolgens worden gebruikt door secundaire fermenterende micro-organismen om azijnzuur, co2en h2te produceren. Voorbeelden van fermentatie producten zijn melkzuur, verschillende vluchtige vetzuren (mieren-, azijnzuur-, propion-, Butyric-, valerische zuren), n-butanol, 2, 3-butandiol, aceton en ethanol.
De teelt van micro-organismen onder strikt anaerobe omstandigheden vereist totaal verschillende methoden en apparatuur in vergelijking met de teelt van aërobe organismen. Terwijl zuurstof tolerante organismen vaak worden gekweekt op agar-gerechten, zogenaamde oppervlakte culturen, is dit-met een paar uitzonderingen-nauwelijks mogelijk voor strikt anaerobe micro-organismen. Daarom worden verrijkings culturen van strikt anaerobe micro-organismen voornamelijk vastgesteld in vloeibare media die kweekvaten met gasdichte septa aanbrengen die een zuurstofvrije ruimteatmosfeer van4,6, 7.
De huidige protocol beschrijving voorziet in passende teeltmethoden voor doel-micro-organismen van een gemengde populatie die afkomstig zijn van een anaerobe biogasinstallatie. De isolatie en teelt van zuivere culturen is nog uitdagender, maar maakt geen deel uit van dit werk.
Hier tonen we de procedure voor het cultiveren van een anaerobe microbiële Gemeenschap op basis van een studie over de vorming van fenylzuren tijdens anaerobe vergisting van Proteïnurie8. De microbiële Gemeenschap bestond uit leden uit alle vier fasen van anaerobe vergisting: hydrolyse, acidogenese, acetogenese en methanogenese. Een mineraal zout medium aangevuld met een koolstofbron, redox-indicator, vitamine-en spoorelement oplossing en reduceermiddel werd toegepast9. Het medium werd gewijzigd met de respectieve proteinaceeuze fenyl zuur precursor substraten8.